These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6793#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 707 fasta sequence [AACAAATCCCAAAATAGATTACGATTGTTTACTATTAATTATGAGCTGACATCGTTCAAAATGTACGCAAATCAATAGAAGAACAAGTTTGTGGCCTAAAGGTGAGAAATATTGATTCCACAATATACACTATAACACGTTACACGTACGCGAAAAGTGCAGGAATAACTCTCTTTTTTACCGTGCCGGAATTTTTAGTAAGTTGTTTTGTATTTTCAAGATTATGGATTCCTGAGATTAGTCCAGCATAAAATAGTAAAAAAACATTTAAATATTGATCGATATATTTTGTCAAATGTTTTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAAATCGATCAATAGGCAATAAATTGTTTTAATTCATTAATGAAACCATATAATGTTATGGTTTTCTTTCCTTTTTTGCATTGAATAAGATCAGTACCTTTAATGCATTAAAAAGTTAATCTTCTTAATGAGATTTGGCATTCGTTATATAACTACTTTAAAGTCTTCAACCATTCTATATCTCTTTGTGGCTTTGTCTAGAAATTTGGAATTTATACAGCTTAATTATGATTTATAAATAAGAAAAATGTAACTAAATTCATTGTAGATGCACTCATTGCATACAAATCAGTTCTTTTTTGTTGTCAAAAGACTTTTCTGTTTTTGTGTACTTATTTGTTTTATTTTGAATAATA] [+] EMBL CD082226 [AACAAATCCCAAAATAGATTACGATTGTTTACTATTAATTATGAGCTGACATCGTTCAAAATGTACGCAAATCAATAGAAGAACAAGTTTGTGGCCTAAAGGTGAGAAATATTGATTCCACAATATACACTATAACACGTTACACGTACGCGAAAAGTGCAGGAATAACTCTCTTTTTTACCGTGCCGGAATTTTTAGTAAGTTGTTTTGTATTTTCAAGATTATGGATTCCTGAGATTAGTCCAGCATAAAATAGTAAAAAAACATTTAAATATTGATCGATATATTTTGTCAAATGTTTTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAAATCGATCAATAGGCAATAAATTGTTTTAATTCATTAATGAAACCATATAATGTTATGGTTTTCTTTCCTTTTTTGCATTGAATAAGATCAGTACCTTTAATGCATTAAAAAGTTAATCTTCTTAATGAGATTTGGCATTCGTTATATAACTACTTTAAAGTCTTCAACCATTCTATATCTCTTTGTGGCTTTGTCTAGAAATTTGGAATTTATACAGCTTAATTATGATTTATAAATAAGAAAAATGTAACTAAATTCATTGTAGATGCACTCATTGCATACAAATCAGTTCTTTNTTGTTGTC AAAGACTNTTCTGTTTTTGGGTACTTATTTGTTTTATTTTGAATAtna] [-] EMBL CD076776 [ CACTATAACACGTTACACGTACGCGAAAAGTGCAGGAATAACTCTCTTTTTTACCGTGCCGGAATTTTTAGTAAGTTGTTTTGTATTTTCAAGATTATGGATTCCTGAGATTAGTCCAGCATAAAATAGTAAAAAAACATTTAAATATTGATCGATATATTTTGTCAAATGTTTTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAAATCGATCAATAGGCAATAAATTGTTTTAATTCATTAATGAAACCATATAATGTTATGGTTTTCTTTCCTTTTTTGCATTGAATAAGATCAGTACCTTTAATGCATTAAAAAGTTAATCTTCTTAATGAGATTTGGCATTCGTTATATAACTACTTTAAAGTCTTCAACCATTCTATATCTCTTTGTGGCTTTGTCTAGAAATTTGGAATTTATACAGCTTAATTATGATTTATAAATAAGAAAAATGTAACTAAATTCATTGTAGATGCACTCATTGCATACAAATCAGTTCTTTTTTGTTATCAAAAGACTTTTCTGTTTTTGTGTACTTATTTGTTTTATTTTGAATAAT ] [-] EMBL CD075837 [ TATAACACGTTACACGTACGCGAAAAGTGCAGGAATAACTCTCTTTTTTACCGTGCCGGAATTTTTAGTAAGTTGTTTTGTATTTTCAAGATTATGGATTCCTGAGATTAGTCCAGCATAAAATAGTAAAAAAACATTTAAATATTGATCGATATATTTTGTCAAATGTTTTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAAATCGATCAATAGGCAATAAATTGTTTTAATTCATTAATGAAACCATATAATGTTATGGTTTTCTTTCCTTTTTTGCATTGAATAAGATCAGTACCTTTAATGCATTAAAAAGTTAATCTTCTTAATGAGATTTGGCATTCGTTATATAACTACTTTAAAGTCTTCAACCATTCTATATCTCTTTGTGGCTTTGTCTAGAAATTTGGAATTTATACAGCTTAATTATGATTTATAAATAAGAAAAATGTAACTAAATTCATTGTAGATGCACTCATTGCATACAAATCAGTTCTTTTTTGTTGTCAAAAGACTTTTCTGTTTTTGTGTACTTATTTGTTTTATTTTGAATAAT ] [+] EMBL CD083201 [ TTTAAATATTGATCGATATATTTTGGCAAATGTTTTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||