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Schistosoma mansoni
cluster # 6793 cluster # 6793       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6793#0 length = 707 sequences # 4  

consensusID : consensus_6793#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 707
fasta sequence
                              [AACAAATCCCAAAATAGATTACGATTGTTTACTATTAATTATGAGCTGACATCGTTCAAAATGTACGCAAATCAATAGAAGAACAAGTTTGTGGCCTAAAGGTGAGAAATATTGATTCCACAATATACACTATAACACGTTACACGTACGCGAAAAGTGCAGGAATAACTCTCTTTTTTACCGTGCCGGAATTTTTAGTAAGTTGTTTTGTATTTTCAAGATTATGGATTCCTGAGATTAGTCCAGCATAAAATAGTAAAAAAACATTTAAATATTGATCGATATATTTTGTCAAATGTTTTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAAATCGATCAATAGGCAATAAATTGTTTTAATTCATTAATGAAACCATATAATGTTATGGTTTTCTTTCCTTTTTTGCATTGAATAAGATCAGTACCTTTAATGCATTAAAAAGTTAATCTTCTTAATGAGATTTGGCATTCGTTATATAACTACTTTAAAGTCTTCAACCATTCTATATCTCTTTGTGGCTTTGTCTAGAAATTTGGAATTTATACAGCTTAATTATGATTTATAAATAAGAAAAATGTAACTAAATTCATTGTAGATGCACTCATTGCATACAAATCAGTTCTTTTTTGTTGTCAAAAGACTTTTCTGTTTTTGTGTACTTATTTGTTTTATTTTGAATAATA]

[+] EMBL CD082226             [AACAAATCCCAAAATAGATTACGATTGTTTACTATTAATTATGAGCTGACATCGTTCAAAATGTACGCAAATCAATAGAAGAACAAGTTTGTGGCCTAAAGGTGAGAAATATTGATTCCACAATATACACTATAACACGTTACACGTACGCGAAAAGTGCAGGAATAACTCTCTTTTTTACCGTGCCGGAATTTTTAGTAAGTTGTTTTGTATTTTCAAGATTATGGATTCCTGAGATTAGTCCAGCATAAAATAGTAAAAAAACATTTAAATATTGATCGATATATTTTGTCAAATGTTTTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAAATCGATCAATAGGCAATAAATTGTTTTAATTCATTAATGAAACCATATAATGTTATGGTTTTCTTTCCTTTTTTGCATTGAATAAGATCAGTACCTTTAATGCATTAAAAAGTTAATCTTCTTAATGAGATTTGGCATTCGTTATATAACTACTTTAAAGTCTTCAACCATTCTATATCTCTTTGTGGCTTTGTCTAGAAATTTGGAATTTATACAGCTTAATTATGATTTATAAATAAGAAAAATGTAACTAAATTCATTGTAGATGCACTCATTGCATACAAATCAGTTCTTTNTTGTTGTC AAAGACTNTTCTGTTTTTGGGTACTTATTTGTTTTATTTTGAATAtna]
[-] EMBL CD076776             [                                                                                                                               CACTATAACACGTTACACGTACGCGAAAAGTGCAGGAATAACTCTCTTTTTTACCGTGCCGGAATTTTTAGTAAGTTGTTTTGTATTTTCAAGATTATGGATTCCTGAGATTAGTCCAGCATAAAATAGTAAAAAAACATTTAAATATTGATCGATATATTTTGTCAAATGTTTTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAAATCGATCAATAGGCAATAAATTGTTTTAATTCATTAATGAAACCATATAATGTTATGGTTTTCTTTCCTTTTTTGCATTGAATAAGATCAGTACCTTTAATGCATTAAAAAGTTAATCTTCTTAATGAGATTTGGCATTCGTTATATAACTACTTTAAAGTCTTCAACCATTCTATATCTCTTTGTGGCTTTGTCTAGAAATTTGGAATTTATACAGCTTAATTATGATTTATAAATAAGAAAAATGTAACTAAATTCATTGTAGATGCACTCATTGCATACAAATCAGTTCTTTTTTGTTATCAAAAGACTTTTCTGTTTTTGTGTACTTATTTGTTTTATTTTGAATAAT ]
[-] EMBL CD075837             [                                                                                                                                  TATAACACGTTACACGTACGCGAAAAGTGCAGGAATAACTCTCTTTTTTACCGTGCCGGAATTTTTAGTAAGTTGTTTTGTATTTTCAAGATTATGGATTCCTGAGATTAGTCCAGCATAAAATAGTAAAAAAACATTTAAATATTGATCGATATATTTTGTCAAATGTTTTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAAATCGATCAATAGGCAATAAATTGTTTTAATTCATTAATGAAACCATATAATGTTATGGTTTTCTTTCCTTTTTTGCATTGAATAAGATCAGTACCTTTAATGCATTAAAAAGTTAATCTTCTTAATGAGATTTGGCATTCGTTATATAACTACTTTAAAGTCTTCAACCATTCTATATCTCTTTGTGGCTTTGTCTAGAAATTTGGAATTTATACAGCTTAATTATGATTTATAAATAAGAAAAATGTAACTAAATTCATTGTAGATGCACTCATTGCATACAAATCAGTTCTTTTTTGTTGTCAAAAGACTTTTCTGTTTTTGTGTACTTATTTGTTTTATTTTGAATAAT ]
[+] EMBL CD083201             [                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTAAATATTGATCGATATATTTTGGCAAATGTTTTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]


>consensus_6793#0 AACAAATCCCAAAATAGATTACGATTGTTTACTATTAATTATGAGCTGACATCGTTCAAA ATGTACGCAAATCAATAGAAGAACAAGTTTGTGGCCTAAAGGTGAGAAATATTGATTCCA CAATATACACTATAACACGTTACACGTACGCGAAAAGTGCAGGAATAACTCTCTTTTTTA CCGTGCCGGAATTTTTAGTAAGTTGTTTTGTATTTTCAAGATTATGGATTCCTGAGATTA GTCCAGCATAAAATAGTAAAAAAACATTTAAATATTGATCGATATATTTTGTCAAATGTT TTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAAATCGAT CAATAGGCAATAAATTGTTTTAATTCATTAATGAAACCATATAATGTTATGGTTTTCTTT CCTTTTTTGCATTGAATAAGATCAGTACCTTTAATGCATTAAAAAGTTAATCTTCTTAAT GAGATTTGGCATTCGTTATATAACTACTTTAAAGTCTTCAACCATTCTATATCTCTTTGT GGCTTTGTCTAGAAATTTGGAATTTATACAGCTTAATTATGATTTATAAATAAGAAAAAT GTAACTAAATTCATTGTAGATGCACTCATTGCATACAAATCAGTTCTTTTTTGTTGTCAA AAGACTTTTCTGTTTTTGTGTACTTATTTGTTTTATTTTGAATAATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)