cluster # 6845

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Schistosoma mansoni
cluster # 6845 cluster # 6845 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6845#0 length = 614 sequences # 4

consensusID : consensus_6845#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 614
fasta sequence

                              [CCTACCTTTTCTTTACTGATNNGCTTTCCTAATAAAAATTCAATTCCCAAATTTTCAAGCCTTGTTAGGGTGCTTTTATCCAATTCCAAAGTATCAATGAAGTATAAATCATTTTCATAGATAGGAAGTTTCATAAGAATACGTAGCAGCTCATAACAAGATGATCGCATCACCTTGCCGAACT-CTTCGCAGTATGTTCAATAAATATTGTTTATGCTTGGCCATTTATATTTGTGAACCATGGGAAAA-GGTCATATTACATTGCATCACACTGGCAATAATCTGTGCTCTTACATATACTGCAGTTTTAATTGTTCCTAGTCACTTATCTACCCTTATAATATTTGTATGGAAATGCCTGAATGGAGATAAGCATTGACATTCTAAAACTCTGAACAACGTTTTATAATATTGTTAGTTATTTTAAAGTTATTAAATATTTAAAACTAACATT-AAAATATTTTTTAAACA-ATAGTTTCCTCCAGCGTTTATTCTATTTCTTAAAATATTT-CACAAACCATGTGTTGT-CAATAGTAAA-ATGCTTTATTTTGCTGTGCATTAGAAGCTATGTAATTAATTTTATTGAAAAACTGCTTTTCAAATGGTATTTAAAG]

[+] EMBL AW061366             [CCTACCTTTTCTTTACTGATNNGCTTTCCTAATAAAAATTCAATTCCCAAATTTTCAAGCCTTGTTAGGGTGCTTTTATCCAATTCCAAAGTATCAATGAAGTATAAATCATTTTCATAGATAGGAAGTTTCATAAGAATACGTAGCAGCTCATAACAAGATGATCGCATCACCTTGCCGAACT CTTCGCAGTATGTTCAATAAATATTGTTTATGCTTGGCCATTTATATTTGTGAACCATGGGAAAA GGTCATATTACATTGCATCACACTGGCAATAATCTGTGCTCTTACATATACTGCAGTTTTAATTGTTCCTAGTCACTTATCTACCCTTATAATATTTGTATGGAAATGCCTGAATGGAGATAAGCATTGACATTCTAAAACTCTGAACAACGTTTTATAATATTGTTAGTTATTTTAAAGTTATTAAATATTTAAAACTAACATT AAAATATTTTTTAAACA ATAGTTTCCTCCAGCGTTTATTCTATTTCTTAAAATATTT CACAAACCATGTGTTGT CAATAGTAAA ATGCTTTATTTTGCTGTG                                                          ]
[-] EMBL CD148178             [                                                                                                 actcGTATGTTTTAATTCCACCGGTAGGAAGTTTCATAAGAATACGTAGCAGCTCATAACAAGATGATCGCATCACCTTGCCGAACT CTTCGCAGTATGTTCAATAAATATTGTTTATGCTTGGCCATTTATATTTGTGAACCATGGGAAAA GGTCATATTACATTGCATCACACTGGCAATAATCTGTGCTCTTACATATACTGCAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AI739738             [                                                                                                                                                                           ACCTTGCCGAACTAGTTCGCAGTATGTTCAATAAATATTGTTTATGCTTGGCCATTTATATTTGTGAACCATGGGAAAAGGGTCATATAACATTGCATCACACTGGCAATAATCTGTGCTC TACATATACTGCAGTTTTAATTG TCCTAGTCACTTATCTACCCTTATAATATTTGTATGGAAATGCCTGAATGGAGAT AGCATTGACATTCTAAAACTCTGAACAACGTTTTATAATATTGTTAGTTA TTTAAAGTTA TAAAT                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD076981             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TACTGCAGTTTTAATTGTTCCTAGTCACTTATCTACCCTTATAATATTTGTATGGAAATGCCTGAATGGAGATAAGCATTGCCATTTTAAAACTTTGAACAACGTTTTATAATATTGTTAGTTATTTTAAAGTTATTAAATATTTAAAACTACCATTAAAAATATTTTTTAAACATATAGTTTCCT CAGCGTTTATTCTATTTTTAAAAATATTTACACAAACCATGTGTTGTCCATTAGTAAATATGCTTTATTTTGCTGTGCATTAGAAGCTATGTAATTAATTTTATTGAAAAACTGCTTTTCAAATGGTATTTAAAG]




>consensus_6845#0
CCTACCTTTTCTTTACTGATNNGCTTTCCTAATAAAAATTCAATTCCCAAATTTTCAAGC
CTTGTTAGGGTGCTTTTATCCAATTCCAAAGTATCAATGAAGTATAAATCATTTTCATAG
ATAGGAAGTTTCATAAGAATACGTAGCAGCTCATAACAAGATGATCGCATCACCTTGCCG
AACTCTTCGCAGTATGTTCAATAAATATTGTTTATGCTTGGCCATTTATATTTGTGAACC
ATGGGAAAAGGTCATATTACATTGCATCACACTGGCAATAATCTGTGCTCTTACATATAC
TGCAGTTTTAATTGTTCCTAGTCACTTATCTACCCTTATAATATTTGTATGGAAATGCCT
GAATGGAGATAAGCATTGACATTCTAAAACTCTGAACAACGTTTTATAATATTGTTAGTT
ATTTTAAAGTTATTAAATATTTAAAACTAACATTAAAATATTTTTTAAACAATAGTTTCC
TCCAGCGTTTATTCTATTTCTTAAAATATTTCACAAACCATGTGTTGTCAATAGTAAAAT
GCTTTATTTTGCTGTGCATTAGAAGCTATGTAATTAATTTTATTGAAAAACTGCTTTTCA
AATGGTATTTAAAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case