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Schistosoma mansoni
cluster # 6855 cluster # 6855       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6855#0 length = 1052 sequences # 4  

consensusID : consensus_6855#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1052
fasta sequence
                              [TGATCAGCTGAAGAGTATTGATGACTCAAAACCCACCTCTTTATTTAGGATCAGCAACAAATACCGTTATACAAACTCTAACGATGTGAAAATCACCGATCCCGTTAGCGCAGTGGCATTTCATAAAGATTTAAAGTTGCTTGCAACTGGGTTTGAATCAGGATTACTTTTACTACATACATTTCCAGACTTCATATTAATCAGTGAAGTAAATCTGTTCACTAACAGTATAAGCAGTCTAACGATTAACCGCAATGGTGACTGGATTGGTGCAAGTTCAGAGCTATTCGGACAAATTGCTGTTTGGGAATGGAGATCGCAATCCTGTTACCTGCGCGCTGATTCCCATTCTAAGGAAATGACTAGTTTGGCGTACTCTCCTGATGGTCTACATTTGGTGACTGGGGGTTATGATAACAAAG-TAAAAGTGTGGCGTATATCTGGTGGCAGGTGTGTTGTAACCTTTACTGAGCATACAGCTGGTGTAACTGGAGTTGCATTTCCAGCTCAAAATTCCAAAGTCGTTTTGTCAGCCAGTTTGGATGGGACCGTTCGTGCTCATGATTTAATTCGCTACAGGAATTTCCGTACGTTCACTGTGCCTACTCGTCGCATCCAGTTCTCGTCATTGGCTGTTGATACGCGTGGCTCTCTTGTTGCTGCTGGAGGTTTGGATACTTTCGAAGCTTATGTATGGTCAGTTAAGACAGGTCAGCTGTTGACTACTTTGACGGGGCATACTTCTCCTATTAGTGCACTAGCATTTAACCCTGCCATTTCTGGTATTGATATCGAATTGGCTACTGTCAGTCGGGATTGTACGCTTCGATTATGGGATGTTACAGGCAATTTAACTGATGACAATAATTTGTCTAGTAGGGGTCTTACGAAAGAGGTTGTAAATTTTTCATGTGATGCCTTATGCGTCGTATATCGAGGTGATGGTAAACAGTTGGCTATTTCCCTTTTGAACGGAAACATAGTTTTCTATGACCCTAACGAAGGGGTTGAAATGGGAACCATAGATGGTCATCGGGACCTTGGGGTAGCAC]

[+] EMBL AI975704             [TGATCAGCTGAAGAGTATTGATGACTCAAAACCCACCTCTTTATTTAGGATCAGCAACAAATACCGTTATACAAACTCTAACGATGTGAAAATCACCGATCCCGTTAGCGCAGTGGCATTTCATAAAGATTTAAAGTTGCTTGCAACTGGGTTTGAATCAGGATTACTTTTACTACATACATTTCCAGACTTCATATTAATCAGTGAAGTAAATCTGTTCACTAACAGTATAAGCAGTCTAACGATTAACCGCAATGGTGACTGGATTGGTGCAAGTTCAGAGCTATTCGGACAAATTGCTGTTTGGGAATGGAGATCGCAATCCTGTTACCTGCGCGCTGATTCCCATTCTAAGGAAATGACTAGTTTGGCGTACTCTCCTGATGGTCTACATTTGGTGACTGGGGGTTATGATAACAAAG TAAAAGTGTGGCGTATATCTGGTGGCAGGTGTGTTGTAACCTTTACTGAGCATACAGCTGGTGTAACTGGAGTTGCATTTCCAGCTCAAAATTCCAAAGTCGTTTTGTCAGCCAGTTTGGATGGGACCCGTCGTGCTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD111222             [                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCAGAGCTATTCGGACAAATTGCTGTTTGGGAATGGAGATCGCAATCCTGTTACCTGCGCGCTGATTCCCATTCTAAGGAAATGACTAGTTTGGCGTACTCTCCTGATGGTCTACATTTGGTGACT GGGGTTATGATAACAAAG TAAAAGTGTGGCGTATATCTGGTGGCAGGTGTGTTGTAACCTTTACTGAGCATACAGCTGGTGTAACTGGAGTTGCATTTCCAGCTCAAAATTCCAAAGTCGTTTTGTCAGCCAGTTTGGATGGGACCGTTCGTGCTCATGATTTAATTCGCTACAGGAATTTCCGTACGTTCACTGTGCCTACTCGTCGCATCCAGTTCTCGTCATTGGCTGTTGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD060881             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTGGTGACTGGGGGTGATGATAACAAAGATAAAAGTGTGGCGTATATCTGGTGGCAGGTGTG TGTAACCTTTACTGAGCATACAGCTGCTGTAACTGGAGTTGCATTTCCAGCTCAAAATTCCAAAGTCGTTTTGTCAGCCAGTTTGGATGGGACCGTTCGTGCTCATGATTTAATTCGCTACAGGAATTTCCGTACGTTCACTGTGCCTACTCGTCGTATCCAGTTCTCGTCATTGGCTGTTGATACGCGTGGCTCTCTTGTTGCTGCTGGAGGTTTGGATACTTTCGAAGCTTATGTATGGTCAGTTAAGACAGGTCAGCTGTTGACTACTTTGACGGGGCATACTTCTCCTATTAGTGCACTAGCATTTAACCCTGCCATTTCTGGTATTGATATCGAATTGGCTACTGTCAGTCGGGATTGTACGCTTCGATTATGGGATGTTACAGGCAATTTAACTGATGACAATAATTTGTCTAGTAG                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD162121             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATGTTACAGGCAATTTAACTGATGAGAATAA TTGTCTAGTATGGGTCTTACGAAAGAGGTTGTAAATTTTTCATGTGATGCCTTATGCGTCGTATATCGAGGTGATGGTAAACAGTTGGCTATTTCCCTTTTGAACGGAAACATAGTTTTCTATGACCCTAACGAAGGGGTTGAAATGGGAACCATAGATGGTCATCGGGACCTTGGGGTAGCAC]


>consensus_6855#0 TGATCAGCTGAAGAGTATTGATGACTCAAAACCCACCTCTTTATTTAGGATCAGCAACAA ATACCGTTATACAAACTCTAACGATGTGAAAATCACCGATCCCGTTAGCGCAGTGGCATT TCATAAAGATTTAAAGTTGCTTGCAACTGGGTTTGAATCAGGATTACTTTTACTACATAC ATTTCCAGACTTCATATTAATCAGTGAAGTAAATCTGTTCACTAACAGTATAAGCAGTCT AACGATTAACCGCAATGGTGACTGGATTGGTGCAAGTTCAGAGCTATTCGGACAAATTGC TGTTTGGGAATGGAGATCGCAATCCTGTTACCTGCGCGCTGATTCCCATTCTAAGGAAAT GACTAGTTTGGCGTACTCTCCTGATGGTCTACATTTGGTGACTGGGGGTTATGATAACAA AGTAAAAGTGTGGCGTATATCTGGTGGCAGGTGTGTTGTAACCTTTACTGAGCATACAGC TGGTGTAACTGGAGTTGCATTTCCAGCTCAAAATTCCAAAGTCGTTTTGTCAGCCAGTTT GGATGGGACCGTTCGTGCTCATGATTTAATTCGCTACAGGAATTTCCGTACGTTCACTGT GCCTACTCGTCGCATCCAGTTCTCGTCATTGGCTGTTGATACGCGTGGCTCTCTTGTTGC TGCTGGAGGTTTGGATACTTTCGAAGCTTATGTATGGTCAGTTAAGACAGGTCAGCTGTT GACTACTTTGACGGGGCATACTTCTCCTATTAGTGCACTAGCATTTAACCCTGCCATTTC TGGTATTGATATCGAATTGGCTACTGTCAGTCGGGATTGTACGCTTCGATTATGGGATGT TACAGGCAATTTAACTGATGACAATAATTTGTCTAGTAGGGGTCTTACGAAAGAGGTTGT AAATTTTTCATGTGATGCCTTATGCGTCGTATATCGAGGTGATGGTAAACAGTTGGCTAT TTCCCTTTTGAACGGAAACATAGTTTTCTATGACCCTAACGAAGGGGTTGAAATGGGAAC CATAGATGGTCATCGGGACCTTGGGGTAGCAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)