cluster # 6909

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6909 cluster # 6909 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6909#0 length = 746 sequences # 4

consensusID : consensus_6909#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 746
fasta sequence

                              [GGCTATAATGATGAATTCTTAACCTTATTATCTAATTATGGATTAAATATA-TCCCAAACTAAAATTGGTTTATTATTAAATCGTAATAATACATTAAGTCCTACTATATTAATGAATGATGGTTTAAAAAATTATAAAAATCAAGGAAAAATTTTGGAATTTCATCATCAAAATCATTTAAATTATTGGACAACTAAAATAGCTAATATGATTAATGGTACTGATGGTACTATATATCATTTGTTTATGGATAAAGTAGAGAAACCATATGTATTTGCATATGATTTATGTCGTTCAATTCAATTGATGAAGCATTCAGAGACACAA-ATAAGTAATTTACCAGTATATAAATATATTTTATCAGAAGATACATTTAA-ATCTGGTGAAACATTTGAAAAGAATAAAGGATTTTGTTTAAATTGGTC-AAATTGTTTTAAAGATGGTGTATTGGATATGTCATCATGTCAACCTAATGCACCGG-TTGTTGTATCACAACCACACTTTCTAAATGCTGATAAATCTTATCAAACTGCTATTGATAATATCCAATATAATAATGAAGAATATAATACATCTATTTATATAGAACCCATTACTGGTCTTATTATTAATGCTTCTATTAAATTACAAATTAATGTAATCATTAAAAAGAATCCAAAAATTGAACAATTACGTAATCTATCCG-ATATATTATTACCATTAGTTTATTNTAATGGAAACGGTTTATTTANATCAACCAATCATAA]

[+] EMBL CD083048             [GGCTATAATGATGAATTCTTAACCTTATTATCTAATTATGGATTAAATATA TCCCAAACTAAAATTGGTTTATTATTAAATCGTAATAATACATTAAGTCCTACTATATTAATGAATGATGGTTTAAAAAATTATAAAAATCAAGGAAAAATTTTGGAATTTCATCATCAAAATCATTTAAATTATTGGACAACTAAAATAGCTAATATGATTAATGGTACTGATGGTACTATATATCATTTGTTTATGGATAAAGTAGAGAAACCATATGTATTTGCATATGATTTATGTCGTTCAATTCAATTGATGAAGCATTCAGAGACACAA ATAAGTAATTTACCAGTATATAAATATATTTTATCAGAAGATACATTTAA ATCTGGTGAAACATTTGAAAAGAATAAAGGATTTTGTTTAAATTGGTC AAATTGTTTTAAAGATGGTGTATTGGATATGTCATCATGTCAACCTAATGCACCGG TTGTTGTATCACAACCACACTNTCTAAATGCTGATAAATCTTATCAAACTGCTATT                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD080012             [                                         ATTAAATATANTCCCAAACTAAAATTGGTTTATTATTAAATCGTAATAATACATTAAGTCCTACTATATTAATGAATGATGGTTTAAAAAATTATAAAAATCAAGGAAAAATTTTGGAATTTCATCATCAAAATCATTTAAATTATTGGACAACTAAAATAGCTAATATGATTAATGGTACTGATGGTACTATATATCATTTGTTTATGGATAAAGTAGAGAAACCATATGTATTTGCATATGATTTATGTCGTTCAATTCAATTGATGAAGCATTCAGAGACACAA ATAAGTAATTTACCAGTATATAAATATATTTTATCAGAAGATACATTTAA ATCTGGTGAAACATTTGAAAAGAATAAAGGATTTTGTTTAAATTGGTC AAATTGTTTTAAAGATGGTGTATTGGATATGTCATCATGTCAACCTAATGCACCGGNTTGTTGTATCACAACCACACTTTCTAAATGCTGATAAATCTTATCAAACTGCTATTGATAATATCCAATATAATAATGAAGAATATAATACATCTATTTATATAGAACCCATTACTGGTCTTATTATTAATGCTTCTATTAAATTACAAATTAATGTAATCATTAAAAAGAATCCAAAAATTGAACAATTACGTAATCTATCCG ATATATTATTACCATTAGTTTATTNTAATGGAAACGGTTTATTTANATCAACCAATCATAA]
[+] EMBL CD084112             [                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTGCATATGATTTATGTCG TCAATTCAATTGATGAAGCATTCAGAGACACAATATAAGTAATTTACCAGTATATAAATATATTTTATCAGAAGATACATTTAAGATCTGGTGAAACATTTGAAAAGAATAAAGGATTTTGTTTAAATTGGTCTAAATTGTTTTAAAGATGGTGTATTGGATATGTCATCATGTCAACCTAATGCACCGG TTGTTGTATCACAACCACACTTTCTAAATGCTGATAAATCTTATCAAACTGCTATTGATAATATCCAATATAATAATGAAGAATATAATACATCTATTTATATAGAACCCATTACTGGTCTTATTATTAATGCTTCTATTAAATTACAAATTAATGTAATCATTAAAAAGAATCCAAAAATTGAACAATTACGTAATCTATCCG ATATATTATTAC                                                 ]
[+] EMBL AA938793             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attaaAAATTACAAATTAATGTAATCATTAAAATGAATCCAAAAATTGAACAATTACGTAATCTATCCGTAT TATTATTACCATTAGTTTATT                                     ]




>consensus_6909#0
GGCTATAATGATGAATTCTTAACCTTATTATCTAATTATGGATTAAATATATCCCAAACT
AAAATTGGTTTATTATTAAATCGTAATAATACATTAAGTCCTACTATATTAATGAATGAT
GGTTTAAAAAATTATAAAAATCAAGGAAAAATTTTGGAATTTCATCATCAAAATCATTTA
AATTATTGGACAACTAAAATAGCTAATATGATTAATGGTACTGATGGTACTATATATCAT
TTGTTTATGGATAAAGTAGAGAAACCATATGTATTTGCATATGATTTATGTCGTTCAATT
CAATTGATGAAGCATTCAGAGACACAAATAAGTAATTTACCAGTATATAAATATATTTTA
TCAGAAGATACATTTAAATCTGGTGAAACATTTGAAAAGAATAAAGGATTTTGTTTAAAT
TGGTCAAATTGTTTTAAAGATGGTGTATTGGATATGTCATCATGTCAACCTAATGCACCG
GTTGTTGTATCACAACCACACTTTCTAAATGCTGATAAATCTTATCAAACTGCTATTGAT
AATATCCAATATAATAATGAAGAATATAATACATCTATTTATATAGAACCCATTACTGGT
CTTATTATTAATGCTTCTATTAAATTACAAATTAATGTAATCATTAAAAAGAATCCAAAA
ATTGAACAATTACGTAATCTATCCGATATATTATTACCATTAGTTTATTNTAATGGAAAC
GGTTTATTTANATCAACCAATCATAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case