These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7036#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 383 fasta sequence [AAATTAGTTCATCAAATGTAATCAATGGTCTTTGGAAACAGTGTTTAGAGTTGTCGAGTGTGAGTCACTTTAAAGCAGACAAATTATAAGCCTCATACCCTTTTGTGAACTACTGTTGTCTTCCAAATTTTAAACCCGTATGCCGTATACTTCATTACTACAAACTGTGCTAAACGTTTGGATCA-TTTG-TTGATAA-TTTAGTGTACAAATC-AATCAAAATAAACCTAA-TAGTGTAA-TTAATAATTTCAGTGCTCAAACTTTGAGCCCTTGA-TTTAGTTCCTAACTGCTACAGTTCCATTCACCAATTATTTTAG-TTACCATGTAAATAATACAATTTACAGTTTGTGTGTCGAGTG-ACATAAACTGTGTTTACTCAAAGCTAC] [+] EMBL CD120184 [AAATTAGTTCATCAAATGTAATCAATGGTCTTTGGAAACAGTGTTTAGAGTTGTCGAGTGTGAGTCACTTTAAAGCAGACAAATTATAAGCCTTATACCCTTTTGTGAACTACTGTTGTCTTCCAAATTTTAAACCCGTATGCCGTATACTTCATTACTACAAACTGTGCTAAACGTTTGGATCA TTTG TTGATAA TTTAGTGTACAAATCAAATCAAAATAAACCTAA TAGTGTAA TTAATAATTTCAGTGCTCAAACTTTGAGCCCTTGATTTTAG TCCNTACTGCTACAGNTCCATTCACCAATTA TTTAGNNTA CATGTAANNTATACNATTTACAGTTNATGTGTCGAGTG ACATAAACTGTGTTTACTCAAAGCTA ] [+] EMBL CD120260 [AAATTAGTTCATCAAATGTAATCAATGGTCTTTGGAAACAGTGTTTAGAGTTGTCGAGTGTGAGTCACTTTAAAGCAGACAAATTATAAGCCTCATACCCTTTTGTGAACTACTGTTGTCTTCCAAATTTTAAACCCGTATGCCGTATACTTCATTACTACAAACTGTGCTAAACGTTTGGATCA TTTG TTGATAA TTTAGTGTACAAATC AATCAAAATAAACCTAA TAGTGTAA TTAATAATTTCAGTGCTCAAACTTTGAGCCCTTGA TTTAGTTCCTAACTGCTACAGTTCCATTCACCAATTATTTTAG TTACCATGTAAATAATACAATTTACAGTTTGTGTGTCGAGTGNACAT AACTGTGTTTACTCAAAGCTA ] [-] EMBL CD120386 [ AATTAGTTCATCAAATGTAATCAATGGTCTTTGGAAACAGTGTTTAGAGTTGTCGAGTGTGAGTCACTTTAAAGCAGACAAATTATAAGCCTCATACCCTTTTGTGAACTACTGTTGTCTTCCAAATTTTAAACCCGTATGCCGTATACTTCATTACTACAAACTGTGCTAAACGTTTGGATCA TTTG TTGATAA TTTAGTGTACAAATC AATCAAAATAAACCTAA TAGTGTAA TTAATAATTTCAGTGCTCAAACTTTGAGCCCTTGA TTTAGTTCCTAACTGCTACAGTTCCATTCACCAATTATTTTAG TTACCATGTAAATAATACAATTTACAGTTTGTGTGTCGAGTG ACATAAACTGTGTTTACTCAAAGCTAC] [-] EMBL CD120027 [ AAACCCGTATGCCGTATACTTCATTACTACAAACTGTGCTAAACGTTTGGATCATTTTGTTTGATAATTTTAGTGTACAAATC AATCAAAATAAACCTAATTAGTGTAATTTAATAATTTCAGTGCTCAAACTTTGAGCCCTTGA TTTAGTTCCTAACTGCTACAGTTCCATTCACCAATTATTTTAG TTACCATGTAAATAATACAATTTACAGTTTGTGTGTCGAGTG ACATAAACTGTGTTTACTCAAAGCTAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||