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Schistosoma mansoni
cluster # 7051 cluster # 7051       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7051#0 length = 399 sequences # 4  

consensusID : consensus_7051#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 399
fasta sequence
                              [AATGAGTATCCTTCAACTCGGAGGGTAGAATTTAGATTTTTAATTTGTTTATTCTAGTTAGTGTATTTTTAGCAACGTTGGCTTCTACGGGATGGGATAGCTGACCCCATGCCTAACCCTCTTCCTTTATCTGGTTTTGGGACCGGGAGTAACTTTAGAAGGGCCACAGATGGAGTTGTCTTAATGCATATTAAGAAACAACACACCTGAAACTTGTTTTATCCTGAATGAGTTTAAAGAGGAAAACTATTTGATCGCACTTGAAAATTTCGTTTAGGAGCATTAAACTTTCCCTAAGCCGCTTAGATTGTTTGTTCAAAATCTTGAAGTAATTACCTTCCATCACTAAAAGGTTGTATGTTATACACAACAGGCATTCTAGTTGCATTAAGTATTTTT]

[+] EMBL CD120437             [AATGAGTATCCTTCAACTCGGAGGGTAGAATTTAGATTTTTAATTTGTTTATTCTAGTTAGTGTATTTTTAGCAACGTTGGCTTCTACGGGATGGGATAGCTGACCCCATGCCTAACCCTCTTCCCTTATCTGGTTCTGGGACCGGGAGTAACTTTAGAAGGGCCACAGATGGAGTTGTCTTAATGCATATTAAGAAACAACACACCTGAAACTTGTTTTATCCTGAATGAGTTTAAAGAGGAAAACTATTTGATCGCACTTGAAAATTTCGCTTAGGAGCATTAAACTTTCCCTAAGCCGCTTAGATTGTTTGTTCAAAATCTTGAAGTAATTACCTTCCATCACTAAAAGGTTGTATGTTATACACAACAGGCATTCTAGTTGCATTAAGTATTTTT]
[+] EMBL CD120424             [AATGAGTATCCTTCAACTCGGAGGGTAGAATTTAGATTTTTAATTTGTTTATTCTAGTTAGTGTATTTTTAGCAACGTTGGCTTCTACGGGATGGGATAGCTGACCCCATGCCTAACCCTCTTCCTTTATCTGGTTTTGGGACCGGGAGTAACTTTAGAAGGGCCACAGATGGAGTTGTCTTAATGCATATTAAGAAACAACACACCTGAAACTTGTTTTATCCTGAATGAGTTTAAAGAGGAAAACTATTTGATCGCACTTGAAAATTTCGTTTAGGAGCATAAAACTTTCCCTAAGCCGCTTAGATTGCTTGTTCAAAATCTTGAAGTAATTACCTTCCATCACTAAAAGGTTGTATGTTATACACAACAGGCATTCTAGTTGCATTAAGTATTTTT]
[+] EMBL CD120505             [AATGAGTATCCTTCAACTCGGAGGGTAGAATTTAGATTTTTAATTTGTTTATTCTAGTTAGTGTATTTTTAGCAACGTTGGCTTCTACGGGATGGGATAGCTGACCCCATGCCTAACCCTCTTCCTTTATCTGGTTTTGGGACCGGGAGTAACTTTAGAAGGGCCACAGATGGAGTTGTCTTAATGCATATTAAGAAACAACACACCTGAAACTTGTTTTATCCTGAATGAGTTTAAAGAGGAAAACTATTTGATCGCACTTGAAAATTTCGTTTAGGAGCATTAAACTTTCCCTAAGCCGCTTAGATTGTTTGATCAAAATCTTGAAGTAATTACCTTCCATCACTANAAGGCTGTATGTTATACACAACAGGCATTCTAGTTGCATTAAGTATATTT]
[+] EMBL CD120042             [AATGAGTTTACTTCAACTCGGAGGGNAGAATTTAGATTTTTAATTTGTTTATTCTAGTTAGNGTATTTTTAGCAACGTTGGCTTCTACGGGATGGGATAGCTGACCCCATGCCTAACCCTCTTCCTTTATCTGGTTTTGGGACCGGGAGTAACTTTAGAAGGGCC                                                                                                                                                                                                                                          ]


>consensus_7051#0 AATGAGTATCCTTCAACTCGGAGGGTAGAATTTAGATTTTTAATTTGTTTATTCTAGTTA GTGTATTTTTAGCAACGTTGGCTTCTACGGGATGGGATAGCTGACCCCATGCCTAACCCT CTTCCTTTATCTGGTTTTGGGACCGGGAGTAACTTTAGAAGGGCCACAGATGGAGTTGTC TTAATGCATATTAAGAAACAACACACCTGAAACTTGTTTTATCCTGAATGAGTTTAAAGA GGAAAACTATTTGATCGCACTTGAAAATTTCGTTTAGGAGCATTAAACTTTCCCTAAGCC GCTTAGATTGTTTGTTCAAAATCTTGAAGTAATTACCTTCCATCACTAAAAGGTTGTATG TTATACACAACAGGCATTCTAGTTGCATTAAGTATTTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)