These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7074#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 572 fasta sequence [TCTAGTCCTACGCCTTAACCACTCAGCCATCGCGACACCTTAAGCTGATGAACAAGTAGGTAAGGAATAAGTTGCTTTCAAGTGATTTCATTTTAATGAAGAAAAAGCACTGATTACGAAATCACATATTCAATTTTACTACATTTTAACGCAACTTTGTTAAGAATAAAAAACGGAGTCATTGTATATGGATTATTGGTAATTTTGGGAATGAATTTAACCAGAAAAAGAAACAACTAAACTGGTTTCTTTTAAGCATACAATTGATTATAATTTTAAAGAATTAATTGATTGGACATAAGGCATTTGTAAACAAGGGAAACTAAGGTGGCAGGAATGTAGATATGAAATAAATGAACATTACTCATGTAAGATTACTTATTTATTTATTTGACTATATCAGCATTGCTACAAGGGAGCATCGAATACATATAAGCCACACAATAACAATGATTGTGTGAGGGCCGGGTGCCCAGACCGAAGTAGATGGTTTTTTTTTCAGGGGATCATACTCAGAGCCTCCGACCTAAAGGTCTAATACATAAGACAGTAAAGCAACGTCACAACATGCA] [+] EMBL CD097664 [TCTAGTCCTACGCCTTAACCACTCAGCCATCGCGACACCTTAAGCTGATGAACAAGTAGGTAAGGAATAAGTTGCTTTCAAGTGATTTCATTTTAATGAAGAAAAAGCACTGATTACGAAATCACATATTCAATTTTACTACATTTTAACGCAACTTTGTTAAGAATAAAAAACGGAGTCATTGTATATGGATTATTGGTAATTTTGGGAATGAATTTAACCAGAAAAAGAAACAACTAAACTGGTTTCTTTTAAGCATACAGTTGATTATAATTTTAAAGAATTAATTGATTGGACATAAGGCATTTGTAAACAAGGGAAACTAAGGTGGCAGGAATGTAGATATGAAATAAATGAACATTACTCATGTAAGATTACTTATTTATTTATTTGACTATATCAGCATTGCTACAAGGGAGCATCGAATACATATAAGCCACACAATAACAATGATTGTGTGAGGGCCGGGTGCCCAGACCGAAGTAGATGGTTTTTTTTTCAGGGGATCATACTCAGAGCCTCCGACCTAAAGGTCTAATACATAAGACAGTAAAGCAACGTCACAACATGCA] [+] EMBL CD097742 [TCTAGTCCTACGCCTTAACCACTCAGCCATCGCGACACCTTAAGCTGATGAACAAGTAGGTAAGGAATAAGTTGCTTTCAAGTGATTTCATTTTAATGAAGAAAAAGCACTGATTACGAAATCACATATTCAATTTTACTACATTTTAACGCAACTTTGTTAAGAATAAAAAACGGAGTCATTGTATATGGATTATTGGTAATTTTGGGAATGAATTTAACCAGAAAAAGAAACAACTAAACTGGTTTCTTTTAAGCATACAATTGATTATAATTTTAAAGAATTAATTGATTGGACATAAGGCATTTGTAAACAAGGGAAACTAAGGTGGCAGGAATGTAGATATGAAATAAATGAACATTACTCATGTAAGATTACTTATTTATTTATTTGACTATAACAGCATTGCTACAAGGGAGCATCGAATACATATAAGCCACACAATAACAATGATTGTGTGAGGGCCGGGTGCCCAGACCGAAGTAGATGGTTTTTTTTTCAGGGGATCATACTCAGAGCCTCCGACCTAAAGGTCTAATACATAAGAC ] [+] EMBL CD097653 [TCTAGTCCTACGCCTTAACCACTCAGCCATCGCGACACCTTAAGCTGATGAACAAGTAGGTAAGGAATAAGTTGCTTTCAAGTGATTTCATTTTAATGAAGAAAAAGCACTGATTACGAAATCACATATTCAATTTTACTACATTTTAACGCAACTTTGTTAAGAATAAAAAACGGAGTCATTGTATATGGATTATTGGTAATTTTGGGAATGAATTTAACCAGAAAAAGAAACAACTAAACTGGTTTCTTTTAAGCATACAATTGATTATAATTTTAAAGAATTAATTGATTGGACATAAGGCATTTGTAAACAAGGGAAACTAAGGTGGCAGGAATGTAGATATGAAATAAATGAACATTACTCATGTAAGATTACTTATTTATTTATTTGACTATATCAGCATTGCTACAAGGGAGCATCGAATACATATAAGCCACACAATAACAATGATTGTGTGAGGGCCGGGTGCCCAGACCGAAGTAGATGGTTTTTTTTTCAGGGGATCATACTCAGAGCCTCCGACCTANAGGTCT ] [+] EMBL CD097674 [TCTAGTCCTACGCCTTAACCACTCAGCCATCGCGACACCTTAAGCTGATGAACAAGTAGGTAAGGAATAAGTTGCTTTCAAGTGATTTCATTTTAATGAAGAAAAAGCACTGATTACGAAATCACATATTCAATTTTACTACATTTTAACGCAACTTTGTTAAGAATAAAAAACGGAGTCATTGTATATGGATTATTGGTAATTTTGGGAATGAATTTAACCAGAAAAAGAAACAACTAAACTGGTTTCTTTTAAGCATACAATTGATTATAATTTTAAAGAATTAATTGATTGGACATAAGGCATTTGTAAACAAGGGAAACTAAGGTGGCAGGAATGTAGATATGAAATAAATGAACATTACTCATGTAAGATTACTTATTTATTTATTTGACTATATCAGCATTGCTACAAGGGAGCATCGAATACATATAAGCCACACAATAACAATGATTGTGTGAGGGCCGGGTGCCCAGACCGAAGTAGATGGTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||