These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7096#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1024 fasta sequence [TATTTGTCATTATGATGGAGTGGGGATTGTAATAAGGATAAATTATTTGACTATGTAATTATTTTTGTGTTCTCGAATCCTCTCTAAATTACCATATTTATTTGCAGAGCTATATATGTTTCCAATCTTATTACCTTTATTCTAACCGTCACTTCACCATGCCGATTCATTATTATAAGTATGGAAATTATGTTAATTTTGATTTTAAAATATTATAGATGGTAAGCGGCCGACTAAATGTACGATGTTATAAATGGAATTTTAGCTCAAATCAAATTACTCGTGTTGATTGGATGGGATAAAACTAATGCATATCACAAGAAGTCTACTACAGGATTCAAATAAGTCAACAATGTTAACAGATTATTCCATACTGACAAGTGAACACAGAAAGTCACGCACAATTCTCTAACCAAAATGACAACAATAAAATTCACCTGTTCAGAAGCTATCAGCAGCGAGGACAATTCTTCATCGTACTGTTTTTTCAAGGTTAATAAGGCACCCTCATGTCCGGTCATTAACATTTCCGCGGCGCTTTTAATATTTGCCAATTCTAGTTCAAGTTTGACTAACTGTTTTCGTGACTCTACAACCTCATTCTGTGCATCCTTACAGGCTGACTGAGATTCTAATAGTCCCGATTCTCTGTCTAACAAGACAGATTCTAAACGACATTTAAGTTCGTTATCGGTTAACTGGTCTAAAATATTTGAAATAAACGGAGGTAAAGAAGGTTTGATGAAGTTATCGGTTGTATTGCTAGGAAAATTTTCACATACAGGTGTTTTTTCGTGATTCGAATTAGGCGATAACATAATTGTTAACTCCACAAAATAAATCAGAATTATTCCACAGATCAATTGAAAACAGTTCCTTGCATTACGAATTTATGGAGACTGTTATTTGTGTTACTTTTGACAGAGAACTAAGAAATTTGGTATAATGCCCAAGAAAATTGGCGAAACTAACCAAATACACTAAACAGAGACCGATGAGGACCGTAACGCGCTCTTTTGAAGGG] [+] EMBL CD194874 [TATTTGTCATTATGATGGAGTGGGGATTGTAATAAGGATAAATTATTTGACTATGTAATTATTTTTGTGTTCTCGAATCCTCTCTAAATTACCATATTTATTTGCAGAGCTATATATGTTTCCAATCTTATTACCTTTATTCTAACCGTCACTTCACCATGCCGATTCATTATTATAAGTATGGAAATTATGTTAATTTTGATTTTAAAATATTATAGATGGTAAGCGGCCGACTAAATGTACGATGTTATAAATGGAATTTTAGCTCAAATCAAATTACTCGTGTTGATTGGATGGGATAAAACTAATGCATATCACAAGAAGTCTACTACAGGATTCAAATAAGTCAACAATGTTAACAGATTATTCCATACTGACAAGTGAACACAGAAAGTCACGCACAATTCTCTAACCAAAATGACAACAATAAAATTCACCTGTTCAGAAGCTATCAGCAGCGAGGACAATTCTTCATCGTACTGTTTTTTCAAGGTTAATAAGGCACCCTCATGTCCGGTCATTAACATTTCCGCGGCGCTTTTAATATTTGCCAATTCTAGTTCAAGTTTGACTAAC ] [-] EMBL CD098161 [ ACAGAAAGTCACGCACAATTCTCTAACCAAAATGACAACAATAAAATTCACCTGTTCAGAAGCTATCAGCAGCGAGGACAATTCTTCATCGTACTGTTTTTTCAAGGTTAATAAGGCATCCTCATGTTCGGTCATTAACATTTCCGCGGCGCTTTTAATATTTGCCAATTCTAGTTCAAGTTTGACTAACTGTTTTCGTGACTCTACAACCTCATTCTGTGCATCCTTACAGGCTGACTGAGATTCTAATAGTCCCGATTCTCTGTCTAACAAGACAGATTCTAAACGACATTTAAGTTCGTTATCGGTTAACTGGTCTAAAATATTTGAAATAAACGGAGGTAAAGAAGGTTTGATGAAGTTATCGGTTGTATTGCTAGGAAAATTTTCACATACAGG ] [-] EMBL CD111036 [ ATTCTAGTTCAAGTTTGACTAACTGTTTTCGTGACTCTACAACCTCATTCTGTGCATCCTTACAGGCTGACTGAGATTCTAATAGTCCCGATTCTCTGTCTAACAAGACAGATTCTAAACGACATTTAAGTTCGTTATCGGTTAACTGGTCTAAAATATTTGAAATAAACGGAGGTAAAGAAGGTTTGATGAAGTTATCGGTTGTATTGCTAGGAAAATTTTCACATACAGGTGTTTTTTCGTGATTCGAATTAGGCGATAACATAATTGTTAACTCCACAAAATAAATCAGAATTATTCCACAGATCAATTGAAAACAGTTCCTTGCATTACGAATTTATGGAGACTGTTATTTGTGTTACTTTTGACAGAGAACTAAGAAATTTGGTATAATGCCCAAGAAAATTGGCGAAACTAACCAAATACACTAAACAGAGACCGATGAGGACCGTAACGCGCTCTTTTGAAGGG] [-] EMBL CD111491 [ CATTCTGTGCATCCTTACAGGCTGACTGAGATTCTAATAGTCCCGATTCTCTGTCTAACAAGACAGATTCTAAACGACATTTAAGTTCGTTATCGGTTAACTGGTCTAAAATATTTGAAATAAACGGAGGTAAAGAAGGTTTGATGAAGTTATCGGTTGTATTGCTAGGAAAATTTTCACATACAGGTGTTTTTTCGTGATTCGAATTAGGCGATAACATAATTGTTAACTCCACAAAATAAATCAGAATTATTCCACAGATCAATTGAAAACAGTTCCTTGCATTACGAATTTATGGAGACTGTTATTTGTGTTACTTTTGACAGAGAACTAAGAAATTTGGTATAATGCCCAAGAAAATTGGCGAAACTAACCAAATACACTAAACAGAGACCGATGAGGACCGTAACGCGCTCTTTTGAAGGG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||