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Schistosoma mansoni
cluster # 7096 cluster # 7096       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7096#0 length = 1024 sequences # 4  

consensusID : consensus_7096#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1024
fasta sequence
                              [TATTTGTCATTATGATGGAGTGGGGATTGTAATAAGGATAAATTATTTGACTATGTAATTATTTTTGTGTTCTCGAATCCTCTCTAAATTACCATATTTATTTGCAGAGCTATATATGTTTCCAATCTTATTACCTTTATTCTAACCGTCACTTCACCATGCCGATTCATTATTATAAGTATGGAAATTATGTTAATTTTGATTTTAAAATATTATAGATGGTAAGCGGCCGACTAAATGTACGATGTTATAAATGGAATTTTAGCTCAAATCAAATTACTCGTGTTGATTGGATGGGATAAAACTAATGCATATCACAAGAAGTCTACTACAGGATTCAAATAAGTCAACAATGTTAACAGATTATTCCATACTGACAAGTGAACACAGAAAGTCACGCACAATTCTCTAACCAAAATGACAACAATAAAATTCACCTGTTCAGAAGCTATCAGCAGCGAGGACAATTCTTCATCGTACTGTTTTTTCAAGGTTAATAAGGCACCCTCATGTCCGGTCATTAACATTTCCGCGGCGCTTTTAATATTTGCCAATTCTAGTTCAAGTTTGACTAACTGTTTTCGTGACTCTACAACCTCATTCTGTGCATCCTTACAGGCTGACTGAGATTCTAATAGTCCCGATTCTCTGTCTAACAAGACAGATTCTAAACGACATTTAAGTTCGTTATCGGTTAACTGGTCTAAAATATTTGAAATAAACGGAGGTAAAGAAGGTTTGATGAAGTTATCGGTTGTATTGCTAGGAAAATTTTCACATACAGGTGTTTTTTCGTGATTCGAATTAGGCGATAACATAATTGTTAACTCCACAAAATAAATCAGAATTATTCCACAGATCAATTGAAAACAGTTCCTTGCATTACGAATTTATGGAGACTGTTATTTGTGTTACTTTTGACAGAGAACTAAGAAATTTGGTATAATGCCCAAGAAAATTGGCGAAACTAACCAAATACACTAAACAGAGACCGATGAGGACCGTAACGCGCTCTTTTGAAGGG]

[+] EMBL CD194874             [TATTTGTCATTATGATGGAGTGGGGATTGTAATAAGGATAAATTATTTGACTATGTAATTATTTTTGTGTTCTCGAATCCTCTCTAAATTACCATATTTATTTGCAGAGCTATATATGTTTCCAATCTTATTACCTTTATTCTAACCGTCACTTCACCATGCCGATTCATTATTATAAGTATGGAAATTATGTTAATTTTGATTTTAAAATATTATAGATGGTAAGCGGCCGACTAAATGTACGATGTTATAAATGGAATTTTAGCTCAAATCAAATTACTCGTGTTGATTGGATGGGATAAAACTAATGCATATCACAAGAAGTCTACTACAGGATTCAAATAAGTCAACAATGTTAACAGATTATTCCATACTGACAAGTGAACACAGAAAGTCACGCACAATTCTCTAACCAAAATGACAACAATAAAATTCACCTGTTCAGAAGCTATCAGCAGCGAGGACAATTCTTCATCGTACTGTTTTTTCAAGGTTAATAAGGCACCCTCATGTCCGGTCATTAACATTTCCGCGGCGCTTTTAATATTTGCCAATTCTAGTTCAAGTTTGACTAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD098161             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACAGAAAGTCACGCACAATTCTCTAACCAAAATGACAACAATAAAATTCACCTGTTCAGAAGCTATCAGCAGCGAGGACAATTCTTCATCGTACTGTTTTTTCAAGGTTAATAAGGCATCCTCATGTTCGGTCATTAACATTTCCGCGGCGCTTTTAATATTTGCCAATTCTAGTTCAAGTTTGACTAACTGTTTTCGTGACTCTACAACCTCATTCTGTGCATCCTTACAGGCTGACTGAGATTCTAATAGTCCCGATTCTCTGTCTAACAAGACAGATTCTAAACGACATTTAAGTTCGTTATCGGTTAACTGGTCTAAAATATTTGAAATAAACGGAGGTAAAGAAGGTTTGATGAAGTTATCGGTTGTATTGCTAGGAAAATTTTCACATACAGG                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD111036             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATTCTAGTTCAAGTTTGACTAACTGTTTTCGTGACTCTACAACCTCATTCTGTGCATCCTTACAGGCTGACTGAGATTCTAATAGTCCCGATTCTCTGTCTAACAAGACAGATTCTAAACGACATTTAAGTTCGTTATCGGTTAACTGGTCTAAAATATTTGAAATAAACGGAGGTAAAGAAGGTTTGATGAAGTTATCGGTTGTATTGCTAGGAAAATTTTCACATACAGGTGTTTTTTCGTGATTCGAATTAGGCGATAACATAATTGTTAACTCCACAAAATAAATCAGAATTATTCCACAGATCAATTGAAAACAGTTCCTTGCATTACGAATTTATGGAGACTGTTATTTGTGTTACTTTTGACAGAGAACTAAGAAATTTGGTATAATGCCCAAGAAAATTGGCGAAACTAACCAAATACACTAAACAGAGACCGATGAGGACCGTAACGCGCTCTTTTGAAGGG]
[-] EMBL CD111491             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CATTCTGTGCATCCTTACAGGCTGACTGAGATTCTAATAGTCCCGATTCTCTGTCTAACAAGACAGATTCTAAACGACATTTAAGTTCGTTATCGGTTAACTGGTCTAAAATATTTGAAATAAACGGAGGTAAAGAAGGTTTGATGAAGTTATCGGTTGTATTGCTAGGAAAATTTTCACATACAGGTGTTTTTTCGTGATTCGAATTAGGCGATAACATAATTGTTAACTCCACAAAATAAATCAGAATTATTCCACAGATCAATTGAAAACAGTTCCTTGCATTACGAATTTATGGAGACTGTTATTTGTGTTACTTTTGACAGAGAACTAAGAAATTTGGTATAATGCCCAAGAAAATTGGCGAAACTAACCAAATACACTAAACAGAGACCGATGAGGACCGTAACGCGCTCTTTTGAAGGG]


>consensus_7096#0 TATTTGTCATTATGATGGAGTGGGGATTGTAATAAGGATAAATTATTTGACTATGTAATT ATTTTTGTGTTCTCGAATCCTCTCTAAATTACCATATTTATTTGCAGAGCTATATATGTT TCCAATCTTATTACCTTTATTCTAACCGTCACTTCACCATGCCGATTCATTATTATAAGT ATGGAAATTATGTTAATTTTGATTTTAAAATATTATAGATGGTAAGCGGCCGACTAAATG TACGATGTTATAAATGGAATTTTAGCTCAAATCAAATTACTCGTGTTGATTGGATGGGAT AAAACTAATGCATATCACAAGAAGTCTACTACAGGATTCAAATAAGTCAACAATGTTAAC AGATTATTCCATACTGACAAGTGAACACAGAAAGTCACGCACAATTCTCTAACCAAAATG ACAACAATAAAATTCACCTGTTCAGAAGCTATCAGCAGCGAGGACAATTCTTCATCGTAC TGTTTTTTCAAGGTTAATAAGGCACCCTCATGTCCGGTCATTAACATTTCCGCGGCGCTT TTAATATTTGCCAATTCTAGTTCAAGTTTGACTAACTGTTTTCGTGACTCTACAACCTCA TTCTGTGCATCCTTACAGGCTGACTGAGATTCTAATAGTCCCGATTCTCTGTCTAACAAG ACAGATTCTAAACGACATTTAAGTTCGTTATCGGTTAACTGGTCTAAAATATTTGAAATA AACGGAGGTAAAGAAGGTTTGATGAAGTTATCGGTTGTATTGCTAGGAAAATTTTCACAT ACAGGTGTTTTTTCGTGATTCGAATTAGGCGATAACATAATTGTTAACTCCACAAAATAA ATCAGAATTATTCCACAGATCAATTGAAAACAGTTCCTTGCATTACGAATTTATGGAGAC TGTTATTTGTGTTACTTTTGACAGAGAACTAAGAAATTTGGTATAATGCCCAAGAAAATT GGCGAAACTAACCAAATACACTAAACAGAGACCGATGAGGACCGTAACGCGCTCTTTTGA AGGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)