cluster # 7142

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Schistosoma mansoni
cluster # 7142 cluster # 7142 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7142#0 length = 528 sequences # 4

consensusID : consensus_7142#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 528
fasta sequence

                              [CGTTATTT-TCATGATCTTGATCCAATTTGTTCGATTCTACTTCCACTTGATTTAGATTCAGGATTTCGTCGTCTCTCCGATGCTAAACGTGTTTTATGGGATAGTATACAAGAATATTATCGTCGAGACGATCGGTTAACAAGGGTTGTGCTTAATCGAAATGCTGCAAATTACAACAGTTTTATTAATTCTTCAGTTGCACAGGCCAAAGAAATTCCTGCTAGTCATCGTTGGCATTAATCATCAAAGTAGGCGATTACTCACGAAAGTATACATGTATCAAGTTGAAGTTTATATGTAACCATTTTGTAAGGTGTTTCAGTTATTGATGCTGTGTTTTTTTTGAAAAGTGATATTTTTCTCATCAAAAACTCACACTGATCGGTAATTGTCTTCCAATGCTCTATTATACTACAATAAAAAATCAGTAATACACATAAAAGAATGATCCTTTTCACCCTATTGCCCCCTTGTCCCCCACCTTCATCTACTTCACATCAATTTTCAATGAGAACATAGGACACAGTA]

[+] EMBL CD137479             [CGTTATTT TCATGATCTTGATCCAATTTGTTCGATTCTACTTCCACTTGATTTAGATTCAGGATTTCGTCGTCTCTCCGATGCTAAACGTGTTTTATGGGATAGTATACAAGAATATTATCGTCGAGACGATCGGTTAACAAGGGTTGTGCTTAATCGAAATGCTGCAAATTACAACAGTTTTATTAATTCTTCAGTTGCACAGGCCGAAGAAATTCCTGCTAGTCATCGTTGGCATTAATCATCAAAGTAGGCGATTACTCACGAAAGTATACATGTATCAAGTTGAAGTTTATATGTAACCATTTTGTAAGGTGTTTCAGTTATTGATGCTGTGTTTTTTTTGAAAAGTGATATTTTTCTCATCAAAAACTCACACTGATCGGTAATTGTCTTCCAATGCTCTATTATACTACAATAAAAAATCAGTAATACACATAAAAGAATGATCCTTTTCACCCTATTGCCCCCTTGTCCCCCACCTTCATCTACTTCACATCAATTNTCAATGAGAACATAGGACACAGTA]
[-] EMBL CD137468             [ GTTATTT TCATGATCTTGATCCAATTTGTTCGATTCTACTTCCACTTGATTTAGATTCAGGATTTCGTCGTCTCTCCGATGCTAAACGTGTTTTATGGGATAGTATACAAGAATATTATCGTCGAGACGATCGGTTAACAAGGGTTGTGCTTAATCGAAATGCTGCAAATTACAACAGTTTTATTAATTCTTCAGTTGCACAGGCCAAAGAAATTCCTGCTAGTCATCGTTGGCATTAATCATCAAAGTAGGCGATTACTCACGAAAGTATACATGTATCAAGTTGAAGTTTATATGTAACCATTTTGTAAGGTGTTTCAGTTATTGATGCTGTGTTTTTTTTGAAAAGTGATATTTTTCTCATCAAAAACTCACACTGATCGGTAATTGTCTTCCAATGCTCTATTATACTACAATAAAAAATCAGTAATACACATAAAAGAATGATCCTTTTCACCCTATTGCCCCCTTGTCCCCCACCTTCATCTACTTCACATCAATTTTCAATGAGAACATAGGACA     ]
[-] EMBL CD137442             [  gTATTTNTCATGATCTTGATCCAATNTGTTCGATTCTACTTCCACTTGATTTAGATTCAGGATTTCGTCGTCTCTCCGATGCTAAACGTGTTTTATGGGATAGTATACAAGAATATTATCGTCGAGACGATCGGTTAACAAGGGTTGTGCTTAATCGAAATGCTGCAAATTACAACAGTTTTATTAATTCTTCAGTTGCACAGGCCAAAGAAATTCCTGCTAGTCATCGTTGGCATTAATCATCAAAGTAGGCGATTACTCACGAAAGTATACATGTATCAAGTTGAAGTTTATATGTAACCATTTTGTAAGGTGTTTCAGTTATTGATGCTGTGTTTTTTTTGAAAAGTGATATTTTTCTCATCAAAAACTCACACTGATCGGTAATTGTCTTCCAATGCTCTATTATACTACAATAAAAAATCAGTAATACACATAAAAGAATGATCCTTTTCACCCTATTGCCCCCTTGTCCCCCACCTTCATCTACTTCACATCAATTTTCAATGAGAACATAGGACA     ]
[-] EMBL CD182234             [                                                                                                                                                                                                                                                                                TACATGTATCAAGTTGAAGTTTATATGTAACCATTTTGTAAGGTGTTTCAGTTATTGATGCTGTGTTTTTTTTGAAAAGTGATATTTTTCTCATCAAAAACTCACACTGATCGGTAATTGTCTTCCAATGCTCTATTATACTACAATAAAAAATCAGTAATACACATAAAAGAATGATCCTT                                                                           ]




>consensus_7142#0
CGTTATTTTCATGATCTTGATCCAATTTGTTCGATTCTACTTCCACTTGATTTAGATTCA
GGATTTCGTCGTCTCTCCGATGCTAAACGTGTTTTATGGGATAGTATACAAGAATATTAT
CGTCGAGACGATCGGTTAACAAGGGTTGTGCTTAATCGAAATGCTGCAAATTACAACAGT
TTTATTAATTCTTCAGTTGCACAGGCCAAAGAAATTCCTGCTAGTCATCGTTGGCATTAA
TCATCAAAGTAGGCGATTACTCACGAAAGTATACATGTATCAAGTTGAAGTTTATATGTA
ACCATTTTGTAAGGTGTTTCAGTTATTGATGCTGTGTTTTTTTTGAAAAGTGATATTTTT
CTCATCAAAAACTCACACTGATCGGTAATTGTCTTCCAATGCTCTATTATACTACAATAA
AAAATCAGTAATACACATAAAAGAATGATCCTTTTCACCCTATTGCCCCCTTGTCCCCCA
CCTTCATCTACTTCACATCAATTTTCAATGAGAACATAGGACACAGTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case