These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7211#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1332 fasta sequence [CTAATAACGATAACAACACTAATTAAACACTATTTTTATATGCTAAATCTTATCCAAGGTCTATTCTCTTTACTATTTTATTGCTTTATCTACGTCACATAATAATCATCTCTGTGTTGTCTGTTGCTTGTAATTATAAAGAAATATGCATAACTAGTCGAACATTCTATTCAAAAGGTATCACACTATTATTTTTCTACTTCTATCCCACTATTTCCATCCCATCCTTATGTGTGTACTTGTTGGATTTGCTATACTACCAATAATATATACACTTAAACTTCTGTGAAATATAAGACAATGTTAATGTATTGTGTATTGAGTTTTCTTCCTTTGAAATTTGTCTCGTTTCTATATTGCTTACGACAGATACTGGTTTTCTTTCATCTCATTATGTAAATAACTTGGTCTCTTCGCTTGTCCTCTCTCTCTATTTCCCTTCCTTTTCTTATGGATTGATTCATGTGTAAATGATTTGTAACATTGAGACTAATGTGATTACTACTACTTCTGTGTTGTTATTATCCTTATCGTTAAATCTCACATTATTCATGTAGGTTCTTCTTGACAGTTTCCTGTTTTTCTACAACTCAATCGTTATAATTTTGCTTTTAACTATAACTATACCTCTTACGCACATAATCAATTTCTCTTCTGTTATTGTTTCTTAGTCACTTACTGCTTGTTCATTTTTATCATTGTTATGTACATTTACTATTGATGATAACTATCATGATGATGCTATCGTTAAGATGCCTCATATTATTGCTTTCATTGTTGTTACTACTGCTGCTATTGCTGACGCCACCGCTGCCATCATCGTATTTGTTGTTTCTGTGAAGAAATTTCATTTACTTATTACTTTCTTTGATATTAACCATATTCTAGCAAATACTTTCACTACTACTCTTACTCCTACTACTACCACTAATCTGTCTTTTCATTCATTCTGTTAATTTGATTTTAATTAATTCATGTTTATTATATTTGATAATTTATTGATTAATTGATTGATTTATTGACTTAATGTTATGTTTTTTTTTCGAAACAAAACAAATCGAATGTCATCGATGTTTTTTTTTGTTGGTTGTGTAATTTGTCAGTGTTTTTTTTCTTTCTTTAAATTTCATTTTTTGATGCTGGTCTCATCGTGTGTGTGTGTGTGTGAAAATTTGATGAACTCGTTTGTGTTTATAAGTTTGTCAAAAAATTTTTAAAAAAATTGTTCGATTTGAAAGATTTCAACAGATGTATACCGTTTGTTTGTTTTTTTTGTTGTTGCTATTTGTCTATTTATTTTCAAGAAAATCAATTACATAAAATATTTAAAGT] [+] EMBL CD082880 [CTAATAACGATAACAACACTAATTAAACACTATTTTTATATGCTAAATCTTATCCAAGGTCTATTCTCTTTACTATTTTATTGCTTTATCTACGTCACATAATAATCATCTCTGTGTTGTCTGTTGCTTGTAATTATAAAGAAATATGCATAACTAGTCGAACATTCTATTCAAAAGGTATCACACTATTATTTTTCTACTTCTATCCCACTATTTCCATCCCATCCTTATGTGTGTACTTGTTGGATTTGCTATACTACCAATAATATATACACTTAAACTTCTGTGAAATATAAGACAATGTTAATGTATTGTGTATTGAGTTTTCTTCCTTTGAAATTTGTCTCGTTTCTATATTGCTTACGACAGATACTGGTTTTCTTTCATCTCATTATGTAAATAACTTGGTCTCTTCGCTTGTCCTCTCTCTCTATTTCCCTTCCTTTTCTTATGGATTGATTCATGTGTAAATGATTTGTAACATTGAGACTAATGTGATTACTACTACTTCTGTGTTGNTATTATCCTTATCGTTAAATCTCACATTATTCATGTANGGTCTTCTT ] [-] EMBL CD118697 [ GTATTGAGTTTTCTTCCTNTGAAATNTGTCTCGTTTCTATATTGCTTACGACAGATACTGGTTTTCTTTCATCTCATTATGTAAATAACTTGGTCTCTTCGCTTGTCCTCTCTCTCTATTTCCCTTCCTTTTCTTATGGATTGATTCATGTGTAAATGATTTGTAACATTGAGACTAATGTGATTACTACTACTTCTGTGTTGTTATTATCCTTATCGTTAAATCTCACATTATTCATGTAGGTTCTTCTTGACAGTTTCCTGTTTTTCTACAACTCAATCGTTATAATTTTGCTTTTAACTATAACTATACCTCTTACGCACATAATCAATTTCTCTTCTGTTATTGTTTCTTAGTCACTTACTGCTTGTTCATTTTTATCATTGTTATGTACATTTACTATTGATGATAACTATCATGATGATGCTATCGTTAAGATGCCTCATATTATTGCTTTCATTGTTGTTACTACTGCTGCTATTGCTGACGCCACCGCTGCCATCATCGTATTTGTTGTTTCTGTGAAGAAATTTCATTTACTTATTACTTTCTTT ] [+] EMBL CD120658 [ GTTTTCTTTCATCTCATTATGTAAATAACTTGGTCTCTTCGCTTGTCCTCTCTCTCTCCTTCCCTTCCTTTTCTTATGGATTGATTCATGTGTAAATGATTTGTAACATTGAGACTAATGTGATTACTACTACTTCTGTGTTGTTATTATCCTTATCGTTAAATCTCACATTATTCATGTAGGTTCTTCTTGACAGTTTCCTGTTTTTCTACAACTCAATCGTTATAATTTTGCTTTTAACTATAACTATACCTCTTACGCACATAATCAATTTCTCTTCTGTTATTGTTTCTTAGTCACTTACTGCTTGTTCATTTTTATCATTGTTATGTACATTTACTATTGATGATAACTATCATGATGATGCTATCGTTAAGATGCCTCATATTATTGCTTTCATTG ] [-] EMBL CD183178 [ ACAGTTTCCTGTTNTTCTACAACTCAATCGTTATAATTTTGCTTTTAACTATAACTATACCTCTTACGCACATAATCAATTTCTCTTCTGTTATTGTTTCTTAGTCACTTACTGCTTGTTCATTTTTATCATTGTTATGTACATTTACTATTGGTGATAACTATCATGATGATGCTATCGTTAAGATGCCTCATATTATTGCTTTCATTGTTGTTACTACTGCTGCT ] [-] EMBL CD076465 [ GCTGCCATCATCGTATTTGTTGTTTCTGTGAAGAAATTTCATTTACTTATTACTTTCTTTGATATTAACCATATTCTAGCAAATACTTTCACTACTACTCTTACTCCTACTACTACCACTAATCTGTCTTTTCATTCATTCTGTTAATTTGATTTTAATTAATTCATGTTTATTATATTTGATAATTTATTGATTAATTGATTGATTTATTGACTTAATGTTATGTTTTTTTTTCGAAACAAAACAAATCGAATGTCATCGATGTTTTTTTTTGTTGGTTGTGTAATTTGTCAGTGTTTTTTTTCTTTCTTTAAATTTCATTTTTTGATGCTGGTCTCATCGTGTGTGTGTGTGTGTGAAAATTTGATGAACTCGTTTGTGTTTATAAGTTTGTCAAAAAATTTTTAAAAAAATTGTTCGATTTGAAAGATTTCAACAGATGTATACCGTTTGTTTGTTTTTTTTGTTGTTGCTATTTGTCTATTTATTTTCAAGAAAATCAATTACATAAAATATTTAAAGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||