These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7242#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 869 fasta sequence [TGATACTATTATTGGAGCGTGTACCTTCTGAATTGAATATATCTAGTTCAACTGAACAATTGAATGAATCATGTAAAGATAATCATTCTTATGGATTAGATCATGTACTACAAGATTTGATTAAGGCCTGTCCACATCTTAATCTACTAGCTCTTGGTGGTTCAAGTGTTTATGTGCATATTTTAACTTTATTGGTAATATGTCGTCAGAGAAATCAATGTTGTAATTCTATGAATGAATGTAAATATAGTCCATTACAATTATTTATCCAAAAGGAATGTTGCCAGTTAGATGGTGTTTGCCCATTAA-TTGTTCCAGCTACAATATCTACATG-GTATGATACAATGATGACTGAATCGATATCGTCTAGATTAAGAATAGCAGAGTGTTGCATTTGTACTGCATTGGGTCAACGTCG-ATGGCATTTTTTAACAAATTCAG-AATTTCATAATCAAC-TTAGTAATTATTTGTTATAAGTTATTTATTTATTATTTGTTAATGAGTTGCTTTTCCTTTTGTCAAACAGTGATTTCCCTTATCCTACTCACCATTTTTGGATAAGGTAATTTCTTTATTTTTTTTGTTCTTCCCCTTACTTGTACTTCGTGTTTTGCTTATCCCTAGTCTTTCATGAACCGTCTTTGAATTTTTTAACACAGACATTAATAGAATGATGTTAGCGTGAATGGGATAATTTTTTAATTTATCCCAAGTAAATATCATTGAATCAATTTGTCCGTTAAATTTTAATTGGATTTGTGCATTTAATTTATTTTTACCTTTGTGCCTTCCTTTTTTGGTAGATTTATCTTTAATTTAATTATACATTGTGATTTCAGTTTGAATATTTATGCTTATTAAAAAAAAAG] [+] EMBL CD083076 [TGATACTATTATTGGAGCGTGTACCTTCTGAATTGAATATATCTAGTTCAACTGAACAATTGAATGAATCATGTAAAGATAATCATTCTTATGGATTAGATCATGTACTACAAGATTTGATTAAGGCCTGTCCACATCTTAATCTACTAGCTCTTGGTGGTTCAAGTGTTTATGTGCATATTTTAACTTTATTGGTAATATGTCGTCAGAGAAATCAATGTTGTAATTCTATGAATGAATGTAAATATAGTCCATTACAATTATTTATCCAAAAGGAATGTTGCCAGTTAGATGGTGTTTGCCCATTAA TTGTTCCAGCTACAATATCTACATG GTATGATACAATGATGACTGAATCGATATCGTCTAGATTAAGAATAGCAGAGTGTTGCATTTGTACTGCATTGGGTCAACGTCG ATGGCATTTTTTAACAAATTCAG AATTTCATAATCAAC TTAGTAATTATTTGTTATAAGTTATTTATTTATTATTTGTTAATGAGTTGCTTTTCCTTTTGTCAAACAGTGATTTCCCTTATCCTACTCACCATTTTTGGATAAGGTAATTTCT ] [+] EMBL CD179033 [ TCATGTACTACAAGATTTGATTAAGGCCTGTCCACATCTTAATCTACTAGCTCTTGGTGGTTCAAGTGTTTATGTGCATATTTTAACTTTATTGGTAATATGTCGTCAGAGAAATCAATGTTGTAATTCTATGAATGAATGTAAATATAGTCCATTACAATTATTTATCCAAAAGGAATGTTGCCAGTTAGATGGTGTTTGCCCATTAA TTGTTCCAGCTACAATATCTACATG GTATGATACAATGATGACTGAATCGATATCGTCTAGATTAAGAATAGCAGAGTGTTGCATTTGTACTGCATTGGGTCAACGTCG ATGGCATTTTTTAACAAATTCAG AATTTCATAATCAAC TTAGTAATTATTTGTTATAAGTTATTTATTTATTATTTGTTAATGAGTTGCTTTTCCTTTTGTCAAACAGTGATTTCCCTTATCCTACTCACCATTTTTGGATAAGGTAATTTCTTTATTTTTTTTGTTCTTCCCCTTACTTGTACTTCGTGTTTTGCTTATCCCTAGTCT ] [-] EMBL CD110993 [ TTGGTGGTTCAAGTGTTTATGTGCATATTTTAACTTTATTGGTAATATGTCGTCAGAGAAATCAATGTTGTAATTCTATGAATGAATGTAAATATAGTCCATTACAATTATTTATCCAAAAGGAATGTTGCCAGTTAGATGGTGTTTGCCCATTAA TTGTTCCAGCTACAATATCTACATG GTATGATACAATGATGACTGAATCGATATCGTCTAGATTAAGAATAGCAGAGTGTTGCATTTGTACTGCATTGGGTCAACGTCG ATGGCATTTTTTAACAAATTCAG AATTTCATAATCAAC TTAGTAATTATTTGTTATAAGTTATTTATTTATTATTTGTTAATGAGTTGCTTTTCCTTTTGTCAAACAGTGATTTCCCTTATCCTACTCACCATTTTTGGATAAGGTAATTTCTTTATTTTTTTTGTTCTTCCCC TACTTGTACTTCGTGT ] [+] EMBL AW587532 [ ATTAATTTGTTCCAGCTACAATATCTACATGCCTATGATACAATGATGACTGAATCGATATCGTCTAGATTAAGAATAGCAGAGTGTTGCATTTGTACTGCATTGGGTCAACGTCG ATGGCATTTTTTAACAAATTCAGTAATTTCATAATCAACGTAAGTAA ] [-] EMBL CD076650 [ TGGGTCAACNNNGTAT GCATTTTTTAACAAATTCAG AATTTCATAATCAAC TTAGTAATTATTTGTTATAAGTTATTTATTTATTATTTGTTAATGAGTTGCTTTTCCTTTTGTCAAACAGTGATTTCCCTTATCCTACTCACCATTTTTGGATAAGGTAATTTCTTTATTTTTTTTGTTCTTCCCCTTACTTGTACTTCGTGTTTTGCTTATCCCTAGTTTTTCATGAACCGTCTTTGAATTTTTTAACACAGACATTAATAGAATGATGTTAGCGTGAATGGGATAATTTTTTAATTTATCCCAAGTAAATATCATTGAATCAATTTGTCCGTTAAATTTTAATTGGATTTGTGCATTTAATTTATTTTTACCTTTGTGCCTTCCTTTTTTGGTAGATTTATCTTTAATTTAATTATACATTGTGATTTCAGTTTGAATATTTATGCTTATTAAAAAAAAAG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||