These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7282#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1024 fasta sequence [CAGAACTATCATTATCAATAAAACGAGAAAGTGATGTACTCCATATGAAAATTTCACAGGATCCTGAAACCGGAGGTTATGTTCTAGGCGAATATAGTCAACCATATCCAAGTGTTTCATCTATGATTTATCGTTATTCACGAACTTTGCTACCAGTACGTGGTACAACTCCGGTGTTGTTGCGCTTCCCAATCAGTCGTATTGCATTTTCACACTAAATAAATCAAACAAATTATAACTATGTGTCAGTTATACATTCTATTTACTTAGTGATTTATTTATACGTCTCTTTGTTAATTTTTTTTCTAACAGATATTGGTGATGATCATTTTGTTTTACGATCCTCTCCCCCATTACTTTTACAATTTCTTTTTCCATGTTCCTTTTATTTTATGACTTTGTTGTCCATTTTCATTGAATTTCATTTTCTTTGTATTTATACCTATTTAACATTTCAATGTAACTGTCAACTTGTCC-TACATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTTTAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACTAGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTTACGAACAGTGAACAAAACACACATGTTTATTCTTTAACTCTTCGTTGATTTCTTTCCATTNTGTAGGTTCATAATTCAAATTTTGTCCGTTTTCCTTCCCGAATCGAATGTAATGTCTTCTAGTTAATGACTGTCTAATTACGCAATATTTATATTATTCAACTCACTGATATAGTCCAGTAATCTTATTCTGTTTTTAAGCCTATTTAGACTATTTTACACTCAGATTAAACGTGTTCACTTTCAATAACTAGGCAAAAATATTTGAGAGAGAATCTTTAACACGCACAAGCCTTGGGNCANCTCATGTATATTAAACACNATTAACTNCCTCGCCTCCAANNTTCTTCATCCGCTTACTCATTTNATGNAATTNATGGGNTAT] [+] EMBL CD178224 [CAGAACTATCATTATCAATAAAACGAGAAAGTGATGTACTCCATATGAAAATTTCACAGGATCCTGAAACCGGAGGTTATGTTCTAGGCGAATATAGTCAACCATATCCAAGTGTTTCATCTATGATTTATCGTTATTCACGAACTTTGCTACCAGTACGTGGTACAACTCCGGTGTTGTTGCGCTTCCCAATCAGTCGTATTGCATTTTCACACTAAATAAATCAAACAAATTATAACTATGTGTCAGTTATACATTCTATTTACTTAGTGATTTATTTATACGTCTCTTTGTTAATTTTTTTTCTAACAGATATTGGTGATGATCATTTTGTTTTACGATCCTCTCCCCCATTACTTTTACAATTTCTTTTTCCATGTTCCTTTTATTTTATGACTTTGTTGTCCATTTTCATTGAATTTCATTTTCTTTGTATTTATACCTATTTAACATTTCAATGTAACTGTCAACTTGTCC TACATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTNTAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACTAGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTa ] [+] EMBL CD096653 [ TCCCAATCAGTCGTATTGCATTTTCACACTAAATAAATCAAACAAATTATAACTATGTGTCAGTTATACATTCTATTTACTTAGTGATTTATTTATACGTCTCTTTGTTAATTTTTTTTCTAACAGATATTGGTGATGATCATTTTGTTTTACGATCCTCTCCCCCATTAC TTTACAATTTCTTTTTCCATGTTCCTTCTATTTTATGACTTTGTTGTCCATTTTCATTGAATTTCATTTTCTTTGTATTTATACCTATTTAACATTTCAATGTAACTGTCAACTTGTCC TACATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTTTAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACTAGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTTACGAACAGTGAACAAAACACACATGTTTATTCTTTAACTCTTCGTTGATTTCTTTCCATTNTGTAGGTTCATAATTCAAATTTTGTCCGTTTTCCTTCCCGAATCGAATGTAATGTCTTCTAGTTAATGACTGTC ] [+] EMBL CD147242 [ TCCCAATCAGTCGTATTGCATTTTCACACTAAATAAATCAAACAAATTATAACTATGTGTCAGTTATACATTCTATTTACTTAGTGATTTATTTATACGTCTCTTTGTTAATTTTTTTTCTAACAGATATTGGTGATGATCATTTTGTTTTACGATCCTCTCCCCCATTACTTTTACAATTTCTTTTTCCATGTTCCTTTTATTTTATGACTTTGTTGTCCATTTTCATTGAATTTCATTTTCTTTGTATTTATACCTATTTAACATTTCAATGTAACTGTCAACTTGTCC TACATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTTTAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACTAGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTTACGAACAGTGAACAAAACACACATGTTTATTCTTTAACTCT ] [-] EMBL CD143454 [ nACCTANTTAACATTTCAATGTAACTGTCAAC TGTCCNTACATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTTTAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACTAGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTTACGAACAGTGAACAAAACACACATGTTTATTCTTTAACTCTTCGTTGATTTCTTTCCATTTTGTAGGTTCATAATTCAAATTTTGTCCGTTTTCCTTCCCGAATCGAATGTAATGTCTTCTAGTTAATGACTGTCTAATTACGCAATATTTATATTATTCAACTCACTGATATAGTCCAGTAATCTTATTCTGTTTTTAAGCCTATTTAGACTATTTTACACTCAGATTAAACGTGTTCACTTTCAATAACTAGGCAAAAATATTTGAGAGAGAATCTTTAACACGCAC ] [+] EMBL SM778 [ nTCAAATTTNGTCCGATTTCCTTCCCGAATCGAATGTAATGTCTTCTAGTTAATGACTGTCTAATTACGCAATATTTATATCATCCAACTCACTGATATAGTCCAGTAATCTTATTCTGTTTTTAAGCCTATATAGACTATNNTACACACAGATTAAACGTATTCACTTNCAATAACTAGGCAAAAATATTNGAGAGAGANTCTTTACCACGCACAAGCCTTGGGNCANCTCATGTATATTAAACACNATTAACTNCCTCGCCTCCAANNTTCTTCATCCGCTTACTCATTTNATGNAATTNATGGGNTAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||