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Schistosoma mansoni
cluster # 7282 cluster # 7282       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7282#0 length = 1024 sequences # 5  

consensusID : consensus_7282#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1024
fasta sequence
                              [CAGAACTATCATTATCAATAAAACGAGAAAGTGATGTACTCCATATGAAAATTTCACAGGATCCTGAAACCGGAGGTTATGTTCTAGGCGAATATAGTCAACCATATCCAAGTGTTTCATCTATGATTTATCGTTATTCACGAACTTTGCTACCAGTACGTGGTACAACTCCGGTGTTGTTGCGCTTCCCAATCAGTCGTATTGCATTTTCACACTAAATAAATCAAACAAATTATAACTATGTGTCAGTTATACATTCTATTTACTTAGTGATTTATTTATACGTCTCTTTGTTAATTTTTTTTCTAACAGATATTGGTGATGATCATTTTGTTTTACGATCCTCTCCCCCATTACTTTTACAATTTCTTTTTCCATGTTCCTTTTATTTTATGACTTTGTTGTCCATTTTCATTGAATTTCATTTTCTTTGTATTTATACCTATTTAACATTTCAATGTAACTGTCAACTTGTCC-TACATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTTTAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACTAGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTTACGAACAGTGAACAAAACACACATGTTTATTCTTTAACTCTTCGTTGATTTCTTTCCATTNTGTAGGTTCATAATTCAAATTTTGTCCGTTTTCCTTCCCGAATCGAATGTAATGTCTTCTAGTTAATGACTGTCTAATTACGCAATATTTATATTATTCAACTCACTGATATAGTCCAGTAATCTTATTCTGTTTTTAAGCCTATTTAGACTATTTTACACTCAGATTAAACGTGTTCACTTTCAATAACTAGGCAAAAATATTTGAGAGAGAATCTTTAACACGCACAAGCCTTGGGNCANCTCATGTATATTAAACACNATTAACTNCCTCGCCTCCAANNTTCTTCATCCGCTTACTCATTTNATGNAATTNATGGGNTAT]

[+] EMBL CD178224             [CAGAACTATCATTATCAATAAAACGAGAAAGTGATGTACTCCATATGAAAATTTCACAGGATCCTGAAACCGGAGGTTATGTTCTAGGCGAATATAGTCAACCATATCCAAGTGTTTCATCTATGATTTATCGTTATTCACGAACTTTGCTACCAGTACGTGGTACAACTCCGGTGTTGTTGCGCTTCCCAATCAGTCGTATTGCATTTTCACACTAAATAAATCAAACAAATTATAACTATGTGTCAGTTATACATTCTATTTACTTAGTGATTTATTTATACGTCTCTTTGTTAATTTTTTTTCTAACAGATATTGGTGATGATCATTTTGTTTTACGATCCTCTCCCCCATTACTTTTACAATTTCTTTTTCCATGTTCCTTTTATTTTATGACTTTGTTGTCCATTTTCATTGAATTTCATTTTCTTTGTATTTATACCTATTTAACATTTCAATGTAACTGTCAACTTGTCC TACATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTNTAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACTAGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD096653             [                                                                                                                                                                                          TCCCAATCAGTCGTATTGCATTTTCACACTAAATAAATCAAACAAATTATAACTATGTGTCAGTTATACATTCTATTTACTTAGTGATTTATTTATACGTCTCTTTGTTAATTTTTTTTCTAACAGATATTGGTGATGATCATTTTGTTTTACGATCCTCTCCCCCATTAC TTTACAATTTCTTTTTCCATGTTCCTTCTATTTTATGACTTTGTTGTCCATTTTCATTGAATTTCATTTTCTTTGTATTTATACCTATTTAACATTTCAATGTAACTGTCAACTTGTCC TACATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTTTAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACTAGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTTACGAACAGTGAACAAAACACACATGTTTATTCTTTAACTCTTCGTTGATTTCTTTCCATTNTGTAGGTTCATAATTCAAATTTTGTCCGTTTTCCTTCCCGAATCGAATGTAATGTCTTCTAGTTAATGACTGTC                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD147242             [                                                                                                                                                                                          TCCCAATCAGTCGTATTGCATTTTCACACTAAATAAATCAAACAAATTATAACTATGTGTCAGTTATACATTCTATTTACTTAGTGATTTATTTATACGTCTCTTTGTTAATTTTTTTTCTAACAGATATTGGTGATGATCATTTTGTTTTACGATCCTCTCCCCCATTACTTTTACAATTTCTTTTTCCATGTTCCTTTTATTTTATGACTTTGTTGTCCATTTTCATTGAATTTCATTTTCTTTGTATTTATACCTATTTAACATTTCAATGTAACTGTCAACTTGTCC TACATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTTTAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACTAGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTTACGAACAGTGAACAAAACACACATGTTTATTCTTTAACTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD143454             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       nACCTANTTAACATTTCAATGTAACTGTCAAC TGTCCNTACATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTTTAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACTAGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTTACGAACAGTGAACAAAACACACATGTTTATTCTTTAACTCTTCGTTGATTTCTTTCCATTTTGTAGGTTCATAATTCAAATTTTGTCCGTTTTCCTTCCCGAATCGAATGTAATGTCTTCTAGTTAATGACTGTCTAATTACGCAATATTTATATTATTCAACTCACTGATATAGTCCAGTAATCTTATTCTGTTTTTAAGCCTATTTAGACTATTTTACACTCAGATTAAACGTGTTCACTTTCAATAACTAGGCAAAAATATTTGAGAGAGAATCTTTAACACGCAC                                                                                                ]
[+] EMBL SM778                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          nTCAAATTTNGTCCGATTTCCTTCCCGAATCGAATGTAATGTCTTCTAGTTAATGACTGTCTAATTACGCAATATTTATATCATCCAACTCACTGATATAGTCCAGTAATCTTATTCTGTTTTTAAGCCTATATAGACTATNNTACACACAGATTAAACGTATTCACTTNCAATAACTAGGCAAAAATATTNGAGAGAGANTCTTTACCACGCACAAGCCTTGGGNCANCTCATGTATATTAAACACNATTAACTNCCTCGCCTCCAANNTTCTTCATCCGCTTACTCATTTNATGNAATTNATGGGNTAT]


>consensus_7282#0 CAGAACTATCATTATCAATAAAACGAGAAAGTGATGTACTCCATATGAAAATTTCACAGG ATCCTGAAACCGGAGGTTATGTTCTAGGCGAATATAGTCAACCATATCCAAGTGTTTCAT CTATGATTTATCGTTATTCACGAACTTTGCTACCAGTACGTGGTACAACTCCGGTGTTGT TGCGCTTCCCAATCAGTCGTATTGCATTTTCACACTAAATAAATCAAACAAATTATAACT ATGTGTCAGTTATACATTCTATTTACTTAGTGATTTATTTATACGTCTCTTTGTTAATTT TTTTTCTAACAGATATTGGTGATGATCATTTTGTTTTACGATCCTCTCCCCCATTACTTT TACAATTTCTTTTTCCATGTTCCTTTTATTTTATGACTTTGTTGTCCATTTTCATTGAAT TTCATTTTCTTTGTATTTATACCTATTTAACATTTCAATGTAACTGTCAACTTGTCCTAC ATTTATTTACAGTAGTACACATATAGAGTCTTTCGTATTAGTACTATGATGGATAAATTT TAAAAAAATGTTACCGATGTTTAACACAAATTCTCCTGGTTATGCAACTACAGTTTAACT AGCATTTAGTAATTGTTTATTTATACCAGTGCTTTTTTTACGAACAGTGAACAAAACACA CATGTTTATTCTTTAACTCTTCGTTGATTTCTTTCCATTNTGTAGGTTCATAATTCAAAT TTTGTCCGTTTTCCTTCCCGAATCGAATGTAATGTCTTCTAGTTAATGACTGTCTAATTA CGCAATATTTATATTATTCAACTCACTGATATAGTCCAGTAATCTTATTCTGTTTTTAAG CCTATTTAGACTATTTTACACTCAGATTAAACGTGTTCACTTTCAATAACTAGGCAAAAA TATTTGAGAGAGAATCTTTAACACGCACAAGCCTTGGGNCANCTCATGTATATTAAACAC NATTAACTNCCTCGCCTCCAANNTTCTTCATCCGCTTACTCATTTNATGNAATTNATGGG NTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)