These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7285#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 612 fasta sequence [ACAGAATCAATATTATTACCAGATTCATTTTCTTCTGACACAACATCAGCTGTACATGGGTATTCATCAAGACTGCCACCAAATACAATAAACTGTGCTGATCCTACAGAATAGCTAGGAGTAGGGGAATCAATTGACGGAGATAAAGATAATGTTAGTGATGTACGTGATCCTCTACGACTTTCTAAAAGACCTTTGGATCGTGCTCGACGACTCGCAGTGAATCCAATGCCTGGATAGGTTTTCGGGACTTGTGTACTACCACCAGTACAACTAGTAGTGTTAGTACATGACGATTGATTTAATTCCTGAGTAACTGTATCTGAATTAAGACAGGTAACATGATTATAGGGTGAATTTAATAAAGGTA-G-CGGTTGTGTTGTGATTAAAGTTTGACTACAAGGTGCAGATTGTGATTCGCACGGTG-TACAATGAGAATGTAAAACATCAGCTGATGTATTTAATATCAGTGGACTGTGCAAAAGTTGTGTTGGAGTAAGTGTGAATGTACCCAAACTATTATTAATTCATTGAATAAATTGTATGAACAAAACGAAGAANAAAATCAGAGTAAACCTCAACAAATATTACATTTAAAATGCGANCATAAAT] [-] EMBL CD114323 [ACAGAATCAATATTATTACCAGATTCATTTTCTTCTGACACAACATCAGCTGTACATGGGTATTCATCAAGACTGCCACCAAATACAATAAACTGTGCTGATCCTACAGAATAGCTAGGAGTAGGGGAATCAATTGACGGAGATAAAGATAATGTTAGTGATGTACGTGATCCTCTACGACTTCCTAAAAGACCTTTGGATCGTGCTCGACGACTCGCAGTGAATCCAATGCCTGGATAGGTTTTCGGGA ] [+] EMBL CD193222 [ tcTTCATCAAGACTGCCACCAAATACACTAAACTGTGCTGATCCTACAGAATAGCTAGGAGTAGGGGAATCAATTGACGGAGATAAAGATAATGTTAGTGATGTACGTGATCCTCTACGACTTTCTAAAAGACCTTTGGATCGTGCTCGACGACTCGCAGTGAATCCAATGCCTGGATAGGTTTTCGGGACTTGTGTACTACCACCAGTACAACTAGTAGTGTTAGTACATGACGATTGATTTAATTCCTGAGTAACTGTATCTGAATTAAGACAGGTAACATGATTATAGGGTGAATTTAATAAAGGTA G CGGTTGTGTTGTGATTAAAGTTTGACTACAAGGTGCAGATTGTGATTCGCACGGTG TACAATGAGAATGTAAAACATCAGCTGATGTATTTAATATCAGTGGACTGTGCAAAAGTTGTGTTGGAGTAAGTGTGAATGTACCCAAACTATTATTAATTCATTGAATAAATTGTATGAACAAAACGAAGAANAAAATCAGAGTAAACCTCAACAAATATTACATTTAAAATGCGANCATAAAT] [-] EMBL CD167361 [ AAGATAATGTTAGTGATGTACGTGATCCTCTACGACTTTCTAAAAGACCTTTGGATCGTGCTCGACGACTCGCAGTGAATCCAATGCCTGGATAGGTTTTCGGGACTTGTGTACTACCACCAGTACAACTAGTAGTGTTAGTACATGACGATTGATTTAATTCCTGAGTAACTGTATCTGAATTAAGACAGGTAACATGATTATAGGGTGAATTTAATAAAGGTACGACGGTTGTGTTGTGATTAAAGTTAGACTACAAGGTGCAGATTGTGATTCGCACGGTGCTACAATGAGAATGTAAAACATCAGCTGATGTATTTAATATC GTGGA ] [-] EMBL CD181997 [ GACTTGTGTACTACCACCAGTACAACTAGTAGTGTTAGTACATGACGATTGATTTAATTCCTGAGTAACTGTATCTGAATTAAGACAGGTAACATGATTATAGGGTGAATTTAATAAAGGTA G CG ] [-] EMBL CD167449 [ TTGTGATTAAAGTTTGACTACAAGGTGCAGATTGTGATTCGCACGGTG TACAATGAGAATGTAAAACATCAGCTGATGTATTTAATTTCAGT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||