These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7306#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 538 fasta sequence [CAATGTTTGTGTTTATTACCGTTGAGACATATTCTGTTTTCTGCATATTCCTAAATATTGCACACACGTTCATGCGCACGCACTCATTTTAAGACATCAACCAATTTACAACAGATGATAATCTAGAGAAATCTCACCAAAAACAAAAGAGTATCCAAATCTGATCTAAAAAGTATTTTATCAATTCATTTATAATGGAAGAGTTTTTTTTGGATTTGCTTTGCATGATCATATATTATATATATTATGGATTACTCGTCCTCAGTGCTAAATGATATTTTTTAATACAAAAGATCCCGTTTATGATAGAATTTGTCGTCTACCCGGTTGAATAAGAGTGCTTATTATGAAACATTACTAATACCATTTGATTACTTTTATGCACAGCTGTGGCATTTTGTTTATCTTTTTATGTACATGTGTGTGTGTGTGCATTTGTGTAAGTGCATGGATAGACGGTCACAATCTATTATTAGTTCTTATTATGTTTGTTTTCTAGCCTTAATTGCACTATTAAAAAAAAATAATTAAATTCTTG] [+] EMBL CD081707 [CAATGTTTGTGTTTATTACCGTTGAGACATATTCTGTTTTCTGCATATTCCTAAATATTGCACACACGTTCATGCGCACGCACTCATTTTAAGACATCAACCAATTTACAACAGATGATAATCTAGAGAAATCTCACCAAAAACAAAAGAGTATCCAAATCTGATCTAAAAAGTATTTTATCAATTCATTTATAATGGAAGAGTTTTTTTTGGATTTGCTTTGCATGATCATATATTATATATATTATGGATTACTCGTCCTCAGTGCTAAATGATATTTTTTAATACAAAAGATCCCGTTTATGATAGAATTTGTCGTCTACCCGGTTGAATAAGAGTGCTTATTATGAAACATTACTAATACCATTTGATTACTTTTATGCACAGCTGTGGCATTTTGTTTATCTTTTTATGTACATGTGTGTGTGTGTGCATTTGTGTAAGTGCATGGATAGACGGTCACAATCTATTATTAGTTCTTATTATGTTTGTTTTCTAGCCTTAATTGCACTATTAAAAAAAAATAATTAAATTCTTG] [+] EMBL CD082941 [CAATGTTTGTGTTTATTACCGTTGAGACATATTCTGTTTTCTGCATATTCCTAAATATTGCACACACGTTCATGCGCACGCACTCATTTTAAGACATCAACCAATTTACAACAGATGATAATCTAGAGAAATCTCACCAAAAACAAAAGAGTATCCAAATCTGATCTAAAAAGTATTTTATCAATTCATTTATAA ] [-] EMBL CD076803 [ AATGTTTGTGTTTATTACCGTTGAGACATATTCTGTTTTCTGCATATTCCTAAATATTGCACACACGTTCATGCGCACGCACTCATTTTAAGACATCAACCAATTTACAACAGATGATAATCTAGAGAAATCTCACCAAAAACAAAAGAGTATCCAAATCTGATCTAAAAAGTATTTTATCAATTCATTTATAATGGAAGAGTTTTTTTTGGATTTGCTTTGCATGATCATATATTATATATATTATGGATTACTCGTCCTCAGTGCTAAATGATATTTTTTAATACAAAAGATCCCGTTTATGATAGAATTTGTCGTCTACCCGGTTGAATAAGAGTGCTTATTATGAAACATTACTAATACCATTTGATTACTTTTATGCACAGCTGTGGCATTTTGTTTATCTTTTTATGTACATGTGTGTGTGTGTGCATTTGTGTAAGTGCATGGATAGACGGTCACAATCTATTATTAGTTCTTATTATGTTTGTTTTCTAGCCTTAATTGCACTATTAAAAAAAAATAATTAAATTCTT ] [-] EMBL CD076526 [ AATGTTTGTGTTTATTACCGTTGAGACATATTCTGTTTTCTGCATATTCCTAAATATTGCACACACGTTCATGCGCACGCACTCATTTTAAGACATCAACCAATTTACAACAGATGATAATCTAGAGAAATCTCACCAAAAACAAAAGAGTATCCAAATCTGATCTAAAAAGTATTTTATCAATTCATTTATAATGGAAGAG TTTTTTTGGATTTGCTTTGCATGATCATATATTATATATATTATGGATTACTCGTCCTCAGTGCTAAATGATATTTTTTAATACAAAAGATCCCGTTTATGATAGAATTTGTCGTCTACCCGGTTGAATAAGAGTGCTTATTATGAAACATTACTAATACCATTTGATTACTTTTATGCACAGCTGTGGCATTTTGTTTATCTTTTTATGTACATGTGTGTGTGTGTGCATTTGTGTAAGTGCATGGATAGACGGTCACAATCTATTATTAGTTCTTATTATGTTTGTTTTCTAGCCTTAATTGCACTATTAAAAAAAAATAATTAAAT ] [-] EMBL CD160161 [ TAAGACATCAACCCATTTACAACAGATGATAATCTAGAGAAATCTCACCGCAAACTAAAGAGTATCCAAATCTGATCTAAAAAGTATTTTATCAATTCATTTATAATGGAAGAGTTTTTTTTGGATTTGCTTTGCATGATCATATATTATATATATTATGGATTACTCGTCCTCAGTGCTAAATGATATTTTTTAATACAAAAGATCCCGTTTATGATAGAATTTGTCGTCTACCCGGTTGAATAAGAGTGCTTATTATGAAACATTACTAATACCATTTGATTACTTTTATGCACAGCTGTGGCATTTTGTTTATCTTTTTATGTACATGTGTGTGTGTGTGCATTTGTGTAAGTGCATGGATAGACGGTCACAATCTATTATTAGTTCTTATTATGTTTGTTTTC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||