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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7337#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 592 fasta sequence
[TAAATACATACGATCGATTAAATTAACTCAAGATGGAAGGACATTAGTGGTTGGT-GGTGAATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACTTACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTTCAGTTGTTGTTCAAATGGAAATATTGGTGTTTGGGATATACATAACCGTATTTTAGTTCGCCAGTATCAAGGACATGCTGAAGGAGCATCTTGTGTCGATATCCGTCCTGATGGAACACGCTTGTGGAGTGGAGGCTTAGATAAAACTGTACGTTGTTGGGACTTACGGGAACACTGCCAAATAAGTCAGGTTGATTTATCAGCTCAAATATTTTCTCTTGGTTATTGTCCAACTGGAGATTGGTTAGCTGTTGGATTAGAAACAGATCAAGTTGAAGTGTTCGGTCCTGGTCGTCCAGAACGTTATCAACTATCTCTGCATGAAAGTTGTGTTTTATCTCTTAAATTTGCTCACAGTGGTTTATGGTTTGCTTCCACTGGTAAAGACCATTGTCTATACGCTTGGAGAACT]
[+] EMBL CD183093 [TAAATACATACGATCGATTAAATTAACTCAAGATGGAAGGACATTAGTGGTTGGG GGTGAATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACTTACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTTCAGTTGTTGTTCAAATGGAAATATTGGTGTTTGGGATATACA ]
[+] EMBL CD183141 [TAAATACATACGATCGATTAAATTAACTCAAGATGGAAGGACATTAGTGGTTGGT GGTGAATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACTTACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTTCAGTTGTTGTTCAAATGG AATATT ]
[+] EMBL CD182936 [TAAATACATACGATCGATTAAATTAACTCAAGATGGAAGGACATTAGTGGTTGGT GGTGAATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACTTACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTTCAGTTGTTGTTCAAATGG AATAT ]
[+] EMBL CD178264 [ gcGTTGGTCGGAGAATCTAGTATATTAAGTATATGGGATTTGGGTCAAGCTAGTCCTCATCCAAAAAGTGAACTTACATTTACAGCTCCAGCATGTTATGCCTTGGCTGTATCGCCTGATAGTAAATTATGCTTCAGTTGTTGTTCAAATGGAAATATTGGTGTTTGGGATATACATAACCGTATTTTAGTTCGCCAGTATCAAGGACATGCTGAAGGAGCATCTTGTGTCGATATCCGTCCTGATGGAACACGCTTGTGGAGTGGAGGCTTAGATAAAACTGTACGTTGTTGGGACTTACGGGAACACTGCCAAATAAGTCAGGTTGATTTATCAGCTCAAATATTTTCTCTTGGTTATTGTCCAACTGGAGATTGGTTAGCTGTTGGATTAGAAACAGATCAAGTTGAAGTGTTCGGTCCTGGTCGTCCAGAACGTTATCAACTATCTCTGCATGAAAGTTGTGTTTTATCTCTTAAATTTGCTCACAGTGGTTTATGGTTTGCTTCCACTGGTAAAGACCATTGTCTATACGCTTGGAGAACT]
[+] EMBL CD195687 [ TTGGTGTTTGGGATATACATAACCGTATTTTAGTTCGCCAGTATCAAGGACATGCTGAAGGAGCATCTTGTGTCGATATCCGTCCTGATGGAACACGCTTGTGGAGTGGAGGCTTAGATAAAACTGTACGTTGTTGGGACTTACGGGAACACTGCCAAATAAGTCAGGTTGATTTATCAGCTCAAATATTTTCTCTTGGTTGTTGTCCAACTGGAGATTGGTTAGCTGTTGGATTAGAAACAGATCAAGTTGAAGTGTTCGGTCCTGGTCGTCAAGAACGTTATCAACTATCTCTGCATGAAAAGTGTGTTTTATCTCTTAAATTNGCTCACAGNGGTTTATGGNTTGCTTCCACTGGTAAAGACCATGGTC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||