cluster # 7377

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Schistosoma mansoni
cluster # 7377 cluster # 7377 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7377#0 length = 432 sequences # 5

consensusID : consensus_7377#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 432
fasta sequence

                              [GCAGTGCTGTAGTCATTTATTAATGAAATTAGATGGAAACTGTACTGTTATACACAGTTTTAGAGTACAACCAAACTGTTTTCGTTTAAACTGCACTTTTCGGACAAACTTTAAATATTTAGT-TACACATATAGACCTAGCAGTGAATCAGATTCTACAGAACCTGAAAATGTGGTTGTCAGGCAAATGGAATGAAGTAACTAGTCAGTAAGTTGATTTAAGAAACTACTTTCAAACAAAAAAAAGAAAGCAATGAGAGGGAAACATCTTAAATTTGCGTTTTTGTCCATAATTAGTGTTAAGAATTGGAACTCTAAGTATTATGATAAACAAAATATTCACTATTATTCGATTACTATGTAAATAGATATCTTGGTGGATATTCTAAAATAATATCCATGACTTCTATTATCGCTACTCCGCCTGCAGCCC]

[+] EMBL CD085491             [GCACTGCTGTAGTCATTTATTAATGAAATTAGATGGAAACTGTACTGTTATACACAGTTTTAGAGTACAACCAAACTGTTTTCGTTTAAACCGCACTTTTCGGACAAACTTTAAATATTTAGTCTACACATATAGACCTAGCAGTGAATCAGATTCTACAGAACCTCTAAATGTGGTTGTCAGGCAAATGGAATGAAGTAACTTGTCAGTAAGTTGATTTAAGAAACTACTTTCAAACAAAAAAAAGAGAGCAATGAGAGGGAACTATCTTAAATTTGCGTTTTTGTCCATAATTAGTGTTAAGAACTGGAACTCTAAGTATTATGATAAACAAAATATTCACTATTATTCGATTACTATGTAAATAGATATCTTGGTGGATATTCTAAAATAATATCCATGACTTCTATTATCGCTACTCCGCCTGCAGCC ]
[+] EMBL CD085537             [GCAGTGCTGTAGTCATTTATTAATGAAATTAGATGGAAACTGTACTGTTATACACAGTTTTAGAGTACAACCAAACTGTTTTCGTTTAAACTGCACTTTTCGGACAAACTTTAAATATTTAGT TACACATATAGACCTAGCAGTGAATCAGATTCTACAGAACCTGAAAATGTGGTTGTCAGGCAAATGGAATGAAGTAACTAGTCAGTAAGTTGATTTAAGAAACTACTTTCAAACAAAAAAAAGAAAGCAATGAGAGGGAAACATCTTAAATTTGCGTTTTTGTCCATAATTGGTGTTAAGAATTGGAACTCTAAGTATTATGATAAACACAATATTCACTATTATTCGATTACTATGTAAATAGATATCTTGGTGGATATTCTAAAATAATATCCATGACTTCTATTATCGCTACTCCGCCTGCAGCC ]
[+] EMBL CD085553             [GCAGTGCTGTAGTCATTTATTAATGAAATTAGATGGAAACTGTACTGTTATACACAGTTTTAGAGTACAACCAAACTGTTTTCGTTTAAACTGCACTTTTCGGACAAACTTTAAATATTTAGT TACACATATAGACCTAGCAGTGAATCAGATTCTACAGAACCTGAAAATGTGGTTGTCAGGCAAATGGAATGAAGTAACTAGTCAGTAAGTTGATTTAAGAAACTACTTTCAAACAAAAAAAAGAGAGCAATGAGAGGGAAACATCTTAAATTTGCGTTTTTGTCCATAATTAGTGTTAAGAATTGGAACTCTAAGTATTATGATAAACAAAATATTCACTATTATTCGATTACTATGTAAATGGATATCTTGGTGGATATTCTAAAATAATATCCATGACTTCTATTATCGCTACTCCGCCTGCAGCC ]
[+] EMBL CD085485             [GCAGTGCTGTAGTCATTTATTAATGAAATTAGATGGAAACTGTACTGTTATACACAGTTTTAGAGTACAACCAAACTGTTTTCGTTTAAACTGCACTTTTCGGACAAACTTTAAATATTTAGT TACACATATAGACCTAGCAGTGAATCAGATTCTACAGAACCTGAAAATGTGGTTGTCAGGCAAATGGAATGAAGTAACTAGTCAGTAAGTTGATTTAAGAAACTACTTTCAAACAAAAAAAAGAAAGCAATGAGAGGGAAACATCTTAAATTTGCGTTTTTGTCCATAATTAGTGTTAAGAATTGGAACTCTAAGTATTATGATAAACAAAATATTCACTATTATTCGATTACTATGTAAATAGATATCTTGGTGGATATTCTAAAATAATATCCATGACTTCTATTATCGCTACTCCGCCTGCAGCC ]
[-] EMBL CD085405             [cagGTGCTGTAGTCATTTATTAATGAAGTTAGATGCAAGCTGTGCTGTTATACGCAGTTTTAGAGTGCAACCAAACTGTTTTCGTTTAAACTGCACTTTTCGGACAAACTTTAAATATTTAGT TACACATATAGACCTAGCAGTGAATCAGATTCTACAGAACCTGAAAATGTGGTTGTCAGGCAAATGGAATGAAGTAACTAGTCAGTAAGTTGATTTAAGAAACTACTTTCAAACAAAAAAAAGAAAGCAATGAGAGGGAAACATCTTAAATTTGCGTTTTTGTCCATAATTAGTGTTAAGAATTGGAACTCTAAGTATTATGATAAACAAAATATTCACTATTATTCGATTACTATGTAAATAGATATCTTGGTGGATATTCTAAAATAATATCCATGACTTCTATTATCGCTACTCCGCCTGCAGCCC]




>consensus_7377#0
GCAGTGCTGTAGTCATTTATTAATGAAATTAGATGGAAACTGTACTGTTATACACAGTTT
TAGAGTACAACCAAACTGTTTTCGTTTAAACTGCACTTTTCGGACAAACTTTAAATATTT
AGTTACACATATAGACCTAGCAGTGAATCAGATTCTACAGAACCTGAAAATGTGGTTGTC
AGGCAAATGGAATGAAGTAACTAGTCAGTAAGTTGATTTAAGAAACTACTTTCAAACAAA
AAAAAGAAAGCAATGAGAGGGAAACATCTTAAATTTGCGTTTTTGTCCATAATTAGTGTT
AAGAATTGGAACTCTAAGTATTATGATAAACAAAATATTCACTATTATTCGATTACTATG
TAAATAGATATCTTGGTGGATATTCTAAAATAATATCCATGACTTCTATTATCGCTACTC
CGCCTGCAGCCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case