cluster # 7380

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Schistosoma mansoni
cluster # 7380 cluster # 7380 Sequences # 5 consensus # 2

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consensus_7380#0 length = 912 sequences # 3

consensus_7380#1 length = 704 sequences # 2

consensusID : consensus_7380#0
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Sequences nbr = 3
consensus length = 912
fasta sequence

                              [TAAATAATTAAGTAAAGAAAATATATATTGAGCATTGTTTTTTTATTCATACATTGAATTACATATTTTGTTGGTAATGAAAAATAATAACCATAAACACCATGAGAAAGGCACAAAATCGAACTCATATTGGTTATCTAATTTTTTTTTTATAATGATTGTAATTTTTCACCTATTTATATTACGTAACTGTTATCACAGATAATGAGAATGATATGTTATCACTAGGCTTGACCAATTTACACATCGTTTGTTTATACATACATATATATATATAGATACGGATCTTGGAAGCACACACAAAAAAGAAATGAAATTGATAGATAGCAGAATATAACATTTGTGTACTTTCTTCTCTATTCAGATTTTACATCTAAGGAAAGACATTGTTGTTCTTGTTGGTGGTGGGTGGTGGTGGTTATTTTTCTCTTGTTAGTACAAATACATATTTAATAGATATATACACATTAAGTAGTTGAATAGGAAATAAGACAAATAAGAGATGGGTAATTATTCCAATCTGTTCAAGTTAATATTAAAATCGATTAAAATCGTTAGCGGTTGGCATATACGGTTTACGATTAAATTTCCATTGTTGTTTTAATGATCCAGTACATGCAGTAAGTTGAACACTGGATTTTTCAATATTGATCTCT-AACATTTTCCTTGATGACGAATAGTATCGTCCTGTTAAAAAAAGTAGTTTAAGAAACATTTATTGATAGTTGAAATCATGAGTCAATTGAAGCTAGATCACCAAGGAAAACCTGGAAACACTGGACGTCCGTTTCGTCCTATTATGGGACTCCTCAGCAGTGCGCATCCACGATCCCGCACCCGCGAGATTCGAACCCAGGACCTACCAGCTTCGCGCCGGAGCACTTAATCGATAAACCACTGAGCCGGCATCCA]

[+] EMBL BF936952             [TAAATAATTAAGTAAAGAAAATATATATTGAGCATTGTTTTTTTATTCATACATTGAATTACATATTTTGTTGGTAATGAAAAATAATAACCATAAACACCATGAGAAAGGCACAAAATCGAACTCATATTGGTTATCTAATTTTTTTTTTATAATGATTGTAATTTTTCACCTATTTATATTACGTAACTGTTATCACAGATAATGAGAATGATATGTTATCACTAGGCTTGACCAATTTACACATCGTTTGTTTATACATACATATATATATATAGATACGGATCTTGGAAGCACACACAAAAAAGAAATGAAATTGATAGATAGCAGAATATAACATTTGTGTACTTTCTTCTCTATTCAGATTTTACATCTAAGGAAAGACATTGTTGTTCTTGTTGGTGGTGGGTGGTGGTGGTTATTTTTCTCTTGTTAGTACAAATACATATTTAATAGATATATACACATTAAGTAGTTGAATAGGAAATAAGACAAATAAGAGATGGGTAATTATTCCAATCTGTTCAAGTTAATATTAAAATCGATTAAAATCGTTAGCGGTTGGCATATACGGTTTACGATTAAATTTCCATTGTTGTTTTAATGATCCAGTACATGCAGTAAGTTGAACACTGGATTTTTCAATATTGATCTCT AACATTTTCCTTGATGACG                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AI975245             [TAAATAATTAAGTAAAGAAAATATATATTGAGCATTGCTTTTTTATTCATACATTGAATTACATATTTTGTTGGTAATGAAAAATAATAACCATAAACACCATGAGAAAGGCACAAAATCGAACTCATATTGGTTATCTAATTTTTTTTTTATAATGATTGTAATTTTTCACCTATTTATATTACGTAACTGTTATCACAGATAATGAGAATGATATGTTATCACTAGGCTTGACCAATTTACACATCGTTTGTTTATACATACATATATATATATAGATACGGATCTTGGAAGCTCACACAAAAAAGAAATGAAATTGATAGATAGCAGAATATAACATTTGTGTACTTTCTTCTCTATTCAGATTTTACATCTAAGGAAAGACATTGCTGCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD116008             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACATGNTTGTTCTTGTTGTTGGT GGTGGTGGT GTTATTTTTCTCTTGTTAGTACAAATACATATTTAATAGATATATACACATTAAGTAGTTGAATAGGAAATAAGACAAATAAGAGATGGGTAATTATTCCAATCTGTTCAAGTTAATATTAAAATCGATTAAAATCGTTAGCGGTTGGCATATACGGTTTACGATTAAATTTCCATTGTTGTTTTAATGATCCAGTACATGCAGTAAGTTGAACACTGGATTTTTCAATATTGATCTCTAAACATTTTCCTGGATGACGAATAGTATCGTCCTGTTAAAAAAAGTAGTTTAAGAAACATTTATTGATAGTTGAAATCATGAGTCAATTGAAGCTAGATCACCAAGGAAAACCTGGAAACACTGGACGTCCGTTTCGTCCTATTATGGGACTCCTCAGCAGTGCGCATCCACGATCCCGCACCCGCGAGATTCGAACCCAGGACCTACCAGCTTCGCGCCGGAGCACTTAATCGATAAACCACTGAGCCGGCATCCA]




>consensus_7380#0
TAAATAATTAAGTAAAGAAAATATATATTGAGCATTGTTTTTTTATTCATACATTGAATT
ACATATTTTGTTGGTAATGAAAAATAATAACCATAAACACCATGAGAAAGGCACAAAATC
GAACTCATATTGGTTATCTAATTTTTTTTTTATAATGATTGTAATTTTTCACCTATTTAT
ATTACGTAACTGTTATCACAGATAATGAGAATGATATGTTATCACTAGGCTTGACCAATT
TACACATCGTTTGTTTATACATACATATATATATATAGATACGGATCTTGGAAGCACACA
CAAAAAAGAAATGAAATTGATAGATAGCAGAATATAACATTTGTGTACTTTCTTCTCTAT
TCAGATTTTACATCTAAGGAAAGACATTGTTGTTCTTGTTGGTGGTGGGTGGTGGTGGTT
ATTTTTCTCTTGTTAGTACAAATACATATTTAATAGATATATACACATTAAGTAGTTGAA
TAGGAAATAAGACAAATAAGAGATGGGTAATTATTCCAATCTGTTCAAGTTAATATTAAA
ATCGATTAAAATCGTTAGCGGTTGGCATATACGGTTTACGATTAAATTTCCATTGTTGTT
TTAATGATCCAGTACATGCAGTAAGTTGAACACTGGATTTTTCAATATTGATCTCTAACA
TTTTCCTTGATGACGAATAGTATCGTCCTGTTAAAAAAAGTAGTTTAAGAAACATTTATT
GATAGTTGAAATCATGAGTCAATTGAAGCTAGATCACCAAGGAAAACCTGGAAACACTGG
ACGTCCGTTTCGTCCTATTATGGGACTCCTCAGCAGTGCGCATCCACGATCCCGCACCCG
CGAGATTCGAACCCAGGACCTACCAGCTTCGCGCCGGAGCACTTAATCGATAAACCACTG
AGCCGGCATCCA

consensusID : consensus_7380#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 704
fasta sequence

                              [CTGAAATGAAAATATGTTTTGAGTAATAACCACCGCAGGTTTTATGACGTTTGAAACTGACAGCTGGATGCGTTTGTATTATTCTCAGTGCTGATAAGCGAACTGAGACATAATTCCTGTATCTATAGTTTTAAACACCAAAGAATTATCCATTTAGATACTAAGTTTAGATAGCTATTAAATTGTTAAGTGAGTGCGGTGTCACGTAACTTAGTAGTTTTTAAAGAGGTAGTGGCTGAGTTCGAGTTCAATTTTCGTTAACGTCAACATAGGATGGAAGCATGGTCACCTGATGAGTTCCAGATAAGACGAAACGTATGTATTGGACTCTATTCCTAACGATTACTAACAATAAGACCATTCATTATATCAACTCTTTCTCCAATTTTCACTAAAATTATGGTCACTTCACTTGAATTCATAATTTTCATTAAAATTAACTGATTTCAATTCATATCTTTGTTTATTGTCATTAATCTGTTATCAGTCGATTCATTACGTAACCATCTTAGATTTGTTAACATTATGATTNTANATCACTAGTTTGATATTCTGGAGTT--CCCCCCCCCTCACACTTTATTTATCTGAAACGGATTTTTTATGACCTTATTGGCTCCATTGGCTCAGTGGTCTATCGGTTAAGTGCTCCGGTGCGAAGCCGGAAGGTCCTGGGTTCGAATCTCGCAAGTGCGGGATCGTGAATG]

[+] EMBL CD085375             [CTGAAATGAAAATATGTTTTGAGTAATAACCACCGCAGGTTTTATGACGTTTGAAACTGACAGCTGGATGCGTTTGTATTATTCTCAGTGCTGATAAGCGAACTGAGACATAATTCCTGTATCTATAGTTTTAAACACCAAAGAATTATCCATTTAGATACTAAGTTTAGATAGCTATTAAATTGTTAAGTGAGTGCGGTGTCACGTAACTTAGTAGTTTTTAAAGAGGTAGTGGCTGAGTTCGAGTTCAATTTTCGTTAACGTCAACATAGGATGGAAGCATGGTCACCTGATGAGTTCCAGATAAGACGAAACGTATGTATTGGACTCTATTCCTAACGATTACTAACAATAAGACCATTCATTATATCAACTCTTTCTCCAATTTTCACTAAAATTATGGTCACTTCACTTGAATTCATAATTTTCATTAAAATTAACTGATTTCAATTCATATCTTTGTTTATTGTCATTAATCTGTTATCAGTCGATTCATTACGTAACCATCTTAGATTTGTTAACATTATGATTNTANATCACTAGTTTGATATTCTGGAGTT  CCCCCCCCCTCACACTTTA                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD085046             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CCATTCATTATATCAACTCTTTCTCCAATTTTCACTAAAATTATGGTCACTTCACTTGAATTCATAATTTTCATTAAAATTAACTGATTTCAATTCATATCTTTGTTTATTGTCATTAATCTGTTATCAGTCGATTCATTACGTAACCATCTTAGATTTGTTAACATTATGATTTTAAATCACTAGTTTGATATTCTGGAGTTCCCCCCCCCCCTCACACTTTATTTATCTGAAACGGATTTTTTATGACCTTATTGGCTCCATTGGCTCAGTGGTCTATCGGTTAAGTGCTCCGGTGCGAAGCCGGAAGGTCCTGGGTTCGAATCTCGCAAGTGCGGGATCGTGAATG]




>consensus_7380#1
CTGAAATGAAAATATGTTTTGAGTAATAACCACCGCAGGTTTTATGACGTTTGAAACTGA
CAGCTGGATGCGTTTGTATTATTCTCAGTGCTGATAAGCGAACTGAGACATAATTCCTGT
ATCTATAGTTTTAAACACCAAAGAATTATCCATTTAGATACTAAGTTTAGATAGCTATTA
AATTGTTAAGTGAGTGCGGTGTCACGTAACTTAGTAGTTTTTAAAGAGGTAGTGGCTGAG
TTCGAGTTCAATTTTCGTTAACGTCAACATAGGATGGAAGCATGGTCACCTGATGAGTTC
CAGATAAGACGAAACGTATGTATTGGACTCTATTCCTAACGATTACTAACAATAAGACCA
TTCATTATATCAACTCTTTCTCCAATTTTCACTAAAATTATGGTCACTTCACTTGAATTC
ATAATTTTCATTAAAATTAACTGATTTCAATTCATATCTTTGTTTATTGTCATTAATCTG
TTATCAGTCGATTCATTACGTAACCATCTTAGATTTGTTAACATTATGATTNTANATCAC
TAGTTTGATATTCTGGAGTTCCCCCCCCCTCACACTTTATTTATCTGAAACGGATTTTTT
ATGACCTTATTGGCTCCATTGGCTCAGTGGTCTATCGGTTAAGTGCTCCGGTGCGAAGCC
GGAAGGTCCTGGGTTCGAATCTCGCAAGTGCGGGATCGTGAATG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_7380#0      TAAATAATTAAGTAAAGAAAATATATATTGAGCATTGTTTTTTTATTCATACATTGAATT 60
consensus_7380#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7380#0      ACATATTTTGTTGGTAATGAAAAATAATAACCATAAACACCATGAGAAAGGCACAAAATC 120
consensus_7380#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7380#0      GAACTCATATTGGTTATCTAATTTTTTTTTTATAATGATTGTAATTTTTCACCTATTTAT 180
consensus_7380#1      --------------------------------------CTGAAAT-----GAAAATATGT 17
                                                             ** ***         ** * *

consensus_7380#0      ATTACGTAACTGTTATCACAGATAATGAGAATGATATGTTATCACTAGGCTTGACCAATT 240
consensus_7380#1      TTTGAGTAATAACCACCGCAGGTTTTATGAC--GTTTGAAACTGACAG-CTGGATGCGTT 74
                       **  ****     * * *** *  *  **    * **  *     ** ** **    **

consensus_7380#0      TACAC-ATCGTTTGTTTATACATACATATATATATATAGATACGGATCTTGGAAGCACAC 299
consensus_7380#1      TGTATTATTCTCAGTGCTGATAAGCGAACTGAGACATAATTCCTGTATCTATAGTTTTAA 134
                      *  *  **  *  **    * *  *  *   * * ***  * * *    *  *     * 

consensus_7380#0      ACAAAAAAGAAATGAAATTGATAGATAGCAGAATATAACATTTGTGTACTTTCTTCTCTA 359
consensus_7380#1      ACACCAAAGAA-TTATCCATTTAGATACTAAGTTTAGATAGCTATTAAATTGTTAAGTGA 193
                      ***  ****** * *      ******  *   *   * *  * *  * **  *     *

consensus_7380#0      TTCAGATTTTACATCTAAGGAAAGACATTGTTGTTCTTGTTGGTGGTGGGTGGTGGTGGT 419
consensus_7380#1      GTGCGGTGTCACGT-------AACTTAGTAGTTTTTAAAGAGGTAGTGGCTG--AGTTCG 244
                       *  * * * ** *       **   * *  * **      *** **** **   **   

consensus_7380#0      TATTTTTCTCTTGTTAGTACAAATACATATTTAATAGATATATACACATTAAGTAGTTGA 479
consensus_7380#1      AGTTCAATTTTCGTTAACGTCAACATAGGATGGAAGCATGGTCAC---CTGATGAGTTCC 301
                        **    * * ****     ** * *   *  *   **    **    * *  ****  

consensus_7380#0      ATAGGAAATAAGACAAATAAGAGATGGGTAATTATTCCAATCTGTTCAAGTTAATATTAA 539
consensus_7380#1      AGATAAGACGAAACGTATG---TATTGGACTCTATTCCTAACGATT---ACTAACAATAA 355
                      * *  * *  * **  **     ** **    ****** * *  **     *** * ***

consensus_7380#0      AATCGATTAAAATCGTTAGCGGTTGGCATATACGGTTTACGATTAAATTTCCATTGTTGT 599
consensus_7380#1      GACCATTCATTAT-ATCAACTCTT----TCTCCAATTTTCACTAAAATT---ATGGTCAC 407
                       * *  * *  **  * * *  **    * * *  *** *  * *****   ** **   

consensus_7380#0      TTTAAT--GATCCAGTACATGCAGTAAGTTGAAC--ACTGGATTTTTCAATATTGATCTC 655
consensus_7380#1      TTCACTTGAATTCATAATTTTCATTAAAATTAACTGATTTCAATTCATATCTTTGTTTAT 467
                      ** * *   ** **  *  * ** ***  * ***  * *  * **   *   *** *   

consensus_7380#0      TAACATTTTCCTTGATGACGAATAGTATCGTCCTGTTAAAAAAAGTAGTTTAAGAAACAT 715
consensus_7380#1      TGTCATTAATCT--GTTATCAGTCGATTCATTACGT-AACCATCTTAGATTTGTTAACAT 524
                      *  ****   **   * *  * * *  ** *   ** **  *   *** **    *****

consensus_7380#0      T-TATTGATAGTTGAAATCATGAGTCAATTGAAGCTAGATCACCAAGGAAAACCTGGAAA 774
consensus_7380#1      TATGATTNTANATCACTAGTTTGATATTCTGGAGTTCCCCCCCCCTC-ACACTTTATTTA 583
                      * *  *  **  * *     *   *    ** ** *    * **    * *   *    *

consensus_7380#0      CACTGGACGTCCGTTTCGTCCTATTATGGGACTCCTCAGCAGTGCGCATCCACGATCCCG 834
consensus_7380#1      TCTGAAACGGATTTTTTATGACCTTATTGGCTCCATTGGCTCAGTGGTCTATCGGTTAAG 643
                            ***    ***  *    **** **   * *  **   * *      ** *   *

consensus_7380#0      CACCCGCGAGATTCGAACCCAGGACCTACCAGCTTCGCGCCG---GAGCACTTAATCGAT 891
consensus_7380#1      TGCTCC---GGTGCGAAGCCGGAAGGTCCTGGGTTCGAATCTCGCAAGTGCGGGATCG-T 699
                        * *    * * **** ** * *  * *  * ****   *     **  *   **** *

consensus_7380#0      AAACCACTGAGCCGGCATCCA 912
consensus_7380#1      GAATG---------------- 704
                       **