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Schistosoma mansoni
cluster # 7414 cluster # 7414       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7414#0 length = 649 sequences # 5  

consensusID : consensus_7414#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 649
fasta sequence
                              [GGNTGTAAAGNCAGAAAAAGGTTCGAAAACATCTGACAAGTTTGNAAACTAAGTCAACAGTTCATAACATTAACTCACGCAATCGTAACACGCAAAGAATAATATGGACTGTCACTTATACGAAAGAATTCCTCAAATACTCTGCTTCTCTAGCTGCATTTGGCACCTTTTGCTGGTTTGCTAAGGGACACCCTTTCGCAATTATGTTTGCGTCACTACTAATCGGCTTATATGTATATTTTCAGAGTATTAACT-TTGATTTTGTATTTACTAACCAAAAATAGACACTATTCCCTACTG-AATTTTGTAATTTTTCCCTAC-AAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGATACTATGAAAACAGGGGGACTATACTCTAACCATTTTTCTAAAGAACTTTGACTTGAGACTAATATCTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGACTACCAAATGTATTCACTTTATAAACTTGGTGAATTTCATGTGTTTTTGATATTGTCTATCTTCTCAAGTTTTTATCATTATACCTCAGATACGGTTAAATGTTACCTTTTTGTACAGAATCTATTCTATATTTTCCAAATTCGTGTCTATGTTTTGCTAATCATCCTCAAGATATCTTAATTGGTCAACA]

[+] EMBL SM7091               [GGNTGTAAAGNCAGAAAAAGGTTCGAAAACATCTGACAAGTTTGNAAACTAAGTCAACAGTTCATAACATTAACTCACGCAATCGTAACACGCAAAGAATAATATGGACTGTCACTTATACGAAAGAATTCCTCAAATACTCTGCTTCTCTAGCTGCATTTGGCACCTTTTGNTGGTTTGCTAAGGGACACCCTTTCGCAATTATGTTTGCGTCACTACTAATCGGCTTATATGTATATTTNCAGAGTATTAACTCTGGATTTCGNATTTACTAACCAAAAATAGACACTATTCCNTACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD075084             [                                                                                        CACGCAAAGAATAATATGGACTGTCCCTTATACGAAAGAATTCCTCAAATACTTTGGTTCTCTAGCTGCATTTGGCCCCTTTTGCTGGTTTGGTAAGGGACACCCTTTCGCAATTATGTTTGCGTCCCTACTAATCGGCTTATATGTATATTTTCAGAGTATTAACT TTGATTTTGTATTTACTAACCAAAAATAGACCCTATTCCCTACTG AATTTTGTAATTTTTCCCTAC AAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGATACTATGAAAACAGGGGGGCTATACTTTAACCCTTTTTTTAAAGAACTTTGAATTGAGACTAATATTTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGAGTACCAAATGTATTCCCTTTATA                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD160781             [                                                                                                                                                           GCATTTGGCACCTTTTGCTGGTTTGCTAAGGGACACCCTTTCGCAATTATGTTTGCGTCACTACTAATCGGCTTATATGTATATTTTCAGAGTATTAACT TTGATTTTGTATTTACTAACCAAAAATAGACACTATTCCCTACTG GATTTTGTAATTTTTCCCTAC AAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGATACTATGAAAACAGGGGGACTATACTCTAACCATTTTTCTAAAGAACTTTGACTTGAGACTAATATCTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGACTACCAAATGTATTCACTTTATAAACTTGGTGAATTTCATGTGTTTTTGATATTGTCTATCTTCTCAAGTTTTTATCATTACACCTCAGATACGGTTAAATGTTACCTTTTTGTACAGAATCTATTCTATATTTTCCAAATTCGTGTCTATGTTTTGCTAATCATCCTCAAGATATCTTAATTGGTCAACA]
[-] EMBL AI026169             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTCCCTACCGCCCCGGGGAAATTTTTCCCTAC AAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGATACTATGAAAACAGGGGGACTATACTCTAACCATTTTTCTAAAGAACTTTGACTTGAGACTAATATCTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGACTACCAAATGTATTCACTTTATAAACTTGGTGAATTTCATGTGTTTTTGATATTGTCTATCTTCTCAAGTTTTTATCATTATACCTCA                                                                                                       ]
[-] EMBL AI026168             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCCCTACAAAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGATACTATGAAAACA GGGGACTATACTCTAACCATTTTTCTAAAGAACTTTGACTTGAGACTAATATCTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGACTACCAAATGTATTCACTTTATAAACTTGGTGAATTTCATGTGTTTTGGATATTGTCTATCTTCTCAAGTTTTTATCATTATACCTCAag                                                                                                     ]


>consensus_7414#0 GGNTGTAAAGNCAGAAAAAGGTTCGAAAACATCTGACAAGTTTGNAAACTAAGTCAACAG TTCATAACATTAACTCACGCAATCGTAACACGCAAAGAATAATATGGACTGTCACTTATA CGAAAGAATTCCTCAAATACTCTGCTTCTCTAGCTGCATTTGGCACCTTTTGCTGGTTTG CTAAGGGACACCCTTTCGCAATTATGTTTGCGTCACTACTAATCGGCTTATATGTATATT TTCAGAGTATTAACTTTGATTTTGTATTTACTAACCAAAAATAGACACTATTCCCTACTG AATTTTGTAATTTTTCCCTACAAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGA TACTATGAAAACAGGGGGACTATACTCTAACCATTTTTCTAAAGAACTTTGACTTGAGAC TAATATCTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGACTACCAAATGTATTCACTTTAT AAACTTGGTGAATTTCATGTGTTTTTGATATTGTCTATCTTCTCAAGTTTTTATCATTAT ACCTCAGATACGGTTAAATGTTACCTTTTTGTACAGAATCTATTCTATATTTTCCAAATT CGTGTCTATGTTTTGCTAATCATCCTCAAGATATCTTAATTGGTCAACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)