These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7415#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1269 fasta sequence [CTCGCAGCCAAGAATTCGGCACGAGGTGTATGTGAATGCGGGTCATGCTTTCATGAAGAAATCCCTGTTAATGTGTTACCTAATAAATTCTTCACTGCTAAACCTGGAAAACTAGTATCTGCCATCAATACGTTAGTCGAAAATATCTGTAAACAAAAAGTTGGCTCCAACAACCCTATCCACTATGCTTCTAACANAATGAGTAAGATGACATCCAGTG-A-TTGAAGACAAGCAGTATTGGTGGAATAACTTATTGTTCGTACAAGGCGAAAAGTCGGAGTCCTTAACACCATGTACGCAAATTCTTCGAGCGTTAATCCGCTTCGAAGACGTCTATGCTAATAGTCNAAAAAACCGTTTGACCGAAATCATTAATATTTGTCGTTCGTGTGATCATAAAAAAAGACCAGACTATAAATCAACTCGTTTAAAATTTTATATTGGATTGAGTTCATACGTCAACAGTATCGATATGTTTTGTTGGTGTCCTGGTTCACGAGATATTGCCTTTGAATATGTTCTAGCTTGGAGTAATCTACTCATAAATGAGACTGGTTCACAAGATATCGGCCGTAGTAATCTGGCTCCAGAATCATTTGGTGTGATTGAGAATTGGGCCGAATATTTATCAACGGGAAAATTAAGTTCAAAATCTTCTAGATTTATTCAAGTAGAACCAGAACCTCCTAGCATCTTTCATGAGCTCGATTCATCTAATGTTTCTGAAAATCCTATACATCTTGCTACAAAAGAGATCGTTATAGCTAAAAATCCCGAAGCAGAAACTACTAATTCTCATAACAATTCTAGGCATAGATCGGTAACTTTAATTATCGATACTGGTGAATCGTGTACTGTAGAAGAAAAATTGATGAATACAAATCCTGAGTTGTACAAATTGAGCAAAGTATGGGAATCTGTTGTTGCTAAACAACTAGAAAATGTGAATAATACAATTGTATACAAAATTGGCGAACCACTTGACTCATTGATCACATCAATTACCAAGTATTGGGGACATANTCGATGTACAATATGTTCAGAAAGTAATTAATATGAAAGTTAATTCAGTTTCCCTTTTTATTATTTATTCAATGTCTAATATTTTTTTAAACCTTCCCCAACCAAAGTTAACTTAAACAATACCAGTGATTATCTGACTGATGTTAAGTATTTTCTTTACTAATCATAAGATTAATGCATAGTTTTGTATTTTGCTATTTTATTTATCAAGGGGAGTTACATTTCTCAAGAAATAAATTTTGTTTT] [+] EMBL CD078177 [CTCGCAGCCAAGAATTCGGCACGAGGTGTATGTGAATGCGGGTCATGCTTTCATGAAGAAATCCCTGTTAATGTGTTACCTAATAAATTCTTCACTGCTAAACCTGGAAAACTAGTATCTGCCATCAATACGTTAGTCGAAAATATCTGTAAACAAAAAGTTGGCTCCAACAACCCTATCCACTATGCTTCTAACANAATGAGTAAGATGACATCCAGTGCAGTTGAAGACAAGCAGTATTGGTGGAATAACTTATTGTTCGT ] [-] EMBL CD123720 [ ATGAAGAAATCCCTGTTAATGTGTTACCTAATAAATTCTTCACTGCTAAACCTGCAGAACTAGTATCTGCCATCAATACGTTAGTCGAAAATATCTGTAAACAAAAAGTTGGCTCCAACAACCCTATCCACTATGCTTCTAACAAAATGAGTAAGATGACGGCCAGTGCAGTTGAAGACAAGCAGTATTGGTGGAATAACTTATTGTTCGTACAAGGCGAAAAGTCGGAGTCCTTAACACCATGTACGCAAATTCTTCGAGCGTTAATCCGCTTCGAAGACGTCTATGCTAATAGTCNAAAAAACCGTTTGACCGAAATCATTAATATTTGTCGTTCGTGTGATCAT AAAAAAGACCACACTAT AATCAACTCaag ] [+] EMBL CD126252 [ TGACATCCAGTG A TTGAAGACAAGCAGTATTGGTGGAATAACTTATTGTTCGTACAAGGCGAAAAGTCGGAGTCCTTAACACCATTTACGCTTATTCTTCGAGCGTTAATCCGCTTCGAAGACCTCTATGTTAATAGTCGAAGAAACTGTTTGACCGAAATCATTAATATTTGTCGTTCGTGTGATCATAAAAAAAGACCAGACTATAAATCAACTCGTTTAAAATTTTATATTGGATTGAGTTCATACGTCAACAGTATCGATATGTTTTGTTGGTGTCCTGGTTCACGAGATATTGCCTTTGAATATGTTCTAGCTTGGAGTAATCTACTCATAAATGAGACTGGTTCACAAGATATCGGCCGTAGTAATCTGGCTCCAGAATCATTTGGTGTGATTGAGAATTGGGCCGAATATTTATCAACGG ] [+] EMBL CD082430 [ gCGAAATCATTAATATTTGTCGTTCGTGTGATCATAAAAAAAGACCAGACTATAAATCAACTCGTTTAAAATTTTATATTGGATTGAGTTCATACGTCAACAGTATCGATATGTTTTGTTGGTGTCCTGGTTCACGAGATATTGCCTTTGAATATGTTCTAGCTTGGAGTAATCTACTCATAAATGAGACTGGTTCACAAGATATCGGCCGTAGTAATCTGGCTCCAGAATCATTTGGTGTGATTGAGAATTGGGCCGAATATTTATCAACGGGAAAATTAAGTTCAAAATCTTCTAGATTTATTCAAGTAGAACCAGAACCTCCTAGCATCTTTCATGAGCTCGATTCATCTAATGTTTCTGAAAATCCTATACATCTTGCTACAAAAGAGATCGTTATAGCTAAAAATCCCGAAGCAGAAACTACTAATTCTCATAACAATTCTAGGCATAGATCGGTAACTTTAATTATCGATACTGGTGAATCGTGTACTGTAGAAGAAAAATTGATGAATACAAATCCTGAGTTGTACAAATTGAGCAAAGTATGGGAATCTGTTGTTGCTAAACAACTAGAAAATGTGAATAATACAATTGTATACAAAATTGGCGAACCACTTGACTCATTGATCACATCAATTACCAAGTATTGGGGACATANTCGATGTA ] [-] EMBL CD076029 [ CCTATACATCTTGCTACAAAAGAGATCGTTATAGCTAAAAATCCCGAAGCAGAAACTACTAATTCTCATAACAATTCTAGGCATAGATCGGTAACTTTAATTATCGATACTGGTGAATCGTGTACTGTAGAAGAAAAATTGATGAATACAAATCCTGAGTTGTACAAATTGAGCAAAGTATGGGAATCTGTTGTTGCTAAACAACTAGAAAATGTGAATAATACAATTGTATACAAAATTGGCGAACCACTTGACTCATTGATCACATCAATTACCAAGTATTGGGGACATAATCGATGTACAATATGTTCAGAAAGTAATTAATATGAAAGTTAATTCAGTTTCCCTTTTTATTATTTATTCAATGTCTAATATTTTTTTAAACCTTCCCCAACCAAAGTTAACTTAAACAATACCAGTGATTATCTGACTGATGTTAAGTATTTTCTTTACTAATCATAAGATTAATGCATAGTTTTGTATTTTGCTATTTTATTTATCAAGGGGAGTTACATTTCTCAAGAAATAAATTTTGTTTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||