cluster # 7416

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Schistosoma mansoni
cluster # 7416 cluster # 7416 Sequences # 5 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_7416#0 length = 932 sequences # 1

consensus_7416#1 length = 591 sequences # 4

consensusID : consensus_7416#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 932
fasta sequence

                              [CCAGAATTCGGCACGAGGGTTTAACCAATTCACGTGCATAAATATATTTGTATTAACAAGTCAACTGTGTATGTATTTGGATGTAACAATTCGTTTCAATATGTAATAATAATGATTAATATTAGGATATGTTTTATTTTTTCTAATCTTTTTTTGAAACAACTGTACTAATCTGTCCAATGTGCACCTTCATGACTTCTACAATATAATAATAGTAAAATGGTGTTAATATTTCTTTCTCTGGTAGAATATTAAGCAAATGTCCTTACTTCACTTTCTTCATTCGTTCTTTTTCATTAAAGAAATAAATATCTGTCTTAATAATAATAATGATAATAAACATGGAATCCTTGATACGTCGATGTATGGATTTATAGATTTGGACGGGTTTGGTGCGTGGTTATTGATGTACCATTGATGATACTCTCATTGACAACGATTACAATGTTCGGTTTTTCGTTTTCTTATGTTTGATTCATGATACCGCCTCTTTTAGAATACGGAAATTCAGAGCAAAGTTCCTTCGAAGTAGAGATTTTTCATTTGTTTTGTTTATATTATATATTATCTTTTGTGTTGTACTTAATAATCGTTGTCATACACTACTACTATTCATTTACTTTGTTGTTCTTGTGTCATTTGTAAACTAGTTNTATCCTTATCTATCTCTCTAGTTNTATTCTCTCTATTGGTCCGTTGAATATTTCTTGGGTCCCACTNNTCTTTTCTATNCTATCTCTACATGATAGTNGTTATTAGTATTTGNATATGTGTGTACATTGAATCTCACTTATTATACCTGCTGACATTATAAAAATTAGTGTGTGATAATTATACCGATTGAATAAAGAATNATATTGNNGATGTCAATCTTNATCACTTCGTCGTCTCCCTCCTCTTTCATGACGNAATGATGCTTGAATATCGTTACT]

[+] EMBL CD079933             [CCAGAATTCGGCACGAGGGTTTAACCAATTCACGTGCATAAATATATTTGTATTAACAAGTCAACTGTGTATGTATTTGGATGTAACAATTCGTTTCAATATGTAATAATAATGATTAATATTAGGATATGTTTTATTTTTTCTAATCTTTTTTTGAAACAACTGTACTAATCTGTCCAATGTGCACCTTCATGACTTCTACAATATAATAATAGTAAAATGGTGTTAATATTTCTTTCTCTGGTAGAATATTAAGCAAATGTCCTTACTTCACTTTCTTCATTCGTTCTTTTTCATTAAAGAAATAAATATCTGTCTTAATAATAATAATGATAATAAACATGGAATCCTTGATACGTCGATGTATGGATTTATAGATTTGGACGGGTTTGGTGCGTGGTTATTGATGTACCATTGATGATACTCTCATTGACAACGATTACAATGTTCGGTTTTTCGTTTTCTTATGTTTGATTCATGATACCGCCTCTTTTAGAATACGGAAATTCAGAGCAAAGTTCCTTCGAAGTAGAGATTTTTCATTTGTTTTGTTTATATTATATATTATCTTTTGTGTTGTACTTAATAATCGTTGTCATACACTACTACTATTCATTTACTTTGTTGTTCTTGTGTCATTTGTAAACTAGTTNTATCCTTATCTATCTCTCTAGTTNTATTCTCTCTATTGGTCCGTTGAATATTTCTTGGGTCCCACTNNTCTTTTCTATNCTATCTCTACATGATAGTNGTTATTAGTATTTGNATATGTGTGTACATTGAATCTCACTTATTATACCTGCTGACATTATAAAAATTAGTGTGTGATAATTATACCGATTGAATAAAGAATNATATTGNNGATGTCAATCTTNATCACTTCGTCGTCTCCCTCCTCTTTCATGACGNAATGATGCTTGAATATCGTTACT]




>consensus_7416#0
CCAGAATTCGGCACGAGGGTTTAACCAATTCACGTGCATAAATATATTTGTATTAACAAG
TCAACTGTGTATGTATTTGGATGTAACAATTCGTTTCAATATGTAATAATAATGATTAAT
ATTAGGATATGTTTTATTTTTTCTAATCTTTTTTTGAAACAACTGTACTAATCTGTCCAA
TGTGCACCTTCATGACTTCTACAATATAATAATAGTAAAATGGTGTTAATATTTCTTTCT
CTGGTAGAATATTAAGCAAATGTCCTTACTTCACTTTCTTCATTCGTTCTTTTTCATTAA
AGAAATAAATATCTGTCTTAATAATAATAATGATAATAAACATGGAATCCTTGATACGTC
GATGTATGGATTTATAGATTTGGACGGGTTTGGTGCGTGGTTATTGATGTACCATTGATG
ATACTCTCATTGACAACGATTACAATGTTCGGTTTTTCGTTTTCTTATGTTTGATTCATG
ATACCGCCTCTTTTAGAATACGGAAATTCAGAGCAAAGTTCCTTCGAAGTAGAGATTTTT
CATTTGTTTTGTTTATATTATATATTATCTTTTGTGTTGTACTTAATAATCGTTGTCATA
CACTACTACTATTCATTTACTTTGTTGTTCTTGTGTCATTTGTAAACTAGTTNTATCCTT
ATCTATCTCTCTAGTTNTATTCTCTCTATTGGTCCGTTGAATATTTCTTGGGTCCCACTN
NTCTTTTCTATNCTATCTCTACATGATAGTNGTTATTAGTATTTGNATATGTGTGTACAT
TGAATCTCACTTATTATACCTGCTGACATTATAAAAATTAGTGTGTGATAATTATACCGA
TTGAATAAAGAATNATATTGNNGATGTCAATCTTNATCACTTCGTCGTCTCCCTCCTCTT
TCATGACGNAATGATGCTTGAATATCGTTACT

consensusID : consensus_7416#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 591
fasta sequence

                              [GTTCGGTTTTTCGTTTTCTTATGTTTGATTCATGATACCGCCTCTTTTAGAATACGGAAATTCAGAGCAAAGTTCCTTCGAAGTAGAGATTTTTCATTTGTTTTGTTTATATTATATATTATCTTTTGTGTTGTACTTAATAATCGTTGTCATACACTACTACTATTCATTTACTTTGTTGTTCTTGTGTCATTTGTAAACTAGTTTTATCCTTATCTATCTCTCTAGTTTTATTCTCTCTATTGTTCCGTTGAATATTTCTTGTGTCCCACTTTCTTTTTCTATCTTATCTCTTACATGATAGTGTTTATTAAGTATTTGTATATGTGTGTACATTGAATTCTCACTTTATTATTAACCTGCTGACAATTTATAGAAATTAGTTGTTGTGATAAATTTATTACCGAATATGAAATAAATAGAAATTTATTATTTGTGT-ATTGTTTTCATATTCTTTTATTCATCTTTCCGTTCTGTTCTCCTCCTCTCCTCCTCTTTTTCTATTGACTGCGTATTTGTATATGTCTTTTTGTATATTATTCAGTTTATACCATAAATACAATCTATAATACTTAACGGGGTTTAGTTATT]

[-] EMBL CD074130             [GTTCGGTTTTTCGTTTTCTTATGTTTGATTCATGATACCGCCTCTTTTAGAATACGGAAATTCAGAGCAAAGTTCCTTCGAAGTAGAGATTTTTCATTTGTTTTGTTTATATTATATATTATCTTTTGTGTTGTACTTAATAATCGTTGTCATACACTACTACTATTCATTTACTTTGTTGTTCTTGTGTCATTTGTAAACTAGTTTTATCCTTATCTATCTCTCTAGTTTTATTCTCTCTATTGTTCCGTTGAATATTTCTTGTGTCCCACTTTCTTTTTCTATCTTATCTCTTACATGATAGTGTTTATTAAGTATTTGTATATGTGTGTACATTGAATTCTCACTTTATTATTAACCTGCTGACAATTTATAGAAATTAGTTGTTGTGATAAATTTATTACCGAATATGAAATAAATAGAAATTTATTATTTGTGT ATTGTTTTCATATTCTTTTATTCATCTTTCCGTTCTGTTTTCCTCCTCTCCTCCTCTTTTTTTATTGACTGCGTATTTGTATATGTCTTTTTGTATATTATTCAGTTTATACCATAAATACAATCT                          ]
[-] EMBL CD118632             [                                                                  GCAAAGTTCCTTCGAAGTAGAGATTTTTCATTTGTTTTGTTTATATTATATATTATCTTTTGTGTTGTACTTAATAATCGTTGTCATACACTACTACTATTCATTTACTTTGTTGTTCTTGTGTCATTTGTAAACTAGTTTTATCCTTATCTATCTCTCTAGTTTTATTCTCTCTATTGTTCCGTTGAATATTTCTTGTGTCCCACTTTCTTTTTCTATCTTATCTCTTACATGATAGTGTTTATTAAGTATTTGTATATGTGTGTACATTGAATTCTCACTTTATTATTAACCTGCTGACAATTTATAGAAATTAGTTGTTGTGATAAATTTATTACCGAATATGAAATAAATAGAAATTTATTATTTGTGT ATTGTTTTCATATTCTTTTATTCATCTTTCCGTTCTGTTCTCCTCCTCTCCTCCTCTTTTTC                                                                                          ]
[-] EMBL CD118702             [                                                                  GCAAAGTTCCTTCGAAGTAGAGATTTTTCATTTGTTTTGTTTATATTATATATTATCTTTTGTGTTGTACTTAATAATCGTTGTCATACACTACTACTATTCATTTACTTTGTTGTTCTTGTGTCATTTGTAAACTAGTTTTATCCTTATCTATCTCTCTAGTTTTATTCTCTCTATTGTTCCGTTGAATATTTCTTGTGTCCCACTTTCTTTTTCTATCTTATCTCTTACATGATAGTGTTTATTAAGTATTTGTATATGTGTGTACATTGAATTCTCACTTTATTATTAACCTGCTGACAATTTATAGAAATTAGTTGTTGTGATAAATTTATTACCGAATATGAAATAAATAGAAATTTATTATTTGTGT ATTGTTTTCATATTCTTTTATTCATCTTTCCGTTCTGTTCTCCTCCTCTCCTCCTCTTTTTC                                                                                          ]
[+] EMBL AI977154             [                                                                                                                                        TTAATAATCGTTGTCATACACTACTACTATTCATTTACTTTGTTGTTCTTGTGTCATTTGTAAACTAGTTTTATCCTTATCTATATCTCTAGTTTTATTCTCTCTATTGTTCCGGTGAATATTTCTTGTGTCCCACTTTCTTTATCTATCTTATCTCTTACATGATAGTGGTTATTAAGTATTTGTATATGTGTGTACATTGAATTCTCACTTTATTATTAACCTGCTGACAATTTATAGAAATTAGTTGTTGTGATAAATTTATTACCGAATATGAAATAAATAGAAATTTATTATTTGTGTGATTG TTTCATATTCTCTTATTCATCTTTCCGTTCTGTTCTGCTGCTCTCCTCCTATTTTTCTATTGACTGCGTATCTGTATATGTCTTTTTGTATATTATTCAGGTTATACCATAAATACAATCTATAATACTTAACGGGGTTTAGTTATT]




>consensus_7416#1
GTTCGGTTTTTCGTTTTCTTATGTTTGATTCATGATACCGCCTCTTTTAGAATACGGAAA
TTCAGAGCAAAGTTCCTTCGAAGTAGAGATTTTTCATTTGTTTTGTTTATATTATATATT
ATCTTTTGTGTTGTACTTAATAATCGTTGTCATACACTACTACTATTCATTTACTTTGTT
GTTCTTGTGTCATTTGTAAACTAGTTTTATCCTTATCTATCTCTCTAGTTTTATTCTCTC
TATTGTTCCGTTGAATATTTCTTGTGTCCCACTTTCTTTTTCTATCTTATCTCTTACATG
ATAGTGTTTATTAAGTATTTGTATATGTGTGTACATTGAATTCTCACTTTATTATTAACC
TGCTGACAATTTATAGAAATTAGTTGTTGTGATAAATTTATTACCGAATATGAAATAAAT
AGAAATTTATTATTTGTGTATTGTTTTCATATTCTTTTATTCATCTTTCCGTTCTGTTCT
CCTCCTCTCCTCCTCTTTTTCTATTGACTGCGTATTTGTATATGTCTTTTTGTATATTAT
TCAGTTTATACCATAAATACAATCTATAATACTTAACGGGGTTTAGTTATT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_7416#0      CCAGAATTCGGCACGAGGGTTTAACCAATTCACGTGCATAAATATATTTGTATTAACAAG 60
consensus_7416#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7416#0      TCAACTGTGTATGTATTTGGATGTAACAATTCGTTTCAATATGTAATAATAATGATTAAT 120
consensus_7416#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7416#0      ATTAGGATATGTTTTATTTTTTCTAATCTTTTTTTGAAACAACTGTACTAATCTGTCCAA 180
consensus_7416#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7416#0      TGTGCACCTTCATGACTTCTACAATATAATAATAGTAAAATGGTGTTAATATTTCTTTCT 240
consensus_7416#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7416#0      CTGGTAGAATATTAAGCAAATGTCCTTACTTCACTTTCTTCATTCGTTCTTTTTCATTAA 300
consensus_7416#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7416#0      AGAAATAAATATCTGTCTTAATAATAATAATGATAATAAACATGGAATCCTTGATACGTC 360
consensus_7416#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7416#0      GATGTATGGATTTATAGATTTGGACGGGTTTGGTGCGTGGTTATTGATGTACCATTGATG 420
consensus_7416#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7416#0      ATACTCTCATTGACAACGATTACAATGTTCGGTTTTTCGTTTTCTTATGTTTGATTCATG 480
consensus_7416#1      --------------------------GTTCGGTTTTTCGTTTTCTTATGTTTGATTCATG 34
                                                **********************************

consensus_7416#0      ATACCGCCTCTTTTAGAATACGGAAATTCAGAGCAAAGTTCCTTCGAAGTAGAGATTTTT 540
consensus_7416#1      ATACCGCCTCTTTTAGAATACGGAAATTCAGAGCAAAGTTCCTTCGAAGTAGAGATTTTT 94
                      ************************************************************

consensus_7416#0      CATTTGTTTTGTTTATATTATATATTATCTTTTGTGTTGTACTTAATAATCGTTGTCATA 600
consensus_7416#1      CATTTGTTTTGTTTATATTATATATTATCTTTTGTGTTGTACTTAATAATCGTTGTCATA 154
                      ************************************************************

consensus_7416#0      CACTACTACTATTCATTTACTTTGTTGTTCTTGTGTCATTTGTAAACTAGTTNTATCCTT 660
consensus_7416#1      CACTACTACTATTCATTTACTTTGTTGTTCTTGTGTCATTTGTAAACTAGTTTTATCCTT 214
                      **************************************************** *******

consensus_7416#0      ATCTATCTCTCTAGTTNTATTCTCTCTATTGGTCCGTTGAATATTTCTTGGGTCCCACTN 720
consensus_7416#1      ATCTATCTCTCTAGTTTTATTCTCTCTATTGTTCCGTTGAATATTTCTTGTGTCCCACTT 274
                      **************** ************** ****************** ******** 

consensus_7416#0      NTCTTTTCTATNCTATCTCT-ACATGATAGTNGTTATTA-GTATTTGNATATGTGTGTAC 778
consensus_7416#1      TCTTTTTCTATCTTATCTCTTACATGATAGTGTTTATTAAGTATTTGTATATGTGTGTAC 334
                         ********  ******* **********  ****** ******* ************

consensus_7416#0      ATTGAAT-CTCACTT-ATTAT--ACCTGCTGACA--TTATAAAAATTAGTG--TGTGATA 830
consensus_7416#1      ATTGAATTCTCACTTTATTATTAACCTGCTGACAATTTATAGAAATTAGTTGTTGTGATA 394
                      ******* ******* *****  ***********  ***** ********   *******

consensus_7416#0      A--TTAT-ACCGATTG---AATAAA--GAATNATATTGNNGATGT-CAATCTTNATCACT 881
consensus_7416#1      AATTTATTACCGAATATGAAATAAATAGAAATTTATTATTTGTGTATTGTTTTCATATTC 454
                      *  **** ***** *    ******  ***   ****     ***    * ** **    

consensus_7416#0      TCGTCGTCTCCCTCCTCTTTCATGACGNAATGATGCTTGAATATCGTTACT--------- 932
consensus_7416#1      TTTTATTCATCTTTCCGTTCTGTTCTCCTCCTCTCCTCCTCTTTTTCTATTGACTGCGTA 514
                      *  *  **  * * *  **   *          * **    * *   ** *         

consensus_7416#0      ------------------------------------------------------------
consensus_7416#1      TTTGTATATGTCTTTTTGTATATTATTCAGTTTATACCATAAATACAATCTATAATACTT 574
                                                                                  

consensus_7416#0      -----------------
consensus_7416#1      AACGGGGTTTAGTTATT 591