These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7436#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 739 fasta sequence [CAATAACACGCTAAGAATTATAAAGACACGTAATGCCAACCTCTGATATACATATTAAATATCGGGAAGTTAAAGAAAACTTTGAAAATTACTTCAATACATTCGTCAATCTGTTACGTCATGTTCATCCAAAAAGTCTTGAATTGGCCGAACAACATTTCCAAAATGTAACGTCGTATAATTTATCCAGTGGCAAACGAATTCGAGGAGTGTTGGTTGTCCTTTCGTATATGGTGTTCAGCAATAAAAAT-GAGAACTCTAGAAAAAACTTGTCATGTGTTTATCTTATTGGTTGGTGTGTCGAATTGTTACACGCAGGATATCTTGTTTTGGATGATATAATTGACAATTCCACCCTTAGACGAGGCCAACCGTGTTGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAGTTAATGATGGTTTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTGAAAATCAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTGGAAAGACAAA-AAT-ACGTATATCTCAAATTATGCAAGTTGTTTGATGAAATTAGTTACAAGACATGTTCNTGGTCAATGTTNTGGATGTACTATGCATCAAATCCTAATAACCAATGTATTTTGGACAGAAAACAGAATAATTTGGAGTTTGATAGTCTTACTCGAAACTACTCACCTGATGTCTTTGAAGCTATAACACACTGGAAGACGGGTTTTTATACTTTTATT] [+] EMBL AI975950 [CAATAACACGCTAAGAATTATAAAGACACGTAATGCCAACCTCTGATATACATATTAAATATCGGGAAGTTAAAGAAAACTTTGAAAATTACTTCAATACATTTGTCAATCTGTTACGTCATGTTCATCCAAAAAGTATTGAATTGGCCGAACAACAATTCCAAAATGTAACGTCGTATAATTTATCCAGCGGCAAACGAATTCGAGGAGTGTTGGTTGTACTTTCGCATATGGGGTTCAACCATTAAAATGGAGAACTCTAGAAAAACCTGGTCATGTGATTATCTTATAGGTCGGTGTGTCGAATTGTTACACGCAGGATATCTTGTATTGGATGATAAAATTGACAATTCCACCCTTAGACGAGGCCAACCGAGATGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAGTTAATGATGGTCTACATCTGATTATATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTGAAAATCAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTG ] [+] EMBL AI975181 [ ATAACACGCTAAGAATTATAAAGACACGTAATGCCAACCTCTGATATACATATTAAATATCGGGAAGTTAAAGAAAACTTTGAAAATTACTTCAATACATTCGTCAATCTGTTACGTCATGTTCATCCAAAAAGTCTTGAATTGGCCGAACAACATTTCCAAAATGTAACGTCGTATAATTTATCCAGTGGCAAACGAATTCGAGGAGTGTTGGTTGTCCTTTCGTATATGGTGTTCAGCAATAAAAAT GAGAACTCTAGAAAAAACTTGTCATGTGTTTATCTTATTGGTTGGTGTGTCGAATTGTTACACGCAGGATTTCTTGTTTTGGATGATATAATTGACAATTCCACCCTTAGACGAGGCCAACCGTGTTGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAGTTAATGATGGTTTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTGAAAATCAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTGGAAAGACAAACAAT ACGTATATCT ] [+] EMBL AI976367 [ ATAACACGCTAAGAATTATAAAGACACGTAATGCCAACCTCTGATATACATATTAAATATCGGGAAGTTAAAGAAAACTTTGAAAATTACTTCAATACATTCGTCAATCTGTTACGTCATGTTCATCCAAAAAGTCTTGAATTGGCCGAACAACATTTCCAAAATGTAACGTCGTATAATTTATCCAGTGGCAAACGAATTCGAGGAGTGTTGGTTGACCTTTCGTATATGGTGTTCAGCAATAAAAAT GAGAACTCTAGAAAAAACTTGTCATGTGTTTATCTTATTGGTTGGTGTGTCGAATTGTTACACGCAGGATATCTTGTTTTGGATGATATAATTGACAATTCCACCCTTAGACGAGGCCAACCGTGTTGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAGTTAATGATGGTGTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTGAAAAATAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTGGAAAGAC ] [-] EMBL CD111586 [ TCGAATTGTTACACGCAGGATTTCTTGTTTTGGATGATATAATTGACAATTCCACCCTTAGACGAGGCCAACCGTGTTGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAGTTAATGATGGTTTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTGAAAATCAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTGGAAAGACAAA AATAACGTATATCTCAAATTATGCAAGTTGTTTGATGAAATTAGTTACAAGACATGTTCNTGGTCAATGTTNTGGATGTACTATGCATCAAA ] [-] EMBL CD184584 [ GAGTTAATGATGGTTTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGGTCCACTCATTATTTGCTGAAAATCAAAGTGATGTTGATTTATATTCGTGGAAAGACAAA AATAACGTATATCTCAAATTATGCAAGTTGTTTGATGAAATTAGTTACAAGACATGTTC TGGTCAATGTT TGGATGTACTAT CATCAAATCCTAATAACCAATGTATTTTGGACAGAAAACAGAATAATTTGGAGTTTGATAGTCTTACTCGAAACTACTCACCTGATGTCTTTGAAGCTATAACACACTGGAAGACGGGTTTTTATACTTTTATT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||