Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7436 cluster # 7436       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7436#0 length = 739 sequences # 5  

consensusID : consensus_7436#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 739
fasta sequence
                              [CAATAACACGCTAAGAATTATAAAGACACGTAATGCCAACCTCTGATATACATATTAAATATCGGGAAGTTAAAGAAAACTTTGAAAATTACTTCAATACATTCGTCAATCTGTTACGTCATGTTCATCCAAAAAGTCTTGAATTGGCCGAACAACATTTCCAAAATGTAACGTCGTATAATTTATCCAGTGGCAAACGAATTCGAGGAGTGTTGGTTGTCCTTTCGTATATGGTGTTCAGCAATAAAAAT-GAGAACTCTAGAAAAAACTTGTCATGTGTTTATCTTATTGGTTGGTGTGTCGAATTGTTACACGCAGGATATCTTGTTTTGGATGATATAATTGACAATTCCACCCTTAGACGAGGCCAACCGTGTTGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAGTTAATGATGGTTTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTGAAAATCAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTGGAAAGACAAA-AAT-ACGTATATCTCAAATTATGCAAGTTGTTTGATGAAATTAGTTACAAGACATGTTCNTGGTCAATGTTNTGGATGTACTATGCATCAAATCCTAATAACCAATGTATTTTGGACAGAAAACAGAATAATTTGGAGTTTGATAGTCTTACTCGAAACTACTCACCTGATGTCTTTGAAGCTATAACACACTGGAAGACGGGTTTTTATACTTTTATT]

[+] EMBL AI975950             [CAATAACACGCTAAGAATTATAAAGACACGTAATGCCAACCTCTGATATACATATTAAATATCGGGAAGTTAAAGAAAACTTTGAAAATTACTTCAATACATTTGTCAATCTGTTACGTCATGTTCATCCAAAAAGTATTGAATTGGCCGAACAACAATTCCAAAATGTAACGTCGTATAATTTATCCAGCGGCAAACGAATTCGAGGAGTGTTGGTTGTACTTTCGCATATGGGGTTCAACCATTAAAATGGAGAACTCTAGAAAAACCTGGTCATGTGATTATCTTATAGGTCGGTGTGTCGAATTGTTACACGCAGGATATCTTGTATTGGATGATAAAATTGACAATTCCACCCTTAGACGAGGCCAACCGAGATGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAGTTAATGATGGTCTACATCTGATTATATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTGAAAATCAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTG                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AI975181             [  ATAACACGCTAAGAATTATAAAGACACGTAATGCCAACCTCTGATATACATATTAAATATCGGGAAGTTAAAGAAAACTTTGAAAATTACTTCAATACATTCGTCAATCTGTTACGTCATGTTCATCCAAAAAGTCTTGAATTGGCCGAACAACATTTCCAAAATGTAACGTCGTATAATTTATCCAGTGGCAAACGAATTCGAGGAGTGTTGGTTGTCCTTTCGTATATGGTGTTCAGCAATAAAAAT GAGAACTCTAGAAAAAACTTGTCATGTGTTTATCTTATTGGTTGGTGTGTCGAATTGTTACACGCAGGATTTCTTGTTTTGGATGATATAATTGACAATTCCACCCTTAGACGAGGCCAACCGTGTTGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAGTTAATGATGGTTTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTGAAAATCAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTGGAAAGACAAACAAT ACGTATATCT                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AI976367             [  ATAACACGCTAAGAATTATAAAGACACGTAATGCCAACCTCTGATATACATATTAAATATCGGGAAGTTAAAGAAAACTTTGAAAATTACTTCAATACATTCGTCAATCTGTTACGTCATGTTCATCCAAAAAGTCTTGAATTGGCCGAACAACATTTCCAAAATGTAACGTCGTATAATTTATCCAGTGGCAAACGAATTCGAGGAGTGTTGGTTGACCTTTCGTATATGGTGTTCAGCAATAAAAAT GAGAACTCTAGAAAAAACTTGTCATGTGTTTATCTTATTGGTTGGTGTGTCGAATTGTTACACGCAGGATATCTTGTTTTGGATGATATAATTGACAATTCCACCCTTAGACGAGGCCAACCGTGTTGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAGTTAATGATGGTGTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTGAAAAATAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTGGAAAGAC                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD111586             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCGAATTGTTACACGCAGGATTTCTTGTTTTGGATGATATAATTGACAATTCCACCCTTAGACGAGGCCAACCGTGTTGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAGTTAATGATGGTTTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTGAAAATCAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTGGAAAGACAAA AATAACGTATATCTCAAATTATGCAAGTTGTTTGATGAAATTAGTTACAAGACATGTTCNTGGTCAATGTTNTGGATGTACTATGCATCAAA                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD184584             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAGTTAATGATGGTTTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGGTCCACTCATTATTTGCTGAAAATCAAAGTGATGTTGATTTATATTCGTGGAAAGACAAA AATAACGTATATCTCAAATTATGCAAGTTGTTTGATGAAATTAGTTACAAGACATGTTC TGGTCAATGTT TGGATGTACTAT CATCAAATCCTAATAACCAATGTATTTTGGACAGAAAACAGAATAATTTGGAGTTTGATAGTCTTACTCGAAACTACTCACCTGATGTCTTTGAAGCTATAACACACTGGAAGACGGGTTTTTATACTTTTATT]


>consensus_7436#0 CAATAACACGCTAAGAATTATAAAGACACGTAATGCCAACCTCTGATATACATATTAAAT ATCGGGAAGTTAAAGAAAACTTTGAAAATTACTTCAATACATTCGTCAATCTGTTACGTC ATGTTCATCCAAAAAGTCTTGAATTGGCCGAACAACATTTCCAAAATGTAACGTCGTATA ATTTATCCAGTGGCAAACGAATTCGAGGAGTGTTGGTTGTCCTTTCGTATATGGTGTTCA GCAATAAAAATGAGAACTCTAGAAAAAACTTGTCATGTGTTTATCTTATTGGTTGGTGTG TCGAATTGTTACACGCAGGATATCTTGTTTTGGATGATATAATTGACAATTCCACCCTTA GACGAGGCCAACCGTGTTGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAG TTAATGATGGTTTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTG AAAATCAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTGGAAAGACAAAAATACGTATATCTCAAATT ATGCAAGTTGTTTGATGAAATTAGTTACAAGACATGTTCNTGGTCAATGTTNTGGATGTA CTATGCATCAAATCCTAATAACCAATGTATTTTGGACAGAAAACAGAATAATTTGGAGTT TGATAGTCTTACTCGAAACTACTCACCTGATGTCTTTGAAGCTATAACACACTGGAAGAC GGGTTTTTATACTTTTATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)