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Schistosoma mansoni
cluster # 7482 cluster # 7482       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7482#0 length = 761 sequences # 5  

consensusID : consensus_7482#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 761
fasta sequence
                              [GACCGCTCCAACATTAGAATGGTAACACGGTTCAGTAAAGGCTCTTAAAATTGAAGCGAGTGGAGATAACTTTGGTGTGTTTTTACGCAGTCCACTTAGTTTCCGTCCTGTTCAACGCACGCTACCTTCTCTTGCTTTCCTTCTCCCGGATTCTCGTTTGTGGTCACCAACCGAACCTCTTATTATAACACCAACAACAAACTATTCTGCTCATGACTACGAACGTTTCTTTCGTGATGTCAATTATTCAATCGGTTTCCAGATGATGTCGGACAGTAAATCTATAATTGATACACTCGAAAAACCAAGTGATATTGATGAAATCTATTGTATTCATGGGGCAAATTTGAGTACTACTGACAAAATGATTTATTCACCGCCCAATTTCTTTCATGGTGGATTCCCAGATCAAGTGCCGACTTTAATTCCTGGAAATGGTGATGGAACTGTTAGCCTACGTAGTTTAGAAGTCTGTAAACGTTGGCCTGGTATAAAATATTTCGTGTTACCTGGGGCTGAACATGTAAATATTATGGGAGATCCTCGTTTTATTGATATTATTCGTCAAATTGTTGGTGCTAATACAACTAAGACATTAAACTGTTGTTAGTTATTTTCTTCACTTTATTGTTTACTTCTTCACTGTAATAAGATTCTCATTTCATTCAATTTCCACNNNTATANTCGAANNTATTGTTACACTATGTGATGGNGGTCAAGGTAGACTGCNAAGTATTAGACACATGATCGATCAGATCATT]

[+] EMBL CD075932             [GACCGCTCCAACATTAGAATGGTAACACGGTTCAGTAAAGGCTCTTAAAATTGAAGCGAGTGGAGATAACTTTGGTGTGTTTTTACGCAGTCCACTTAGTTTCCGTCCTGTTCAACGCACGCTACCTTCTCTTGCTTTCCTTCTCCCGGATTCTCGTTTGTGGTCACCAACCGAACCTCTTATTATAACACCAACAACAAACTATTCTGCTCATGACTACGAACGTTTCTTTCGTGATGTCAATTATTCAATCGGTTTCCAGATGATGTCGGACAGTAAATCTATAATTGATACACTCGAAAAACCAAGTGATATTGATGAAATCTATTGTATTCATGGGGCAAATTTGAGTACTACTGACAAAATGATTTATTCACCGCCCAATTTCTTTCATGGTGGATTCCCAGATCAAGTGCCGACTTTAATTCCTGGAAATGGTGATGGAACTGTTAGCCTACGTAGTTTAGAAGTCTGTAAACGTTGGCCTGGTATAAAATATTTCGTGTTACCTGNGGCTGAACATGTAAATATTATGGGAGATCCTCGTTNTATTGATATTATTCGTCAAATTGTTGGTGC                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD181012             [                         ggCGGTTCAGTAAAGGCTCTTAAAATTGAAGCGAGTGGAGATAACTTTGGTGTGTTTTTACGCAGTCCACTTAGTTTCCGTCCTGTTCAACGCACGCTACCTTCTCTTGCTTTCCTTCTCCCGGATTCTCGTTTGTGGTCACCAACCGAACCTCTTATTATAACACCAACAACAAACTATTCTGCTCATGACCACGAACGTTTCTTTCGTGATGTCAATTATTCAATCGGTTTCCAGATGATGTCGGACAGTAAATCTATAATTGATACACTCGAAAAACCAAGTGATATTGATGAAATCTATTGTATTCATGGGGCAAATTTGAGTACTACTGACAAAATGATTTATTCACCGCCCAATTTCTTTCATGGTGGATTCCCAGATCAAGTGCCGACTTTAATTCCTGGAAATGGTGATGGAACTGTTAGCCTACGTAGTTTAGAAGTCTGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD068882             [                                   TAAAGGCTCTTAAAATTGAAGCGAGTGGAGATAACTTTGGTGTGTTTTTACGCAGTCCACTTAGTCTCCGTCCTGTTCAACGCACGCTACCTTCTCTTGCTTTCCTTCTCCCGGATTCTCGTTTGTGGTCACCAACCGAACCTCTTATTATAACACCAACAACAAACTATTCTGCTCATGACTACGAACGTTTCTTTCGTGATGTCAATTATTCAATCGGTTTCCAGATGATGTCGGACAGTAAATCTATAATTGATACACTCGAAAAACCAAGTGATATTGATGAAATCTATTGTATTCATGGGGCAAATTTGAGTACTACTGACAAAATGATTTATTCACCGCCCAATTTCTTTCATGGTGGATTCCCAGATCAAGTGCCGACTTTAATTCCTGGAAATGGTGATGGAACTGTTAGCCTACGTAGTTTAGAAGTCTGTAAACGTTGGCCTGGTATAAAATAT                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD082334             [                                                                                                                                              CTCCCGGATTCTCGTTTGTGGTCACCAACCGAACCTCTTATTATAACACCAACAACAAACTATTCTGCTCATGACTACGAACGTTTCTTTCGTGATGTCAATTATTCAATCGGTTTCCAGATGATGTCGGACAGTAAATCTATAATTGATACACTCGAAAAACCAAGTGATATTGATGAAATCTATTGTATTCATGGGGCAAATTTGAGTACTACTGACAAAATGATTTATTCACCGCCCAATTTCTTTCATGGTGGATTCCCAGATCAAGTGCCGACTTTAATTCCTGGAAATGGTGATGGAACTGTTAGCCTACGTAGTTTAGAAGTCTGTAAACGTTGGCCTGGTATAAAATATTTCGTGTTACCTGGGGCTGAACATGTAAATATTATGGGAGATCCTCGTTTTATTGATATTATTCGTCAAATTGTTGGTGCTAATACAACTAAGACATTAAACTGTTGTTAGTTATTTTCTTCACTTTATTGTTTACTTCTTCACTGTAATAAGATTCTCATTTCATTCAA                                                                                            ]
[+] EMBL CD196225             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCCAGATCAAGTGCCGACTTTAATTCCTGGAAATGGTGATGGAACTGTTAGCCTACGTAGTTTAGAAGTCTGTAAACGTTGGCCTGGTATAAAATATTTCGTGTTACCTGGGGCTGAACATGTAAATATTATGGGAGATCCTCGTTTTATTGATATTATTCGTCAAATTGTTGGTGCTAATACAACTAAGACATTAAACTGTTGTTAGTTATTTTCTTCACTTTATTGTTTACTTCTTCACTGTAATAAGATTCTCATTTCATACNATTTCCACNNNTATANTCGAANNTATTGTTACACTATGTGATGGNGGTCAAGGTAGACTGCNAAGTATTAGACACATGATCGATCAGATCATT]


>consensus_7482#0 GACCGCTCCAACATTAGAATGGTAACACGGTTCAGTAAAGGCTCTTAAAATTGAAGCGAG TGGAGATAACTTTGGTGTGTTTTTACGCAGTCCACTTAGTTTCCGTCCTGTTCAACGCAC GCTACCTTCTCTTGCTTTCCTTCTCCCGGATTCTCGTTTGTGGTCACCAACCGAACCTCT TATTATAACACCAACAACAAACTATTCTGCTCATGACTACGAACGTTTCTTTCGTGATGT CAATTATTCAATCGGTTTCCAGATGATGTCGGACAGTAAATCTATAATTGATACACTCGA AAAACCAAGTGATATTGATGAAATCTATTGTATTCATGGGGCAAATTTGAGTACTACTGA CAAAATGATTTATTCACCGCCCAATTTCTTTCATGGTGGATTCCCAGATCAAGTGCCGAC TTTAATTCCTGGAAATGGTGATGGAACTGTTAGCCTACGTAGTTTAGAAGTCTGTAAACG TTGGCCTGGTATAAAATATTTCGTGTTACCTGGGGCTGAACATGTAAATATTATGGGAGA TCCTCGTTTTATTGATATTATTCGTCAAATTGTTGGTGCTAATACAACTAAGACATTAAA CTGTTGTTAGTTATTTTCTTCACTTTATTGTTTACTTCTTCACTGTAATAAGATTCTCAT TTCATTCAATTTCCACNNNTATANTCGAANNTATTGTTACACTATGTGATGGNGGTCAAG GTAGACTGCNAAGTATTAGACACATGATCGATCAGATCATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)