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Schistosoma mansoni
cluster # 7505 cluster # 7505       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7505#0 length = 1272 sequences # 5  

consensusID : consensus_7505#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1272
fasta sequence
                              [AGCGATCTGTATCAGAAAACTTATGTCAAAAAGATGTGTGCTGCTGATGATGATAGTGAATAACTAGTGATGTGCAAGTAGTAGTTTAAAGCGATTGCAAACACTGAATTAATGAATACTAAAATGACAAGAAGCATAACGTATTGTTGGTGTTGTGTTGCTTTTTACAATAAAGACAGGAAAAACAAAGCTAGTTAGTATACATTGTGTAATGACAGAGACAAACGACTGATTGTCGAAGAAAAATGTTCAAAAAATGAGAGAATTATAACAATCCACAAATGGTATATATATATATGAAGAGACAAAACTAAACTAATAAATGTATATAGAATATGGGGA-AATAAGAAATTAAT-AATAAACGGTGCTCTAATTCACTTATCCCTGTTCGTCGTTACACTGTAGTAGTAGCATAAAGCAACACAGATTATTGTAGTTGCAATAGTAACAAACTCTACGTGCGATGATTAGCTTTGTCATTTGATGATTTGTGTGTAGTTGTTGTTGCTGTAGTGTTAGTAGAAGAATCGTTTTGTTGTAATGTAGTCATACCATTACTTTCAGAGTTCGAACCAGGCGATTTGCTGGCTGCTGGCGTCCCACCATTATTACTATTGTTGGTGTTATTACAACCGCCATTGTTGTTACCAGTGCCGTTATTATTATTACTATTATTTGAAGTTTTAGAAACATGATTGGTGGAAGAATTATTTGAAACTGACAAATTAGTATTGTTATTATTAGTTGTATTATTATTATTGTTGTTATTATTATTATTATTTGCAGATGAGCTTTTTCCAGTAGTGTTATTATTCCCGGCCACATTGTTATATTTTTCCAATTTAGCTATAATATGCTTGCCATAATTAAATTTGCGTAGAACATTTTGCATAGGACGGATTCGATTAATTAATACACGACGTTGTTCAGTATCGGCTAATTCTAGCATACGTTGAACTACATAATTTGCATATTGATCTTTCATCATATCAACTAATGATGAAGAGATGTTATTAGTTGTTACTGACGAGGTGTCTCCATTAATATTCACATTAGAAATTGGATGTAAAATTTCTTCAATTAATACAGCTCTTTCAGATGGTACAGCGTTGGCAATTGCTTTCTCCATAACATTCGATGCAAATTTATGCGAACTTAAAGCACATACACGACCACGTAGATTTTGAATAATACGTGATTTATCCTCATTTGAACCATGCTCTAAAACATGTTGAATGACGTAGTTGCCGTACTGATCTTTGAATAAATGTT]

[+] EMBL CD187828             [AGCGATCTGTATCAGAAAACTTATGTCAAAAAGATGTGTGCTGCTGATGATGATAGTGAATAACTAGTGATGTGCAAGTAGTAGTTTAAAGCGATTGCAAACACTGAATTAATGAATACTAAAATGACAAGAAGCATAACGTATTGTTGGTGTTGTGTTGCTTTTTACAATAAAGACAGGAAAAACAAAGCTAGTTAGTATACATTGTGTAATGACAGAGACAAACGACTGATTGTCGAAGAAAAATGTTCAAAAAATGAGAGAATTATAACAATCCACAAATGGTATATATATATATGAAGAGACAAAACTAAACTAATAAATGTATATAGAATATGGGGA AATAAGAAATTAAT AATAAACGGTGCTCTAATTCACTTATCCCTGTTCGTCGTTACACTGTAGTAGTAGCATAAAGCAACACAGATTATTGTAGTTGCAATAGTAACAAACTCTACGTGCGATGATTAGCTTTGTCATTTGATGATTTGTGTGTAGTTGTTGTTGCTGTAGTGTTAGTAGAAGAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD069146             [                                                                                                                                                     GTGTTGTGTTGCTTTTTACAATAAAGACAGGAAAAACAAAGCTAGTTAGTATACATTGTGTAATGACAGAGACAAACGACTGGTTGTCGAAGAAAAATGTTCAAAAAATGAGAGAATTATAACAATCCACAAATGGTATATATATATATGAAGAGACAAAACTAAACTAATAAATGTATATAGAATATGGGGACAATAAGACATTACTCACTAAACGGTGCTCTAATTCACTTATCCCTGTTCGTCGTTACACTGTAGTAGTAGCATAAAGCAACACAGATTATTGTAGTTGCAATAGTAACAAACTCTACGTGCGATGATTAGCTTTGTCATTTGATGATTTGTGTGTAGTTGTTGTTGCTGTAGTGTTAGTAGAAGAATCGTTTTGTTGTAATGTAGTCATACCATTACTTTCAGAGTTCGAACCAGGCGATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD152084             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGTAGTAGTAGCATAAAGCAACACAGATTATTGTAGTTGCAATAGTAACAAACTCTACGTGCGATGATTAGCTTTGTCATTTGATGATTTGTGTGTAGTTGTTGTTGCTGTAGTGTTAGTAGAAGAATCGTTTTGTTGTAATGTAGTCATACCATTACTTTCAGAGTTCGAACCAGCCGATTTGCTGGCTGCTGGCGTCCCACCATTATTACTATTGTTGGTGTTATTACAACCGCCATTGTTGTTACCAGTGCCGTTATTATTATTACTATTATTTGAAGTTTTAGAAACATGATTGGTGGAAGAATTATTTGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD146086             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTACTATTATTTGAAGTTTTAGAAACATGATTGGTGGAAGAATTATTTGAAACTGACAAATTAGTATTGTTATTATTAGTTGTATTATTATTATTGTTGTTATTATTATTATTATTTGCAGATGAGCTTTTTCCAGTAGTGTTATTATTCCCGGCCACATTGTTATATTTTTCCAATTTAGCTATAATATGCTTGCCATAATTAAATTTGCGTAGAACATTTTGCATAGGACGGATTCGATTAATTAATACACGACGTTGTTCAGTATCGGCTAATTCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL AI975784             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAATT AATTTGCGTAGAACATTTTGCATAGGACGGATTCGATTAATTAATACACGACGTTGTTCAGTATCAGCTAATTCTAGCATACGTTGAACTACATAATTTGCATATTGATCTTTCATCATATCAACTAATGATGAAGAGATGTTATTAGTTGTTACTGACGAGGTGTCTCCATTAATATTCACATTAGAAATTGGATGTAAAATTTCTTCAATTAATACAGCTCTTTCAGATGGTACAGCGTTGGCAATTGCTTTCTCCATAACATTCGATGCAAATTTATGCGAACTTAAAGCACATACACGACCACGTAGATTTTGAATAATACGTGATTTATCCTCATTTGAACCATGCTCTAAAACATGTTGAATGACGTAGTTGCCGTACTGATCTTTGAATAAATGTT]


>consensus_7505#0 AGCGATCTGTATCAGAAAACTTATGTCAAAAAGATGTGTGCTGCTGATGATGATAGTGAA TAACTAGTGATGTGCAAGTAGTAGTTTAAAGCGATTGCAAACACTGAATTAATGAATACT AAAATGACAAGAAGCATAACGTATTGTTGGTGTTGTGTTGCTTTTTACAATAAAGACAGG AAAAACAAAGCTAGTTAGTATACATTGTGTAATGACAGAGACAAACGACTGATTGTCGAA GAAAAATGTTCAAAAAATGAGAGAATTATAACAATCCACAAATGGTATATATATATATGA AGAGACAAAACTAAACTAATAAATGTATATAGAATATGGGGAAATAAGAAATTAATAATA AACGGTGCTCTAATTCACTTATCCCTGTTCGTCGTTACACTGTAGTAGTAGCATAAAGCA ACACAGATTATTGTAGTTGCAATAGTAACAAACTCTACGTGCGATGATTAGCTTTGTCAT TTGATGATTTGTGTGTAGTTGTTGTTGCTGTAGTGTTAGTAGAAGAATCGTTTTGTTGTA ATGTAGTCATACCATTACTTTCAGAGTTCGAACCAGGCGATTTGCTGGCTGCTGGCGTCC CACCATTATTACTATTGTTGGTGTTATTACAACCGCCATTGTTGTTACCAGTGCCGTTAT TATTATTACTATTATTTGAAGTTTTAGAAACATGATTGGTGGAAGAATTATTTGAAACTG ACAAATTAGTATTGTTATTATTAGTTGTATTATTATTATTGTTGTTATTATTATTATTAT TTGCAGATGAGCTTTTTCCAGTAGTGTTATTATTCCCGGCCACATTGTTATATTTTTCCA ATTTAGCTATAATATGCTTGCCATAATTAAATTTGCGTAGAACATTTTGCATAGGACGGA TTCGATTAATTAATACACGACGTTGTTCAGTATCGGCTAATTCTAGCATACGTTGAACTA CATAATTTGCATATTGATCTTTCATCATATCAACTAATGATGAAGAGATGTTATTAGTTG TTACTGACGAGGTGTCTCCATTAATATTCACATTAGAAATTGGATGTAAAATTTCTTCAA TTAATACAGCTCTTTCAGATGGTACAGCGTTGGCAATTGCTTTCTCCATAACATTCGATG CAAATTTATGCGAACTTAAAGCACATACACGACCACGTAGATTTTGAATAATACGTGATT TATCCTCATTTGAACCATGCTCTAAAACATGTTGAATGACGTAGTTGCCGTACTGATCTT TGAATAAATGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)