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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7561#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 911 fasta sequence
[GCGTTATTCAATCCCCGTGAATCATTCGAAGATTGTTCTTCCGTCGTTGTGGATGTTTTCTTTCAGCTTTTAATTGTCTATATTTAATTGCTTCCTCTTCTAAACGTTTCCTATCCGCTTCTAATTTGTTTACATTAACTGGGCGTTTCGGTCGACTGCTACTAGAAGTCGTCGTAACTGAAAAAGATTTAGAAGTTTCATGATTTCCTTCATCAGCAAGTATATTGAATTGCTT-ATTATTCAAGTCTTCAGAGGTTGGCCTAACTTCACCAAGTTCAGTATCATGCCAACGCTTCAAACTAGTTACAGAGTCAATACGAGAAGCAGGAAGTATAGGTGGCTCACCATCATCATCATAACAATAGCCTTTGTTCATATGGTTATCATCATATGGAGCAGTAATGTCATTATTATCATCGCCGCCATCAGATTTTCCAGTACAGCCAAACTGACGGGTCTGTGGTGATGATGAATAAGTTGCATTACGTTCAGTAATTGGATCTGAATTTTCTTCAAAATCTAATGGATCATTTTCCATCTCTTGTAATAGCAGAGATGGTTTCGATTTAAAATGTTTACTTAACTGTTGTGATACGTCCATAGTGATTTGTGGAGGTGAATGATTCATTACATCATATTCATCTAACGAATTTGTATGTGATTGTTGTTGTTGACAATCAGCTTCAAACAAATCTTCCATAGTTGGATCCATATCACTATCATCGGGTATATCAGGTTTAGTTTCAATTATACTAGGAATTGACGATACATTTTTTTGCTGAACTGATGGTTCTGATAATGATGGTAATACAGAAGAAGACGAAGATTGAAGTAATGATGAATGAAGATTTGATTGACTAGAAATAGAATTAAACGAACCTATTGGTTGTATAGAATGAGATGTAAATGAA]
[-] EMBL SMAA17934 [GCGTTATTCAATCCCCGTGAATCATTCGAAGATTGTTCTTCCGTCGTTGTGGATGTTTTC TTCAGC TTTAATTGCCAATATATAATGGCTCCCTCTTCTAAACGTTTCCTATCCGCTTCCAATTTGTTTACATTAACTGGGCGTTTCGGTCGACTGCTACTAGAAGTCGTCGTAACTGAAAAAGATTTAGAAGTTTCATGATTCCCTTCATCAGCAAGTATATTGAATTGCTTAATAATTCAAGTCTTCAGAGGTTGGCCTAACTTCACCAAGTTCAGTATCATGCCAACGCTTCAAACTAGTTACAGAGTCAATACGAGAAGCAGGAAGT ]
[+] EMBL CD153479 [ TTTTCTTTCAGCTTTTAATTGTCTATATTTAATTGCTTCCTCTTCTAAACGTTTCCTATCCGCTTCTAATTTGTTTACATTAACTGGGCGTTTCGGTCGACTGCTACTAGAAGTCGTCGTAACTGAAAAAGATTTAGAAGTTTCATGATTTCCTTCATCAGCAAGTATATTGAATTGCTT ATTATTCAAGTCTTCAGAGGTTGGCCTAACTTCACCAAGTTCAGTATCATGCCAACGCTTCAAACTAGTTACAGAGTCAATACGAGAAGCAGGAAGTATAGGTGGCTCACCATCATCATCATAACAATAGCCTTTGTTCATATGGTTATCATCATATGGAGCAGTAATGTCATTATTATCATCGCCGCCATCAGATTTTCCAGTACAGCCAAACTGACGGGTCTGTGGTGATGATGAATAAGTTGCATTACGTTCAGTAATTGGATCTGAATTTTCTTCANAATCTAATGGATCATTTTCCATCTCTTGTAATAGCAGAGATGGTTTCGATTTAAAATGTTTACTTAACTGTTGTGATACGTCCATAGTGATTTGTGGAGGTGAATGATTCA ]
[+] EMBL CD153112 [ TTTTCTTTCAGCTTTTAATTGTCTATATTTAATTGCTTCCTCTTCTAAACGTTTCCTATCCGCTTCTAATTTGTTTACATTAACTGGGCGTTTCGGTCGACTGCTACTAGAAGTCGTCGTAACTGAAAAAGATTTAGAAGTTTCATGCTTTCCTTCATCAGCAAGTATATTGAATTGCTT ATTATTCAAGTCTTCAGAGGTTGGCCTAACTTCACCAAGTTCAGTATCATGCCAACGCTTCAAACTAGTTACAGAGTCAATACGAGAAGCAGGAAGTATAGGTGGCTCACCATCATCATCATAACAATAGCCTTTGTTCATATGGTTATCATCATATGGAGCAGTAATGTCATTATTATCATCGCCGCCATCAGATTTTCCAGTACAGCCAAACTGACGGGTCTGTGGTGATGATGAATAAGTTGCATTACGTTCAGTAATTGGATCTGAATTTTCTTCAAAATCTAATGGATCATTTTCCATCTCTTGTAATAGCAGAGATGGTTTCGATTTAAAATGTTTACTTAACTGTTGTGATACGTCCATA ]
[-] EMBL CD124639 [ TTCAAAATCTAATGGATCATTTTCCATCTCTTGTAATAGCAGAGATGGTTTCGATTTAAAATGTTTACTTAACTGTTGTGATACGTCCATAGTGATTTGTGGAGGTGAATGATTCATTACATCATATTCATCTAACGAATTTGTATGTGATTGTTGTTGTTGACAATCAGCTTCAAACAAATCTTCCATAGTTGGATCCATATCACTATCATCGGGTATATCAGGTTTAGTTTCAATTATACTAGGAATTGACGATACATTTTTTTGCTGAACTGATGGTTCTGATAATGATGGTAATACAGAAGAAGACGAAGATTGAAGTAATGATGAATGAAGATTTGATTGACTAGAAATAGAATTAAACGAACCTATTGGTTGTATAGAATGAGATGTAAATGAA]
[-] EMBL CD124637 [ TTCAAAATCTAATGGATCATTTTCCATCTCTTGTAATAGCAGAGATGGTTTCGATTTAAAATGTTTACTTAACTGTTGTGATACGTCCATAGTGATTTGTGGAGGTGAATGATTCATTACATCATATTCATCTAACGAATTTGTATGTGATTGTTGTTGTTGACAATCAGCTTCAAACAAATCTTCCATAGTTGGATCCATATCACTATCATCGGGTATATCAGGTTTAGTTTCAATTATACTAGGAATTGACGATACATTTTTTTGCTGAACTGATGGTTCTGATAATGATGGTAATACAGAAGAAGACGAAGATTGAAGTAATGATGAATGAAGATTTGATTGACTAGAAATAGAATTAAACGAACCTATTGGTTGTATAGAATGAGATGTAAATGAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||