cluster # 7564

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Schistosoma mansoni
cluster # 7564 cluster # 7564 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7564#0 length = 627 sequences # 5

consensusID : consensus_7564#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 627
fasta sequence

                              [TTGAGTAATATGATTGATAAATTGACGAATGACTATTTGTTCTTCTTCTAAACTACTTGTAGTTATATTTAATTCACGTCGAATACGTTCAGCTATTTGTTGTGTATCACCAGTACCAACTTGGATCCAACTTGGATGAAAATCTGAACTAGTTGTTATCTTATCAGCTTCATTCA-TTTTTTGAATGATCGAATTAAAATGAACATCATTTTCACGGATACTTTTTAATAAAGAAGAGAATTGATTAGCTAATTCTAATCGTAATTGAATAATTTGCCTATAACGTGTCCAACAAGATGATAGTTCATTTAAACGATCCTGTGCACTTGATCGACCAGCAGGTGGTGACAGTCGACCAATTGCAATTCTTAATTCCTCTAAATCAGGTTCTCTAGATTGCAGTTCACGTTGAAGACGACGATGAACGTCTCCAAAATCAGCTACTTGTTCAACTGTTGTGCCATACCTTCCATACTCCACGAGTGAACGATGAATCCTTTGACTTAACCACATGCTCAGTTCATTTAGCCGGAATTCTGTTTCTTCACGTTTTTGTATTTTAATATTCAATTCTTTATGTTGATTCAACAGATCTCGGCATCTAGTAATTCCTTCGTCTACTTCACG]

[+] EMBL CD189933             [TTGAGTAATATGATTGATAAATTGACGAATGACTATTTGTTCTTCTTCTAAACTACTTGTAGTTATATTTAATTCACGTCGAATACGTTCAGCTATTTGTTGTGTATCACCAGTACCAACTTGGATCCAACTTGGATGAAAATCTGAACTAGTTGTTATCTTATCAGCTTCATTCA TTTTTTGAATGATCGAATTAAAATGAACATCATTTTCAagaagc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD195564             [      AATATGATTGATAAATTGACGAATGACTATTTGTTCTTCTTCTAAACTACTTGTAGTTATATTTAATTCACGTCGAATACGTTCAGCTATTTGTTGTGTATCACCAGTACCAACTTGGATCCAACTTGGATGAAAATCTGAACTAGTTGTTATCTTATCAGCTTCATTCA TTTTTTGAATGATCGAATTAAAATGAACATCATTTTCACGGATACTTTTTAATAAAGAAGAGAATTGATTAGCTAATTCTAATCGTAATTGAATAATTTGCCTATAACGTGTCCAACAAGATGATAGTTCATTTAAACGATCCTGTGCACTTGATCGACCAGCAGGTGGTGACAGTCGACCAATTGCAATTCTTAATTCCTCTAAATCAGGTTCTCTAGATTGCAGTTCACGTTGAAGACGATGATGAACGTCTCCAAAATCAGCTACTTGTTCAACT                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD195503             [       ATATGATTGATAAATTGACGAATGACTATTTGTTCTTCTTCTAAACTACTTGTAGTTATATTGAATTCACGTCGAATACGTTCAGCTATTTGTTGTGTATCACCAGTACCAACTTGGATCCAACTTGGATGAAAATCTGAACTAGTTGTTATCTTATCAGCTTCATTCATTTTTTTGAATGATCGAATTAAAATGAACATCATTTTCACGGATACTTTTTAATAAAGAAGAGAATTGATTAGCTAATTCTAATCGTAATTGAATAATTTGCCTATAACGTGTCCAACAAGATGATAGTTCATTTAAACGATCCTGTGCACTTGATCGACCAGCAGGTGGTGACAGTCGACCAATTGCAATTCTTAATTCCTCTAAATCAG                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD193263             [                                                       CTTGTAGTTATATTTAATTCACGTCGAATACGTTCAGCTATTTGTTGTGTATCACCAGTACCAACTTGGATCCAACTTGGATGAAAATCTGAACTAGTTGTTATCTTATCAGCTTCATTCA TTTTCTGAATGATCGAATTAAAATGAACATCATTTTCACGGATACTTTTTAATAAAGAAGAGAATTGATTAGCTAATTCTAATCGTAATTGAATAATTTGCCTATAACGTGTCCAACAAGATGATAGTTCATTTAAACGATCCTGTGCACTTGATCGACCAGCAGGTGGTGACAGTCGACCAATTGCAATTCTTAATTCCTCTAAATCAGGTTCTCTAGATTGCAGTTCACGTTGAAGACGACGATGAACGTCTTCAAAATCAGCTACTTGTTCAACTGTTGTGCCATACCTTCCATACTCCACGAGTGAACGATGAATCCTTTGACTTAACCACATGCTCAGTTCATTTAGCCGGAATTCTGTTTCTTCACGTTTTTGTATTTTAATATTCAATTCTTTATGTTGATTCAACAGATCTCGGCATCTAGTAATTCCTTCGTCTACTTCAC ]
[-] EMBL CD191777             [                                                                                                   TTGTGTATCACCAGTACCAACTTGGATCCAACTTGGATGAAAATCTGAACTAGTTGTTATCTTATCAGCTTCATTCA TTTTTTGAATGATCGAATTAAAATGAACATCATTTTCACGGATACTTTTTAATAAAGAAGAGAATTGATTAGCTAATTCTAATCGTAATTGAATAATTTGCCTATAACGTGTCCAACAAGATGATAGTTCATTTAAACGATCCTGTGCACTTGATCGACCAGCAGGTGGTGACAGTCGACCAATTGCAATTCTTAATTCCTCTAAATCAGGTTCTCTAGATTGCAGTTCACGTTGAAGACGACGATGAACGTCTCCAAAATCAGCTACTTGTTCAACTGTTGTGCCATACCTTCCATACTCCACGAGTGAACGATGAATCCTTTGACTTAACCACATGCTCAGTTCATTTAGCCGGAATTCCGTTTCTTCACGTTTTTGTATTTTAATATTTAATTCTTTATGTTGATTCAACAGATTTCGGCATCTAGTAATTCCTTCGTCTACTTCACG]




>consensus_7564#0
TTGAGTAATATGATTGATAAATTGACGAATGACTATTTGTTCTTCTTCTAAACTACTTGT
AGTTATATTTAATTCACGTCGAATACGTTCAGCTATTTGTTGTGTATCACCAGTACCAAC
TTGGATCCAACTTGGATGAAAATCTGAACTAGTTGTTATCTTATCAGCTTCATTCATTTT
TTGAATGATCGAATTAAAATGAACATCATTTTCACGGATACTTTTTAATAAAGAAGAGAA
TTGATTAGCTAATTCTAATCGTAATTGAATAATTTGCCTATAACGTGTCCAACAAGATGA
TAGTTCATTTAAACGATCCTGTGCACTTGATCGACCAGCAGGTGGTGACAGTCGACCAAT
TGCAATTCTTAATTCCTCTAAATCAGGTTCTCTAGATTGCAGTTCACGTTGAAGACGACG
ATGAACGTCTCCAAAATCAGCTACTTGTTCAACTGTTGTGCCATACCTTCCATACTCCAC
GAGTGAACGATGAATCCTTTGACTTAACCACATGCTCAGTTCATTTAGCCGGAATTCTGT
TTCTTCACGTTTTTGTATTTTAATATTCAATTCTTTATGTTGATTCAACAGATCTCGGCA
TCTAGTAATTCCTTCGTCTACTTCACG

clustalw multiple alignements is not computed in this case