These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7573#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 939 fasta sequence [ATTAAAAACCACTAATATGTAAAAGAATCTCGTATGAGAAACACTTTGACAACATACCGAAAGTTTTTGATATAAGTTTTTAATATTTATGGACTGTATACTTTGTATTCGTTTGTTTCACCTGATTACTTTACTTAATACTGTGAGCTCATTCTGATGTGAATACTAGTCATCACAACGTTTCAATACATCCATAAAGTTTCTTTTGCTTCTTATGTCTAACCACATCACATAGATAACGGAAACACCTATTATTGGATGAAAATATCTAAATGCAACCATTAACAAATAAAAAGGTCGTTAAAAACTTCTCAACTAAGTGTACACTGAAAACAGTAACTAGATATAAAAGTTTCGCTTTATAAGGATAAAGTGTGAAAATCAACAGATAATCACTTTGTAGACAAAGTGTTTTCTTAACCTACATATCTATTAATTGTAACTAGTTGACTGTGAGTGTAGTAATCCAAGTCATTTCATACTGTTTTCCCTTGTGTTGTTCTATATGGCATAATATGTCCAGTTTCTTATAGTGTTTCATGGTTTATGTTTTCTAAAAAATCATTCATGGTAACTAATCTAATGCTTTTTTTATTTGACCTGAACAAAACGGAAACGTTAGCCAATCTTCCCTTTAAGCAATCATGATCACTTTTAACTAACTGATCTTTGCTTATAAATATAAAACGTATAGACCACGTTATTAAACAGCTATTTTAGTTTACTATTCATTGTTGTTCTTTAAAATAGGTTCCATAATTTGTATATTAGTGGCTAGTGCATTTTTTTTCTAAATTTAAATAGGTTATTCACTTGAATAAATTTTCTATATAACGATATGAAAATTGCCAAAGAAGAAAATTCTCCATCATATTAACATATAGATATATGTGTGCTCTGATGTGAAAATCAAAAGTCATTCATACGTATCTATTTTAT] [+] EMBL CD088669 [ATTAAAAACCACTAATATGTAAAAGAATCTCGTATGAGAAACACTTTGACAACATACCGAAAGTTTTTGATATAAGTTTTTAATATTTATGGACTGTATACTTTGTATTCGTTTGTTTCACCTGATTACTTTACTTAATACTGTGAGCTCATTCTGATGTGAATACTAGTCATCACAACGTTTCAATACATCCATAAAGTTTCTTTTGCTTCTTATGTCTAACCACATCACATAGATAACGGAAACACCTATTATTGGATGAAAATATCTAAATGCAACCATTAACAAATAAAAAGGTCGTTAAAAACTTCTCAACTAAGTGTACACTGAAAACAGTAACTAGATATAAAAGTTTCGCTTTATAAGGATAAAGTGTGAAAATCAACAGATAATCACTTTGTAGACAAAGTGTTTTCTTAACCTACATATCTATTAATTGTAACTAGTTGACTGTGAGTGTAGTAATCCAAGTCATTTCATACTGTTTTCCCTTGTGTTGTTCTATATGGCATAATATGTCCAGTTTCTTATAGTGTTTCATGGTTTATGTTTTCTAAAAAATCATTCATGGTAACTAATCTA ] [+] EMBL CD088630 [ATTAAAAACCACTAATATGTAAAAGAATCTCGTATGAGAAACACTTTGACAACATACCGAAAGTTTTTGATATAAGTTTTCAATATTTATGGACTGTATACTTTGTATTCGTTTGTTTCACCTGATTACTTTACTTAATACTGTGAGCTCATTCTGATGTGAATACTAGTCATCACAACGTTTCAATACATCCATAAAGTTTCTTTTGCTTCTTATGTCTAACCACATCACATAGATAACGGAAACACCTATTATTGGATGAAAATATCTAAATGCAACCATTAACAAATAAAAAGGTCGTTAAAAACTTCTCAACTAAGTGTACACTGAAAACAGTAACTAGATATAAAAGTTTCGCTTTATAAGGATAAAGTGTGAAAATCAACAGATAATCACTTTGTAGACAAAGTGTTTTCTTAACCTACATATCTATTAATTGTAACTAGTTGACTGTGAGTGTAGTAATCCAAGTCATTTCATACTGTTTTCCCTTGTGTTGTTCTATATGGCATAATATGTCCAGTTTCTTATAGTGTTTCATGGgt ] [-] EMBL CD088627 [ tnTATAAGGATANAGTGTGANAATCAACAGATAATCACTTTGTAGACAAAGTGTTTTCTTAACCTACATATCTATTAATTGTAACTAGTTGACTGTGAGTGTAGTAATCCAAGTCATTTCATACTGTTTTCCCTTGTGTTGTTCTATATGGCATAATATGTCCAGTTTCTTATAGTGTTTCATGGTTTATGTTTTCTAAAAAATCATTCATGGTAACTAATCTAATGCTTTTTTTATTTGACCTGAACAAAACGGAAACGTTAGCCAATCTTCCCTTTAAGCAATCATGATCACTTTTAACTAACTGATCTTTGCTTATAAATATAAAACGTATAGACCACGTTATTAAACAGCTATTTTAGTTTACTATTCATTGTTGTTCTTTAAAATAGGTTCCATAATTTGTATATTAGTGGCTAGTGATTTTTTTTTCTAAATTTAAATAGGTTATTCAGTTGAATAAATTTTCTATATAACGATATGAAAATTGCCAAAGAAGAAAATTCTCCATCATATTAACATATAGATATATGTGTGCTCTGGTGTGAAAATCAAAAGTCATTCATACGTATCTATTTTAT] [-] EMBL CD088633 [ AGGATAAAGTGTGAAAATCAACAGATAATCACTTTGTAGACANAGTGTTTTCTTAACCTACATATCTATTAATTGTAACTAGTTGACTGTGAGTGTAGTAATCCAAGTCATTTCATACTGTTTTCCCTTGTGTTGTTCTATATGGCATAATATGTCCAGTTTCTTATAGTGTTTCATGGTTTATGTTTCCTAAAAAATCATTCATGGTAACTAATCTAATGCTTTTTTTATTTGACCTGAACAAAACGGAAACG TAGCCAATCTTCCCTTTAAGCAATCATGATCACTTTTAACTAACTGATCTTTGCTTATAAATATAAAACGTATAGACCACGTTATTAAACAGCTATTTTAGTTTACTATTCATTGTTGTTCTTTAAAATAGGTTCCATAATTTGTATATTAGTGGCTAGTGCATTTTTTTTCTAAATTTAAATAGGTTATTCACTTGAATAAATTTTCTATATAACGATATGAAAATTGCCAAAGAAGAAAATTCTCCATCATATTAACATATAGATATATGTGTGCTCTGATGTGAAAATCAAAAGTCATTCATACGTATCTATTTTAT] [-] EMBL CD088717 [ TAATCACTTGNTAGACAAAGTGTTTTCTTAACCTACATATCTATTAATTGTAACTAGTTGACTGTGAGTGTAGTAATCCAAGTCATTTCATACTGTTTTCCCTTGTGTTGTTCTATATGGCATAATATGTCCAGTTTCTTATAGTGTTTCATGGTTTATGTTTTCTAAAAAATCATTCATGGTAACTAATCTAATGCTTTTTTTATTTGACCTGAACAAAACGGAAACGTTAGCCAATCTTCCCTTTAAGCAATTATGATCACTTTTAACTAACTGATCTTTGCTTATAAATATAAAACGTATAGACCACGTTATTAAACAGCTATTTTAGTTTACCATTCATTGTTGTTCTTTAAAATAGGTTCCATAATTTGTATATTAGTGGCTAGTGCATTTTTTTTCTAAATTTAAATAGGTTATTCACTTGAATAAATTTTCTATATAACGATATGAAAATTGCCAAAGAAGAAAATTCTCCATCATATTAACATATAGATATATGTGTGCTCTGATGTGAAAAACAAAAGTCATTCATACGTATCTATTTTAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||