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Schistosoma mansoni
cluster # 7578 cluster # 7578       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7578#0 length = 1064 sequences # 5  
consensusID : consensus_7578#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1064
fasta sequence 
                              [CGGCACGAGGCAGAAGTCTAGATAACATTTCAGTTGAAACGAAAGTTTTATATANAAAATCCAGCTTCCATGGGAGTCAAATATTTAAATCAGCTCCTGTTTGGTCAATTCTAATTTGTCATGTTTGTTTCAATTGGTCTTTTTATTCATTA-ATTACATCTATGCCTACTTATATGTGTCGGGTCTTAGGATTCAGTATGACTGAAAATGGTCTCCTGTCATCTATTCCGTATATTGCACAATCTATTGTCAGTTTACTTGCCGCCTATCTGTCAGATTTTTTAATCGCTAAACACTTTTTATCTACCACTTCGGTGCGTAAATTAAATAATGTCATAGCATTGGGTGGCCTTGGTTTAGGTTTAATATCTGTCAGTCTAGTTGGATGTAATCGGATGGCTGCTATTGTTTTA-TTCTCTGTTACAATTGGTTTAATGGGATTTTCTTTGTCTGGTTATGGATCAAATGCTTTGGATTTAGCCCCAATTTACAATGGTAATATAATTTCAGTAACCAATACTGCTGCTACTCTGCCAGGTATTTTTGGACCACTAGTAATCGGTTATGTAACAAGAAATAGTTCAAGCATTCACAATTGGATGATTGTTTTTGGTATAGCCGCTGGAATAGCATGGTTTGGTGCACTAATGAATTTATGGTTAACAAGTGGTGAAATTCAACC-TGGAGTCGATTAATTTACATAAAAACTAATAATAATAATCCATTGAATAGACAATCTTCAATAACTACTGGTAATACTTCACCAAAATTTCAAAATATTGTTACTAATGAAACTGAGAATCATTAATCTCAGCGAATTCCATGGTATATACTATTCATTAAATATTTCTCAACTACATGATTTCTCTACAAACTGTATTCAATTCTAATTGTATTTTGAATTATTGATGTAAAACATGAGAGAATGATTTTTTTTTCTTGAAGAAAGAAGAACTATGGTCAAAACCAGTCTTCCAGTTTCCTTTTTTTTTTCTCTATTATACTTTTATACTTATATCTCTTGACATATTTACATGTACATAAATCTTATAAATGGGATAGAA]

[+] EMBL CD081352             [CGGCACGAGGCAGAAGTCTAGATAACATTTCAGTTGAAACGAAAGTTTTATATANAAAATCCAGCTTCCATGGGAGTCAAATATTTAAATCAGCTCCTGTTTGGTCAATTCTAATTTGTCATGTTTGTTTCAATTGGTCTTTTTATTCATTA ATTACATCTATGCCTACTTATATGTGTCGGGTCTTAGGATTCAGTATGACTGAAAATGGTCTCCTGTCATCTATTCCGTATATTGCACAATCTATTGTCAGTTTACTTGCCGCCTATCTGTCAGATTTTTTAATCGCTAAACACTTTTTATCTACCACTTCGGTGCGTAAATTAAATAATGTCATAGCATTGGGTGGCCTTGGTTTAGGTTTAATATCTGTCAGTCTAGTTGGATGTAATCGGATGGCTGCTATTGTTTTA TTCTCTGTTACAATTGGTTTAATGGGATTTTCTTTGTCTGGTTATGGATCAAATGCTTTGGATTTAGCCCCAATTTACAATGGTAATATAATTTCAGTAACCAATACTGCTGCTACTCTGCCAGGTATTTTTGGACCACTAGTAATCGGTTATGTAACAAGAAATAGTTCAAGCATTCACAATTGGATGATTGTTTTTGGTATAGCCGCTGGAATAGCATGGTTTGGTGCACTAATGAATTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD189615             [                                                                                  ATTTAAATCAGCTCCTGTTTGGTCAATTCTAATTTGTCATGTTTGTTTCAATTGGTCTTTTTATTCATTA ATTACATCTATGCCTACTTATATGTGTCGGGTCTTAGGATTCAGTATGACTGAAAATGGTCTCCTGTCATCTATTCCGTATATTGCACAATCTATTGTCAGTTTACTTGCCGCCTATCTGTCAGATTTTTTAATCGCTAAACACTTTTTATCTACCACTTCGGTGCGTAAATTAAATAATGTCATAGCATTGGGTGGCCTTGGTTTAGGTTTAATATCTGTCAGTCTAGTTGGATGTAATCGGATGGCTGCTATTGTTTTA TTCTCTGTTACAATTGGTTTAATGGGATTTTCTTTGTCTGGTTATGGATCANATGCTTTGGATTTAGCCCCAATTTACAATGGTAATATAACTTCAGTAACCAATACTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD189742             [                                                                                   TTTAAATCAGCTCCTGTTTGGTCAATTCTAATTTGCCATGTTTGTTTCAATTGGTCTTTTTATTCATTACATTACATCTATGCCTACTTATATGTGTCGGGTCTTACGATTCAGTATGACTGAAAATGGTCTCCTGTCATCTATTCTGTATATTGCACAATCTATTGTCAGTTTACTTGCCGCCTATCTGTCAGATTTTTTAATCGCTAAACACTTTTTATCTACCACTTCGGTGCGTAAATTAAATAATGTCATAGCATTGGGTGGCCTTGGTTTAGGTTTAATATCTGTCAGTCTAGTTGGATGTAATCGGATGGCTGCTATTGTTTTA TTCTCTGTTACAATTGGTTTAATGGGATTTTCTTTGTCTGGTTATGGATCAAATGCTTTGGATTTAGCCCCAATTTACAATGGTAATATAATTTCAGTAACCAATACTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD075184             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTATTTCTCTGTANCAATTGGTTTAATGGGATTTTCTTTGTCTGGTTATGGATCAAATGCTTTGGATTTAGCCCCAATTTACAATGGTAATATAATTTCAGTAACCAATACTGCTGCTACTCTGCCAGGTATTTTTGGACCACTAGTAATCGGTTATGTAACAAGAAATAGTTCAAGCATTCACAATTGGATGATTGTTTTTGGTATAGCCGCTGGAATAGCATGGTTTGGTGCACTAATGAATTTATGGTTAACAAGTGGTGAAATTCAACCATGGAGTCGATTAATTTACATAAAAACTAATAATAATAATCCATTGAATAGACAATCTTCAATAACTACTGGTAATACTTCACCAAAATTTCAAAATATTGTTACTAATGAAACTGAGAATCATTAATCTCAGCGAATTCCATGGTATATACTATTCATTAAATATTTCTCAACTACATGATTTCTCTACAAACTGTATTCAATTCTAATTGTATTTTGAATTATTGATGTAAAACATGAGAGAATGATTTTTTTTTCTTGAAGAAAGAAGAACTATGGTCAAAACCAGTCTT                                                                                          ]
[-] EMBL CD077069             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCAAATGCTTTGGATTTAGCCCCAATTTACAATGGTAATATAATTTCAGTAACCAATACTGCTGCTACTCTGCCAGGTATTTTTGGACCACTAGTAATCGGTTATGTAACAAGAAATAGTTCAAGCATTCACAATTGGATGATTGTTTTTGGTATAGCCGCTGGAATAGCATGGTTTGGTGCACTAATGAATTTATTGTTAACAAGTGGTCCAAAAATACC TGGAGTCGATTAATTTACATAAAAACTAATAATAATAATCCATTGAATAGCCAATCTTCAATAACTACTGGTAATACTTCACCAAAATTTCAAAATATTGTTACTAATGAAACTGAGAATCATTAATCTCAGCGAATTCCATGGTATATACTATTCATTAAATATTTCTCAACTACATGATTTCTCTACAAACTGTATTCAATTCTAATTGTATTTTGAATTATTGATGTAAAACATGAGAGAATGATTTTTTTTTCTTGAAGAAAGAAGAACTATAGTCAAAACGAGTCTTCCAGTTTCCTTTTTTTTTTCTCTATTATACTTTTATACTTATATCTCTTGACATATTTACATGTACATAAATCTTATAAATGGGATAGAA]




>consensus_7578#0
CGGCACGAGGCAGAAGTCTAGATAACATTTCAGTTGAAACGAAAGTTTTATATANAAAAT
CCAGCTTCCATGGGAGTCAAATATTTAAATCAGCTCCTGTTTGGTCAATTCTAATTTGTC
ATGTTTGTTTCAATTGGTCTTTTTATTCATTAATTACATCTATGCCTACTTATATGTGTC
GGGTCTTAGGATTCAGTATGACTGAAAATGGTCTCCTGTCATCTATTCCGTATATTGCAC
AATCTATTGTCAGTTTACTTGCCGCCTATCTGTCAGATTTTTTAATCGCTAAACACTTTT
TATCTACCACTTCGGTGCGTAAATTAAATAATGTCATAGCATTGGGTGGCCTTGGTTTAG
GTTTAATATCTGTCAGTCTAGTTGGATGTAATCGGATGGCTGCTATTGTTTTATTCTCTG
TTACAATTGGTTTAATGGGATTTTCTTTGTCTGGTTATGGATCAAATGCTTTGGATTTAG
CCCCAATTTACAATGGTAATATAATTTCAGTAACCAATACTGCTGCTACTCTGCCAGGTA
TTTTTGGACCACTAGTAATCGGTTATGTAACAAGAAATAGTTCAAGCATTCACAATTGGA
TGATTGTTTTTGGTATAGCCGCTGGAATAGCATGGTTTGGTGCACTAATGAATTTATGGT
TAACAAGTGGTGAAATTCAACCTGGAGTCGATTAATTTACATAAAAACTAATAATAATAA
TCCATTGAATAGACAATCTTCAATAACTACTGGTAATACTTCACCAAAATTTCAAAATAT
TGTTACTAATGAAACTGAGAATCATTAATCTCAGCGAATTCCATGGTATATACTATTCAT
TAAATATTTCTCAACTACATGATTTCTCTACAAACTGTATTCAATTCTAATTGTATTTTG
AATTATTGATGTAAAACATGAGAGAATGATTTTTTTTTCTTGAAGAAAGAAGAACTATGG
TCAAAACCAGTCTTCCAGTTTCCTTTTTTTTTTCTCTATTATACTTTTATACTTATATCT
CTTGACATATTTACATGTACATAAATCTTATAAATGGGATAGAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)