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Schistosoma mansoni
cluster # 758 cluster # 758       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_758#0 length = 847 sequences # 2  

consensusID : consensus_758#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 847
fasta sequence
                              [CAAGATGCGGCACGAGGCGATTTGGGATACTGCTGGACAAGAGCGTTATTATAGTTTGGCCCCTATGTACTACAGAGGAGCCCAGGCAGCCGTTGTCGTTTACGATATTACTAACCAGAACTCATTCGAACGTGCAAAATCCTGGGTTAATGAACTTCAAGAGAAAGCAAATACTAGTGGGGTGATTGCACTTGCAGGAAACAAAGTGGATCTCGAAGGACAGCGAGCTGTTTCGTTCGAGGAAGCACAAGAATACGCCGATAAAAATAGATTACTATTTATGGAGACGTCAGCCAAGATTTCAACTAATGTCTCCGAATTATTCACTGCCATAGCTCGGGAGTTACTTAGTCATGCAGAGCCATCTAGACCTTCTGGGGGACAACAGCTTACGCCAAACGATTCGCCTACACAACAAAGACAGTGTTGTAGATAGTCCTGATTCATCCACTCAATATTTTCCTATTACGTGGGTATATCACATGTTTCTCCAATCCTCCAGTCTTTAATGTCATTATCTTGCGTGTTCAGTCTCTTTCAACTAATGATTTTGCTTTGTAGTCATATTGGTCACATTTTTACGCATACGGGTTGCTGTAATTTCTGTTGAAGAACTTAATTGACCTTCAGATCTCGAATCANACTGTCACATGCTATATTATTTTTACCCAGTATGCTAAATACTTCCTTACTTGCATCGGATTTACATAACTATGGGTCATACAAATTTTTAATCTACATTATTGTTTAATGATTTATTGGAGCCGTTTGTGTAACTAAAATATATCGTTTTTCTCTCCTCGAACGTATGACCTGCGAACCTATGAGGGGATCCTCATTGTCGTCG]

[+] EMBL CD081471             [CAAGATGCGGCACGAGGCGATTTGGGATACTGCTGGACAAGAGCGTTATTATAGTTTGGCCCCTATGTACTACAGAGGAGCCCAGGCAGCCGTTGTCGTTTACGATATTACTAACCAGAACTCATTCGAACGTGCAAAATCCTGGGTTAATGAACTTCAAGAGAAAGCAAATACTAGTGGGGTGATTGCACTTGCAGGAAACAAAGTGGATCTCGAAGGACAGCGAGCTGTTTCGTTCGAGGAAGCACAAGAATACGCCGATAAAAATAGATTACTATTTATGGAGACGTCAGCCAAGATTTCAACTAATGTCTCCGAATTATTCACTGCCATAGCTCGGGAGTTACTTAGTCATGCAGAGCCATCTAGACCTTCTGGGGGACAACAGCTTACGCCAAACGATTCGCCTACACAACAAAGACAGTGTTGTAGATAGTCCTGATTCATCCACTCAATATTTTCCTATTACGTGGGTATATCACATGTTTCTCCAATCCTCCAGTCTTTAATGTCATTATCTTGCGTGTTCAGTCTCTTTCAACTAATGATTTTGCTTTGTAGTCATATTGGTCACATTTTTACGCATACGGGTTGCTGTAATTTCTGTTGAAGAACTTAATTGACCTTCAGATCTCGAATCANACTGTCACATGCTATATTATTTTTACCCAGTATGCTAAATACTTCCTTAC                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD060707             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcagGGGGGACAACAGCTTACGCCAAACGATTCGCCTACACAACAAAGACAGTGTTGTAGATAGTCCTGATTCATCCACTCAATATTTTCCTATTACGTGGGTATATCACATGTTTCTCCAATCCTCCAGTCTTTAATGTCATTATCTTGCGTGTTCAGTCTCTTTCAACTAATGATTTTGCTTCGTAGTCATATTGGTCACATTTTTACGCATACGGGTTGCTGTAATTTCTGTTGAAGAACTTAATTGACCTTCAGATCTCGAATCAAACTGTCACATGCTATATTATTTTTACCCAGTATGCTAAATACTTCCTTACTTGCATCGGATTTACATAACTATGGGTCATACAAATTTTTAATCTACATTATTGTTTAATGATTTATTGGAGCCGTTTGTGTAACTAAAATATATCGTTTTTCTCTCCTCGAACGTATGACCTGCGAACCTATGAGGGGATCCTCATTGTCGTCG]


>consensus_758#0 CAAGATGCGGCACGAGGCGATTTGGGATACTGCTGGACAAGAGCGTTATTATAGTTTGGC CCCTATGTACTACAGAGGAGCCCAGGCAGCCGTTGTCGTTTACGATATTACTAACCAGAA CTCATTCGAACGTGCAAAATCCTGGGTTAATGAACTTCAAGAGAAAGCAAATACTAGTGG GGTGATTGCACTTGCAGGAAACAAAGTGGATCTCGAAGGACAGCGAGCTGTTTCGTTCGA GGAAGCACAAGAATACGCCGATAAAAATAGATTACTATTTATGGAGACGTCAGCCAAGAT TTCAACTAATGTCTCCGAATTATTCACTGCCATAGCTCGGGAGTTACTTAGTCATGCAGA GCCATCTAGACCTTCTGGGGGACAACAGCTTACGCCAAACGATTCGCCTACACAACAAAG ACAGTGTTGTAGATAGTCCTGATTCATCCACTCAATATTTTCCTATTACGTGGGTATATC ACATGTTTCTCCAATCCTCCAGTCTTTAATGTCATTATCTTGCGTGTTCAGTCTCTTTCA ACTAATGATTTTGCTTTGTAGTCATATTGGTCACATTTTTACGCATACGGGTTGCTGTAA TTTCTGTTGAAGAACTTAATTGACCTTCAGATCTCGAATCANACTGTCACATGCTATATT ATTTTTACCCAGTATGCTAAATACTTCCTTACTTGCATCGGATTTACATAACTATGGGTC ATACAAATTTTTAATCTACATTATTGTTTAATGATTTATTGGAGCCGTTTGTGTAACTAA AATATATCGTTTTTCTCTCCTCGAACGTATGACCTGCGAACCTATGAGGGGATCCTCATT GTCGTCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)