These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7643#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 795 fasta sequence [TCGATAAGATGCTTGACTCCATCGACTTTCTAATGATAATTTCTCTGTATATAAAATTGCTTTTTGCCAATCTGCTTGTAATGCATAACACCATATTAATTCCCAATAACAAAGATGATGATAATGTATCCAATCTGATTGTGAATTTATTGAACGTTGAAATAATATAATAGCCTTCTGTAAATTTCCAGATATTTCTTCTAAACGACCAGCTAATAATAAGAATATAGCACTATTTGGATATATAATAGACCAATAATCTAATAATTCACGAGCTTCTTTCATATGCTCTGGTTGTTCAGAAGATACGCTGACAACACTGTCACCTAACATATGAGTAGCATATAAATCATATGCTAATAATAATAGAGCACATAATGGACCACGTAATGAATCTTTCATTCCTGCACCCAATCTTAACTGTTCTAAACCGAATTGGCGATCTCCAGAGAATCCAACAAATTCCAATAATTTTAAGACACTTCTAGGAAGCATAGAGATCATTAAATTAAAAGCTCCAACACCTAAATGTACACCACTTTCAAAAGCTGATTTACTAATTTCATTTTGCCAATTTCGATATTTCAATATTCTCCAACATATACGATAACATTTATAACATTGTCTTATCTTTAATGAACATTTGATAAGACTTGTTAATTTTTCATCTTGTAACATTGAAAGAAATGCTAATTGAAGTAAACCTTCTGCATAACAAAGTTCAGCATGAGCCTGTTCATCAGTATATAAACCATAAATGGTATTACGACTTTTTTCTGTTTGTTTAATAAATGT] [+] EMBL CD121335 [TCGATAAGATGCTTGACTCCATCGACTTTCTAATGATAATTTCTCTGTATATAAAATTGCTTTTTGCCAATCTGCTTGTAATGCATAACACCATATTAATTCCCAATAACAAAGATGATGATAATGTATCCAATCTGATTGTGAATTTATTGAACGTTGAAATAATATAATAGCCTTCTGTAAATTTCCAGATATTTCTTCTAAACGACCAGCTAATAATAAGAATATAGCACTATTTGGATATATAATAGACCAATAATCTAATAATTCACGAGCTTCTTTCATATGCTCTGGTTGTTCAGAAGATACGCTGACAACACTGTCACCTAACATATGAGTAGCATATAAATCATATGCTAATAATAATAGAGCACATAATGGACCACGTAATGAATCTTTCATTCCTGCACCCAATCTTAACTGTTCTAAAGCGAATTGGCGATCTCCAGA ] [-] EMBL CD158253 [ ATGCTTGACTCCATCGACTTTCTAATGATAATTTCTCTGTATATAAAATTGCTTTTTGCCAATCTGCTTGTAATGCATAACACCGTATTAATTCCCAATAACAAAGATGATGATAATGTATCCAATCTGATTGTGAATTTATTGAACGTTGAAATAATATAATAGCCTTCTGTAAATTTCCAGATATTTCTTCTAAACGACCAGCTAATAATAAGAATATAGCACTATTTGGATATATAATAGACCAATAATCTAATAATTCACGAGCTTCTTTCATATGCTCTGGTTGTTCAGAAGATACGCTGACAACACTGTCACCTAACATATGAGTAGCA ] [-] EMBL CD121346 [ AATAATAATAGAGCACATAATGGACCACGTAATGAATCTTTCATTCCTGCACCCAATCTTAACTGTTCTAAACCGAATTGGCGATCTCCAGAGAATCCAACAAATTCCAATAATTGTAAGACACTTCTAGGAAGCATAGAGATCATTAAATTAAAAGCTCCAACACCTAAATGTACACCACTTTCAAAAGCTGATTTACTAATTTCATTTTGCCAATTTCGATATTTCAATATTCTCCAACATATACGATAACATTTATAACATTGTCTTATCTTTAATGAACATTTGATAAGACTTGTTAATTTTTCATCTTGTAACATTGAAAGAAATGCTAATTGAAGTAAACCTTCTGCATAACAAAGTTCAGCATGAGCCTGTTCATCAGTATATAAACCATAAATGGTATTACGACTTTTTTCTGTTTGTTTAATAAATGT] [-] EMBL CD121348 [ ACATAATGGACCACGTAATGAATCTTTCATTCCTGCACCCAATCTTAACTGTTCTAAACCGAATTGGCGATCTCCAGAGAATCCAACAAATTCCAATAATTTTAAGACACTTCTAGGAAGCATAGAGATCATTAAATTAAAAGCTCCAACACCTAAATGTACACCACTTTCAAAAGCTGATTTACTAATTTCATTTTGCCAATTTCGATATTTCAATATTCTCCAACATATACGATAACATTTATAACATTGTCTTATCTTTAATGAACATTTGATAAGACTTGTTAATTTTTCATCTTGTAACATTGAAAGAAATGCTAATTGAAGTAAACCTTCTGCATAACAAAGTTCAGCATGAGCCTGTTCATCAGTATATAAACCATAAATGGTATTACGACTTTTTTCTGTTTGTTTAATAAATGT] [-] EMBL CD098016 [ AATTGGCGATCTCCAGAGAATCCAACAAATGGCAATAATTTTAAGACACTTCTAGGAAGCATAGAGATCATTAAATTAAAAGCTCCAACACCTAAATGTACACCACTTTCAAAAGCTGATTTACTAATTTCATTTTGCCAATTTCGATATTTCAATATTCTCCAACATATACGATAACATTTATAACATTGTCTTATCTTTAATGAACATTTGATAAGACTTGTTAATTTTTCATCTTGTAACATTGAAAGAAATGCTAATTGAAGTAAACCTTCTGCATAACAAAGTTCAGCATGAGCCTGTTCATCAGTATATAAACCATAAATGGTATTACGACTTTTTTCTGTTTGT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||