cluster # 7666

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Schistosoma mansoni
cluster # 7666 cluster # 7666 Sequences # 5 consensus # 2

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consensus_7666#0 length = 1502 sequences # 4

consensus_7666#1 length = 674 sequences # 1

consensusID : consensus_7666#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1502
fasta sequence

                              [ATAATTGTTATTTTAAAACAAAATGTTTAAATATTCAATATATTTAGTGTAATATATAAATGAATATTCCATGGATACAATTTAATCACCATTTCATTTATAGACAAAGAAGTTATTATTACATCATTCTAAGTATTCTATTATTACCATTTATATTTACATTCATACAAAAATATCATTTATATAAATATAATGAAATAGATGAAGTATACAATAGTTATTCAACATTTCATGAATTAAAAAAGGATTTCGTGAATGGAAAATTCAAATTGAACACTGAAAAAATTAAAGAAATTGTTATTTATGGGAAAACAACAGTTCCTATCAATACTGACCTTCGAGGTTGTTTAGTATCGAATTGTGTACTTCACAAGACAAAATGGCGTTCATATTATGCTGAAATGGTTATTATTACCAATGGTAACTTTCCAAAAGTTAAAAATCATCAAAATCAAGCTTGGCTAGCATATCATTATGAAGCGCCTCCACATAGTCGTTTAAATAAACTATTAGGTGAAAAAATTAATTTCACCGCTACATATAGACTTGATTCAACCATACACTTACCATATGGAAAAGTTATAGAAAATCTTGAATATCATCAAAAGCTTAATAATAATGATGATAGTAGTCGTAGTAGTATTAGTACTGATAATTTCTTTAAACCACGAAATATATCTGCATTAAAGAAGAAAACTGTAGCATGGATTGTAAGTAATTGTCATCCGGATAGTCCAAGAAATTTATACGCCTATGAATTATCGAAATATATCACTGTTGATGTATACGGTAAATGTAGCCAACGAGAATGCCAAGATTCAAAATGTCATAAAATGTTAAAAGAACAATATAAGTTCTATTTAAGTTTTGAAAATTCTCTTTGTCAAGATTATATTACTGAAAAATTTTTTAAAAATGCTCTAATGAATGATGTTATACCAGTCGTAATGGGTGCATCAATTGAAGAGTATAAAAGTGTAGCACCACCAAATTCTTTTATACATGTTGATCAATTTTCTAGTCCAAGACAATTAGCTAAATATTTACATTATCTGGACAATAATCATACAGCATTTAATGAATATTTCATTTGGCAAAATAAATGGAAAGTATTATTATTCCCTGAACGACCAGAATGTGATTTTTGTTTGTTGGCTAATGCTTTGCCAAATCTCAAACCGTCTTGGTATATTGATGTTAATTCATGGTTTGACAGGAGTTGTCATGGAAGGAGGCTAAAATGGAAAGGAAATCAAAAAGATTTCTCTGCAGCTATTTGGTTTTCTAAATTGAAACAACAAAATCCTGTAACTACATCGACCAATTCACAAATGAATTAAAAATGATAGAAGAACATTCGACATTGACCAGTGAATATCTCATGAAGATATTATGTGATGGAGTTGTGATGTGAACATGAACGATTTCCAGTTTTGTTCTTTGTAAAGTCTATAGATTGAATTTTATTTTTACGGATATAAAAATATTAAAAAAAACATCTA]

[+] EMBL AF183577             [ATAATTGTTATTTTAAAACAAAATGTTTAAATATTCAATATATTTAGTGTAATATATAAATGAATATTCCATGGATACAATTTAATCACCATTTCATTTATAGACAAAGAAGTTATTATTACATCATTCTAAGTATTCTATTATTACCATTTATATTTACATTCATACAAAAATATCATTTATATAAATATAATGAAATAGATGAAGTATACAATAGTTATTCAACATTTCATGAATTAAAAAAGGATTTCGTGAATGGAAAATTCAAATTGAACACTGAAAAAATTAAAGAAATTGTTATTTATGGGAAAACAACAGTTCCTATCAATACTGACCTTCGAGGTTGTTTAGTATCGAATTGTGTACTTCACAAGACAAAATGGCGTTCATATTATGCTGAAATGGTTATTATTACCAATGGTAACTTTCCAAAAGTTAAAAATCATCAAAATCAAGCTTGGCTAGCATATCATTATGAAGCGCCTCCACATAGTCGTTTAAATAAACTATTAGGTGAAAAAATTAATTTCACCGCTACATATAGACTTGATTCAACCATACACTTACCATATGGAAAAGTTATAGAAAATCTTGAATATCATCAAAAGCTTAATAATAATGATGATAGTAGTCGTAGTAGTATTAGTACTGATAATTTCTTTAAACCACGAAATATATCTGCATTAAAGAAGAAAACTGTAGCATGGATTGTAAGTAATTGTCATCCGGATAGTCCAAGAAATTTATACGCCTATGAATTATCGAAATATATCACTGTTGATGTATACGGTAAATGTAGCCAACGAGAATGCCAAGATTCAAAATGTCATAAAATGTTAAAAGAACAATATAAGTTCTATTTAAGTTTTGAAAATTCTCTTTGTCAAGATTATATTACTGAAAAATTTTTTAAAAATGCTCTAATGAATGATGTTATACCAGTCGTAATGGGTGCATCAATTGAAGAGTATAAAAGTGTAGCACCACCAAATTCTTTTATACATGTTGATCAATTTTCTAGTCCAAGACAATTAGCTAAATATTTACATTATCTGGACAATAATCATACAGCATTTAATGAATATTTCATTTGGCAAAATAAATGGAAAGTATTATTATTCCCTGAACGACCAGAATGTGATTTTTGTTTGTTGGCTAATGCTTTGCCAAATCTCAAACCGTCTTGGTATATTGATGTTAATTCATGGTTTGACAGGAGTTGTCATGGAAGGAGGCTAAAATGGAAAGGAAATCAAAAAGATTTCTCTGCAGCTATTTGGTTTTCTAAATTGAAACAACAAAATCCTGTAACTACATCGACCAATTCACAAATGAATTAAAAATGATAGAAGAACATTCGACATTGACCAGTGAATATCTCATGAAGATATTATGTGATGGAGTTGTGATGTGAACATGAACGATTTCCAGTTTTGTTCTTTGTAAAGTCTATAGATTGAATTTTATTTTTACGGATATAAAAATA                ]
[+] EMBL CD083759             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GAGAATGCCAAGATTCAAAATGTCATAAAATGTTAAAAGAACAATAT AGTTCTATTTAAGTTTTGAAAATTCTCTTTGTCAAGATTATATTACTGAAAAATTTTTTAAAAATGCTCTAATGAATGATGTTATACCAGTCGTAATGGGTGCATCAATTGAAGAGTATAAAAGTGTAGCACCACCAAATTCTTTTATACATGTTGATCAATTTTCTAGTCCAAGACAATTAGCTAAATATTTACATTATCTGGACAATAATCATACAGCATTTAATGAATATTTCATTTGGCAAAATAAATGGAAAGTATTATTATTCCCTGAACGACCAGAATGTGATTTTTGTTTGTTGGCTAATGCTTTGCCAAATCTCAAACCGTCTTGGTATATTGATGTTAATTCATGGTTTGACAGGAGTTGTCATGGAAGGAGGCTAAAATGGAAAGGAAATCAAAAAGATTTCTCTGCAGCTATTTGGTTTTCTAAATTGAAACAACAAAATCCTGTAACTACATCGACCAATTCACAAATGAATTNAAAATGATAGAAGA                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD073877             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACAATATAAGTTCTATTTAAGTTTTGAAAATTCTCTTTGTCAAGATTATATTACTGAAAAATTTTTTAAAAATGCTCTAATGAATGATGTTATACCAGTCGTAATGGGTGCATCAATTGAAGAGTATAAAAGTGTAGCACCACCAAATTCTTTTATACATGTTGATCAATTTTCTAGTCCAAGACAATTAGCTAAATATTTACATTATCTGGACAATAATCATACAGCATTTAATGAATATTTCATTTGGCAAAATAAATGGAAAGTATTATTATTCCCTGAACGACCAGAATGTGATTTTTGTTTGTTGGCTAATGCTTTGCCAAATCTCAAACCGTCTTGGTATATTGATGTTAATTCATGGTTTGACAGGAGTTGTCATGGAAGGAGGCTAAAATGGAAAGGAAATCAAAAAGATTTCTCTGCAGCTATTTGGTTTTCTAAATTGAAACAACAAAATCCTGTAACTACATCGACCAATTCACAAATGAATTAAAAATGATAGAAGAACATTCGACATTGACCAGTGAATATCTCATGAAGATATTATGTGATGGAGTTGTGATGTGAACATGAACGATTTCCAGTTTTGTTCTTTGTAAAGTCTATAGATTGAATTTTATTTTTACGGATATAAAAATATTAAAAAAAACATCTA]
[+] EMBL CD084420             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aggCAGTCGTAATGGGTGCATCAATTGAAGAGTATAAAAGTGTAGCACCACCAAATTCTTTTATACATGTTGATCAATTTTCTAGTCCAAGACAATTAGCTAAATATTTACATTATCTGGACAATAATCATACAGCATTTAATGAATATTTCATTTGGCAAAATAAATGGAAAGTATTATTATTCCCTGAACGACCAGAATGTGATTTTTGTTTGTTGGCTAATGCTTTGCCAAATCTCAAACCGTCTTGGTATATTGATGTTAATTCATGGTTTGACAGGAGTTGTCATGGAAGGAGGCTAAAATGGAAAGGAAATCAAAAAGATTTCTCTGCAGCTATTTGGTTTTCTAAATTGAAACAACAAAATCCTGTAACTACATCGACCAATTCACAAATGAATTAAAAATGATAGAAGAACATTCGACATTGACCAGTGAATATCTCATGAAGATATTATGTGATGGAGTTGTGATGTGAACTTG                                                                                   ]




>consensus_7666#0
ATAATTGTTATTTTAAAACAAAATGTTTAAATATTCAATATATTTAGTGTAATATATAAA
TGAATATTCCATGGATACAATTTAATCACCATTTCATTTATAGACAAAGAAGTTATTATT
ACATCATTCTAAGTATTCTATTATTACCATTTATATTTACATTCATACAAAAATATCATT
TATATAAATATAATGAAATAGATGAAGTATACAATAGTTATTCAACATTTCATGAATTAA
AAAAGGATTTCGTGAATGGAAAATTCAAATTGAACACTGAAAAAATTAAAGAAATTGTTA
TTTATGGGAAAACAACAGTTCCTATCAATACTGACCTTCGAGGTTGTTTAGTATCGAATT
GTGTACTTCACAAGACAAAATGGCGTTCATATTATGCTGAAATGGTTATTATTACCAATG
GTAACTTTCCAAAAGTTAAAAATCATCAAAATCAAGCTTGGCTAGCATATCATTATGAAG
CGCCTCCACATAGTCGTTTAAATAAACTATTAGGTGAAAAAATTAATTTCACCGCTACAT
ATAGACTTGATTCAACCATACACTTACCATATGGAAAAGTTATAGAAAATCTTGAATATC
ATCAAAAGCTTAATAATAATGATGATAGTAGTCGTAGTAGTATTAGTACTGATAATTTCT
TTAAACCACGAAATATATCTGCATTAAAGAAGAAAACTGTAGCATGGATTGTAAGTAATT
GTCATCCGGATAGTCCAAGAAATTTATACGCCTATGAATTATCGAAATATATCACTGTTG
ATGTATACGGTAAATGTAGCCAACGAGAATGCCAAGATTCAAAATGTCATAAAATGTTAA
AAGAACAATATAAGTTCTATTTAAGTTTTGAAAATTCTCTTTGTCAAGATTATATTACTG
AAAAATTTTTTAAAAATGCTCTAATGAATGATGTTATACCAGTCGTAATGGGTGCATCAA
TTGAAGAGTATAAAAGTGTAGCACCACCAAATTCTTTTATACATGTTGATCAATTTTCTA
GTCCAAGACAATTAGCTAAATATTTACATTATCTGGACAATAATCATACAGCATTTAATG
AATATTTCATTTGGCAAAATAAATGGAAAGTATTATTATTCCCTGAACGACCAGAATGTG
ATTTTTGTTTGTTGGCTAATGCTTTGCCAAATCTCAAACCGTCTTGGTATATTGATGTTA
ATTCATGGTTTGACAGGAGTTGTCATGGAAGGAGGCTAAAATGGAAAGGAAATCAAAAAG
ATTTCTCTGCAGCTATTTGGTTTTCTAAATTGAAACAACAAAATCCTGTAACTACATCGA
CCAATTCACAAATGAATTAAAAATGATAGAAGAACATTCGACATTGACCAGTGAATATCT
CATGAAGATATTATGTGATGGAGTTGTGATGTGAACATGAACGATTTCCAGTTTTGTTCT
TTGTAAAGTCTATAGATTGAATTTTATTTTTACGGATATAAAAATATTAAAAAAAACATC
TA

consensusID : consensus_7666#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 674
fasta sequence

                              [ATTTGGCATCGAGGACTTATTCAACATTTCATGAATTAAAAAAGGATTTTGTGAATGGAAAATTCAAATTGAACACTGAAAAAATTAAAGAAATTGTTATTTATGGGAAAACAACAGTTCCTATCAATACTGACCTTCGAGGTTGTTTAGTATCGAATTGTGTACTTCACAAGACAAAATGGCGTTCATATTATGCTGAAATGGTTATTATTACCAATGGTAACTTTCCAAAAGTTAAAAATCATCAAAATCAAGCTTGGCTAGCATATCATTATGAAGCGCCTCCACATAGTCGTTTAAATAAACTATTAGGTGAAAAAATTAATTTCACCGCTACATATAGACTTGATTCAACCATACACTTACCATATGGAAAAGTTATAGAAAATCTTGAATATCATCAAAAGCTTAATAATAATGATGATAGTAGTCGTAGTAGTATTAGTACTGATAATTTCTTTAAACCACGAAATATATCTGCATTAAAGAAGAAAACTGTAGCATGGATTGTAAGTAATTGTCATCCGGATAGTCCAAGAAATTTATACGCCTATGAATTATCGAAATATATCACTGTTGATGTATACGGTAAATGTAGCCAACGAGAATGCCAAGATTCANAATGTCATAAAATGTTAAAAGAACAATANTAGTTCTATTTAAGTTTTGAAATT]

[+] EMBL CD079613             [ATTTGGCATCGAGGACTTATTCAACATTTCATGAATTAAAAAAGGATTTTGTGAATGGAAAATTCAAATTGAACACTGAAAAAATTAAAGAAATTGTTATTTATGGGAAAACAACAGTTCCTATCAATACTGACCTTCGAGGTTGTTTAGTATCGAATTGTGTACTTCACAAGACAAAATGGCGTTCATATTATGCTGAAATGGTTATTATTACCAATGGTAACTTTCCAAAAGTTAAAAATCATCAAAATCAAGCTTGGCTAGCATATCATTATGAAGCGCCTCCACATAGTCGTTTAAATAAACTATTAGGTGAAAAAATTAATTTCACCGCTACATATAGACTTGATTCAACCATACACTTACCATATGGAAAAGTTATAGAAAATCTTGAATATCATCAAAAGCTTAATAATAATGATGATAGTAGTCGTAGTAGTATTAGTACTGATAATTTCTTTAAACCACGAAATATATCTGCATTAAAGAAGAAAACTGTAGCATGGATTGTAAGTAATTGTCATCCGGATAGTCCAAGAAATTTATACGCCTATGAATTATCGAAATATATCACTGTTGATGTATACGGTAAATGTAGCCAACGAGAATGCCAAGATTCANAATGTCATAAAATGTTAAAAGAACAATANTAGTTCTATTTAAGTTTTGAAATT]




>consensus_7666#1
ATTTGGCATCGAGGACTTATTCAACATTTCATGAATTAAAAAAGGATTTTGTGAATGGAA
AATTCAAATTGAACACTGAAAAAATTAAAGAAATTGTTATTTATGGGAAAACAACAGTTC
CTATCAATACTGACCTTCGAGGTTGTTTAGTATCGAATTGTGTACTTCACAAGACAAAAT
GGCGTTCATATTATGCTGAAATGGTTATTATTACCAATGGTAACTTTCCAAAAGTTAAAA
ATCATCAAAATCAAGCTTGGCTAGCATATCATTATGAAGCGCCTCCACATAGTCGTTTAA
ATAAACTATTAGGTGAAAAAATTAATTTCACCGCTACATATAGACTTGATTCAACCATAC
ACTTACCATATGGAAAAGTTATAGAAAATCTTGAATATCATCAAAAGCTTAATAATAATG
ATGATAGTAGTCGTAGTAGTATTAGTACTGATAATTTCTTTAAACCACGAAATATATCTG
CATTAAAGAAGAAAACTGTAGCATGGATTGTAAGTAATTGTCATCCGGATAGTCCAAGAA
ATTTATACGCCTATGAATTATCGAAATATATCACTGTTGATGTATACGGTAAATGTAGCC
AACGAGAATGCCAAGATTCANAATGTCATAAAATGTTAAAAGAACAATANTAGTTCTATT
TAAGTTTTGAAATT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_7666#0      ATAATTGTTATTTTAAAACAAAATGTTTAAATATTCAATATATTTAGTGTAATATATAAA 60
consensus_7666#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7666#0      TGAATATTCCATGGATACAATTTAATCACCATTTCATTTATAGACAAAGAAGTTATTATT 120
consensus_7666#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7666#0      ACATCATTCTAAGTATTCTATTATTACCATTTATATTTACATTCATACAAAAATATCATT 180
consensus_7666#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7666#0      TATATAAATATAATGAAATAGATGAAGTATACAATAGTTATTCAACATTTCATGAATTAA 240
consensus_7666#1      ---------------------ATTTGGCATCGAGGACTTATTCAACATTTCATGAATTAA 39
                                           **   * **  *  * ***********************

consensus_7666#0      AAAAGGATTTCGTGAATGGAAAATTCAAATTGAACACTGAAAAAATTAAAGAAATTGTTA 300
consensus_7666#1      AAAAGGATTTTGTGAATGGAAAATTCAAATTGAACACTGAAAAAATTAAAGAAATTGTTA 99
                      ********** *************************************************

consensus_7666#0      TTTATGGGAAAACAACAGTTCCTATCAATACTGACCTTCGAGGTTGTTTAGTATCGAATT 360
consensus_7666#1      TTTATGGGAAAACAACAGTTCCTATCAATACTGACCTTCGAGGTTGTTTAGTATCGAATT 159
                      ************************************************************

consensus_7666#0      GTGTACTTCACAAGACAAAATGGCGTTCATATTATGCTGAAATGGTTATTATTACCAATG 420
consensus_7666#1      GTGTACTTCACAAGACAAAATGGCGTTCATATTATGCTGAAATGGTTATTATTACCAATG 219
                      ************************************************************

consensus_7666#0      GTAACTTTCCAAAAGTTAAAAATCATCAAAATCAAGCTTGGCTAGCATATCATTATGAAG 480
consensus_7666#1      GTAACTTTCCAAAAGTTAAAAATCATCAAAATCAAGCTTGGCTAGCATATCATTATGAAG 279
                      ************************************************************

consensus_7666#0      CGCCTCCACATAGTCGTTTAAATAAACTATTAGGTGAAAAAATTAATTTCACCGCTACAT 540
consensus_7666#1      CGCCTCCACATAGTCGTTTAAATAAACTATTAGGTGAAAAAATTAATTTCACCGCTACAT 339
                      ************************************************************

consensus_7666#0      ATAGACTTGATTCAACCATACACTTACCATATGGAAAAGTTATAGAAAATCTTGAATATC 600
consensus_7666#1      ATAGACTTGATTCAACCATACACTTACCATATGGAAAAGTTATAGAAAATCTTGAATATC 399
                      ************************************************************

consensus_7666#0      ATCAAAAGCTTAATAATAATGATGATAGTAGTCGTAGTAGTATTAGTACTGATAATTTCT 660
consensus_7666#1      ATCAAAAGCTTAATAATAATGATGATAGTAGTCGTAGTAGTATTAGTACTGATAATTTCT 459
                      ************************************************************

consensus_7666#0      TTAAACCACGAAATATATCTGCATTAAAGAAGAAAACTGTAGCATGGATTGTAAGTAATT 720
consensus_7666#1      TTAAACCACGAAATATATCTGCATTAAAGAAGAAAACTGTAGCATGGATTGTAAGTAATT 519
                      ************************************************************

consensus_7666#0      GTCATCCGGATAGTCCAAGAAATTTATACGCCTATGAATTATCGAAATATATCACTGTTG 780
consensus_7666#1      GTCATCCGGATAGTCCAAGAAATTTATACGCCTATGAATTATCGAAATATATCACTGTTG 579
                      ************************************************************

consensus_7666#0      ATGTATACGGTAAATGTAGCCAACGAGAATGCCAAGATTCAAAATGTCATAAAATGTTAA 840
consensus_7666#1      ATGTATACGGTAAATGTAGCCAACGAGAATGCCAAGATTCANAATGTCATAAAATGTTAA 639
                      ***************************************** ******************

consensus_7666#0      AAGAACAATATAAGTTCTATTTAAGTTTTGAAAATTCTCTTTGTCAAGATTATATTACTG 900
consensus_7666#1      AAGAACAATANTAGTTCTATTTAAGTTTTGAAATT------------------------- 674
                      **********  ********************* *                         

consensus_7666#0      AAAAATTTTTTAAAAATGCTCTAATGAATGATGTTATACCAGTCGTAATGGGTGCATCAA 960
consensus_7666#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7666#0      TTGAAGAGTATAAAAGTGTAGCACCACCAAATTCTTTTATACATGTTGATCAATTTTCTA 1020
consensus_7666#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7666#0      GTCCAAGACAATTAGCTAAATATTTACATTATCTGGACAATAATCATACAGCATTTAATG 1080
consensus_7666#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7666#0      AATATTTCATTTGGCAAAATAAATGGAAAGTATTATTATTCCCTGAACGACCAGAATGTG 1140
consensus_7666#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7666#0      ATTTTTGTTTGTTGGCTAATGCTTTGCCAAATCTCAAACCGTCTTGGTATATTGATGTTA 1200
consensus_7666#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7666#0      ATTCATGGTTTGACAGGAGTTGTCATGGAAGGAGGCTAAAATGGAAAGGAAATCAAAAAG 1260
consensus_7666#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7666#0      ATTTCTCTGCAGCTATTTGGTTTTCTAAATTGAAACAACAAAATCCTGTAACTACATCGA 1320
consensus_7666#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7666#0      CCAATTCACAAATGAATTAAAAATGATAGAAGAACATTCGACATTGACCAGTGAATATCT 1380
consensus_7666#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7666#0      CATGAAGATATTATGTGATGGAGTTGTGATGTGAACATGAACGATTTCCAGTTTTGTTCT 1440
consensus_7666#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7666#0      TTGTAAAGTCTATAGATTGAATTTTATTTTTACGGATATAAAAATATTAAAAAAAACATC 1500
consensus_7666#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7666#0      TA 1502
consensus_7666#1      --