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Schistosoma mansoni
cluster # 7679 cluster # 7679       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7679#0 length = 972 sequences # 5  

consensusID : consensus_7679#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 972
fasta sequence
                              [CGACTGACCAAATTACATTACGAGCGCGTTGTGCAACACGTTCCAGATAATGTTTAGCAGAATTATGAGAATTAACAATAATTTTATGATTAATATCTTCTGTAGTTTTGGTGACACGATCAGATATTTGAGGTTTTGTAGAGTTTGATATTCCTACTGTTGGTGTTACTGGATATGATATAATAGTTGTAGTATGTGGTATAGATGAGCCAAGTGTACGTAAACGTTCGTAGAAACTCATAAAATCTAAATGAAAACGTTCAATCGCTTCGGAAAGACTTAAATTGGCATCAAATGGAACAGTTTGTGATAGCTGTCTGACAGGAGAATGATTAGATGTAGTTGATATTGCTGAACTACTATTAACAGCAGTAGGAGTAGTGGTTGGATTATATTCTGTTTGTGTAACCAACATTTGAATATTTGAACCAGGCACTGTAGGTGTATCATTGTCAGTTGGATATAAATTGACTTGAATTTCTGTATCTGCGACAACAAACGCTACAACTTGATCATCGTCTTCTTCATTAATTTCATTTGGTAGAGGAATAATTGTTGGTCCATTATTAACAACTACCTCAGCAGTAGTAGCAGCACGTCGACCACTTGGACGTTGTACAAGTGTATCCAGTGATTTCGGTTGACATAAACTAGCTAATCGTTGAACTAACGTAAATAAATTCGTGGAGACTAGAAGAGATGAAGATTGTGGTGGTAAAAGATTCCTTAAAGTGTTTCCACTAACTTTAGCATTATCATTATTACTGCTTCTGGAGTTAGATGAATTCATCGTGGTATTGTCATTATCTGAAACAGAACGTCTGGAAAAGCGTCTAGATGTCCAAAATTGTCGACTTAAAGGATTTAAACTACTGCTACTACTACTACCGCTAACTCCACAATCAGTATTTTTCGCAGAGACTTTTGAATTTTTCTTATTATTGCCCATTTCATTATTATAATTATCAATTT]

[-] EMBL CD163894             [CGACTGACCAAATTACATTACGAGCGCGTTGTGCAACACGTTCCAGATAATGTTTAGCAGAATTATGAGAATTAACAATAATTTTATGATTAATATCTTCTGTAGTTTTGGTGACACGATCAGATATTTGAGGTTTTGTAGAGTTTGATATTCCTACTGTTGGTGTTACTGGATATGATATAATAGTTGTAGTATGTGGTATAGATGAGCCAAGTGTACGTAAACGTTCGTAGAAACTCATAAAATCTAAATGAAAACGTTCAATCGCTTCGGAAAGACTTAAATTGGCATCAAATGGAACAGTTTGTGATAGCTGTCTGACAGGAGAATGATTAGATGTAGTTGATATTGCTGAACTACTATTAACAGCAGTAGGAGTAGTGGTTGGATTATATTCTGTCTGTGTAACCAACATCTGAATATTTGAACCAGGCACTGTAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD129177             [                                                                                                                                                                                       TAGTTGTAGTATGTGGTATAGATGAGCCAAGTGTACGTAAACGTTCGTAGAAACTCATAAAATCTAAATGAAAACGTTCAATCGCTTCGGAAAGACTTAAATTGGCATCAAATGGAACAGTTTGTGATAGCTGTCTGACAGGAGAATGATTAGATGTAGTTGATATTGCTGAACTACTATTAACAGCAGTAGGAGTAGTGGTTGGATTATATTCTGTTTGTGTAACCAACATTTGAATATTTGAACCAGGCACTGTAGGTGTATCATTGTCAGTTGGATATAAATTGACTTGAATTTCTGTATCTGCGACAACAAACGCTACAACTTGATCATCGTCTTCTTCATTAATTTCATTTGGTAGAGGAATAATTGTTGGTCCATTATTAACAACTACCTCAGCAGTAGTAGCAGCACGTCGACCACTTGGACGTTGTACAAGTGTATCCAGTGATTTCGGTTGACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD129200             [                                                                                                                                                                                       TAGTTGTAGTATGTGGTATAGATGAGCCAAGTGTACGTAAACGTTCGTAGAAACTCATAAAATCTAAATGAAAACGTTCAATCGCTTCGGAAAGACTTAAATTGGCATCAAATGGAACAGTTTGTGATAGCTGTCTGACAGGAGAATGATTAGATGTAGTTGATATTGCTGAACTACTATTAACAGCAGTAGGAGTAGTGGTTGGATTATATTCTGTTTGTGTAACCAACATTTGAATATTTGAACCAGGCACTGTAGGTGTATCATTGTCAGTTGGATATAAATTGACTTGAATTTCTGTATCTGCGACAACAAACGCTACAACTTGATCATCGTCTTCTTCATTAATTTCATTTGGTAGAGGAATAATTGTTGGTCCATTATTAACAACTACCTCAGCAGTAGTAGCAGCACGTCGACCACTTGGACGTTGTACAAGTGTATCCAGTGATTTCGGTTGACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD129201             [                                                                                                                                                                                        AGTTGTAGTATGTGGTATAGATGAGCCAAGTGTACGTAAACGTTCGTAGAAACTCATAAAATCTAAATGAAAACGTTCAATCGCTTCGGAAAGACTTAAATTGGCATCAAATGGAACAGTTTGTGATAGCTGTCTGACAGGAGAATGATTAGATGTAGTTGATATTGCTGAACTACTATTAACAGCAGTAGGAGTAGTGGGTGGATTATATTCTGTTTGTGTAACCAACATTTGAATATTTGAACCAGGCACTGTAGGTGTATCATTGTCAGTTGGATATAAATTGACTTGAATTTCTGTATCTGCGACAACAAACGCTACAACTTGATCATCGTCTTCTTCATTAATTTCATTTGGTAGAGGAATAATTGTTGGTCCATTATTAACAACTACCTCAGCAGTAGTAGCAGCACGTCGACCACTTGGACGTTGTACAAGTGTATCCAGTGATTTCGGTTGACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD116883             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTGCTGAACTACTATTAACAGCAGTAGGAGTAGTGGTTGGATTATATTCTGTTTGTGTAACCAACATTTGAATATTTGAACCAGGCACTGTAGGTGTATCATTGTCAGTTGGATATAAATTGACTTGAATTTCTGTATCTGCGACAACAAACGCTACAACTTGATCATCGTCTTCTTCATTAATTTCATTTGGTAGAGGAATAATTGTTGGTCCATTATTAACAACTACCTCAGCAGTAGTAGCAGCACGTCGACCACTTGGACGTTGTACAAGTGTATCCAGTGATTTCGGTTGACATAAACTAGCTAATCGTTGAACTAACGTAAATAAATTCGTGGAGACTAGAAGAGATGAAGATTGTGGTGGTAAAAGATTCCTTAAAGTGTTTCCACTAACTTTAGCATTATCATTATTACTGCTTCTGGAGTTAGATGAATTCATCGTGGTATTGTCATTATCTGAAACAGAACGTCTGGAAAAGCGTCTAGATGTCCAAAATTGTCGACTTAAAGGATTTAAACTACTGCTACTACTACTACCGCTAACTCCACAATCAGTATTTTTCGCAGAGACTTTTGAATTTTTCTTATTATTGCCCATTTCATTATTATAATTATCAATTT]


>consensus_7679#0 CGACTGACCAAATTACATTACGAGCGCGTTGTGCAACACGTTCCAGATAATGTTTAGCAG AATTATGAGAATTAACAATAATTTTATGATTAATATCTTCTGTAGTTTTGGTGACACGAT CAGATATTTGAGGTTTTGTAGAGTTTGATATTCCTACTGTTGGTGTTACTGGATATGATA TAATAGTTGTAGTATGTGGTATAGATGAGCCAAGTGTACGTAAACGTTCGTAGAAACTCA TAAAATCTAAATGAAAACGTTCAATCGCTTCGGAAAGACTTAAATTGGCATCAAATGGAA CAGTTTGTGATAGCTGTCTGACAGGAGAATGATTAGATGTAGTTGATATTGCTGAACTAC TATTAACAGCAGTAGGAGTAGTGGTTGGATTATATTCTGTTTGTGTAACCAACATTTGAA TATTTGAACCAGGCACTGTAGGTGTATCATTGTCAGTTGGATATAAATTGACTTGAATTT CTGTATCTGCGACAACAAACGCTACAACTTGATCATCGTCTTCTTCATTAATTTCATTTG GTAGAGGAATAATTGTTGGTCCATTATTAACAACTACCTCAGCAGTAGTAGCAGCACGTC GACCACTTGGACGTTGTACAAGTGTATCCAGTGATTTCGGTTGACATAAACTAGCTAATC GTTGAACTAACGTAAATAAATTCGTGGAGACTAGAAGAGATGAAGATTGTGGTGGTAAAA GATTCCTTAAAGTGTTTCCACTAACTTTAGCATTATCATTATTACTGCTTCTGGAGTTAG ATGAATTCATCGTGGTATTGTCATTATCTGAAACAGAACGTCTGGAAAAGCGTCTAGATG TCCAAAATTGTCGACTTAAAGGATTTAAACTACTGCTACTACTACTACCGCTAACTCCAC AATCAGTATTTTTCGCAGAGACTTTTGAATTTTTCTTATTATTGCCCATTTCATTATTAT AATTATCAATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)