These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_768#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 725 fasta sequence [GAATTCGGCACGAGGGACTTTCAACACTGTCACGTGAACATGGACAGCAGAACAAATGCATCAACATGCAATTGAAATATCACTAGAAGCTATGGATCTATTCTCATCTCATGATGGTATAGCTGATTATATTGCAAAAATATTCAACGATACATATTCAGGTTATTGGGAATGTAAAGTTGGAACAACATTTGGAAGCTTCGATACATGTGATTTAGAATACTGTTTTCGATATTTCATTGACGAATTGGCATTCTTACTATACAAATCAAATTAATTTAATTTAAATCTAACTTGTATAAATGATTTGGATAACATTATTACCAATAAAAGGAATTACATCCAATCAATTATATTGAGAAGAATTAATATACTACCTTGTATTATCGATGAATAATGTAAATTGTTATATCCCAAAGAGAATTATGAATGGTCACTTTTGAGGACTATTTATAGACCAATGTGATGTGTACATTTCCTATTGTATAATTNTTAAGTAACTTACCTATTCATATTTCGTGTTCCTCTTATCATAAGCTNTATTNTGACCCTAT-AACTATTATTATACGATTTACCATTNNCTCAGNNTATCTTTAGNCTATTAATTACTGGNTCCCCCTA-TCACAGCCACATTTGGNCTGAGTCTTGTACCATGGNTG-TTTTCTACTTTATGG-ACGATTTGGGNCA-ATTG-TTGGNATTTAAA-CCAG-ATGTTTGGGATTATTGAT] [+] EMBL CD081882 [GAATTCGGCACGAGGGACTTTCAACACTGTCACGTGAACATGGACAGCAGAACAAATGCATCAACATGCAATTGAAATATCACTAGAAGCTATGGATCTATTCTCATCTCATGATGGTATAGCTGATTATATTGCAAAAATATTCAACGATACATATTCAGGTTATTGGGAATGTAAAGTTGGAACAACATTTGGAAGCTTCGATACATGTGATTTAGAATACTGTTTTCGATATTTCATTGACGAATTGGCATTCTTACTATACAAATCAAATTAATTTAATTTAAATCTAACTTGTATAAATGATTTGGATAACATTATTACCAATAAAAGGAATTACATCCAATCAATTATATTGAGAAGAATTAATATACTACCTTGTATTATCGATGAATAATGTAAATTGTTATATCCCAAAGAGAATTATGAATGGTCACTTTTGAGGACTATTTATAGACCAATGTGATGTGTACATTTCCTATTGTATAATTNTTAAGTAACTTACCTATTCATATTTCGTGTTCCTCTTATCATAAGCTNTATTNTGACCCTAT AACTATTATTATACGATTTACCATTNNCTCAGNNTATCTTTAGNCTATTAATTACTGGNTCCCCCTA TCACAGCCACATTTGGNCTGAGTCTTGTACCATGGNTG TTTTCTACTTTATGG ACGATTTGGGNCA ATTG TTGGNATTTAAA CCAG ATGTTTGGGATTATTG ] [-] EMBL CD075589 [ GGTATAGCTGATTATATGNCAAAAATATTCAACGATACATATTCAGGTTATTGGGAATGTAAAGTTGGAACAACATTTGGAAGCTTCGATACATGTGATTTAGAATACTGTTTTCGATATTTCATTGACGAATTGGCATTCTTACTATACAAATCAAATTAATTTAATTTAAATCTAACTTGTATAAATGATTTGGATAACATTATTACCAATAAAAGGAATTACATCCAATCAATTATATTGAGAAGAATTAATATACTACCTTGTATTATCGATGAATAATGTAAATTGTTATATCCCAAAGAGAATTATGAATGGTCACTTTTGAGGACTATTTATAGACCAATGTGATGTGTACATTTCCTATTGTATAATTTTTAAGTAACTTACCTATTCATA TTCGTGTTCCTCTTATCATAAGCTTTATTTTGA CCTATAAACTATTATTATACGATTTACCATT CTTCAG TTATCTTTAGTCTATTAATTACT GTTCCCCCTATTCACAGCCACATTTGG CTGAGTCTTGTACCAATGTTGTTTTTCTACTTTATGGTACGATAT GGTCAGTTTGTTTGGTATATAAACCCAGTATGTTTGTGAATATTGAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||