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Schistosoma mansoni
cluster # 768 cluster # 768       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_768#0 length = 725 sequences # 2  

consensusID : consensus_768#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 725
fasta sequence
                              [GAATTCGGCACGAGGGACTTTCAACACTGTCACGTGAACATGGACAGCAGAACAAATGCATCAACATGCAATTGAAATATCACTAGAAGCTATGGATCTATTCTCATCTCATGATGGTATAGCTGATTATATTGCAAAAATATTCAACGATACATATTCAGGTTATTGGGAATGTAAAGTTGGAACAACATTTGGAAGCTTCGATACATGTGATTTAGAATACTGTTTTCGATATTTCATTGACGAATTGGCATTCTTACTATACAAATCAAATTAATTTAATTTAAATCTAACTTGTATAAATGATTTGGATAACATTATTACCAATAAAAGGAATTACATCCAATCAATTATATTGAGAAGAATTAATATACTACCTTGTATTATCGATGAATAATGTAAATTGTTATATCCCAAAGAGAATTATGAATGGTCACTTTTGAGGACTATTTATAGACCAATGTGATGTGTACATTTCCTATTGTATAATTNTTAAGTAACTTACCTATTCATATTTCGTGTTCCTCTTATCATAAGCTNTATTNTGACCCTAT-AACTATTATTATACGATTTACCATTNNCTCAGNNTATCTTTAGNCTATTAATTACTGGNTCCCCCTA-TCACAGCCACATTTGGNCTGAGTCTTGTACCATGGNTG-TTTTCTACTTTATGG-ACGATTTGGGNCA-ATTG-TTGGNATTTAAA-CCAG-ATGTTTGGGATTATTGAT]

[+] EMBL CD081882             [GAATTCGGCACGAGGGACTTTCAACACTGTCACGTGAACATGGACAGCAGAACAAATGCATCAACATGCAATTGAAATATCACTAGAAGCTATGGATCTATTCTCATCTCATGATGGTATAGCTGATTATATTGCAAAAATATTCAACGATACATATTCAGGTTATTGGGAATGTAAAGTTGGAACAACATTTGGAAGCTTCGATACATGTGATTTAGAATACTGTTTTCGATATTTCATTGACGAATTGGCATTCTTACTATACAAATCAAATTAATTTAATTTAAATCTAACTTGTATAAATGATTTGGATAACATTATTACCAATAAAAGGAATTACATCCAATCAATTATATTGAGAAGAATTAATATACTACCTTGTATTATCGATGAATAATGTAAATTGTTATATCCCAAAGAGAATTATGAATGGTCACTTTTGAGGACTATTTATAGACCAATGTGATGTGTACATTTCCTATTGTATAATTNTTAAGTAACTTACCTATTCATATTTCGTGTTCCTCTTATCATAAGCTNTATTNTGACCCTAT AACTATTATTATACGATTTACCATTNNCTCAGNNTATCTTTAGNCTATTAATTACTGGNTCCCCCTA TCACAGCCACATTTGGNCTGAGTCTTGTACCATGGNTG TTTTCTACTTTATGG ACGATTTGGGNCA ATTG TTGGNATTTAAA CCAG ATGTTTGGGATTATTG  ]
[-] EMBL CD075589             [                                                                                                                   GGTATAGCTGATTATATGNCAAAAATATTCAACGATACATATTCAGGTTATTGGGAATGTAAAGTTGGAACAACATTTGGAAGCTTCGATACATGTGATTTAGAATACTGTTTTCGATATTTCATTGACGAATTGGCATTCTTACTATACAAATCAAATTAATTTAATTTAAATCTAACTTGTATAAATGATTTGGATAACATTATTACCAATAAAAGGAATTACATCCAATCAATTATATTGAGAAGAATTAATATACTACCTTGTATTATCGATGAATAATGTAAATTGTTATATCCCAAAGAGAATTATGAATGGTCACTTTTGAGGACTATTTATAGACCAATGTGATGTGTACATTTCCTATTGTATAATTTTTAAGTAACTTACCTATTCATA TTCGTGTTCCTCTTATCATAAGCTTTATTTTGA CCTATAAACTATTATTATACGATTTACCATT CTTCAG TTATCTTTAGTCTATTAATTACT GTTCCCCCTATTCACAGCCACATTTGG CTGAGTCTTGTACCAATGTTGTTTTTCTACTTTATGGTACGATAT GGTCAGTTTGTTTGGTATATAAACCCAGTATGTTTGTGAATATTGAT]


>consensus_768#0 GAATTCGGCACGAGGGACTTTCAACACTGTCACGTGAACATGGACAGCAGAACAAATGCA TCAACATGCAATTGAAATATCACTAGAAGCTATGGATCTATTCTCATCTCATGATGGTAT AGCTGATTATATTGCAAAAATATTCAACGATACATATTCAGGTTATTGGGAATGTAAAGT TGGAACAACATTTGGAAGCTTCGATACATGTGATTTAGAATACTGTTTTCGATATTTCAT TGACGAATTGGCATTCTTACTATACAAATCAAATTAATTTAATTTAAATCTAACTTGTAT AAATGATTTGGATAACATTATTACCAATAAAAGGAATTACATCCAATCAATTATATTGAG AAGAATTAATATACTACCTTGTATTATCGATGAATAATGTAAATTGTTATATCCCAAAGA GAATTATGAATGGTCACTTTTGAGGACTATTTATAGACCAATGTGATGTGTACATTTCCT ATTGTATAATTNTTAAGTAACTTACCTATTCATATTTCGTGTTCCTCTTATCATAAGCTN TATTNTGACCCTATAACTATTATTATACGATTTACCATTNNCTCAGNNTATCTTTAGNCT ATTAATTACTGGNTCCCCCTATCACAGCCACATTTGGNCTGAGTCTTGTACCATGGNTGT TTTCTACTTTATGGACGATTTGGGNCAATTGTTGGNATTTAAACCAGATGTTTGGGATTA TTGAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)