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Schistosoma mansoni
cluster # 7683 cluster # 7683       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7683#0 length = 914 sequences # 5  

consensusID : consensus_7683#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 914
fasta sequence
                              [GTGATCTTTCACCATGGAATTATCTATATCATCATCAACAACCACAGAATGTTATTATCAATAGCACTACTACTAATAATAATAATGGTCGTTTTGATGGTTTAGTTAATGGATTTCAGTTAACTGAAGAAGATTCATTCAACGATAAACTCCTTATTACTCCTAATACTTCCTCATCGAATAATAATTTGATCATGAATACAATCACAGATGATATGTCGTCCACGTGTAAAATTGCAAATGACTGTGGTAATAATAGTAATAATAAGCTTATACAAAATTCCCAATCAGCTTGTTCAACAAATGGTCTATTTTACGAGATTGTATAATCGGTGTTATAGGCATTACCACCATCGTTACTATGTTGTTTCGTTTTCTTGGTTATCGTAATG------CTCTCTCTCTCTAAAATCTCTATCTCTTGCCTTCAATTATTTTTAACTTCTGTCAAAATGTTTTATTTTGGTTTCAAGTTTTCTCTTGTTATTATTGTTTTCTGCTTATATAGCGTTAAATGCGAAACCCAGCAGTCAGCCACTATTACTATTAGTATGTAATGTTTTATTTTGTTTCACTAATGAAAATGTTAGCTTTGGATGTGGATCGTATACAACAATTAGGTGAAGTTGATGTGGAGCTCAAATGGTTGTGTTTATTTTATCTCGTTTTGTTCATTACGTAATGTGTGTGTGTGAACATATTGCCATATGTGTTACTAAACCGTTTGATGTGTTTATTTATTCGGTGTATTCTCAACCTCTTAATCTTATTGATTTAATATATCTCTCTTAGTATGTGAGCTTGCCTATGTAACCACGTGCCACATTCATCATTTTCTAAAACCTCTGCTTACTGTCTATTAATCTTTTATTGGCTCTTATGTCATCGTATTCATATCTTATCTCTTTTCTTTACTC]

[-] EMBL CD142555             [GTGATCTTTCACCATGGAATTATCTATATCATCATCAACAACCACAGAATGTTATTATCAATAGCACTACTACTAATAATAATAATGGTCGTTTTGATGGTTTAGTTAATGGATTTCAGTTAACTGAAGAAGATTCATTCAACGATAAACTCCTTATTACTCCTAATACTTCCTCATCGAATAATAATTTGATCATGAATACAATCACAGATGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD071534             [                                                                                                                                       CATTCAACGATAAACTCCTTATTACTCCTAATACTTCCTCATCGAATAATAATTTGATCATGAATACAATCACAGATGATATGTCGTCCACGTGTAAAATTGCAAATGACTGTGGTAATAATAGTAATAATAAGCTTATACAAAATTCCCAATCAGTTTGTTCAACAAATGGTCTATTTTACGAGATTGTATAATCGGTGTTATGGACATTACCACCATCGTTACTATGTTGTTTCGTTTTCTTGATTATCGGAATG      CTCTCTCTCTCTAAAATCTCTATCTCTTGACTTCAATTATTTTTAACTTCTGTCAAAATGTTTTATTTTGGTTTCAAGTTTTCTCTTGTTATTATTGTTTTCTGCTTATATAGCGTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD196551             [                                                                                                                                                                                                                                                                   TAATAATAAGCTTATACAAAATTCCCAATCAGCTTGTTCAACAAATGGTCTATTTTACGAGATTGTATAATCGGTGTTATAGGCATTACCACCATCGTTACTATGTTGTTTCGTTTTCTTGGTTATTGTAATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAAATCTCTATCTCTTGCCTTCAATTATTTTTAACTTCTGTCAAAATGTTTTATTTTGGTTTCAAGTTTTCTCTTGTTATTATTGTTTTCTGCGTATACAGCGTTAAATGCGAAACCCAGCAGTCAGCCACTATTACTATTAGTATGTAATGTTTTATCTTGTTTCACTAATGAAAATGTTAGCTTTGGATGTGGATCGTATACAACAATTAGGTGAAGTTGATGTGGAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD197060             [                                                                                                                                                                                                                                                                    AATAATAAGCTTATACAAAATTCCCAATCAGCTTGTTCAACAAATGGTCTATTTTACGAGATTGTATAATCGGTGTTATAGGCATTACCACCATCGTTACTATGTTGTTTCGTTTTCTTGGTTATCGTAATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAAATCTCTATCTCTTGCCTTCAATTATTTTTAACTTCTGTCAAAATGTTTTATTTTGGTTTCAAGTTTTCTCTTGTTATTATTGTTTTCCGCGTATACAGCGTTAAATGCGAAACCCAGCAGTCAGCCACTATTACTATTAGTATGTAATGTTTTATTTTGTTTCACTAATGAAAATGTTAGCTTTGGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD169753             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTATTTTGGTTTCAAGTTTTCTCTTGTTATTATTGTTTTCTGCTTATATAGCGTTAAATGCGAAACCCAGCAGTCAGCCACTATTACTATTATTACGTAATGCTTTATTTTGTTTCACTAATGAAAATGTTAGCTTTGGATGTGGATCGTATACAACAATTAGGTGAAGTTGATGTGGAGCTCAAATGGTTGTGTTTATTTTATCTCGTTTTGTTCATTACGTAATGTGTGTGTGTGAACATATTGCCATATGTGTTACTAAACCGTTTGATGTGTTTATTTATTCGGTGTATTCTCAACCTCTTAATCTTATTGATTTAATATATCTCTCTTAGTATGTGAGCTTGCCTATGTAACCACGTGCCACATTCATCATTTTCTAAAACCTCTGCTTACTGTCTATTAATCTTTTATTGGCTCTTATGTCATCGTATTCATATCTTATCTCTTTTCTTTACTC]


>consensus_7683#0 GTGATCTTTCACCATGGAATTATCTATATCATCATCAACAACCACAGAATGTTATTATCA ATAGCACTACTACTAATAATAATAATGGTCGTTTTGATGGTTTAGTTAATGGATTTCAGT TAACTGAAGAAGATTCATTCAACGATAAACTCCTTATTACTCCTAATACTTCCTCATCGA ATAATAATTTGATCATGAATACAATCACAGATGATATGTCGTCCACGTGTAAAATTGCAA ATGACTGTGGTAATAATAGTAATAATAAGCTTATACAAAATTCCCAATCAGCTTGTTCAA CAAATGGTCTATTTTACGAGATTGTATAATCGGTGTTATAGGCATTACCACCATCGTTAC TATGTTGTTTCGTTTTCTTGGTTATCGTAATGCTCTCTCTCTCTAAAATCTCTATCTCTT GCCTTCAATTATTTTTAACTTCTGTCAAAATGTTTTATTTTGGTTTCAAGTTTTCTCTTG TTATTATTGTTTTCTGCTTATATAGCGTTAAATGCGAAACCCAGCAGTCAGCCACTATTA CTATTAGTATGTAATGTTTTATTTTGTTTCACTAATGAAAATGTTAGCTTTGGATGTGGA TCGTATACAACAATTAGGTGAAGTTGATGTGGAGCTCAAATGGTTGTGTTTATTTTATCT CGTTTTGTTCATTACGTAATGTGTGTGTGTGAACATATTGCCATATGTGTTACTAAACCG TTTGATGTGTTTATTTATTCGGTGTATTCTCAACCTCTTAATCTTATTGATTTAATATAT CTCTCTTAGTATGTGAGCTTGCCTATGTAACCACGTGCCACATTCATCATTTTCTAAAAC CTCTGCTTACTGTCTATTAATCTTTTATTGGCTCTTATGTCATCGTATTCATATCTTATC TCTTTTCTTTACTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)