Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7692 cluster # 7692       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7692#0 length = 1082 sequences # 5  
consensusID : consensus_7692#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1082
fasta sequence 
                              [CAAGAATCGGCACGAGGCCGCAAAAGTAATGCTGAACAAGATTATTATGACATTCTTGGGATAAGTAAATCAGCCTCGAATAGTGATGTTAAAAAAGCCTTCCGTAAACTAGCGTTAAAATATCATCCAGATAAAAATAAAGATGAAGACGCACAGAAAAAGTTTGTGAAAATTGCTGAAGCTTATGATGTTCTCTCTGATGATGAAAAACGTAGACAGTATGATAGTGTTGGACATAGTTATTATACACAACAGCCTGGTGGAAATGGTGCTCCAGATTTTGATTTTAATAGCTTCTTCCGAAACTTCGATATGTTTCGTCAGCACAGACATTCTGATGATCATGGTTCGTTCTTCAATTTCCGTGGATTATTTGACGACGATGATGGTGATGACGATGGCTTTTTTTCACCATTCGGCGGTATGTTCCATTCATCAGATGAATCTCATGGGTTTATTAGACATCAAGGTCAACAAAACTGTCAAACTCAAACTATACGAAGAGGTAACACAATTATTACTCAAACACGTTGTTCTTAATTACATCCTAAAAGTGATTTCATTGATATTATTTTGTACGATTTTACGGAAATGTCTCACGGTTGTTTGCCCTCTTGATAAGCTTAAAATTTTGTACAGCCGATGATCGTTATTATAGTGGTTCACAACGTCATTTTGTGTATATGAACGTTGCATTAC-TTTTTCTATTAATCCACATAAAATAACTGGTTGTTTATATCACAAAGTGTTTTGTTTTTTTTGAAAAATGATTTTTATATACAAAGACGTATCTTTACTTGTTCATCTCTTCTGCTTTATTATGTTGAGACCATTGTCTTTCTCTTCTCATTGATTGATGTGGATAATTTTAAAAAGTAAAGAAAGTGTGTAAATGGGGATTTCCACAAACAATAGAAAAACCATGATAAATAAAAATTTCCATCACTTCATTTGTTGGATAGATATAACCAACTGTTGGTTTTTGTTTGGTTTAACAAATTTTCATAATAAAAATTAAAGCCATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTTCCGTACTGCG]

[+] EMBL CD081425             [CAAGAATCGGCACGAGGCCGCAAAAGTAATGCTGAACAAGATTATTATGACATTCTTGGGATAAGTAAATCAGCCTCGAATAGTGATGTTAAAAAAGCCTTCCGTAAACTAGCGTTAAAATATCATCCAGATAAAAATAAAGATGAAGACGCACAGAAAAAGTTTGTGAAAATTGCTGAAGCTTATGATGTTCTCTCTGATGATGAAAAACGTAGACAGTATGATAGTGTTGGACATAGTTATTATACACAACAGCCTGGTGGAAATGGTGCTCCAGATTTTGATTTTAATAGCTTCTTCCGAAACTTCGATATGTTTCGTCAGCACAGACATTCTGATGATCATGGTTCGTTCTTCAATTTCCGTGGATTATTTGACGACGATGATGGTGATGACGATGGCTTTTTTTCACCATTCGGCGGTATGTTCCATTCATCAGATGAATCTCATGGGTTTATTAGACATCAAGGTCAACAAAACTGTCAAACTCAAACTATACGAAGAGGTAACACAATTATTACTCAAACACGTTGTTCTTAATTACATCCTAAAAGTGATTTCATTGATATTATTTTGTACGATTTTACGGAAATGTCTCACGGTTGTTTGCCCTCTTGATAAGCTTAAAATTNTGTACAGCCGATGATCGTTATTATAGTGGTTCACAACGTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD083719             [                                                                                                                                                    gCGCACAGAAAAAGTTTGTGAAAATTGCTGAAGCTTATGATGTTCTCTCTGATGATGAAAAACGTAGACAGTATGATAGTGTTGGACATAGTTATTATACACAACAGCCTGGTGGAAATGGTGCTCCAGATTTTGATTTTAATAGCTTCTTCCGAAACTTCGATATGTTTCGTCAGCACAGACATTCTGATGATCATGGTTCGTTCTTCAATTTCCGTGGATTATTTGACGACGATGATGGTGATGACGATGGCTTTTTTTCACCATTCGGCGGTATGTTCCATTCATCAGATGAATCTCATGGGTTTATTAGACATCAAGGTCAACAAAACTGTCAAACTCAAACTATACGAAGAGGTAACACAATTATTACTCAAACACGTTGTTCTTAATTACATCCTAAAAGTGATTTCATTGATATTATTTTGTACGATTTTACGGAAATGTCTCACGGTTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD160021             [                                                                                                                                                                                                                                                           ACAGCCTGGTGGAAATGGTGCTCCAGATTTTGATTTTAATAGCTTCTTCCGAAACTTCGATATGTTTCGTCAGCACAGACATCCTGATGATCATGGTTCGTTCTTCAATTTCCGTGGATTATTTGACGGCGATGATGGTGGTGACGATGGCTTTTCTTCACCATTCGGCGGTATGTTCCATTCATCAGATGAATCTCATGGGTTTATTAGACATCAAGGTCAACAAAACTGTCAAACTCAAACTATACGAAGAGGTAACACAATTATTACTCAAACACGTTGTTCTTAATTACATCCTAAAAGTGATTTCATTGATATTATTTTGTACGATTTTACGGAAATGTCTCACGGTTGTTTGCCCTCTTGATAAGCTTAAAATTTTGTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD075251             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAACACG TGTTCTTAATTACATCCTAAAAGTGATTTCATTGATATTATTTTGTACGATTTTACGGAAATGTCTCACGGTTGTTTGCCCTCTTGATAAGCTTAAAATTTTGTACAGCCGATGATCGTTATTATAGTGTTTCACAACGTCATTTTGTGTATATGAACGTTGCATTAC TTTTTCTATTAATCCACATAAAATAACTGGTTGTTTATATCACAAAGTGTTTTGTTTTTTTTGAAAAATGATTTTTATATACAAAGACGTATCTTTACTTGTTCATCTCTTCTGCTTTATTATGTTGAGACCATTGTCTTTCTCTTCTCATTGATTGATGTGGATAATTTTAAAAAGTAAAGAAAGTGTGTAAATGGGGATTTCCACAAACAATAGAAAAACCATGATAAATAAAAATTTCCATCACTTCATTTGTTGGATAGATATAACCAACTGTTGGTTTTTGTTTGGTTTAACAAATTTTCATAATAAAAATT                                                                  ]
[-] EMBL AI974968             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CACAACGTCATTTTGTGTATATGAACGCTGCATAACTTTTTTCTATTAATCCACAAAAAATAATTGGTTGTTTAAATCACAAAGTGTTATGTTTTTTTTGAAAAATGATTTTTATATACAAAGACGTATCTTTACTTGTTCATCTATTCTGCTTTATTATGTTGAGACCATTGTCTTTCTCTTCTCATTGATTGATGAGAATAATTTTAAAAAGTAAAGAAAGTGTGTAAATGGGGATTTCCACAAACAATAGAAAAACCATGATAAATAAAAATTTCCATCACTTCATTTGTTGGATAGAAATAACCAACTGTTGGTTTTTGTTTGGTTTAACAAATTTTAATAATAAAAATTAAAGCCATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTTCCGTACTGCG]




>consensus_7692#0
CAAGAATCGGCACGAGGCCGCAAAAGTAATGCTGAACAAGATTATTATGACATTCTTGGG
ATAAGTAAATCAGCCTCGAATAGTGATGTTAAAAAAGCCTTCCGTAAACTAGCGTTAAAA
TATCATCCAGATAAAAATAAAGATGAAGACGCACAGAAAAAGTTTGTGAAAATTGCTGAA
GCTTATGATGTTCTCTCTGATGATGAAAAACGTAGACAGTATGATAGTGTTGGACATAGT
TATTATACACAACAGCCTGGTGGAAATGGTGCTCCAGATTTTGATTTTAATAGCTTCTTC
CGAAACTTCGATATGTTTCGTCAGCACAGACATTCTGATGATCATGGTTCGTTCTTCAAT
TTCCGTGGATTATTTGACGACGATGATGGTGATGACGATGGCTTTTTTTCACCATTCGGC
GGTATGTTCCATTCATCAGATGAATCTCATGGGTTTATTAGACATCAAGGTCAACAAAAC
TGTCAAACTCAAACTATACGAAGAGGTAACACAATTATTACTCAAACACGTTGTTCTTAA
TTACATCCTAAAAGTGATTTCATTGATATTATTTTGTACGATTTTACGGAAATGTCTCAC
GGTTGTTTGCCCTCTTGATAAGCTTAAAATTTTGTACAGCCGATGATCGTTATTATAGTG
GTTCACAACGTCATTTTGTGTATATGAACGTTGCATTACTTTTTCTATTAATCCACATAA
AATAACTGGTTGTTTATATCACAAAGTGTTTTGTTTTTTTTGAAAAATGATTTTTATATA
CAAAGACGTATCTTTACTTGTTCATCTCTTCTGCTTTATTATGTTGAGACCATTGTCTTT
CTCTTCTCATTGATTGATGTGGATAATTTTAAAAAGTAAAGAAAGTGTGTAAATGGGGAT
TTCCACAAACAATAGAAAAACCATGATAAATAAAAATTTCCATCACTTCATTTGTTGGAT
AGATATAACCAACTGTTGGTTTTTGTTTGGTTTAACAAATTTTCATAATAAAAATTAAAG
CCATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTTCCGTACTG
CG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)