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Schistosoma mansoni
cluster # 7741 cluster # 7741       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7741#0 length = 1147 sequences # 5  

consensusID : consensus_7741#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1147
fasta sequence
                              [GGTCATCGGTTTCTCAAAAATGTCATTTCTTAAAAACTGTCGTGTTTTACTAAAGAGTGCAAACTCAGATATAGGAGAATCGCCTCAACAGTACAATGTTATTTTGGAAAATCGATTTGTGAGAGGTGCTTTATTATTTGATTCAGGGGCTATCGCCCATATCAGTCCTTATGAATTCGACTTTCGAAAGTGCCAGTACACTAAAGCTGTTGACGCTTATGCTTGCCTAGGCGTGTTGGTTCCTATGACATCACCTACCTCAGACTCAAGCATTATGGCGCCACAGTCTTATCTTGTTTTGGCTACTGGATGTACTTCTGTGGGGAAGCTGCCGCTCTTTGAGGTTTTTCGCATCACCAATGTGCAATTCATCAATATGAAGTGTCAAGGAGTTGAAGAAGACATCTATCCTGATCTCCGAAAACTGCTGTCATCGGGAATGTTTTACTTTGCTCGATCCAATATTGATGGGAAACCATTCGATTTAACTGTCAACATTCAGAACCGAAGTCGTTTGGGTGATGAACTTTTGACTTCCAGTGATATATACACTCGAGGTGATGCTGGACTAAATTTTCTGTGGAACAAAGGGTTGATGGGACCTTTGATACGAGCTGGAATCAATCCCAGTGATTGGTTGGTATCCATAATATGTGGTGGATTCGAGGTTTGTACAGTCTATTGCAGCGTTGGTCAAGCTCGAGTTGGTGTCGTATCAAGAGTGTCAGCTCAGAGACCTGGTACCCGTTTTCATGTACGCGGGTTAAATGATTGTGGCGATGTTGCCAATTTTGTTGAAACAGAACAATTTATCTATTTAGGTGACTCTGTCAGTAGTTATATTCAAGTTCGTGGTACAGTTCCATTATTTTGGGAGCAACCAGGTTTACAAGTTGGTTCACATAAAATTTCACTTAGTCGACCGTTAGAAATATCAATGAGTGCATTTGAACGTCATTTTATGAATTTAATATCACAGTATGGATCAGTTGGCGTTGTTAATTTGTTAGGTTGTAAACAAGGCGAGGCAATGCTTAGTAAAGCCTATCAGGAACAACATAGAAAATCATCTTTTCGAAATACTATTCACCATATTATATTTGATTATCATTCGGAATTACAATCTAAGGGTGCAAAAAGTTTAGAA]

[+] EMBL CD187220             [GGTCATCGGTTTCTCAAAAATGTCATTTCTTAAAAACTGTCGTGTTTTACTAAAGAGTGCAAACTCAGATATAGGAGAATCGCCTCAACAGTACAATGTTATTTTGGAAAATCGATTTGTGAGAGGTGCTTTATTATTTGATTCAGGGGCTATCGCCCATATCAGTCCTTATGAATTCGACTTTCGAAAGTGCCAGTACACTAAAGCTGTTGACGCTTATGCTTGCCTAGGCGTGTTGGTTCCTATGACATCACCTACCTCAGACTCAAGCATTATGGCGCCACAGTCTTATCTTGTTTTGGCTACTGGATGTACTTCTGTGGGGAAGCTGCCGCTCTTTGAGGTTTTTCGCATCACCAATGTGCAATTCATCAATATGAAGTGTCAAGGAGTTGAAGAAGACATCTATCCTGATCTCCGAAAACTGCTGTCATCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD155179             [                                                                               TCGCCTCAACAGTACAATGTTATTTTGGAAAATCGATTTGTGAGAGGTGCTTTATTATTTGATTCAGGGGCTATCGCCCATATCAGTCCTTATGAATTCGACTTTCGAAAGTGCCAGTACACTAAAGCTGTTGACGCTTATGCTTGCCTAGGCGTATTGGTTCCTATGACATCACCTACCTCAGACTCAAGCATTATGGCGCCACAGTCTTATCTTGTTTTGGCTACTGGATGTACTTCTGTGGGGAAGCTGCCGCTCTTTGAGGTTTTTCGCATCACCAATGTGCAATTCATCAATATGAAGTGTCAAGGAGTTGAAGAAGACATCTATCCTGATCTCCGAAAACTGCTGTCATCGGGAATGTTTTACTTTGCTCGATCCAATATTGATGGGAAACCATTCGATTTAACTGTCAACATTCAGAACCGAAGTCGTTTGGGTGATGAACTTTTGACTTCCAGTGATATATACACTCGAGGTGATGCTGGACTAAATTTTCTGTGGAACAAAGGGTTGATGGGACCTTTGATACGAGCTGGAATCAATCCCAGTGATTGGTTGGTATCCATAATATGTGGTGGATTCGAGGTTTGTACAGTCTATTGCAGCGTTGGTCAAGCTCGAGTTGGTGTCGTATCAAGAGTGTCAGCTCAGAGACCTGGTACCCGTTTTCATGTACGCGGGTTAAATGATTGTGGCGATTGTGCCATTTTTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD066261             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCATCAATATGAAGTGTCAAGGAGTTGAAGAAGACATCTATCCTGATCTCCGAAAACTGCTGTCATCGGGAATGTTTTACTTTGCTCGATCCAATATTGATGGGAAACCATTCGATTTAACTGTCAACATTCAGAACCGAAGCCGTTTGGGTGATGAACTTTTGACTTCCAGTGATATATACACTCGAGGTGATGCTGGACTAAATTTTCTGTGGAACAAAGGGTTGATGGGACCTTTGATACGAGCTGGAATCAATCCCAGTGATTGGTTGGTATCCATAATATGTGGTGGATTCGAGGTTTGTACAGTCTATTGCAGCGTTGGTCAAGCTCGAGTTGGTGTCGTATCAAGAGTGTCAGCTCAGAGACCTGGTACCCGTTTTCATGTACGCGGGTTAAATGATTGTGGCGATGTTGCCAATTTTGTTGAAACAGAACAATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD091737             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAGAGTGTCAGCTCAGAGACCTGGTACCCGTTTTCATGTACGCGGGTTAAATGATTGTGGCGATGTTGCCAATTTTGTTGAAACAGAACAATTTATCTATTTAGGTGACTCTGTCAGTAGTTATATTCAAGTTCGTGGTACAGTTCCATTATTTTGGGAGCAACCAGGTTTACAAGTTGGTTCACATAAAATTTCACTTAGTCGACCGTTAGAAATATCAATGAGTGCATTTGAACGTCATTTTATGAATTTAATATCACAGTATGGATCAGTTGGCGTTGTTAATTTGTTA                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD160565             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACTCTGTCAGTAGTTATATTCAAGTTCGTGGTACAGTTCCATTATTTTGGGAGCAACCAGGTTTACAAGTTGGTTCACATAAAATTTCACTTAGTCGACCGTTAGAAATATCAATGAGTGCATTTGAACGTCATTTTATGAATTTAATATCACAGTATGGATCAGTTGGCGTTGTTAATTTGTTAGGTTGTAAACAAGGCGAGGCAATGCTTAGTAAAGCCTATCAGGAACAACATAGAAAATCATCTTTTCGAAATACTATTCACCATATTATATTTGATTATCATTCGGAATTACAATCTAAGGGTGCAAAAAGTTTAGAA]


>consensus_7741#0 GGTCATCGGTTTCTCAAAAATGTCATTTCTTAAAAACTGTCGTGTTTTACTAAAGAGTGC AAACTCAGATATAGGAGAATCGCCTCAACAGTACAATGTTATTTTGGAAAATCGATTTGT GAGAGGTGCTTTATTATTTGATTCAGGGGCTATCGCCCATATCAGTCCTTATGAATTCGA CTTTCGAAAGTGCCAGTACACTAAAGCTGTTGACGCTTATGCTTGCCTAGGCGTGTTGGT TCCTATGACATCACCTACCTCAGACTCAAGCATTATGGCGCCACAGTCTTATCTTGTTTT GGCTACTGGATGTACTTCTGTGGGGAAGCTGCCGCTCTTTGAGGTTTTTCGCATCACCAA TGTGCAATTCATCAATATGAAGTGTCAAGGAGTTGAAGAAGACATCTATCCTGATCTCCG AAAACTGCTGTCATCGGGAATGTTTTACTTTGCTCGATCCAATATTGATGGGAAACCATT CGATTTAACTGTCAACATTCAGAACCGAAGTCGTTTGGGTGATGAACTTTTGACTTCCAG TGATATATACACTCGAGGTGATGCTGGACTAAATTTTCTGTGGAACAAAGGGTTGATGGG ACCTTTGATACGAGCTGGAATCAATCCCAGTGATTGGTTGGTATCCATAATATGTGGTGG ATTCGAGGTTTGTACAGTCTATTGCAGCGTTGGTCAAGCTCGAGTTGGTGTCGTATCAAG AGTGTCAGCTCAGAGACCTGGTACCCGTTTTCATGTACGCGGGTTAAATGATTGTGGCGA TGTTGCCAATTTTGTTGAAACAGAACAATTTATCTATTTAGGTGACTCTGTCAGTAGTTA TATTCAAGTTCGTGGTACAGTTCCATTATTTTGGGAGCAACCAGGTTTACAAGTTGGTTC ACATAAAATTTCACTTAGTCGACCGTTAGAAATATCAATGAGTGCATTTGAACGTCATTT TATGAATTTAATATCACAGTATGGATCAGTTGGCGTTGTTAATTTGTTAGGTTGTAAACA AGGCGAGGCAATGCTTAGTAAAGCCTATCAGGAACAACATAGAAAATCATCTTTTCGAAA TACTATTCACCATATTATATTTGATTATCATTCGGAATTACAATCTAAGGGTGCAAAAAG TTTAGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)