These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7741#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1147 fasta sequence [GGTCATCGGTTTCTCAAAAATGTCATTTCTTAAAAACTGTCGTGTTTTACTAAAGAGTGCAAACTCAGATATAGGAGAATCGCCTCAACAGTACAATGTTATTTTGGAAAATCGATTTGTGAGAGGTGCTTTATTATTTGATTCAGGGGCTATCGCCCATATCAGTCCTTATGAATTCGACTTTCGAAAGTGCCAGTACACTAAAGCTGTTGACGCTTATGCTTGCCTAGGCGTGTTGGTTCCTATGACATCACCTACCTCAGACTCAAGCATTATGGCGCCACAGTCTTATCTTGTTTTGGCTACTGGATGTACTTCTGTGGGGAAGCTGCCGCTCTTTGAGGTTTTTCGCATCACCAATGTGCAATTCATCAATATGAAGTGTCAAGGAGTTGAAGAAGACATCTATCCTGATCTCCGAAAACTGCTGTCATCGGGAATGTTTTACTTTGCTCGATCCAATATTGATGGGAAACCATTCGATTTAACTGTCAACATTCAGAACCGAAGTCGTTTGGGTGATGAACTTTTGACTTCCAGTGATATATACACTCGAGGTGATGCTGGACTAAATTTTCTGTGGAACAAAGGGTTGATGGGACCTTTGATACGAGCTGGAATCAATCCCAGTGATTGGTTGGTATCCATAATATGTGGTGGATTCGAGGTTTGTACAGTCTATTGCAGCGTTGGTCAAGCTCGAGTTGGTGTCGTATCAAGAGTGTCAGCTCAGAGACCTGGTACCCGTTTTCATGTACGCGGGTTAAATGATTGTGGCGATGTTGCCAATTTTGTTGAAACAGAACAATTTATCTATTTAGGTGACTCTGTCAGTAGTTATATTCAAGTTCGTGGTACAGTTCCATTATTTTGGGAGCAACCAGGTTTACAAGTTGGTTCACATAAAATTTCACTTAGTCGACCGTTAGAAATATCAATGAGTGCATTTGAACGTCATTTTATGAATTTAATATCACAGTATGGATCAGTTGGCGTTGTTAATTTGTTAGGTTGTAAACAAGGCGAGGCAATGCTTAGTAAAGCCTATCAGGAACAACATAGAAAATCATCTTTTCGAAATACTATTCACCATATTATATTTGATTATCATTCGGAATTACAATCTAAGGGTGCAAAAAGTTTAGAA] [+] EMBL CD187220 [GGTCATCGGTTTCTCAAAAATGTCATTTCTTAAAAACTGTCGTGTTTTACTAAAGAGTGCAAACTCAGATATAGGAGAATCGCCTCAACAGTACAATGTTATTTTGGAAAATCGATTTGTGAGAGGTGCTTTATTATTTGATTCAGGGGCTATCGCCCATATCAGTCCTTATGAATTCGACTTTCGAAAGTGCCAGTACACTAAAGCTGTTGACGCTTATGCTTGCCTAGGCGTGTTGGTTCCTATGACATCACCTACCTCAGACTCAAGCATTATGGCGCCACAGTCTTATCTTGTTTTGGCTACTGGATGTACTTCTGTGGGGAAGCTGCCGCTCTTTGAGGTTTTTCGCATCACCAATGTGCAATTCATCAATATGAAGTGTCAAGGAGTTGAAGAAGACATCTATCCTGATCTCCGAAAACTGCTGTCATCGG ] [+] EMBL CD155179 [ TCGCCTCAACAGTACAATGTTATTTTGGAAAATCGATTTGTGAGAGGTGCTTTATTATTTGATTCAGGGGCTATCGCCCATATCAGTCCTTATGAATTCGACTTTCGAAAGTGCCAGTACACTAAAGCTGTTGACGCTTATGCTTGCCTAGGCGTATTGGTTCCTATGACATCACCTACCTCAGACTCAAGCATTATGGCGCCACAGTCTTATCTTGTTTTGGCTACTGGATGTACTTCTGTGGGGAAGCTGCCGCTCTTTGAGGTTTTTCGCATCACCAATGTGCAATTCATCAATATGAAGTGTCAAGGAGTTGAAGAAGACATCTATCCTGATCTCCGAAAACTGCTGTCATCGGGAATGTTTTACTTTGCTCGATCCAATATTGATGGGAAACCATTCGATTTAACTGTCAACATTCAGAACCGAAGTCGTTTGGGTGATGAACTTTTGACTTCCAGTGATATATACACTCGAGGTGATGCTGGACTAAATTTTCTGTGGAACAAAGGGTTGATGGGACCTTTGATACGAGCTGGAATCAATCCCAGTGATTGGTTGGTATCCATAATATGTGGTGGATTCGAGGTTTGTACAGTCTATTGCAGCGTTGGTCAAGCTCGAGTTGGTGTCGTATCAAGAGTGTCAGCTCAGAGACCTGGTACCCGTTTTCATGTACGCGGGTTAAATGATTGTGGCGATTGTGCCATTTTTGTT ] [-] EMBL CD066261 [ TCATCAATATGAAGTGTCAAGGAGTTGAAGAAGACATCTATCCTGATCTCCGAAAACTGCTGTCATCGGGAATGTTTTACTTTGCTCGATCCAATATTGATGGGAAACCATTCGATTTAACTGTCAACATTCAGAACCGAAGCCGTTTGGGTGATGAACTTTTGACTTCCAGTGATATATACACTCGAGGTGATGCTGGACTAAATTTTCTGTGGAACAAAGGGTTGATGGGACCTTTGATACGAGCTGGAATCAATCCCAGTGATTGGTTGGTATCCATAATATGTGGTGGATTCGAGGTTTGTACAGTCTATTGCAGCGTTGGTCAAGCTCGAGTTGGTGTCGTATCAAGAGTGTCAGCTCAGAGACCTGGTACCCGTTTTCATGTACGCGGGTTAAATGATTGTGGCGATGTTGCCAATTTTGTTGAAACAGAACAATTT ] [-] EMBL CD091737 [ AAGAGTGTCAGCTCAGAGACCTGGTACCCGTTTTCATGTACGCGGGTTAAATGATTGTGGCGATGTTGCCAATTTTGTTGAAACAGAACAATTTATCTATTTAGGTGACTCTGTCAGTAGTTATATTCAAGTTCGTGGTACAGTTCCATTATTTTGGGAGCAACCAGGTTTACAAGTTGGTTCACATAAAATTTCACTTAGTCGACCGTTAGAAATATCAATGAGTGCATTTGAACGTCATTTTATGAATTTAATATCACAGTATGGATCAGTTGGCGTTGTTAATTTGTTA ] [+] EMBL CD160565 [ ACTCTGTCAGTAGTTATATTCAAGTTCGTGGTACAGTTCCATTATTTTGGGAGCAACCAGGTTTACAAGTTGGTTCACATAAAATTTCACTTAGTCGACCGTTAGAAATATCAATGAGTGCATTTGAACGTCATTTTATGAATTTAATATCACAGTATGGATCAGTTGGCGTTGTTAATTTGTTAGGTTGTAAACAAGGCGAGGCAATGCTTAGTAAAGCCTATCAGGAACAACATAGAAAATCATCTTTTCGAAATACTATTCACCATATTATATTTGATTATCATTCGGAATTACAATCTAAGGGTGCAAAAAGTTTAGAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||