These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7761#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 618 fasta sequence [TTGCAATTGTGTTGGATATAATTGACTGAATAGCAAATTAGCATTTGTCGACATACCCGTATAATTATAGGTGACAGGATTTGATTTCGTTGTACTTATTGTTGTCATTGAAGTAGGAATAGTGGCAGGAAGCAATGACAATGAACTTGGATTTAAAACATTTTGAAATGTTAAAGTATTTGTACCTTGTTGGTTTGACTGTATTTGTTGGGACTGTTGTTGTTGCTGTAATAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTAGCTGCAGATGTTGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGATGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTTTGTATTCAAAGAACCTGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTCATTATGTAAAGACAAGTCTAATGCATCAGCTTCATTTGAAGTACTTTGTTGTGTAGTCGAAGATTCCAGAGATATTGCACTCAATATAGGCTTTTTTTTCATTGAGCA] [+] EMBL CD152993 [TTGCAATTGTGTTGGATATAATTGACTGAATAGCAAATTAGCATTTGTCGACATACCCGTATAATTATAGGTGACAGGATTTGATTTCGTTGTACTTATTGTTGTCATTGAAGTAGGAATAGTGGCAGGAAGCAATGACAATGAACTTGGATTTAAAACATTTTGAAATGTTAAAGTATTTGTACCTTGTTGGTTTGACTGTATTTGTTGGGACTGTTGTTGTTGCTGTAATAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTAGCTGCAGATGTTGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGATGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGCATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTNTGTATTCAAAGAACCTGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTCATTATGTAAAGACAAGTCTAATGCATCAGCTTCATTTGAAGTACTTTGTT ] [-] EMBL CD166353 [ ATTTCGTTGTACTTATTGTTGTCATTGAAGTAGGAATAGTGGCAGGAAGCAATGACAATGAACTTGGATTTAAAACATTTTGAAATGTTAAAGTATTTGTACCTTGTTGGTTTGACTGTATTTGTTGGGACTGTTGTTGTTGCTGTAATAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTAGCTGCAGATGTTGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGATGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTTTGTATTCAAAGAACCTGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTCATTATGTAAAGACAAGTTTAATGCATCAGCTCCATTTGAAGTACTTTGTTGTGTAGTCGAAGATT ] [+] EMBL CD146895 [ ACTTATTGTTGTCATTGAAGTAGGAATAGTGGCAGGAAGCAATGACAATGAACTTGGATTTAAAACATTTTGAAATGTTAAAGTATTTGTACCTTGTTGGTTTGACTGTATTTGTTGGGACTGTTGTTGGTGCTGTAATAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTAGCTGCAGATGTTGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGATGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTTTGTATTCAAAGAACCTGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTTATTATGTAAAGACAAGTCT ] [+] EMBL CD187261 [ GGACTGTTGTTGTTGCTGTACTAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTATCTGCAGATGTTGTACTCACAATTTTATCCCATGCTTTCGTCCTATACATATTGGACTGTACAGGGCTAGATTATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATCGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTCGATATTGTATTCAAAGAACCTGTATG ] [-] EMBL BG931809 [ gattcGTTGCTGTAATAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAAATAGCTGCAGATGTTGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGATGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTTTGTATTCAAAGAACCTGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTCATTATGTAAAGACAAGTCTAATGCATCAGCTTCATTTGAAGTACTTTGTTGTGTAGTCGAAGATTCCAGAGATATTGCACTCAATATAGGCTTTTTTTTCATTGAGCA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||