These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7820#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 445 fasta sequence [CGTTGATTAGTAGTCAATGTGACTAATGAAGATTGATTTTGATGGAAACCATTTCCAAGAGTATTATTCGTATTGTTAGAACATGGTAGGACAGAACGAAGAAGCATTCCTCCACTTGGAGTTGAGTTGGTGAAACTTCTTCCAAATGTATTCGACATTGACTGATGTTGTGGTGCAGCGATAATTTGCTGTCCAGTCGGTGATTGAAATATGATCTGTTGTGGATGTTGTTGTTGCGGTTGTGGTGTAAAACAACCATGGATTGTTTGATACTGTGGTGGAGTACCAACGCCGCCACCACCAACAGGAACAGCAGCAGCGGTAGCGGGTGAAAGTTGAAC-TTTCTG-TG-NTGNTGCTGCTNGTGCTGNTGATAGTGTGTAGGATGAGGCGTCAATGCAGCAGAGAATTGATGT-GGGTG-TGTACATAATG-CCGATTCAATTGGTTA] [+] EMBL CD115837 [CGTTGATTAGTAGTCAATGTGACTAATGAAGATTGATTTTGATGGAAACCATTTCCAAGAGTATTATTCGTATTGTTAGAACATGGTAGGACAGAACGAAGAAGCATTCCTCCACTTGGAGTTGAGTTGGTGAAACTTCTTCCAAATGTATTCGACATTGACTGATGTTGTGGTGCAGCGATAATTTGCTGTCCAGTCGGTGATTGAAATATGATCTGTTGTGGATGTTGTTGTTGCGGTTGTGGTGTAAAACAACCATGGATTGTTTGATACTGTGGTGGAGTACCAACGCCGCCACCACCAACAGGAACAGCAGCAGCGGCAGCGGGTGAAAGTTGAAC TTTCTGTTG TTGTTGCTGCTGTTGCTGTTGATAGTGTGTAGGATGAGGCGTCAATGCAGCAGAGAATAGATGT GGTTGTTGTACATAATG CCGATTCAATTGGTTA] [+] EMBL CD130377 [ TGTGACTAATGAAGATTGATTTTGATGGAAACCATTTCCAAGAGTATTATTCGTATTGTTAGAACATGGTAGGACAGAACGAAGAAGCATTCCTCCACTTGGAGTTGAGTTGGTGAAACTTCTTCCAAATGTATTCGACATTGACTGATGTTGTGGTGCAGCGATAATTTGCTGTCCAGTCGGTGATTGAAATATGATCTGTTGTGGATGTTGTTGTTGCGGTTGTGGTGTAAAACAACCATGGATTGTTTGATACTGTGGT ] [+] EMBL CD130435 [ ATTTTGATGGAAACCATTTCCAAGAGTATTATTCGTATTGTTAGAACATGGTAGGACAGAACGAAGAAGCATTCTTCCACTTGGAGTTGAGTTGGTGAAACTTCTTCCAAATGTATTCGACATTGACTGATGTTGTGGTGCAGCGTTAATTTGCTGTCCAGTCGGTGATTGAAATATGATCTGTTGTGGATGTTGTTGTTGCGGTTGTGGTGTAAAACAACCATGGATTGTTTGATACTGTGGTGGAGTACCAACGCCGCCACCACCAACAGGAACAGCAGCAGCGGTAGCGGGTGAAAGTTGAACTTTTCTG TG NTGNTGCTGCTNGTGCTGNTGATAGTGTGTAGGATGAGGCGTNCATGCAGCAGAGAATTGATGTNGGGTG TGTACATAATGCCCGAT ] [+] EMBL CD130235 [ ATTTTGATGGAAACCATTTCCAAGAGTATTATTCGTATTGTTAGAACATGGTAGGACAGAACGAAGAAGCATTCCTCCACTTGGAGTTGAGTTGGTGAAACTTCTTCCAAATGTATTCGACATTGACTGATGTTGTGGTGCAGCGATAATTTGCTGTCCAGTCGGTGATTGAAATATGATCTGTTGTGGATGTTGTTGTTGCGGTTGTGGTGTAAAACAACCATGGATTGTTTGATACTGTGGTGGAGTACCAACGCCGCCACCACCAACAGGAACAGCAGCAGCGGTAGCGAGTGAAAGTTGAAC TTTCTGNTGNNTG TGCTGCTNGTGCTGNTGATAGTGTGTAGGATGAGGCGTCAATGCAGCAGAGAATTGATGN TGGTGNTGTACATAATG CCG ] [+] EMBL CD196030 [ TCGTATTGTTAGAACATGGTAGGACAGAACGAAGAAGCATTCCTCCACTTGGAGTTGAGTTGGAGAAACTTCTTCCAAATGTATTCGACATTGACTGATGTTGTGGTGCAGCGATAATTTGCTGTCCAGTCGGTGATTGAAATATGATCTGTTGTGGATGTTGTTGTTGCGGTTGTGGTGT AAACAACCATGGATTGTTTGATACTGTGGTGGAGTACC ACGCCGCCACCACC ACA GAACAGCAGCAGCGGTAGCG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||