These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7852#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 976 fasta sequence [ATTTGTTATTCCTTTTTTAGGATATAATAAATTAACTGGATAAACAACAAGCAATAAACTTTAAAAAAGATAAAACAAAAGCCGATTAATCTTCTACCTTTATTGTTCTGATCATTCCTTATTCTGAGATTGGTTTCCATTTTTTAAATAATATTGATTAGTCGAATTACCTCTCAAGACGATAAAAATTTAATATCCTCAAGTAATAAATATATAACAACAGAGGAATAGTGGTGGTGGGAGGATGAAAAGAGAAAGACAATGTAAGAAAACATCACAGAAATAAGTGAATACTTGAAAGATCAATAAACAACTAACAATGAGCATTTTGAAATATTAACTGGATAGATTAATATTTTCACATTTGAATTTATTTTGGTAAGTAAATTATAAGCAGTAAATAATTAGACAAATAGCAGAGATAAATAATTCTGTTTTCATGAATAATTGACTTGAGTTTCACTTTGTTGTTATATGGTTTCAGAGGATTTGTATATGAACATAAAACGCTTGAACAATAAAGTATCAGTAGTAATTAAATAGGTAAGAATGATAGAAGGTTATTGGTTTTTTGTTTAATTTGAATTGAATAAAACTAAGGTAGAGTTACTATGTTAAAGAAGTATGCAATAACATAAATATGTGGTTATTTTTGTATGAACATTTCATTAAACAAATATCCGGAGTAAAAAAGAGAAAATAAGAATAAAAGAAAGAGAAATCGATGAAGCAGAAATTACATTTTTTTGTTGTAGTTTGGAAACAATTGATTTAAAGATACAACATTTATAATTAGTAAATAATACGTTAGTTATAAATAAGACAATTCTATTGGGCAATTTCTTTTATAAATCACCAAAAATTCCAGCAAATGTTTTGCGTAGGTTTTTCATAGTATCATCTGTATCTTCACTACTTGGTCCCGTACGTAATGAAGTTTGTCTTGGTGGGACATCTGGACGATCAAGTCCACTGG] [+] EMBL CD137324 [ATTTGTTATTCCTTTTTTAGGATATAATAAATTAACTGGATAAACAACAAGCAATAAACTTTAAAAAAGATAAAACAAAAGCCGATTAATCTTCTACCTTTATTGTTCTGATCATTCCTTATTCTGAGATTGGTTTCCATTTTTTAAATAATATTGATTAGTCGAATTACCTCTCAAGACGATAAAAATTTAATATCCTCAAGTAATAAATATATAACAACAGAGGAATAGTGGTGGTGGGAGGATGAAAAGAGAAAGACAATGTAAGAAAACATCACAGAAATAAGTGAATACTTGAAAGATCAATAAACAACTAACAATGAGCATTTTGAAATATTAACTGGATAGATTAATATTTTCA ] [-] EMBL CD201857 [ GGTGGGAGGATGAAAAGAGAAAGACAATGTAAGAAAACATTACAGAAATAAGTGAATACTTGAAAGATCAATAAACAACTAACAATGAGCATTTTGAAATATTAACTGGATAGATTAATATTTTCACATTTGAATTTATTTTGGTAAGTAAATTATAAGCAGTAAATAATTAGACAAATAGCAGAGATAAATAATTCTGTTTTCATGAATAATTGACT ] [-] EMBL CD141497 [ AAGAAAACATCACAGAAATAAGTGAATACTTGAAAGATCAATAAACAACTAACAATGAGCATTTTGAAATATTAACTGGATAGATTAATATTTTCGCATTTGAATTTATTTTGGTAAGTAAATTATAAGCAGTAAATAATTAGACAAATAGCAGAGATAAATAATTCTGTTTTCATGAATAATTGACTTGAGTTTCACTTTGTTGTTATATGGTTTCAGAGGATTTGTATATGAACATAAAACGCTTGAACAATAAAGTATCAGTAGTAATTAAATAGGTAAGAATGATAGAAGGTTATTGGTTTTTTGTTTAATTTGAATTGAATAAA ] [+] EMBL CD137722 [ ATATGGTTTCAGAGGATTTGTATATGAACATAAAACGCTTGAACAATAAAGTATCAGTAGTAATTAAATAGGTAAGAATGATAGAAGGTTATTGGTTTTTTGTTTAATTTGAATTGAATAAAACTAAGGTAGAGTTACTATGTTAAAGAAGTATGCAATAACATAAATATGTGGTTATTTTTGTATGAACATTTCATTAAACAAATATCCGGAGTAAAAAAGAGAAAATAAGAATAAAAGAAAGAGAAATCGATGAAGCAGAAATTACATTTTTTTGTTGTAGTTTGGAAACAATTGATTTAAAGATACAACATTTATAATTAGTAAATAATACGTTAGTTATAAATAAGACAATTCTATTGGGCAATTTCTTTTATAAATCACCAAAAATTCCAGCAAATGTTTTGCGTAGGTTTTTCATAGTATCATCTGTATCTTCACTACTTGGTCCCGTACGTAATGAAGTTTGTCTTGGTGGGACATCTGGACGATCAAGTCCACTGG] [-] EMBL AI559034 [ TGGAAACAATTGATTTAAAGATACAACATTTATAATTAGTAAATAATACGTTAGTTATAAATAAGACAATTCTATTGGGCAATTTCTTTTATAAATCACCAAAAATTCCAGCAAATGTTTTGCGTAGGTTTTTCATAGTATCATCTGTATCTTCACTACTTGGTCCGGTACGTAATGAAGTTTGTCTTGGTGGGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||