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Schistosoma mansoni
cluster # 7859 cluster # 7859       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7859#0 length = 1158 sequences # 5  
consensusID : consensus_7859#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1158
fasta sequence 
                              [CTCCGAGCCAATATTCGGCACGAGGCGGCACGAGGGCAAAATATGTGTATGAACTAAAAACTGATAGTGGTACCGGCGGTGGTTTATCCTCTGATAATGAAAATATGAATCCTCCTTTATCAAATATTGCCTGCCGCCGACTCACTGATGCAGATCTGTTTGTTAAACCATTGGATCCTGTTCATGTTCATCGTCATAGAAGTAAAAAAGTTGATACCTATTCTACTCCACGTACTAATGGTATTTCATCAACCAGTTCTGTACAAAGTATTGATGATCTTAGCGGTGCATCAAGTATTCGAAGTAGTAAGAGTTCAATCGCTTTCGAAATTAAGAATGATCAAAAAGTAACTGTACGACGTTTACCAGCTCCAACTTCACAACTATCCTCTCAATATCATAATAACAATAGTGATAACAACAAATCACGAAAATTAGGACAATCAACTAAGAAATTAAATAATTTTAATTGTAAATCTGCATTTTCTTCATCTAAATTAACTAGAACAACCACTAATACTTCAACTCCATTAATCCCTCAATGATTTCTGATGGTCAACAATGTACATTTTATTTGATATACTTTTGTGATCTGAATTGTTCACCTTGAACCGCGAAAAATAAGCTGGACAAGTATCCTTATCAACATCATCATCTTCATCTAAGAAGCTATTCATTTTCTTCTTCAATTTCCTCATTGGAATGCATTCCAGTGAACACACTTACCTTCTTTG-TTTTACATAACTCANACATACATGCACACTATTTCATTGTTCCTGTACTTCATAAACCTTAATGGTACTTCCTATTCCACAATCTCCTTTAATTAATTTCTTCAGATTTTTTTGTACATTCGATTTCGTTTCTGTACTTACCTTTTTTCATCTTTATTCTA-TGGTGTT--GAATACTG-TTG-AATCTTTCATTTTGCCTT-CGTTATCATCAACATGTTT-GTCTAATGCCTTTATTAGTTTATTTTTTTACAGAATTTTTAGTGTGTACACGAAGGGAGAAAACCAAAACAAGAAACCGTATTAGCTGATCCCGGTTCTTTATATTTTTTTCCTTTTTTTAAAAAAAAACTATTTTATTCTACAAATAAAAGTTAGATATTGTATAGTTGCTGAGTGAAAACAAACATAATTTCAAGANATATATAGT]

[+] EMBL CD082726             [CTCCGAGCCAATATTCGGCACGAGGCGGCACGAGGGCAAAATATGTGTATGAACTAAAAACTGATAGTGGTACCGGCGGTGGTTTATCCTCTGATAATGAAAATATGAATCCTCCTTTATCAAATATTGCCTGCCGCCGACTCACTGATGCAGATCTGTTTGTTAAACCATTGGATCCTGTTCATGTTCATCGTCATAGAAGTAAAAAAGTTGATACCTATTCTACTCCACGTACTAATGGTATTTCATCAACCAGTTCTGTACAAAGTATTGATGATCTTAGCGGTGCATCAAGTATTCGAAGTAGTAAGAGTTCAATCGCTTTCGAAATTAAGAATGATCAAAAAGTAACTGTACGACGTTTACCAGCTCCAACTTCACAACTATCCTCTCAATATCATAATAACAATAGTGATAACAACAAATCACGAAAATTAGGACAATCAACTAAGAAATTAAATAATTTTAATTGTAAATCTGCATTTTCTTCATCTAAATTAACTAGAACAACCACTAATACTTCAACTCCATTAATCCCTCAATGATTTCTGATGGTCAACAATGTACATTTTATTTGATATACTTTTGTGATCTGAATTGTTCACCTTGAACCGCGAAAAAT AGCTGGACAAGTATCCTCATCAACATCATCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD165408             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TAACTGTACGACGTTTACCAGCTCCAACTTCACAACTATCCTCTCAATATCATAATAACAATAGTGATAACAACAAATCACGAAAATTAGGACAATCAACTAAGAAATTAAATAATTTTAATTGTAAATCTGCATTTTCTTCATCTAAATTAACTAGAACAACCACTAATACTTCAACTCCATTAATCCCTCAATGATTTCTGATGGTCAACAATGTACATTTTATTTGATATACCTTTGTGATCTGAATTGTTCACCTTGAACCGCGAAAAATAAGCTGGACAAGTATCCTTATCAACATCATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AI111168             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATTAATCCCTCAATGATTTCTGATGGTCAACAATGTACATTTTATTTGATATACTTTNGTGATCTGAATTGTTCACCTTGAACCGCGAAAAATAAGCTGGACAAGTATCCTTATCAACATCATCATCTTCATCTAAGAAGCTATTCATTTTCTTCTTCAATTTCCTCATTGGAATGCATTCCAGTGAACACACTTACCTTCTTTG TTTTACATAACTCAAACNTACNTGCNCNCTATTTCATTGTTCCTGTACTTCATAAACCTTAATGGTACTTCCTATTCCACAATCTCCTTTAATTAATTTCTTCAGATTTTTTTGTACATTCGATTTCGTTTCTGTACTTACCTTTTTTCATCTTTATTCTA TGGTGTTTGGAATACTGTTTGAAATCTTTCATTTTGCCTTCCGTTATCATCAACATGTTTGGTCTAATGCCTTTATTAGTTTATTTTTTTACAGAATTT                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AI110906             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATTAATCCCTCAATGATTTCTGATGGTCAACAATGTACATTTTATTTGATATACTTTNGTGATCTGAATTGTTCACCTTGAACCGCGAAAAATAAGCTGGACAAGTATCCTTATCAACATCATCATCTTCATCTAANAAGCTATTCATTTTCTTCTTCAATTTCC CATTGGAATGCATTCCAGTGAACACACTTACCTTCTTTG TTTTACATAACTCANACATACATGCACACTATTTCATTGTTCCTGTACTTCATAAACCTTAATGGTACTTCCTATTCCACAATCTCCTTTAATTAATTTCTTCANATTTTTTTGTACATTCGATTTCGTTTCTGTACTTACCTTTTTTCATCTTTATTCTATTGGTGTT  GAATACTG TTG AATCTTTCATTTTGCCTT CGTTATCATCAACATGTTT GTCTAATGCCTTTATTAGTTTATTTTTTTACAGAATT                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD076317             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CGAAAAATAAGCTGGACAAGTATCCTCATCAACATCATCATCTTCATTTAAGAAGCTATTCATTTTCTTCTTCAATTTCCTCATTGGAATGCATTCCAGTGAACACACTTACCTTCTTTGTTTTTACATAACTCAGACATACATGCACACTATTTCATTGTTCCTGTACTTCATAAACCTTAATGGTACTTCCTATTCCACAATCTCCTTTAATTAATTTCTTCAGATTTTTTTGTACATTCGATTTCGTTTCTGTACTTACCTTTTTTCATCTTTATTCTATTGGTGTT  GAATACTG TTG AATCTTTCATTTTGCCTT CGTTATCATCAACATGTTT GTCTAATGCCTTTATTAGTTTATTTTTTTACAGAATTTTTAGTGTGTACACGAAGGGAGAAAACCAAAACAAGAAACCGTATTAGCTGATCCCGGTTCTTTATATTTTTTTCCTTTTTTTAAAAAAAAACTATTTTATTCTACAAATAAAAGTTAGATATTGTATAGTTGCTGAGTGAAAACAAACATAATTTCAAGANATATATAGT]




>consensus_7859#0
CTCCGAGCCAATATTCGGCACGAGGCGGCACGAGGGCAAAATATGTGTATGAACTAAAAA
CTGATAGTGGTACCGGCGGTGGTTTATCCTCTGATAATGAAAATATGAATCCTCCTTTAT
CAAATATTGCCTGCCGCCGACTCACTGATGCAGATCTGTTTGTTAAACCATTGGATCCTG
TTCATGTTCATCGTCATAGAAGTAAAAAAGTTGATACCTATTCTACTCCACGTACTAATG
GTATTTCATCAACCAGTTCTGTACAAAGTATTGATGATCTTAGCGGTGCATCAAGTATTC
GAAGTAGTAAGAGTTCAATCGCTTTCGAAATTAAGAATGATCAAAAAGTAACTGTACGAC
GTTTACCAGCTCCAACTTCACAACTATCCTCTCAATATCATAATAACAATAGTGATAACA
ACAAATCACGAAAATTAGGACAATCAACTAAGAAATTAAATAATTTTAATTGTAAATCTG
CATTTTCTTCATCTAAATTAACTAGAACAACCACTAATACTTCAACTCCATTAATCCCTC
AATGATTTCTGATGGTCAACAATGTACATTTTATTTGATATACTTTTGTGATCTGAATTG
TTCACCTTGAACCGCGAAAAATAAGCTGGACAAGTATCCTTATCAACATCATCATCTTCA
TCTAAGAAGCTATTCATTTTCTTCTTCAATTTCCTCATTGGAATGCATTCCAGTGAACAC
ACTTACCTTCTTTGTTTTACATAACTCANACATACATGCACACTATTTCATTGTTCCTGT
ACTTCATAAACCTTAATGGTACTTCCTATTCCACAATCTCCTTTAATTAATTTCTTCAGA
TTTTTTTGTACATTCGATTTCGTTTCTGTACTTACCTTTTTTCATCTTTATTCTATGGTG
TTGAATACTGTTGAATCTTTCATTTTGCCTTCGTTATCATCAACATGTTTGTCTAATGCC
TTTATTAGTTTATTTTTTTACAGAATTTTTAGTGTGTACACGAAGGGAGAAAACCAAAAC
AAGAAACCGTATTAGCTGATCCCGGTTCTTTATATTTTTTTCCTTTTTTTAAAAAAAAAC
TATTTTATTCTACAAATAAAAGTTAGATATTGTATAGTTGCTGAGTGAAAACAAACATAA
TTTCAAGANATATATAGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)