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Schistosoma mansoni
cluster # 7907 cluster # 7907       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7907#0 length = 1039 sequences # 5  

consensusID : consensus_7907#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1039
fasta sequence
                              [CTCAACGCTTTAAGATTACACGAAACAAAATCGTTATGAATGTGTATATATTCCAACAATCCTATTTGCTGGACAATAATCGAATGCATAAAATGAGAATATTAGATGTAAAATTAAATATCTACAACGTGTAAATTTATATTTCACCATCTAAAGTCTATTTGACGGAAAGAGTGGAAATAAGACAGTAAATAAGCTAACACAAGTAAACTACTTTCAAGCAATTATTTGTCTGTATGAAAGCTCCTATCTGTTTATTTATCATGGACTAACTGGTGTCTTCATTATATTAATTTTCCAGTTTACACGCCTTTTTCCTTTTTCTGATTTGGGTCTGCCTCGTTG-TACATTATGTTGATTTCCTCTGTGAATGACCAACATATCTGAGAGTGTAAAAAACCAACTAACACAATTTATAGTACCCCTTTGTTTTAATTAATCGTAGGCTTATTACTATGTTATTCATATGACCCTGAACTAAAACTTTTTTCTGGATAACGTACATGTGCTACCAATTAGGGAACACGATTATTTATGGTATTTTCTTCGATATTTAACGAATTTTATCGACCAGATGATAAGTCGTGTCTGTCTATTTAGTTAAAAGTACTACATAAAGTTCACTGCTTCCTAAATCTCAAACGCTACTTGGACAACTATAATAATTCTACAACTAACATAACTCATGGTAGATAACAGAGACAGGTTTGGAGGCGGGAGGATATTTTTAAGGTTAGTTAATCAAGTACAGCCTTGAATATGCCTGTTTCATTCCGTGATGGCTCTAGATAAGTGACTACCCATGAGGCTGAATTCATTTGGTCACAGCTCCTACTGAAATTTTAGTAATTAGTGCTGGATTACGCTCAACTCACTGGAGACATGTACAATTCTCTTCAACAAACTTTCAAAACGGTTTAAAAAAGACAACGTCTATGCAGAACTGAACCACTAAAATCTGTTGATGATTTATATGCTACTTAAAAGTATTCATGTCTATTCAGCAGAATTGTTGTTATTCTTATCCATTGGGCCGAAA]

[+] EMBL CD187586             [CTCAACGCTTTAAGATTACACGAAACAAAATCGTTATGAATGTGTATATATTCCAACAATCCTATTTGCTGGACAATAATCGAATGCATAAAATGAGAATATTAGATGTAAAATTAAATATCTACAACGTGTAAATTTATATTTCACCATCTAAAGTCTATTTGACGGAAAGAGTGGAAATAAGACAGTAAATAAGCTAACACAAGTAAACTACTTTCAAGCAATTATTTGTCTGTATGAAAGCTCCTATCTGTTTATTTATCATGGACTAACTGGTGTCTTCATTATATTAATTTTCCAGTTTACACGCCTTTTTCCTTTTTCTGATTTGGGTCTGCCTCGTTG TACATTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD115034             [                                                                                                                                                                   GACGGAAAGAGTGGAAATAAGACAGTAAATAAGCTAACACAAGTAAACTACTTTCAAGCAATTATTTGTCTGTATGAAAGCTCCTATCTGTTTATTTATCATGGACTAACTGGTGTCTTCATTATATTAATTTTCCAGTTTACACGCTTTTTTCATTTTTCTGATTTGTGTCTGCATCGTTGTTACATTATGTTGATTTCCTCTGTGAATGACCAACATATCTGAGAGTGTAAAAAACCAACTAACACAATTTATAGTACCCCTTTGTTTTAATTAATCGTAGGCTTATTACTATGTTATTCATATGACCCTGAACTAAAACTTTTTTCTAGATAACGTACATGTGCTACCAATTAGGGAACACGATTATTTATGGTATTTTCTTCGATATTTAACGAATTTTATCGACCAGATGATAAGTCGTGTCTGTCTATTTAGTTAAAAGTACTACATAAAGTTCACTGCTTCCTAAATCTCAAACGCTACTCGGACAACTATAATAATTCTACAACTAACATAACTCATGGTAGATAACAGAGACAGGTTTGGAGGCGGGAGGATACTTTTAAGGTTAGTTAATCAAGTACAGCCTTGAATATGCCTGTTTCATTCCGTGATGGCTCTAGATAAGTGACTACCCATGAGGCTGAATTC                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD114876             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATTACTATGTTATTCATATGACCCTGAACTAAAACTTTTTTCTGGATAACGTACATGTGCTACCAATTAGGGAACACGATTATTTATGGTATTTTCTTCGATATTTAACGAATTTTATCGACCAGATGATAAGTCGTGTCTGTCTATTTAGTTAAAAGTACTACATAAAGTTCACTGCTTCCTAAATCTCAAACGCTACTTGGACAACTATAATAATTCTACAACTAACATAACTCATGGTAGATAACAGAGACAGGTTTGGAGGCGGGAGGATATTTTTAAGGTTAGTTAATCAAGTACAGCCTTGAATATGCCTGTTTCATTCCGTGATGGCTCTAGATAAGTGACTACCCATGAGGCTGAATTCATTTGGTCACAGCTCCTACTGAAATTTTAGTAATTAGTGCTGGATTACGCTCAACTCACTGGAGACATGTACAATTCTCTTCAACAAACTTTCAAAACGGTTTAAAAAAGACAACGTCTATGCAGAACTGAACCACTAAAATCTGTTGATGATTTATATGCTACTTAAAAGTATTCATGTCTATTCAGCAGAATTGTTGTTATTCTTATCCATTGGGCCGAAA]
[-] EMBL CD115031             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTACTATGTTATTCATATGACCCTGAACTAAAACTTTTTTCTGGATAACGTACATGTGCTACCAATTAGGGAACACGATTATTTATGGTATTTTCTTCGATATTTAACGAATTTTATCGACCAGATGATAAGTCGTGTCTGTCTATTTAGTTAAAAGTACTACATAAAGTTCACTGCTTCCTAAATCTCAAACGCTACTTGGACAACTATAATAATTCTACAACTAACATAACTCATGGTAGATAACAGAGACAGGTTTGGAGGCGGGAGGATATTTTTAAGGTTAGTTAATCAAGTACAGCCTTGAATATGCCTGTTTCATTCCGTGATGGCTCTAGATAAGTGACTACCCATGAGGCTGAATTCATTTGGTCACAGCTCCTACTGAAATTTTAGTAATTAGTGCTGGATTACGCTCAACTCACTGGAGACATGTACAATTCTCTTCAACAAACTTTCAAAACGGTTTAAAAAAGACAACGTCTATGCAGAACTGAACCACTAAAATCTGTTGATGATTTATATGCTACTTAAAAGTATTCATGTCTATTCAGCAGAATTGTTGTTATTCTTATCCATTGGGCCGAAA]
[-] EMBL CD114887             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATCTCAAACGCTACTTGGACAACTATAATAATTCTACAACTAACATAACTCATGGTAGATAACAGAGACAGGTTTGGAGGCGGGAGGATATTTTTAAGGTTAGTTAATCAAGTACAGCCTTGAATATGCCTGTTTCATTCCGTGATGGCTCTAGATAAGTGACTACCCATGAGGCTGAATTCATTTGGTCACAGCTCCTACTGAAATTTTAGTAATTAGTGCTGGATTACGCTCAACTCACTGGAGACATGTACAATTCTCTTCAACAAACTTTCAAAACGGTTTAAAAAAGACAACGTCTATGCAGAACTGAACCACTAAAATCTGTTGATGATTTATATGCTACTTAAAAGTATTCATGTCTATTCAGCAGAATTGTTGTTATTCTTATCCATTGGGCCGAAA]


>consensus_7907#0 CTCAACGCTTTAAGATTACACGAAACAAAATCGTTATGAATGTGTATATATTCCAACAAT CCTATTTGCTGGACAATAATCGAATGCATAAAATGAGAATATTAGATGTAAAATTAAATA TCTACAACGTGTAAATTTATATTTCACCATCTAAAGTCTATTTGACGGAAAGAGTGGAAA TAAGACAGTAAATAAGCTAACACAAGTAAACTACTTTCAAGCAATTATTTGTCTGTATGA AAGCTCCTATCTGTTTATTTATCATGGACTAACTGGTGTCTTCATTATATTAATTTTCCA GTTTACACGCCTTTTTCCTTTTTCTGATTTGGGTCTGCCTCGTTGTACATTATGTTGATT TCCTCTGTGAATGACCAACATATCTGAGAGTGTAAAAAACCAACTAACACAATTTATAGT ACCCCTTTGTTTTAATTAATCGTAGGCTTATTACTATGTTATTCATATGACCCTGAACTA AAACTTTTTTCTGGATAACGTACATGTGCTACCAATTAGGGAACACGATTATTTATGGTA TTTTCTTCGATATTTAACGAATTTTATCGACCAGATGATAAGTCGTGTCTGTCTATTTAG TTAAAAGTACTACATAAAGTTCACTGCTTCCTAAATCTCAAACGCTACTTGGACAACTAT AATAATTCTACAACTAACATAACTCATGGTAGATAACAGAGACAGGTTTGGAGGCGGGAG GATATTTTTAAGGTTAGTTAATCAAGTACAGCCTTGAATATGCCTGTTTCATTCCGTGAT GGCTCTAGATAAGTGACTACCCATGAGGCTGAATTCATTTGGTCACAGCTCCTACTGAAA TTTTAGTAATTAGTGCTGGATTACGCTCAACTCACTGGAGACATGTACAATTCTCTTCAA CAAACTTTCAAAACGGTTTAAAAAAGACAACGTCTATGCAGAACTGAACCACTAAAATCT GTTGATGATTTATATGCTACTTAAAAGTATTCATGTCTATTCAGCAGAATTGTTGTTATT CTTATCCATTGGGCCGAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)