cluster # 7920

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7920 cluster # 7920 Sequences # 6 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7920#0 length = 717 sequences # 6
consensusID : consensus_7920#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 717
fasta sequence
                              [GACTTTGGGAAAATGACACAAAACCCCAAAAGTTTCCCCAGGTCCGTGGAAAGTCCCCAAAATGTTTGGGGAAATTTACGGTTTTCCCCAATATTTCCCCAGAATCTTATAACAATTTGAGGGTTTTACCGAAGATAGGGAGATTGGGTCTCGGTGTGGAAACTGCATTTTCAGTCAGCCGATTTCGGGGACACCAAATGATACCAGGAATTTCTGTCAGAACCTACAGCGAAACCGTGGAGATGCATAAACAAGATTGCAAGTTTAAATCAAGTTATCTCCAACTATGTAGAGGACTCGTAACTTTTTCCAAATCAGTCGGTCCTTATCAGTCTAATCCTCCTAAAAAACCACTCCCCTTGAAGTCTTATATCAGTTGAATTAAGGATCCTCCATCATATTCACTTCTCAACGTTGTCCTGAACTAAATATGTTAAACAGATCAGTTACCTCGGG-TTTGTTA-TTTTGTTATGATAATTTATATTAG-TTCTAACAAGCTTAGTTGTGAAGACCTATAATTTTTCGTACTGATCACGAAGT-AATGTG-TTTTTCGATTATTGAGAAGA-CCCACCTAATAA-CC-CGAATCATAACAAATACTTCACTATAAATCTACATAATCGTTAACATACTCCAAAATTATATGATCTA--GTGTGGGTTTGTTACCACTTATTCACCAGTAATGGTGGGGGTTTCGTATCAATTATACTTTCCCTATAT]

[+] EMBL CD202082             [GACTTTGGGAAAATGACACAAAACCCCAAAAGTTTCCCCAGGTCCGTGGAAAGTCCCCAAAATGTTTGGGGAAATTTACGGTTTCCCCCAATATTTCCCCAGAATCTTATAACAATTTGAGGGTTTTACCGAAGATAGGGAGATTGGGTCTCGGTGTGGAAACTGCATTTTCAGTCAGCCGATTTCGGGGACACCAAATGATACCAGGAATTTCTGTCAGAACCTACAGCGAAACCGTGGAGATGCATAAACAAGATTGCAAGTTTAAATCAAGTTATCTCCAACTATGTAGAGGACTCGTAACTTTTTCCAAATCAGTCGGTCCTTATCAGTCTAATCCTCCTAAAAAACCACTCCCCTTGAAGTCTTATATCAGTTGAATTAAGGATCCTCCATCATATTCACTTCTCAACGTTGTCCTGAACTAAATATGTTAAACAGATCAGTTACCTCGGGTTTTGTTATTTTTGTTATGATAATTTATATTAG TTCTAACAAGCTTAGTTGTGAAGACCTATANTTTTTCGTACTGATCACGAAGT AATGTGTTTTTTCGATTATTGAGAAGACCCCACCTAATTA CC CGAATCATAACAAATACTTCACTATAAATCTACATAATCGTTAACATACTCCAACAATATATGATCTATGGTG GGGTTTGTTACCACTTATTCACCAGGAATGGTGGGGGTTTCGGATCAATTATACTTTTCCTAT  ]
[+] EMBL CD202083             [GACTTTGGGAAAATGACACAAAACCCCAAAAGTTTCCCCAGGTCCGTGGAAAGTCCCCAAAATGTTTGGGGAAATTTACGGTTTTCCCCAATATTTCCCCAGAATCTTATAACAATTTGAGGGTTTTACCGAAGATAGGGAGATTGGGTCTCGGTGTGGAAACTGCATTTTCAGTCAGCCGATTTCGGGGACACCAAATGATACCAGGAATTTCTGTCAGAACCTACAGCGAAACCGTGGAGATGCATAAACAAGATTGCAAGTTTAAATCAAGTTATCTCCAACTATGTAGAGGACTCGTAACTTTTTCCAAATCAGTCGGTCCTTATCAGTCTAATCCTCCTAAAAAACCACTCCCCTTGAAGTCTTATATCAGTTGAATTAAGGATCCTCCATCATATTCACTTCTCAACGTTGTCCTGAACTAAATATGTTAAACAGATCAGTTACCTCGGG TTTGTTA TTTTGTTATGATAATTTATATTAG TTCTAACAAGCTTAGTTGTGAAGACCTATTATTTTTCGTACTGATCACGAAGTAAATGTG  TTTTCGATTATTGAGAAGA CCCACCT ATAA CCNCGAATCATAACANATACTTCACTANTAATCTACTTAATCGTTAACATACTTCAAAATTATATGATCTA  GTGTGGGGTTGTTACCACTTATTCACCAGTAATGTTGGCGG TTCGTATC ATTATACTTTCt      ]
[+] EMBL CD201972             [GACTTTGGGAAAATGACACAAAACCCCAGAAGTTTCCCCAGGTCCGTGGAAAGTCCCCAAAATGTTTGGGGAAATTTACGGTTTTCCCCAATATTTCCCCAGAATCTTATAACAATTTGAGGGTTTTACCGAAGATAGGGAGATTGGGTCTCGGTGTGGAAACTGCATTTTCAGTCAGCCGATTTCGGGGACACCAAATGATACCAGGAATTTCTGTCAGAACCTACAGCGAAACCGTGGAGATGCATAAACAAGATTGCAGGTTTAAATCAAGTTATCTCCAACTATGTAGAGGACTCGTAACTTTTTCCAAATCAGTCGGTCCTTATCAGTCTAATCCTCCTAAAAAACCACTCCCCTTGAAGTCTTATATCAGTTGAATTAAGGATCCTCCATCATATTCACTTCTCAACGTTGTCCTGAACTAAATATGTTAAACAGATCAGTTACCTCGGG TTTGTTA TTTTGTTATGATAATTTATATTAG TTCTAACAAGCTTAGTTGTGAAGACCTATAATTTTTCGTACTGATCACGAAGT AATGTG TTTTTCGATTATTGAGAAGA  CCACCTTATAA CC CCGATCATAAC AATACTTTACTAT AATCTACATAATCGTT ACATACTCC AAATTATATGATCTA  GTGTGGGTTTG TAACACTTATTC CCAGTAATGGTGGGG  TTCGGATCAATTATACTTnct      ]
[-] EMBL CD202122             [                                                                                                                                                                                                            CAGGAATTTCTGTCAGAACCTACAGCGAAACCGTGGAGATGCATAAACAAGATTGCAAGTNTAAATCAAGTTATCTCCAACTATGTAGAGGACTCGTAACTTTTTCCAAATCAGTCGGTCCTTATCAGTCTAATCCTCCTAAAAAACCACTCCCCTTGAAGTCTTATATCAGTTGAATTAAGGATCCTCCATCATATTCACTTCTCAACGTTGTCCTGAACTAAATATGTTAAACAGATCAGTTACCTCGGG TTTGTTA TTTTGTTATGATAATTTATATTAG TTCTAACAAGCTTAGTTGTGAAGACCTATAATTTTTCGTACTGATCACGAAGT AATGTG TTTTTCGATTATTGNAAAGA CCCCCGTAATAACCC CGAATCATAACAAATACTTCACTATAAATCTACATAATCGTTAACATACTCCAAAATTATATGATCTA  GTGTGGGTTTGTTACCACTTATTCACCAGTAAT GTTGGTGTTTCGTATCAATTATACTTTCACTATAT]
[-] EMBL CD072143             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATCATATTCACTTCTCANCGTTGTCCTGAACTANATATGTTAAACAGATCAGTTACCT  GG TTTGTTA TTTTGTTATGATAATTTATATTAG TTCTAACAAGCTTAGTTGTGAAGACCTATAATTTTTCGTACTGATCACGAAGT AATGTG TTTTTCGATTATTGAGAAGA CCCACCTAATAACCC CGAATCATAACAAATACTTCACTATAAATCTACATAATCGTTAACATACTCCAAAATTATATGATCTA  GTGTGGGTTTGTTACCACTTATTCACCAGTAAT GTTGGTGTTTCGTATCAATTATACTTT CCTATA ]
[-] EMBL CD072156             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GATAA TTATATTAGTTTCTACNAAGCTTAGTTGTGAAGACCTAT ATTTTTCGTACTGATCACGAAGT AATGTG TTTTTCGATTATTGAGAAGA CCCACCTAATAACCC CGAATCATAACAAATACTTCACTATAAATCTACATAATCGTTAACATACTCCAAAATTATATGATCTA  GTGTGGGTTTGTTACCACTTATTCACCAGTAAT GTTGGTGTTTCGTATCAATTATACTTT CCTATA ]




>consensus_7920#0
GACTTTGGGAAAATGACACAAAACCCCAAAAGTTTCCCCAGGTCCGTGGAAAGTCCCCAA
AATGTTTGGGGAAATTTACGGTTTTCCCCAATATTTCCCCAGAATCTTATAACAATTTGA
GGGTTTTACCGAAGATAGGGAGATTGGGTCTCGGTGTGGAAACTGCATTTTCAGTCAGCC
GATTTCGGGGACACCAAATGATACCAGGAATTTCTGTCAGAACCTACAGCGAAACCGTGG
AGATGCATAAACAAGATTGCAAGTTTAAATCAAGTTATCTCCAACTATGTAGAGGACTCG
TAACTTTTTCCAAATCAGTCGGTCCTTATCAGTCTAATCCTCCTAAAAAACCACTCCCCT
TGAAGTCTTATATCAGTTGAATTAAGGATCCTCCATCATATTCACTTCTCAACGTTGTCC
TGAACTAAATATGTTAAACAGATCAGTTACCTCGGGTTTGTTATTTTGTTATGATAATTT
ATATTAGTTCTAACAAGCTTAGTTGTGAAGACCTATAATTTTTCGTACTGATCACGAAGT
AATGTGTTTTTCGATTATTGAGAAGACCCACCTAATAACCCGAATCATAACAAATACTTC
ACTATAAATCTACATAATCGTTAACATACTCCAAAATTATATGATCTAGTGTGGGTTTGT
TACCACTTATTCACCAGTAATGGTGGGGGTTTCGTATCAATTATACTTTCCCTATAT
clustalw multiple alignements is not computed in this case