These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7945#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1049 fasta sequence [TCGATTGGTGTCCCTCTTCACACTCTTGGTCCCATTGAAGGGCAAGATGGACTTAGTTTGACTAGACAAGAAATAAATCGACTCATCTTGGAGTATTTAGTTGTCGAAGGCTACAAAGATGTCGCTGAAAAATTCAGTCGTGAAACGGGAATTGTAGAGCCTTTAAATGAGTTGCAAGTTGCAGGTGCAAGTTTAAATGATCGCATGTGGATTCGTGAAGCAGTTTTGTTACGAAAAATCGAAGACGTTATTGATACAGTGAATCGACTATGGCCTGAACTCTTTGATAAAAACCCTTTTATCTACTTTCAGCTTCGACAGCTGCAAATGCTAGAACTTATTCGGAACAAACGTTTAGAAGAAGCCCTTATATTTGCCCAGTCGTATTTAGCGGATCCAGTAGCCAAACGGCTATCAGAACATCCTCAATTATTAAATGAAATGCAGAATACTATGGCACTATTAGCTTTTGACAATCCTGCTGAAAGTATTTACGGCAAGCTGCTTAGTCCTCAACACGCTGAAGTGGTTGCAGGAGCACTAAATCGAGCTATACTTCGACATATCGAATCATCAGGAGATGAAATCGATACTTCAGAAGAGGGTAAAGGCTCTGTGACTGCAAACTCTATGGGTTATTCCGGTGTTTCATCCACTGTACCACGATTGACAAAAATGATGGCACTGTTACTACATTTCCGTGA-TTTATCACAGCTTGAACTTCCACCCGAATTAGCCTCACTATAGATTAGTTGTTGAAAAGTGGAATAAACTCGTTATTATTCTCATCTTTTATGTTTCATAACTTCAACTGATTATTTTTCGTTAAAGGCAGCATGATGGTTGATTTCATGACATTTTGACTAATATACATGTACAAATTATATAACAAGCAAGATTGTGTATTAATAATATTAGCCAAAAATTTCAGGTAGTTGGCCCATTTTGGGAGACTTGTTTTACACTTATGTGACTTTTTAATCAGTATACAGCATTAAAGAGTTTAGTTAATTCTTATANCCCTTG-TTCCTTCAGAAATAAATTGTTTG] [+] EMBL CD123332 [TCGATTGGTGTCCCTCTTCACACTCTTGGTCCCATTGAAGGGCAAGATGGACTTAGTTTGACTAGACAAGAAATAAATCGACTCATCTTGGAGTATTTAGTTGTCGAAGGCTACAAAGATGTCGCTGAAAAATTCAGTCGTGAAACGGGAATTGTAGAGCCTTTAAATGAGTTGCGAGTTGCAGGTGCAAGTTTAAATGATCGCATGTGGATTCGTGAAGCAGTTTTGTTACGAAAAATCGAAGACGTTATTGATACAGTGAATCGACTATGGCCTGAACTCTTTGATAAAAACCCTTTTATCTACTTTCAGCTTCGACAGCTGCAAATGCTAGAACTTATTCGGAACAAACGTTTAGAAGAAGCCCTTATATTTGCCCAGTCGTATTTAGCGGATCCAGTAGCCAAACGGCTATCAGAACATCCTCAATTATTAAATGAAATGCAGAATACTATGGCACTATTAGCTTTTGACAATCCTGCTGAAAGTATTTACGGCAAGCTGCTTAGTC ] [-] EMBL CD123319 [ CGATTGGTGTCCCTCTTCACACTCTTGGTCCCATTGAAGGGCAAGATGGACTTAGTTTGACTAGACAAGAAATAAATCGACTCATCTTGGAGTATTTAGTTGTCGAAGGCTACAAAGATGTCGCTGAAAAATTCAGTCGTGAAACGGGAATTGTAGAGCCTTTAAATGAGTTGCAAGTTGCAGGTGCAAGTTTAAATGATCGCATGTGGATTCGTGAAGCAGTTTTGATACGAAAAATCGAAGACGTTATTGATACAGTGAATCGACTATGGCCTGAACTCTTTGATAAAAACCCTTTTATCTACTTTCAGCTTCGACAGCTGCAAATGCTAGAACTTATTCGGAACAAACGTTTAGAAGAAGCCCTTATATTTGCCCAGTCGTATTTAGCGGATCCAGTAGCCAAACGGCTATCAGAACATCCTCAATTATTAAATGAAATGCAGAATACTATGGCACTATTAGCTTTTGACAATCCTGCTGAAAGTATTTACGGCAAGCTGCTTAGTCC ] [-] EMBL CD167529 [ TTAAATGAGTTGCAAGTTGCAGGTGCAAGTTTAAATGATCGCATGTGGATTCGTGAAGCAGTTTTGTTACGAAAAATCGAAGACGTTATTGATACAGTGAATCGACTATGGCCTGAACTCTTTGATAAAAACCCTTTTATCTACTTTCAGCTTCGACAGCTGCAAATGCTAGAACTTATTCGGAACAAACGTTTAGAAGAAGCCCTTATATTTGCCCAGTCGTATTTAGCGGATCCAGTAGCCAAACGGCTATCAGAACATCCTCAATTATTAAATGAAATGCAGAATACTATGGCACTATTAGCTTTTGACAATCCTGCTGAAAGTATTTACGGCAAGCTGCTTAGTCCTCAACACGCTGAAGTGGTTGCAGGAGCACTAAATCGAGCTATACTTCGACATATCGAATCATCAGGAGATGAAATCGATACTTCAGAAGAGGGTAAAGGCTCTGTGACTGCAAACTCTATGGGTTATTCCGGTGTTTCATCCACTGTACCACGATTGAC AAAATGATGGCACTGTTACTACATTTCCGTGACTTTATCACAGCTTG ACTT ] [+] EMBL CD137323 [ ATTAAATGAAATGCAGAATACTATGGCACTATTAGCTTTTGACAATCCTGCTGAAAGTATTTACGGCAAGCTGCTTAGTCCTCAACACGCTGAAGTGGTTGCAGGAGCACTAAATCGAGCTATACTTCGACATATCGAATCATCAGGAGATGAAATCGATACTTCAGAAGAGGGTAAAGGCTCTGTGACTGCAAACTCTATGGGTTATTCCGGTGTTTCATCCACTGTACCACGATTGACAAAAATGATGGCACTGTTACTACATTTCCGTGA TTTATCACAGCTTGAACTTCCACCCGAATTAGCCTCACTATAGATTAGTTGTTGAAAAGTGGAATAAACTCGTTATTATTCTCATCTTTTATGTTTCATAACTTCAACTGATTATTTTTCGTTAAAGGCAGCATGATGGTTGATTTCATGACATTTTGACTAATATACATGTACAAATTATATAACAAGCAAGATTGTGTATTAATAATATTAGCCAAAAATTTCAGGTAGTTGGCCCATTTTGGGAGACTTGTTTTACACTTATGTGACTTTTTAATCAGTATACAGCATTANAGAGTTTAGNTAATTCTTATANCCCTTG TTCCTTCAGAAATAAA ] [-] EMBL BF936374 [ GCAGAATACTATGGCACTATTAGCTTTTGACAATCCTGCTGAAAGTATTTACGGCAAGCTGCTTAGTCCTCAACACGCTGAAGTGGTTGCAGGAGCACTAAATCGAGCTATACTTCGACATATCGAATCATCAGGAGATGAAATCGATACTTCAGAAGAGGGTAAAGGCTCTGTGACTGCAAACTCTATGGGTTATTCCGGTGTTTCATCCACTGTACCACGATTGACAAAAATGATGGCACTGTTACTACATTTCCGTGA TTTATCACAGCTTGAACTTCCACCCGAATTAGCCTCACTATAGATTAGTTGTTGAAAAGTGGAATAAACTCGTTATTATTCTCATCTTTTATGTTTCATAACTTCAACTGATTATTTTTCGTTAAAGGCAGCATGATGGTTGATTTCATGACATTTTGACTAATATACATGTACAAATTATATAACAAGCAAGATTGTGTATTAATAATATTAGCCAAAAATTTCAGGTAGTTGGCCCATTTTGGGAGACTTGTTTTACACTTATGTGACTTTTTAATCAGTATACAGCATTAAAGAGTTTAGTTAATTCTTATA CCCTTGTTTCCTTCAGAAATAAATTGTTTG] [-] EMBL AI976804 [ AAACTCGTTATAATTCTCATCTTTTATGTTTCATAACTTCAGCTGATTATTTTTCGTTAAAGGCAGCATGATGGTTGATTTCAAGACATTTTGAATAATATACATGTACAAATTATATAACAAGCAAGATTGTGTATTAATAATATTAGCCAAAAATTTCAGGTAGTTGGCCCATTTTGGCAAACTTGTTTAACACATATGTGACTTTTTAAACAGTATGCAGCATTAAAGAGTTTAGTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||