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Schistosoma mansoni
cluster # 7952 cluster # 7952       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7952#0 length = 841 sequences # 6  

consensusID : consensus_7952#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 841
fasta sequence
                              [TTGAATTTATTATTGAATGAGATTCATTCATATGATTACTACTATCATTTACACTAGTAGATTGAGTTACGACTACTGTTGTAGGAGTTGAAAGTGTTACAATTTCTGGATTATTATTAAGATCTATTGTTGTATTTATGGGTGGATTTGATATTGTTACAAAATTTGCCTCAATAGTATCCTTTGTTGTTTGTGCTGGAGGATAAGGACATTCTAAGTGGACTAAATGAAACACATCATTAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAATTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCACGTACAAGTTTCCAATCGACACGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACGTAATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAGCACCATTGCCTAATTGATGACATGTATAACCAGAGTTCCAATCGTACATTCGAATATTACCATCAATTAGTGCATTTCTGTTTCGGCTAACACCTTCTAAAACAGTAGCGCCATGATCGACATTTGCAACATTAAATGTCGGAACCATAAATCCATCTACTTGTTGAAATACTTTCTCACTATAAAAACATCTGAATGTGATTAAATGAAATGTTCGATTAAATGTATTTCTTGCTCCTGTGATACGAATAAAATGGATAACACGTGATGGGAAATATAATGTTTGCCATGAACGACACATATAATTTTGATAATCAACAATACGATGCCAAGTAGACTGATCTAATGATACATCAATAGTATATGAATAAGA]

[+] EMBL CD197686             [TTGAATTTATTATTGAATGAGATTCATTCATATGATTACTACTATCATTTACACTAGTAGATTGAGTTACGACTACTGTTGTAGGAATTGAAAGTGTTACAATTTCTGGATTATTATTAAGATCTATTGTTGTATTTATGGGTGGATTTGATATTGTTACAAAATTTGCCTCAATAGTATCCTTTGTTGTTTGTGCTGGAGGATAAGGACATTCTAAGTGGACTAAATGAAACACATCATTAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAATTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCACGTACAAGTTTCCAATCGACACGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD140767             [         TTATTGAATGAGATTCATTCATATAATTACTACTATCATTTACACTAGTAGATTGAGTTACGACTACTGTTGTAGGAGTTGAAAGTGTTACAATTTCTGGATTATTATTAAGATCTATTGTTGTATTTATGGGTGGATTTGATATTGTTACAAAATTTGCCTCAATAGTATCCTTTGTTGTTTGTGCTGGAGGATAAGGACATTCT AGTGGACTAAATGAAACACATCATCAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAATTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCACGTACAAGTTTCCAATCGACACGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACGTAATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD140772             [         TTATTGAATGAGATTCATTCATATGATTACTACTATCATTTACACTAGTAGATTGAGTTACGACTACTGTTGTAGGAGTTGAAAGTGTTACAATTTCTGGATTATTATTAAGATCTATTGTTGTATTTATGGGTGGATTTGATATTGTTACAAAATTTGCCTCAATAGTATCCTTTGTTGTTTGTGCTGGAGGATAAGGACATTCTAAGTGGACTAAATGAAACACATCATCAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAATTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCATGTACAAGTTTCCAATCGACACGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD119114             [                                                                                                                                                                                                                               TAAATGAGACACATCATTAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAATTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCACGTACAAGTTTCCAATCGACACGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACGTAATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAGCACCATTGCCTAATTGATGACATGTATAACCAGAGTTCCAATCGTACATCCGAATATTACCATCAATTAGTGCATTTCTGTTTCGGCTAACACCTTCTAAAACAGTAGCGCCATGATCGACATTTGCAACATTAAATGTCGGAACCATAAATCCATCTACTTGTTGAAATACTTTCTCACTATAAAAACA                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD069023             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aggGTTTCCA   G CAGGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACGTGATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAGCACCATTGCCTAATTGATGACATGTATAACCAGAGTTCCAATCGTACATTCGAATATTACCATCAATTAGTGCATTTCTGTTTCGGCTAACACCTTCTAAAACAGTAGCGCCATGATCGACATTTGCAACATTAAATGTCGGAACCATAAATCCATCTACTTGTTGAAATACTTTCTCACTATAAAAACATCTGAATGTGATTAAATGAAATGTTCGATTAAATGTATTTCTTGCTCCTGTGATACGAATAAAATGGATAACACGTGATGGGAAA                                                                                                  ]
[-] EMBL CD140751             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CATTGAACGTAATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAGCACCATTGCCTAATTGATGACATGTATAACCAGAGTTCCAATCGTACATTCGAATATTACCATCAATTAGTGCATTTCTGTTTCGGCTAACACCTTCTAAAACAGTAGCGCCATGATCGACATTTGCAACATTAAATGTCGGAACCATAAATCCATCTACTTGTTGAAATACTTTCTCACTATAAAAACATCTGAATGTGATTAAATGAAATGTTCGATTAAATGTATTTCTTGTTCCTGTAATACGAATAAAATGGATAACACGTGATGGGAAATATAATGTTTGCCATGAACGACACATATAATTTTGATAATCAACAATACGATGCCAAGTAGACTGATCTAATGATACATCAATAGTATATGAATAAGA]


>consensus_7952#0 TTGAATTTATTATTGAATGAGATTCATTCATATGATTACTACTATCATTTACACTAGTAG ATTGAGTTACGACTACTGTTGTAGGAGTTGAAAGTGTTACAATTTCTGGATTATTATTAA GATCTATTGTTGTATTTATGGGTGGATTTGATATTGTTACAAAATTTGCCTCAATAGTAT CCTTTGTTGTTTGTGCTGGAGGATAAGGACATTCTAAGTGGACTAAATGAAACACATCAT TAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAA TTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCACGTACAAGTTTCCAATCGACAC GGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAA ATCTCATTGAACGTAATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAGCACCATTGCCTA ATTGATGACATGTATAACCAGAGTTCCAATCGTACATTCGAATATTACCATCAATTAGTG CATTTCTGTTTCGGCTAACACCTTCTAAAACAGTAGCGCCATGATCGACATTTGCAACAT TAAATGTCGGAACCATAAATCCATCTACTTGTTGAAATACTTTCTCACTATAAAAACATC TGAATGTGATTAAATGAAATGTTCGATTAAATGTATTTCTTGCTCCTGTGATACGAATAA AATGGATAACACGTGATGGGAAATATAATGTTTGCCATGAACGACACATATAATTTTGAT AATCAACAATACGATGCCAAGTAGACTGATCTAATGATACATCAATAGTATATGAATAAG A



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)