These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7952#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 841 fasta sequence [TTGAATTTATTATTGAATGAGATTCATTCATATGATTACTACTATCATTTACACTAGTAGATTGAGTTACGACTACTGTTGTAGGAGTTGAAAGTGTTACAATTTCTGGATTATTATTAAGATCTATTGTTGTATTTATGGGTGGATTTGATATTGTTACAAAATTTGCCTCAATAGTATCCTTTGTTGTTTGTGCTGGAGGATAAGGACATTCTAAGTGGACTAAATGAAACACATCATTAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAATTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCACGTACAAGTTTCCAATCGACACGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACGTAATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAGCACCATTGCCTAATTGATGACATGTATAACCAGAGTTCCAATCGTACATTCGAATATTACCATCAATTAGTGCATTTCTGTTTCGGCTAACACCTTCTAAAACAGTAGCGCCATGATCGACATTTGCAACATTAAATGTCGGAACCATAAATCCATCTACTTGTTGAAATACTTTCTCACTATAAAAACATCTGAATGTGATTAAATGAAATGTTCGATTAAATGTATTTCTTGCTCCTGTGATACGAATAAAATGGATAACACGTGATGGGAAATATAATGTTTGCCATGAACGACACATATAATTTTGATAATCAACAATACGATGCCAAGTAGACTGATCTAATGATACATCAATAGTATATGAATAAGA] [+] EMBL CD197686 [TTGAATTTATTATTGAATGAGATTCATTCATATGATTACTACTATCATTTACACTAGTAGATTGAGTTACGACTACTGTTGTAGGAATTGAAAGTGTTACAATTTCTGGATTATTATTAAGATCTATTGTTGTATTTATGGGTGGATTTGATATTGTTACAAAATTTGCCTCAATAGTATCCTTTGTTGTTTGTGCTGGAGGATAAGGACATTCTAAGTGGACTAAATGAAACACATCATTAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAATTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCACGTACAAGTTTCCAATCGACACGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACG ] [+] EMBL CD140767 [ TTATTGAATGAGATTCATTCATATAATTACTACTATCATTTACACTAGTAGATTGAGTTACGACTACTGTTGTAGGAGTTGAAAGTGTTACAATTTCTGGATTATTATTAAGATCTATTGTTGTATTTATGGGTGGATTTGATATTGTTACAAAATTTGCCTCAATAGTATCCTTTGTTGTTTGTGCTGGAGGATAAGGACATTCT AGTGGACTAAATGAAACACATCATCAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAATTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCACGTACAAGTTTCCAATCGACACGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACGTAATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAG ] [+] EMBL CD140772 [ TTATTGAATGAGATTCATTCATATGATTACTACTATCATTTACACTAGTAGATTGAGTTACGACTACTGTTGTAGGAGTTGAAAGTGTTACAATTTCTGGATTATTATTAAGATCTATTGTTGTATTTATGGGTGGATTTGATATTGTTACAAAATTTGCCTCAATAGTATCCTTTGTTGTTTGTGCTGGAGGATAAGGACATTCTAAGTGGACTAAATGAAACACATCATCAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAATTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCATGTACAAGTTTCCAATCGACACGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACGTA ] [-] EMBL CD119114 [ TAAATGAGACACATCATTAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAATTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCACGTACAAGTTTCCAATCGACACGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACGTAATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAGCACCATTGCCTAATTGATGACATGTATAACCAGAGTTCCAATCGTACATCCGAATATTACCATCAATTAGTGCATTTCTGTTTCGGCTAACACCTTCTAAAACAGTAGCGCCATGATCGACATTTGCAACATTAAATGTCGGAACCATAAATCCATCTACTTGTTGAAATACTTTCTCACTATAAAAACA ] [+] EMBL CD069023 [ aggGTTTCCA G CAGGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACGTGATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAGCACCATTGCCTAATTGATGACATGTATAACCAGAGTTCCAATCGTACATTCGAATATTACCATCAATTAGTGCATTTCTGTTTCGGCTAACACCTTCTAAAACAGTAGCGCCATGATCGACATTTGCAACATTAAATGTCGGAACCATAAATCCATCTACTTGTTGAAATACTTTCTCACTATAAAAACATCTGAATGTGATTAAATGAAATGTTCGATTAAATGTATTTCTTGCTCCTGTGATACGAATAAAATGGATAACACGTGATGGGAAA ] [-] EMBL CD140751 [ CATTGAACGTAATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAGCACCATTGCCTAATTGATGACATGTATAACCAGAGTTCCAATCGTACATTCGAATATTACCATCAATTAGTGCATTTCTGTTTCGGCTAACACCTTCTAAAACAGTAGCGCCATGATCGACATTTGCAACATTAAATGTCGGAACCATAAATCCATCTACTTGTTGAAATACTTTCTCACTATAAAAACATCTGAATGTGATTAAATGAAATGTTCGATTAAATGTATTTCTTGTTCCTGTAATACGAATAAAATGGATAACACGTGATGGGAAATATAATGTTTGCCATGAACGACACATATAATTTTGATAATCAACAATACGATGCCAAGTAGACTGATCTAATGATACATCAATAGTATATGAATAAGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||