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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7955#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 669 fasta sequence
[CAATTGCAGCAACAACAAGCAGCAGTTGTTCAACATCAACAACTTTTACAACAGCAGCAACAACAACAGCAGGCTAACTATGCAGTGGCAGCTGCTGCGGCTGCCGCTGCTGCTGGTACACATTTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAGCAATTCCAATT---ACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCATCAACAAGCAGCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGGTACTGTTGCAACACCATCTGGTCCAACTACATTCTTTTGTCATCCACAAGAAGGAATGGCTGCTGGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGTTTTGCATTAGCAGCTGCTGCTCAAGCACAAGCACAAGCAGCTGCGGCAGCTGTTGCCGTTGTCCAGCAACAACAACAACACCAGCAACAGCAGAGTAATGTTAATGCTGTTAATGCTCAGAACAATTCTTCAATTGCTGCTACACAATTACAACTAGTAACAGGTTATTCACAGGTGGCGGCTGATGCTCAACAAACTGTTGCACAACAACAACTACAACATCAACAGCTATTGTTACAACGGCAACAACATCAGCAGAGATTAGCAGCAGTG]
[+] EMBL CD096482 [CAATTGCAGCAACAACAAGCAGCAGTTGTTCAACATCAACAACTTTTACAACAGCAGCAACAACAACAGCAGGCTAACTATGCAGTGGCAGCTGCTGCGGCTGCCGCTGCTGCTGGTACACATTTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAGCAATTCCAATTACAACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCATCAACAAGCAGCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGG ]
[+] EMBL CD138997 [ TTTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAGCAATTCCAATT ACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCGTCAACAAGCAGCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGGTACTGTTGCAACACCATCTGGTCCAACTACATTCTTTTGTCATCCACAAGAAGGAATGGCTGCTGGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGTTTTGCATTAGCAGCTGCTGCTCAAGCACAAGCACAAGCAGCTGCGGCAGCTGTTGCCGTTGTCCAGCAACAACAACAACACCAGCAACAGCAGAGTCATGTTAATGCTGTTAATGCTCAGAACAATTCTTCAATTGCTGCTACACAATTACAACTAGTAACAGG ]
[-] EMBL CD164887 [ TTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAGCAATTCCAATT ACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCATCGACAAGCAGCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGGTACTGTTGCGACACCATCTGGTCCAACTACATTCTTTTGTCATCCACAAGAAGGAATGGCTGCTGGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGT ]
[-] EMBL CD164885 [ TTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAGCAATTCCAATT ACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCATCAACAAGCAGCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGGTACTGTTGCAACACCATCTGGTCCAACTACATTCTTTTGTCATCCACAAGAAGGAATGGCTGCTGGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGT ]
[+] EMBL CD183596 [ ATGGCTGCTGGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGTTTTGCATTAGCAGCTGCTGCTCAAGCACAAGCACAAGCAGCTGCGGCAGCTGTTGCCGTTGTCCAGCAACAACAACAACACCAGCAACAGCAGAGTAATGTTAATGCTGTTAATGCTCAGAACAATTCTTCAATTGCTGCTACACAATTACAACTAGTAACAGGTTATTCACAGGTGGCGGCTGATGCTCAACAAACTGTTGCACAACAACAACTACAACATCAACAGCTATTGTTACAACGGCAACAACATCAGCAGAGATTAGCAGCAGTG]
[+] EMBL CD164827 [ GCAACAACAACAACACCAGCAACAGCAGAGTAATGTTAATGCGGTTAATGCTCAGAACAATTCTTCAATTGCTGCTACACAATTACAACTAGTAACAGGTTATTCACAGGTGGCGGCTGATGCTCAACAAACTGTTGCACAACAACAACTACAACATCAACAGCTATTGTTACAACAGCAACAACATCAGCAGAG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||