These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7986#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 669 fasta sequence [TAGAATAGCATTCCTATATTGTTTGAAACATTTATTTGTTGCACTTGGTAATTCTCTCACAAACGTTATCTTTCTACCTTCTTAATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTTTATGTCGGATAACTGAGTGGTAAATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA-GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGTTATCAGTTCAGGAATAGATATCTGAATAATGTTGATTCTTTTCAGTGCATATTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGATGGTGGTAC] [+] EMBL CD085117 [TAGAATAGCATTCCTATATTGTTTGAAACATTTATTTGTTGCACTTGGTAATTCTCTCACAAACGTTATCTTTCTACCTTCTTAATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTTTATGTCGGATAACTGAGTGGTAAATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGNTATCAGTTCAGGAATAGATATCTGAATAATGGTGATTCTTTTCAGTGCATANTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGATGGTGGTA ] [+] EMBL CD085349 [TAGAATAGCATTCCTATATTGTTTGAAACATTTATTTGTTGCACTTGGTAATTCTCTCACAAACGTTATCTTTCTACCTTCTTAATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTTTATGTCGGATAACTGAGTGGTAAATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGATAGATGnt ] [+] EMBL CD085086 [TAGAATAGCATTCCTATATTGTTTGAAACATTTATTTGTTGCACTTGGTAATTCTCTCACAAACGTTATCTTTCTACCTTCTTAATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTTTATGTCGGATAACTGAGTGGTAAATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTNTAAGCTGANTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCANACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAANGACCC AATTTGTACATACGTAC ] [-] EMBL CD085098 [ TCTTTATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTNTATGTCGNATAACTGAGTGGTAAATTNTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGTTATCAGTTCAGGAATAGATATCTGAATAATGTTGATTCTTTTCAGTGCATATTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGATGGTGGTAC] [-] EMBL CD085169 [ AGTNTATGTCGGATANCTGAGTGGT AATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTGGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGTTATCAGTTCAGGAATAGATATCTGAATAATGTTGATTCTTTTCAGTGCATATTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGATGGTGGTAC] [-] EMBL CD085172 [ AATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGTTATCAGTTCAGGAATAGATATCTGAATAATGTTGATTCTTTTCAGTGCATATTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGATGGTGGTAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||