These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8057#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1133 fasta sequence [GTGGCACCAAGCAAAAGCCATGATAATGTGCGAACTCTTTCAACCATGATAAGAAAATCTTTTGGTCCTAATTGAGATGAAGGTGGAGTGGATTTTAACCAAGGTAAATACTGTAATATAATTGCTTCTGAATGAGCCGTATGTGAAAATGTTGAAGCGAGCATCACATGTGCATAGTTTGGGTGTCGAGAATTAGCTGAACTAGGACTAGAGATTGTTTGTGGCGTGGTAGATGTAGATGAGACAAAATTTGGCGAAGTCAAATTTGAAACAGATGTAGTCGTAGTGGAAGTTGTAACATTAGTAGAAGAAATCTGATCATGTGAAATTGCTGGAGATGGGATAGGAATCGCGGAAGAAATTAGTTTTGTGTTAGTAGCTTCTTGCTTTTTAGTTGAGGATGTTTGGGTTATTGGTATCGTTGAACGTGTATAGTTAGTTTCGCTAGATTTACAACTAGGTGAAGGATTGACACTAGGTTGTGTAATAGCAGTATTGGCTGTATCTGAATGGGGCTCATTTCGTCTCACAACTGATCCACTATTTTTACTAAGTTTAATTTGTGCATTTGATTGTTCCACATTTGCAGTATGTCCACTCTCAGATAGTAAGTTTAAACTTTTTCCCGTTAAACCCATTGAAGTGACATTCGAACTAGGGGCAGTGGTGACTGCCTTTGATCGGGCTGGTAATCCAGGTGCTAAATTTTTACCGTTCCTCGTCGTTTTTACATCGGCTAGTAGTCCGGGTGCAAGTAAAGGTAAGACATCGTGGTCACTTCCACTGTTAGATCTAGATAGCTCCAATGAAACATACTGAGATAAACCTGATTTTAAATGTGCACCTAAAACATCTTCATGCAAGCTTGGAATATTTGTACCTAACCCAACGTTAGAATTAACACCCGTAGCTCCTGTTGCAGAGTTTGATACTCCTGATGAATTAAAACCTCCACCAAATAAACTACTACCTATATTTCCAGATGTTGCTCCTCCACCGCCTGTCAGTGTGTTTGAATCAAGATTACCAGTACCACATGGATTTGATCCGGACATCATAGATGAAGAACCAAGTCCATATCCGACGCTGTTCAACTGAACTGCTGATTTTTGAGACTGTTTAATCTTATTCAC] [-] EMBL CD180527 [GTGGCACCAAGCAAAAGCCATGATAATGTGCGAACTCTTTCAACCATGATAAGAAAATCTTTTGGTCCTAATTGAGATGAAGGTGGAGTGGATTTTAACCAAGGTAAATACTGTAATATAATTGCTTCTGAATGAGCCGTATGTGAAAATGTTGAAGCGAGC ] [+] EMBL CD178231 [ TTTTAACCAAGGTAAATACTGTAATATAATTGCTTCTGAATGAGCCGTATGTGAAAATGTTGAAGCGAGCATCACATGTGCATAGTTTGGGTGTCGAGAATTAGCTGAACTAGGACTAGAGATTGTTTGTGGCGTGGTAGATGTAGATGAGACAAAATTTGGCGAAGTCAAATTTGAAACAGATGTAGTCGTAGTGGAAGTTGTAACATTAGTAGAAGAAATCTGATCATGTGAAATTGCTGGAGATGGGATAGGAATCGCGGAAGAAATTAGTTTTGTGTTAGTAGCTTCTTGCTTTTTAGTTGAGGATGTTTGGGTTATTGGTATCGTTGAACGTGTATAGTTAGTTTCGCTAGATTTACAACTAGGTGAAGGATTGACACTAGGTTGTGTAATAGCAGTATTGGCTGTATCTGAATGGGGCTCATTTCGTCTCACAACTGATCCACTATTTTTACTAAGTTTAATTTGTGCATTTGATTGTTCCACATTTGCAGTATGTCCACTCTCAGATAGTAAGTTTAAACTTTTTCCCGTTAAACCCATTGAAGTGACATTCGAACTAGGGGCAGTGGTGACTGCCTTTGATCGG ] [+] EMBL CD195521 [ ACTAGAGATTGTTTGTGGCGTGGTAGATGTAGATGAGACAAAATTTGGCGAAGTCAAATTTGAAACAGATGTAGTCATAGTGGAAGTTGTAACATTAGTAGAAGAAATCTGATCATGTGAAATTGCTGGAGATGGGATAGGAATCGCGGAAGAAATTAGTTTT ] [-] EMBL CD127817 [ TCGCGGAAGAAATTAGTTTTGTGTTAGTAGCTTCTTGCTTTTTAGTTGAGGATGTTTGGGTTATTGGTATCGTTGAACGTGTATAGTTAGTTTCGCTAGATTTACAACTAGGTGAAGGATTGACACTAGGTTGTGTAATAGCAGTATTGGCTGTATCTGAATGGGGCTCATTTCGTCTCACAACTGATCCACTATTTTTACTAAGTTTAATTTGTGCATTTGATTGTTCCACATTTGCAGTATGTCCACTCTCAGATAGTAAGTTTAAACTTTTTCCCGTTAAACCCATTGAAGTGACATTCGAACTAGGGGCAGTGGTGACTGCCTTTGATCGGGCTGGTAATCCAGGTGCTAAATTTTTACCGTTCCTCGTCGTTTTTACATCGGCTAGTAGTCCGGGTGCAAGTAAAGGTAAGACATCGTGGTCACTTCCACTGTTAGATCTAGATAGCTCCAATGAAACATACTGAGATAAACCTGATTTTAAATGTGCACCTAAAACATCTTCATGCAAGCTTGGAATATTTGTACCTAACCCAACGTTAGAATTAACACCCGTAGCTCCTGTTGCAGAGTTTGATACT ] [+] EMBL CD094395 [ TTTTAGTTGAGGATGTTTGGGTTATTGGTATCGTTGAACGTGTATAGTTAGTTTCGCTAGATTTACAACTAGGTGAAGGATTGACACTAGGTTGTGTAATAGCAGTATTGGCTGTATCTGAATGGGGCTCATTTCGTCTCACAACTGATCCACTATTTTTACTAAGTTTAATTTGTGCATTTGATTGTTCCACATTTGCAGTATGTCCACTCTCAGATAGTAAGTTTAAACTTTTTCCCGTTAAACCCATTGAAGTGACATTCGAACTAGGGGCAGTGGTGACTGCCTTTGATCGGGCTGGTAATCCAGGTGCTAAATTTTTACCGTTCCTCGTCGTT ] [-] EMBL CD192758 [ CCACTGTTAGATCTAGATAGCTCCAATGAAACATACTGAGATAAACCTGATTTTAAATGTGCACCTAAAACATCTTCATGCAAGCTTGGAATATTTGTACCTAACCCAACGTTAGAATTAACACCCGTAGCTCCTGTTGCAGAGTTTGATACTCCTGATGAATTAAAACCTCCACCAAATAAACTACTACCTATATTTCCAGATGTTGCTCCTCCACCGCCTGTCAGTGTGTTTGAATCAAGATTACCAGTACCACATGGATTTGATCCGGACATCATAGATGAAGAACCAAGTCCATATCCGACGCTGTTCAACTGAACTGCTGATTTTTGAGACTGTTTAATCTTATTCAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||