These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8066#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 756 fasta sequence [ATATCTAATTCCCATCGTAGTGAATATTTGCCAGCTAGGTGTGTCTGCAGTCGTTAAGTAATTGATGCTCCCTATGCGATATAGCCGATTCTTGACCCTCTTATGTCACAGTCAGGGATTGTATAAGTTTGAATCTGATACAGAACACCAGTAGTCATCTAAAAACTACAGATACTCCTTTCTGACAAGCACTTCCTAGTACATAACACATATTTCATGCTTCATTTTTAACCATAAATTTGAAAAATGCCTATTCATTACTTGTAAACATAATCGATTATTCTATTGTTGTATTTTTCTCTTGTTTTTATACTTTGTTGTCGATGATGGATACACTTTGTACAGAATAGATTTTGTTTCAGTTAGTTATAATAAGTTTCAAATTAATTTTATTTAGCTTACTATCTAGTTCGTTACAATATTGTGTAGTAAGTTCAGAAAATCAGTTAATCTTAACTCAAAACAGTTCTTTGTGTTTTGGAGCGATAATACGTGAACGGATCAAATATGAATCTTTATACCTAGGGTGACTAACGCATAACGATAACACTTAACTGGTGACAACCACATGTTAGTAATAATAGAGAAGACTGAAATTTATCAGAGAAATTTTCGTTTCAAGAAAAATTAATAAAATGAGTAATTAACTGTAATCAATAAACTTAAGGTCAATTACACGCTGCGCTTCACAATGATCTTAATTCACGAAAAGATAGAAGAATGATCAAGATAAATCATAACAAATACTGGGGTTAG] [+] EMBL CD084976 [ATATCTAATTCCCATCGTAGTGAATATTTGCCAGCTAGGTGTGTCTGCAGTCGTTAAGTAATTGATGCTCCCTATGCGATATAGCCGATTCTTGACCCTCTTATGTCACAGTCAGGGATTGTATAAGTTTGAATCTGATACAGAACACCAGTAGTCATCTAAAAACTACAGATACTCCTTTCTGACAAGCACTTCCTAGTACATAACACATATTTCATGCTTCATTTTTAACCATAAATTTGAAAAATGCCTATTCATTTCTTGTAAACATAATCGATTATTCTATTGTTGTATTTTTCTCTTGTTTTTATACTTTGTTGTCGATGATGGATACACTTTGTACAGAATAGATTTTGTTTCAGTTAGTTATAATAAGTTTCAAATTAATTTTATTTAGCTTACTATCTAGTTCGTTACAATATTGTGTAGTAAGTTCAGAAAATCAGTTAATCTTAACTCAAAACAGTTCTTTGTGTTTTGGAGCGATAATACGTGAACGGATCAAATATGAATCTTTATACCTAGGGTGACTAACGCATAACGATAACACTTAACTGGTGANCACCACATGTTAGTAATAATAGAGAAGACTGAAATTTATCAGAAGAATTTTCGTT ] [+] EMBL CD084849 [ATATCTAATTCCCATCGTAGTGAATATTTGCCAGCTAGGTGTGTCTGCAGTCGTTAAGTAATTGATGCTCCCTATGCGATATAGCCGATTCTTGACCCTCTTATGTCACAGTCAGGGATTGTATAAGTTTGAATCTGATACAGAACACCAGTAGTCATCTAAAAACTACAGATACTCCTTTCTGACAAGCACTTCCTAGTACATAACACATATTTCATGCTTCATTTTTAACCATAAATTTGAAAAATGCCTATTCATTACTTGTAAACATAATCGATTATTCTATTGTTGTATTTTTCTCTTGTTTTTATACTTTGTTGTCGATGATGGATACACTTTGTACAGAATAGATTTTGTTTCAGTTAGTTATAATAAGTTTCAAATTAATTTTATTTAGCTTACTATCTAGTTCGTTACAATATTGTGTAGTAAGTTCAGAAAATCAGTTAATCTTAACTCAAAACAGTTCTTTGTGTTTTGGAGCGATAATACGTGAACGGATCAAATATGAATCTTTATACCTAGGGTGACTAACGCATAACGATAACACTTAACTGGNAACACCC ] [-] EMBL CD084986 [ ATAAGTTTGAATCTGATACAGAACACCAGTAGTCATCTAANAACTACAGATACTCCTTTCTGACAAGCACTTCCTAGTACATAACACATATTTCATGCTTCATTTTTAACCATAAATTTGAAAAATGCCTATTCATTACTTGTAAACATAATCGATTATTCTATTGTTGTATTTTTCTCTTGTTTTTATACTTTGTTGTCGATGATGGATACACTTTGTACAGAATAGATTTTGTTTCAGTTAGTTATAATAAGTTTCAAATTAATTTTATTTAGCTTACTATCTAGTTCGTTACAATATTGTGTAGTAAGTTCAGAAAATCAGTTAATCTTAACTCAAAACAGTTCTTTGTGTTTTGGAGCGATAATACGTGAACGGATCAAATATGAATCTTTATACCTAGGGTGACTAACGCATAACGATAACACTTAACTGGTGACAACCACATGTTAGTAATAATAGAGAAGACTGAAATTTATCAGAGAAATTTTCGTTTCAAGAAAAATTAATAAAATGAGTAATTAACTGTAATCAATAAACTTAAGGTCAATTACACGCTGCGCTTCACAATGATCTTAATTCACGAAAAGATAGAAGAATGATCAAGATAAATCA ] [-] EMBL CD084882 [ AACACCAGTAGTCATCTAAAAACTACAGATACTCCTTTCTGACAAGCACTTCCTAGTACATAACACATATTTCATGCTTCATTTTTTACCATAAATTTGAAAAATGCCTATTCATTTCTTGTAAACATATTCGATTATTCTATTGTTGTATTTTTCTCTTGTTTTTATACTTTGTTGTCGATGATGGATACACTTTGTACAGAATAGATTTTGTTTCAGTTAGTTATAATAAGTTTCAAATTAATTTTATTTAGCTTACTATCTAGTTCGTTACAATATTGTGTAGTAAGTTCAGAAAATCAGTTAATCTTAACTCAAAACAGTTCTTTGTGTTTTGGAGCGATAATACGTGAACGGATCAAATATGAATCTTTATACCTAGGGTGACTAACGCATAACGATAACACTTAACTGGTGACAACCACATGTTAGTAATAATAGAGAAGACCGAAATTTATCAGAGAAATTTTCGTTTCAAGAAAAATTAATAAAATGAGTAATTAACTGTAATCAATAAACTTAAGGTCAATTACACGCTGCGCTTCACAATGATCTTAATTCACGAAAAGATAGAAGAATGATCAAGATAAATCA ] [-] EMBL CD084856 [ AGATACTCCTTTCTGACAAGCACTTCCTAGTACATAACACATATTTCATGCTTCATTTTTAACCATAAATTTGAAAAATGCCTATTCATTACTTGTAAACATAATCGATTATTCTATTGTTGTATTTTTCTCTTGTTTTTATACTTTGTTGTCGATGATGGATACACTTTGTACAGAATAGATTTTGTTTCAGTTAGTTATAATAAGTTTCAAATTAATTTTATTTAGCTTACTATCTAGTTCGTTACAATATTGTGTAGTAAGTTCAGAAAATCAGTTAATCTTAACTCAAAACAGTTCTTTGTGTTTTGGAGCGATAATACGTGAACGGATCAAATATGAATCTTTATACCTAGGGTGACTAACGCATAACGATAACACTTAACTGGTGACAACCACATGTTAGTAATAATAGAGAAGACTGAAATTTATCAGAGAAATTTTCGTTTCAAGAAAAATTAATAAAATGAGCAATTAACTGTAATCAATAAACTTAAGGTCAATTACACGCTGCGCTTCACAATGATCTTAATTCACGAAAAGATAGAAGAATGATCAAGATAAATCATAACAAATACTGGGGTTAG] [-] EMBL CD084977 [ GACAAGCACTTCCTAGTACATAACACATATTTCATGCTTCATTTTTAACCATAAATTTGAAAAATGCCTATTCATTACTTGTAAACATAATCGATTATTCTATTGTTGTATTTTTCTCTTGTTTTTATACTTTGTTGTCGATGATGGATACACTTTGTACAGAATAGATTTTGTTTCAGTCAGTTATAATAAGTTTCAAATTAATTTTATTTAGCTTACTATCTAGTTCGTTACAATATTGTGTAGTAAGTTCAGAAAATCAGTTAATCTTAACTCAAAACAGTTCTTTGTGTTTTGGAGCGATAATACGTGAACGGATCAAATATGAATCTTTATACCTAGGGTGACTAACGCATAACGATAACACTTAACTGGTGACAACCACATGTTAGTAATAATAGAGAAGACTGAAATTTATCAGAGAAATTTTCGTTTCAAGAAAAATTAATAAAATGAGTAATTAACTGTAATCAATAAACTTAAGGTCAATTACACGCTGCGCTTCACAATGATCTTAATTCACGAAAAGATAGAAGAATGATCAAGATAAATCA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||