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Schistosoma mansoni
cluster # 8066 cluster # 8066       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8066#0 length = 756 sequences # 6  

consensusID : consensus_8066#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 756
fasta sequence
                              [ATATCTAATTCCCATCGTAGTGAATATTTGCCAGCTAGGTGTGTCTGCAGTCGTTAAGTAATTGATGCTCCCTATGCGATATAGCCGATTCTTGACCCTCTTATGTCACAGTCAGGGATTGTATAAGTTTGAATCTGATACAGAACACCAGTAGTCATCTAAAAACTACAGATACTCCTTTCTGACAAGCACTTCCTAGTACATAACACATATTTCATGCTTCATTTTTAACCATAAATTTGAAAAATGCCTATTCATTACTTGTAAACATAATCGATTATTCTATTGTTGTATTTTTCTCTTGTTTTTATACTTTGTTGTCGATGATGGATACACTTTGTACAGAATAGATTTTGTTTCAGTTAGTTATAATAAGTTTCAAATTAATTTTATTTAGCTTACTATCTAGTTCGTTACAATATTGTGTAGTAAGTTCAGAAAATCAGTTAATCTTAACTCAAAACAGTTCTTTGTGTTTTGGAGCGATAATACGTGAACGGATCAAATATGAATCTTTATACCTAGGGTGACTAACGCATAACGATAACACTTAACTGGTGACAACCACATGTTAGTAATAATAGAGAAGACTGAAATTTATCAGAGAAATTTTCGTTTCAAGAAAAATTAATAAAATGAGTAATTAACTGTAATCAATAAACTTAAGGTCAATTACACGCTGCGCTTCACAATGATCTTAATTCACGAAAAGATAGAAGAATGATCAAGATAAATCATAACAAATACTGGGGTTAG]

[+] EMBL CD084976             [ATATCTAATTCCCATCGTAGTGAATATTTGCCAGCTAGGTGTGTCTGCAGTCGTTAAGTAATTGATGCTCCCTATGCGATATAGCCGATTCTTGACCCTCTTATGTCACAGTCAGGGATTGTATAAGTTTGAATCTGATACAGAACACCAGTAGTCATCTAAAAACTACAGATACTCCTTTCTGACAAGCACTTCCTAGTACATAACACATATTTCATGCTTCATTTTTAACCATAAATTTGAAAAATGCCTATTCATTTCTTGTAAACATAATCGATTATTCTATTGTTGTATTTTTCTCTTGTTTTTATACTTTGTTGTCGATGATGGATACACTTTGTACAGAATAGATTTTGTTTCAGTTAGTTATAATAAGTTTCAAATTAATTTTATTTAGCTTACTATCTAGTTCGTTACAATATTGTGTAGTAAGTTCAGAAAATCAGTTAATCTTAACTCAAAACAGTTCTTTGTGTTTTGGAGCGATAATACGTGAACGGATCAAATATGAATCTTTATACCTAGGGTGACTAACGCATAACGATAACACTTAACTGGTGANCACCACATGTTAGTAATAATAGAGAAGACTGAAATTTATCAGAAGAATTTTCGTT                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD084849             [ATATCTAATTCCCATCGTAGTGAATATTTGCCAGCTAGGTGTGTCTGCAGTCGTTAAGTAATTGATGCTCCCTATGCGATATAGCCGATTCTTGACCCTCTTATGTCACAGTCAGGGATTGTATAAGTTTGAATCTGATACAGAACACCAGTAGTCATCTAAAAACTACAGATACTCCTTTCTGACAAGCACTTCCTAGTACATAACACATATTTCATGCTTCATTTTTAACCATAAATTTGAAAAATGCCTATTCATTACTTGTAAACATAATCGATTATTCTATTGTTGTATTTTTCTCTTGTTTTTATACTTTGTTGTCGATGATGGATACACTTTGTACAGAATAGATTTTGTTTCAGTTAGTTATAATAAGTTTCAAATTAATTTTATTTAGCTTACTATCTAGTTCGTTACAATATTGTGTAGTAAGTTCAGAAAATCAGTTAATCTTAACTCAAAACAGTTCTTTGTGTTTTGGAGCGATAATACGTGAACGGATCAAATATGAATCTTTATACCTAGGGTGACTAACGCATAACGATAACACTTAACTGGNAACACCC                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD084986             [                                                                                                                          ATAAGTTTGAATCTGATACAGAACACCAGTAGTCATCTAANAACTACAGATACTCCTTTCTGACAAGCACTTCCTAGTACATAACACATATTTCATGCTTCATTTTTAACCATAAATTTGAAAAATGCCTATTCATTACTTGTAAACATAATCGATTATTCTATTGTTGTATTTTTCTCTTGTTTTTATACTTTGTTGTCGATGATGGATACACTTTGTACAGAATAGATTTTGTTTCAGTTAGTTATAATAAGTTTCAAATTAATTTTATTTAGCTTACTATCTAGTTCGTTACAATATTGTGTAGTAAGTTCAGAAAATCAGTTAATCTTAACTCAAAACAGTTCTTTGTGTTTTGGAGCGATAATACGTGAACGGATCAAATATGAATCTTTATACCTAGGGTGACTAACGCATAACGATAACACTTAACTGGTGACAACCACATGTTAGTAATAATAGAGAAGACTGAAATTTATCAGAGAAATTTTCGTTTCAAGAAAAATTAATAAAATGAGTAATTAACTGTAATCAATAAACTTAAGGTCAATTACACGCTGCGCTTCACAATGATCTTAATTCACGAAAAGATAGAAGAATGATCAAGATAAATCA                   ]
[-] EMBL CD084882             [                                                                                                                                               AACACCAGTAGTCATCTAAAAACTACAGATACTCCTTTCTGACAAGCACTTCCTAGTACATAACACATATTTCATGCTTCATTTTTTACCATAAATTTGAAAAATGCCTATTCATTTCTTGTAAACATATTCGATTATTCTATTGTTGTATTTTTCTCTTGTTTTTATACTTTGTTGTCGATGATGGATACACTTTGTACAGAATAGATTTTGTTTCAGTTAGTTATAATAAGTTTCAAATTAATTTTATTTAGCTTACTATCTAGTTCGTTACAATATTGTGTAGTAAGTTCAGAAAATCAGTTAATCTTAACTCAAAACAGTTCTTTGTGTTTTGGAGCGATAATACGTGAACGGATCAAATATGAATCTTTATACCTAGGGTGACTAACGCATAACGATAACACTTAACTGGTGACAACCACATGTTAGTAATAATAGAGAAGACCGAAATTTATCAGAGAAATTTTCGTTTCAAGAAAAATTAATAAAATGAGTAATTAACTGTAATCAATAAACTTAAGGTCAATTACACGCTGCGCTTCACAATGATCTTAATTCACGAAAAGATAGAAGAATGATCAAGATAAATCA                   ]
[-] EMBL CD084856             [                                                                                                                                                                         AGATACTCCTTTCTGACAAGCACTTCCTAGTACATAACACATATTTCATGCTTCATTTTTAACCATAAATTTGAAAAATGCCTATTCATTACTTGTAAACATAATCGATTATTCTATTGTTGTATTTTTCTCTTGTTTTTATACTTTGTTGTCGATGATGGATACACTTTGTACAGAATAGATTTTGTTTCAGTTAGTTATAATAAGTTTCAAATTAATTTTATTTAGCTTACTATCTAGTTCGTTACAATATTGTGTAGTAAGTTCAGAAAATCAGTTAATCTTAACTCAAAACAGTTCTTTGTGTTTTGGAGCGATAATACGTGAACGGATCAAATATGAATCTTTATACCTAGGGTGACTAACGCATAACGATAACACTTAACTGGTGACAACCACATGTTAGTAATAATAGAGAAGACTGAAATTTATCAGAGAAATTTTCGTTTCAAGAAAAATTAATAAAATGAGCAATTAACTGTAATCAATAAACTTAAGGTCAATTACACGCTGCGCTTCACAATGATCTTAATTCACGAAAAGATAGAAGAATGATCAAGATAAATCATAACAAATACTGGGGTTAG]
[-] EMBL CD084977             [                                                                                                                                                                                       GACAAGCACTTCCTAGTACATAACACATATTTCATGCTTCATTTTTAACCATAAATTTGAAAAATGCCTATTCATTACTTGTAAACATAATCGATTATTCTATTGTTGTATTTTTCTCTTGTTTTTATACTTTGTTGTCGATGATGGATACACTTTGTACAGAATAGATTTTGTTTCAGTCAGTTATAATAAGTTTCAAATTAATTTTATTTAGCTTACTATCTAGTTCGTTACAATATTGTGTAGTAAGTTCAGAAAATCAGTTAATCTTAACTCAAAACAGTTCTTTGTGTTTTGGAGCGATAATACGTGAACGGATCAAATATGAATCTTTATACCTAGGGTGACTAACGCATAACGATAACACTTAACTGGTGACAACCACATGTTAGTAATAATAGAGAAGACTGAAATTTATCAGAGAAATTTTCGTTTCAAGAAAAATTAATAAAATGAGTAATTAACTGTAATCAATAAACTTAAGGTCAATTACACGCTGCGCTTCACAATGATCTTAATTCACGAAAAGATAGAAGAATGATCAAGATAAATCA                   ]


>consensus_8066#0 ATATCTAATTCCCATCGTAGTGAATATTTGCCAGCTAGGTGTGTCTGCAGTCGTTAAGTA ATTGATGCTCCCTATGCGATATAGCCGATTCTTGACCCTCTTATGTCACAGTCAGGGATT GTATAAGTTTGAATCTGATACAGAACACCAGTAGTCATCTAAAAACTACAGATACTCCTT TCTGACAAGCACTTCCTAGTACATAACACATATTTCATGCTTCATTTTTAACCATAAATT TGAAAAATGCCTATTCATTACTTGTAAACATAATCGATTATTCTATTGTTGTATTTTTCT CTTGTTTTTATACTTTGTTGTCGATGATGGATACACTTTGTACAGAATAGATTTTGTTTC AGTTAGTTATAATAAGTTTCAAATTAATTTTATTTAGCTTACTATCTAGTTCGTTACAAT ATTGTGTAGTAAGTTCAGAAAATCAGTTAATCTTAACTCAAAACAGTTCTTTGTGTTTTG GAGCGATAATACGTGAACGGATCAAATATGAATCTTTATACCTAGGGTGACTAACGCATA ACGATAACACTTAACTGGTGACAACCACATGTTAGTAATAATAGAGAAGACTGAAATTTA TCAGAGAAATTTTCGTTTCAAGAAAAATTAATAAAATGAGTAATTAACTGTAATCAATAA ACTTAAGGTCAATTACACGCTGCGCTTCACAATGATCTTAATTCACGAAAAGATAGAAGA ATGATCAAGATAAATCATAACAAATACTGGGGTTAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)