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Schistosoma mansoni
cluster # 8083 cluster # 8083       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8083#0 length = 789 sequences # 6  

consensusID : consensus_8083#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 789
fasta sequence
                              [CAACTGAAGCCTGGAATATCTACTGATAGCCTTTAGGTATGGGCTCGTGTTGCTAGCTGTCGTGCTTGGTTCCAGTTACACAAAGCTCATACACTCAGACCAGGTTATGGTGAGTGTAACAATGTACAATTAAATAATCCAGTATGTCCTTCCATCTACTATCATATTAGTGAAAACTCAGAACAGTCAGAGTGTGTTATAAACCGTTTTTCCGTTAGTCAGAGTTTGAATGGATGCAGTAGTTACAATGAAAATCCAGCTATTTTAAAAACGGAAGATGATTCTGTCAATGAACACATTGTTCCTACGATTAATTTTACAGACTCCCTAGATCCTGATAGTATTGTTACTGAACAGATAATTGAAGAGGGAGTTGAAGTCCCTTTGGATGATACTGATGATTTGGCGTATAGCACTTCCGGTTCTGTATTGCAGGAGAATCTCATAGTTTGTGTAGCATCTCAAGATGTTGGTTCAGTGCCTATGTGTACTTCAAGTTCTTCAGTCACCCAAGATGTGTTCCTGAGTGGTATTAATCCAATCAACATGAAGTCCCAACCACTACTGAATCCACATGAAGAGATCGCAGAAAAATATAACTCGCGACCTGAAAACTGAAGGTTTCCCACTAAACTGTGTATAGATTTGACAGTCTCTTGATTTTCTTTATTATTAGAACCTGTAAACAGGTAAATGTGATAGGCCCGCTAATATATGTTTTTCCATATATGTTTACGTAAATCCCTTTTGTTATCTTATGCTAATGTAAAATAAAAATTCTGTTTTCTT]

[+] EMBL CD137586             [CAACTGAAGCCTGGAATATCTACTGATAGCCTTTAGGTATGGGCTCGTGTTGCTAGCTGTCGTGCTTGGTTCCAGTTACACAAAGCTCATACACTCAGACCAGGTTATGGTGAGTGTAACAATGTACAATTAAATAATCCAGTATGTCCTTCCATCTACTATCATATTAGTGAAAACTCAGAACAGTCAGAGTGTGTTATAAACCGTTTTTCCGTTAGTCAGAGTTTGAATGGATGCAGTAGTTACAATGAAAATCCAGCTATTTTAAAAACGGAAGATGATTCTGTCAATGAACACATTGTTCCTACGATTAATTTTACAGACTCCCTAGATCCTGATAGTATTGTTACTGAACAGATAATTGAAGAGGGAGTTGAAGTCCCTTTGGATGATACTGATGATTTGGCGTATAGCACTTCCGGTTCTGTATTGCAGGAGAATCTCATAGTTTGTGTAGCATCTCAAGATGTTGGTTCAGTGCCTATGTGTACTTCAAGTTCTTCAGTCACCCCAGATGTNGTCCTGAGTGGTATTAATCCAATCAACATGAAGTCCCAACCACTACTGANTCCACATGAAGAGATCGCAGAAAAATATAACTCGCGACCTGAAAACTGAAGGTTTCCCACTAAACTGTGTATAGATTTGACAGTCTCTTGATTTTCTTTATTATTAGAACCTGTAAA                                                                                                       ]
[+] EMBL BG932722             [                                                               aCTTGGTTCCAGTTACACAAAGCTCATACACTCAGACCAGGTTATGGTGAGTGTAACAATGTACAATTAAATAATCCAGTATGTCCTTCCATCTACTATCATATTAGTGAAAACTCAGAACAGTCAGAGTGTGTTATAAACCGTTTTTCCGTTAGTCAGAGTTTGAATGGATGCAGTAGTTACAATGAAAATCCAGCTATTTTAAAAACGGAAGATGATTCTGTCAATGAACACATTGTTCCTACGATTAGTTTTACAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AW016953             [                                                                                                                                                                                                                                    AATGGATGCAGTAGTTACAATGAAAATCCAGCTATTTTAAAAACGGAAGATGATTCTGTCAATGAACACATTGTTCCTACGATTAATTTTACAGACTCCCTAGATCCTGATAGTATTGTTACTGAACAGATAATTGAAGAGGGAGTTGAAGTCCCTTTGGATGATACTGATGATTTGGCGTATAGCACTTCCGGTTCTGTATTGCAGGAGAATCTCATAGTTTGTGTAGCATCTCAAGATGTTGGTTCAGTGCCTATGTGTACTTCAAGTTCTTCAGTCACCCAAGATGTGTTCCTGAGTGGTATTAATCCAATCAACATGAAGTCCCAACCACTACTGAATCCACATGAAGAGATCGCAGAANAATATAACTCGCGACCTGAAAACTGAAGt                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL BG932174             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cgGAAGAGGGAGTTGAAGTCCCTTTGAATGATACTGATGATTTGGCGTATAGCACTTCCGGTTCTGTATTGCAGGAGAATCTCATAGTTTGTGTAGCATCTCAAGATGTTGGTTCAGTGCCTATGTGTACTTCAAGTTCTTCAGTCACCCAAGATGTGTTCCTGAGTGGTATTAATCCAATCAACATGAAGTCCCAACCACTACTGAATCCACATGAAGAGATCGCAGAAAAATATAACTCGC                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD078949             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGAGAATCTCATAGTTTGTGTAGCATCTCAAGATGTTGGTTCAGTGCCTATGTGTACTTCAAGTTCTTCAGTCACCCAAGATGTGTTCCTGAGTGGTATTAATCCAATCAACATGAAGTCCCAACCACTACTGAATCCACATGAAGAGATCGCAGAAAAATATAACTCGCGACCTGAAAACTGAA GTTTCCCACTAAACTGTGTATAGATTTGACAGTCTCTTGATTTTCTTTATTATTAGAACCTGTAAACAGGTAAATGTGATAGGCCCGCTAATATATGTTTTTCCATATATGTTTACGTAAATCCCTTTTGTTATCTTATGCTAATGTAAAATAAAAATTCTGTTTTCT ]
[-] EMBL CD073403             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GAGAATCTCATAGTTTGTGTAGCATCTCAAGATGTTGGTTCAGTGCCTATGTGTACTTCAAGTTCTTCAGTCACCCAAGATGTGTTCCTGAGTGGTATTAATCCAATCAACATGAAGTCCCAACCACTACTGAATCCACATGAAGAGATCGCAGAAAAATATAACTCGCGACCTGAAAACTGAA GTTTCCCACTAAACTGTGTATAGATTTGACAGTCTCTTGATTTTCTTTATTATTAGAACCTGTAAACAGGTAAATGTGATAGGCCCGCTAATATATGTTTTTCCATATATGTTTACGTAAATCCCTTTTGTTATCTTATGCTAATGTAAAATAAAAATTCTGTTTTCTT]


>consensus_8083#0 CAACTGAAGCCTGGAATATCTACTGATAGCCTTTAGGTATGGGCTCGTGTTGCTAGCTGT CGTGCTTGGTTCCAGTTACACAAAGCTCATACACTCAGACCAGGTTATGGTGAGTGTAAC AATGTACAATTAAATAATCCAGTATGTCCTTCCATCTACTATCATATTAGTGAAAACTCA GAACAGTCAGAGTGTGTTATAAACCGTTTTTCCGTTAGTCAGAGTTTGAATGGATGCAGT AGTTACAATGAAAATCCAGCTATTTTAAAAACGGAAGATGATTCTGTCAATGAACACATT GTTCCTACGATTAATTTTACAGACTCCCTAGATCCTGATAGTATTGTTACTGAACAGATA ATTGAAGAGGGAGTTGAAGTCCCTTTGGATGATACTGATGATTTGGCGTATAGCACTTCC GGTTCTGTATTGCAGGAGAATCTCATAGTTTGTGTAGCATCTCAAGATGTTGGTTCAGTG CCTATGTGTACTTCAAGTTCTTCAGTCACCCAAGATGTGTTCCTGAGTGGTATTAATCCA ATCAACATGAAGTCCCAACCACTACTGAATCCACATGAAGAGATCGCAGAAAAATATAAC TCGCGACCTGAAAACTGAAGGTTTCCCACTAAACTGTGTATAGATTTGACAGTCTCTTGA TTTTCTTTATTATTAGAACCTGTAAACAGGTAAATGTGATAGGCCCGCTAATATATGTTT TTCCATATATGTTTACGTAAATCCCTTTTGTTATCTTATGCTAATGTAAAATAAAAATTC TGTTTTCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)