cluster # 8088

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Schistosoma mansoni
cluster # 8088 cluster # 8088 Sequences # 6 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_8088#0 length = 685 sequences # 6
consensusID : consensus_8088#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 685
fasta sequence
                              [TATGTTAAGTCAAATTTTTCTATTACCATTTTACAGCAACATTATCAAATAGCAACTTCACGATTAATGCATATGATAGGGGACTGTGGTATGTTGAATGAAATCCAAGTTCCTACCTCTGTCAAAAAGAAAACATGGATTTCTTTCATATTATT-TATGTGTAAGTTGGTTGTTTTATTTTTACGAAAGAAAAT-TTAATAATAATTATTCTTATGACACTAATTTCACACCATCTCCCATTTATTATTGTTTATTGGACAATCATTTTATTCCAGTCAACAAATATTCTNTAATTCATGATGCACTTAATTATTTTTTAGTTCATCGTAATGCTG-GGTTTTTTATCTGACGACGTCAGTAATATACACTTTCTGTTTGTCCAGTCAGTAACTTGGACTTATTACTTTTATTCTCCTTTTTTCACTAACACTATTATTACTACAAGATCAGTGTTTATTATCCATATTACCTTTTTACTCATGGGTCGCCTCTATTTTTCAACTTGGTATGTTCCTTATTTGTTACTTCTCTATATTCTATTCGGAAAGAACAAAACTTTGTGACGTATTTACGCTTATCAGGATAATTATTGTTACTACTATTATCTCTATTTCCTGTATCTTATTCATTGTGTAATTCATGTCAAAGAGGCCAATGTCCATACATATAAAGTTAAAAAAAATAG]

[+] EMBL CD090128             [TATGTTAAGTCAAATTTTTCTATTACCATTTTACAGCAACATTATCAAATAGCAACTTCACGATTAATGCATATGATAGGGGACTGTGGTATGTTGAATGAAATCCAAGTTCCTACCTCTGTCAAAAAGAAAACATGGATTTCTTTCATATTATT TATGTGTAAGTTGGTTGTTTTATTTTTACGAAAGAAAAT TTAATAATAATTATTCTTATGACACTAATTTCACACCATCTCCCATTTATTATTGTTTATTGGACAATCATTTTATTCCAGTCAACAAATATTCTTTAATTCATGATGCACTTAATTATTTTTTAGTTCATCGTAATGCTG GGTTTTTTATCTGACGACGTCAGTAATATACACTTTCTGTTTGTCCAGTCAGTAACTTGGACTTATTACTTTTATTCTCCTTTTTTCACTAACACTATTATTACTACAAGATCAGTGTTTATTATCCATATTACCTTTTTACTCATGGGTCGCCTCTATTTTTCAACTTGGTATGTTCCTTATTTGTTACTTCTCTATATTCTATTCGGAAAGAACAA                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD199197             [                                                                                                                                   AACATGGATTTCTTTCATATTATT TATGTGTAAGTTGGTTGTTTTATTTTTACGAAAGAAAAT TTAATAATAATTATTCTTATGACACTAATTTCACACCATCTCCCATTTATTATTGTTTATTGGACAATCATTTTATTCCAGTCAACAAATATTCTTTAATTCATGATGCACTTAATTATTTTTTAGTTCATCGTAATGCTGNGTTTTTTTATCTGACGACGTCAGTNATATACACTTTCTGTTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD199232             [                                                                                                                                    ACATGGATTTCTTTCATA TATTNNATGTGTAAGTNGG TGTNTTATTTTTACGAAGAAAAAT TNAATAATAATTATTCTTATGACACTAATTTCACACCATCTCCCATTTATTATTGTTTATTGGACAATCATTTTATTCCAGTCAACAAATATTCTNTAATTCATGATGCACTTAATTATTTTTTAGTTCATCGTAATGCTG GGTTTTTTATCTGACGACGTCAGTAATATACACTTTCTGTTTGTCCAGTCAGTAACTTGGACTTATTACTTTTATTCTCCTTTTTTCACTAACACTATTATTACTACAAGATCAGTGTTTATTATCCATATTA                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD199307             [                                                                                                                                                                                               AAATNNTAATAATAATTATTCTTATGACACTAATTTCACACCATCTCCCATTTATTATTGTNTATTGGACAATCATTNTATTCCAGTCAACAAATATTCTNTAATTCATGATGCACTTAATTATTTTTTAGTTCATCGTAATGCTG GGTTTTTTATCTGACGACGTCAGTAATATACACTTTCTGTTTGTCCAGTCAGTAACTTGGACTTATTACTTTTATTCTCCTTTTTTCACTAACACTATTATTACTACAAGATCAGTGTTTATTATCCATATTA                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD199274             [                                                                                                                                                                                                 aa TTAATAATAA TATTCTTATGACACTAATTTCACACCATCTCCCATTTATTATTGTNTATTGGACAATCATTTTATTCCAGTCAACAAATATTCTNTAATTCATGATGCACTTAATTATTTTTTAGTTCATCGTAATGCTG GGCTTTTTATCTGACGACGTCAGTAATATACACTTTCTGTTTGTCCAGTCAGTAACTTGGACTTATTACTTTTATTCTCCTTTTTTCACTAACACTATTATTACTACAAGATCAGTGTTTATTATCCATATTA                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BE431283             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTCGCCTCTATTTTTCAACTTGGTATGTTCCTTATTTGTTACTTCTCTATATTCTATTCGGAAAGAACAAAACTTTGTGACGTATTTACGCTTATCAGGATAATTATTGTTACTACTATTATCTCTATTTCCTGTATCTTATTCATTGTGTAATTCATGTCAAAGAGGCCAATGTCCATACATATAAAGTTAAAAAAAATAG]




>consensus_8088#0
TATGTTAAGTCAAATTTTTCTATTACCATTTTACAGCAACATTATCAAATAGCAACTTCA
CGATTAATGCATATGATAGGGGACTGTGGTATGTTGAATGAAATCCAAGTTCCTACCTCT
GTCAAAAAGAAAACATGGATTTCTTTCATATTATTTATGTGTAAGTTGGTTGTTTTATTT
TTACGAAAGAAAATTTAATAATAATTATTCTTATGACACTAATTTCACACCATCTCCCAT
TTATTATTGTTTATTGGACAATCATTTTATTCCAGTCAACAAATATTCTNTAATTCATGA
TGCACTTAATTATTTTTTAGTTCATCGTAATGCTGGGTTTTTTATCTGACGACGTCAGTA
ATATACACTTTCTGTTTGTCCAGTCAGTAACTTGGACTTATTACTTTTATTCTCCTTTTT
TCACTAACACTATTATTACTACAAGATCAGTGTTTATTATCCATATTACCTTTTTACTCA
TGGGTCGCCTCTATTTTTCAACTTGGTATGTTCCTTATTTGTTACTTCTCTATATTCTAT
TCGGAAAGAACAAAACTTTGTGACGTATTTACGCTTATCAGGATAATTATTGTTACTACT
ATTATCTCTATTTCCTGTATCTTATTCATTGTGTAATTCATGTCAAAGAGGCCAATGTCC
ATACATATAAAGTTAAAAAAAATAG
clustalw multiple alignements is not computed in this case