These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8122#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 487 fasta sequence [ATTGTTTGATATGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGATAAACAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTCAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAACAAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTAAATGCCTTATCTTTGTAATTTTATTTCAAAACTTTGAATTTCTTGTTTTCTTCACCAAAAGCGCTCGTTTTC] [+] EMBL CD118655 [ATTATTTGATATGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTCCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGATAAACAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTCAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAACAAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTANATGCCTTATCTTTGTAATTNTATTTCANAACTTTGAATTTCTTGNTNTCTTCACCANNAGCGCTCGTTTTC] [+] EMBL CD118601 [ATTGTTTGATATGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGCGATAAACAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTCAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAACAAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTAAATGCCTTATCTTTGTAATTTTATTTCAAAACTTTGAATTTCTTGTTTTCTTCACCAAAAGCGCTCGTTTTC] [+] EMBL CD118661 [ATTGTTTGATATGGAGTGTCAACCAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGATAAACAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTCAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAACAAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTAAATGCCTTATCTTTGTAATTTTATTTCAAAACTTTGAATTTCTTGTTTTCTTCACCAAAAGCGCTCGTTTTC] [+] EMBL CD118546 [ATTGTTTGATATGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGATAAACAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTCAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAACAAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTAAATGCCTTATCTTTGTAATTTTATTTCAAAACTTTGAATTTCTTGTTTTCTTCACCAAAAGCGCTCGTTTTC] [+] EMBL CD118633 [ATTGTTTGATATGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGATAAACAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTTAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAACAAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTAAATGCCTTATCTTTGTAATTTTATTTCAAAACTTTGAATTTCTTGTTTTCTTCACCAAAAGCGCTCGTTTTC] [+] EMBL CD118534 [ATTGTTTGATCTGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCCTTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||