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Schistosoma mansoni
cluster # 8122 cluster # 8122       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8122#0 length = 487 sequences # 6  

consensusID : consensus_8122#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 487
fasta sequence
                              [ATTGTTTGATATGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGATAAACAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTCAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAACAAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTAAATGCCTTATCTTTGTAATTTTATTTCAAAACTTTGAATTTCTTGTTTTCTTCACCAAAAGCGCTCGTTTTC]

[+] EMBL CD118655             [ATTATTTGATATGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTCCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGATAAACAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTCAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAACAAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTANATGCCTTATCTTTGTAATTNTATTTCANAACTTTGAATTTCTTGNTNTCTTCACCANNAGCGCTCGTTTTC]
[+] EMBL CD118601             [ATTGTTTGATATGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGCGATAAACAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTCAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAACAAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTAAATGCCTTATCTTTGTAATTTTATTTCAAAACTTTGAATTTCTTGTTTTCTTCACCAAAAGCGCTCGTTTTC]
[+] EMBL CD118661             [ATTGTTTGATATGGAGTGTCAACCAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGATAAACAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTCAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAACAAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTAAATGCCTTATCTTTGTAATTTTATTTCAAAACTTTGAATTTCTTGTTTTCTTCACCAAAAGCGCTCGTTTTC]
[+] EMBL CD118546             [ATTGTTTGATATGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGATAAACAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTCAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAACAAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTAAATGCCTTATCTTTGTAATTTTATTTCAAAACTTTGAATTTCTTGTTTTCTTCACCAAAAGCGCTCGTTTTC]
[+] EMBL CD118633             [ATTGTTTGATATGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGATAAACAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTTAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAACAAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTAAATGCCTTATCTTTGTAATTTTATTTCAAAACTTTGAATTTCTTGTTTTCTTCACCAAAAGCGCTCGTTTTC]
[+] EMBL CD118534             [ATTGTTTGATCTGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCCTTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGAT                                                                                                                                                                                              ]


>consensus_8122#0 ATTGTTTGATATGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGT TAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTT CCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAA TATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAAC AAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGATAAA CAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTCAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAAC AAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTAAATGC CTTATCTTTGTAATTTTATTTCAAAACTTTGAATTTCTTGTTTTCTTCACCAAAAGCGCT CGTTTTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)